演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GPHRBSH120

golgi pH regulator B

GPHRB(golgi pH regulator B)是高基氏體膜上的多次穿膜蛋白,具有陰離子通道活性,參與高基氏體酸化。

Homo sapiens1q21.2UniProt P0CG08
OFFICIAL SYMBOL
GPHRB
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P0CG08
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GPHRB(golgi pH regulator B)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 Golgi pH regulator 家族,定位於高基氏體膜。蛋白質長度為 455 個胺基酸,具有多段穿膜螺旋結構;現有序列註解標示九段穿膜區。其基本角色與高基氏體內腔酸化相關,並具有轉運陰離子的通道活性。這些特性使 GPHRB 成為高基氏體膜上參與離子通透與腔內環境維持的蛋白質。

Official symbol
GPHRB
Gene name
golgi pH regulator B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13840
UniProt
P0CG08
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SH120GPR89GPR89CLINC02804GPR89B

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegGPHRBpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:147,928,322–147,993,850
Gene span
65,529 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000314163 ★147,928,420–147,993,59214
ENST00000902713147,928,394–147,993,58514
ENST00000902714147,928,394–147,993,33914
ENST00000935961147,928,394–147,993,33912
ENST00000935962147,928,394–147,993,33913
ENST00000970056147,928,394–147,993,33514
ENST00000970057147,928,394–147,993,33614
ENST00001111499147,928,394–147,954,6647
ENST00001117258147,928,394–147,993,33613
ENST00001127004147,928,394–147,979,74111
ENST00001141631147,928,394–147,993,59214
ENST00000468618147,928,436–147,966,6457

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GPHRB 是電壓門控通道,可促進碘離子、氯離子、溴離子及氟離子等陰離子轉運。此通道活性可能提供反離子傳導,並參與高基氏體酸化;來源所列的離子轉運方向分別為碘離子向外、氯離子向外、溴離子向外及氟離子向外。這些資料支持其離子通道作用與高基氏體腔內酸性環境之間的關聯,但未提供更詳細的通道調控機制。

在神經元中,GPHRB 被認為是維持高基氏體內腔酸性 pH 的必要因子。這種酸性環境有助維持高基氏體結構完整性;結構完整又支持小腦抑制性神經元(包括 Purkinje 細胞與 basket cells)的軸突運輸及突觸維持。因此,GPHRB 所參與的酸化作用與神經元內部運輸及突觸維護相連,相關敘述依相似性證據提出。

高基氏體酸化也有助於 SREBP2 活化,進而確保足夠的膽固醇生合成;這對正常神經元形態與功能具有必要性。另有資料指出,GPHRB 可能在造血細胞中作為 RABL3 的效應因子,參與淋巴球發育。此角色同樣是依相似性推定,不能視為已確立的直接作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 147928420 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPHRB ENST00000314163 GRCh38 chr1:147927420-147928520 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATCTTCAATTAACTTCCAGTCCTTTGCCCTACAGATAATTCGTAGTGCCACATCAGTTCTACCCATTCT
TTCACATGAAGACAGATGTCATGTTCTGAGTCATCTTTCTTCGCCTCCTTCCAGCAGCCCTTATCTGGTG
GCTCACATTTGAGCGAGCTCCAATATGTCTCTGTAGAATCTCTCTCTTCTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTT
TTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACCGCAACC
TCCCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGTTGGGATTACAGGCATGCACCAC
CACGCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGCTTGTCAGGCTGGTTTTGAACT
TGCGACCTCAGGTGATCCGCCCGCCTTGGTCTCCCCAGGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCGGCCCGGC
CTGTAAAATCTCTTCAAAGTGTGGTACATGGAGTGCAGTACTCCACCTGTGGCCTGACTGATATGCAGTA
CAATATTATCACTAAATTGCTACAGACAGTGTGCTTTTCATTGTTGTCACAGAAATGTATTTGGTTAGTT
ATATTTGTTCATATCTCATCTGACTTTCCAGTCTTCCCTCACTTTGTACAGTCATATTTGCCGAGTCAAG
TAAAAGTTATAACATTTAGGACACAATGCCCGACTTACTATAATTACCATTATTATCTTAGGATCATTAC
AAAACAGAATTACCACTTAGCTCTCAGGCCCTACCTCCTTCAGCCTCAGAAACGTTAACGCTACCTTGCA
TTGCTGCTTTTAGCACCGCCCCTAATAAGCCCCGCCCCTGGGGCTTCCGCGGCGGAAGCCTAGCGTCCGC
CCCACCCACCCCGAGCCCGAGGCGGGGCTGTGGATGTAGCCGCTGATTGGCTGACTGGGGCGCAGCTTGA
CGGCGTCGGGCTGGAGAGCCGCAGTCCCGGCTGCAGCACCTGGGAGAAGGCAGACCGTGTGAGGGGGCCT
GTGGCCCCAGCGTGCTGTGGCCTCCGGGAGTGGGAAGTGGAGGCAGGAGCC
GPHRB 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GPR89B_1 ↗1:147,928,422正股147,928,373–147,928,432

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_946PB8 · enhancer · 147927817–147928299 · regulatory

ENSR1_86CFLN · promoter · 147928300–147928430 · regulatory

ENSR1_CJNBT · enhancer · 147928431–147929481 · regulatory

· motif · 147927549–147927555 · motif

· motif · 147928272–147928282 · motif

· motif · 147928288–147928298 · motif

· motif · 147928297–147928314 · motif

· motif · 147928328–147928338 · motif

· motif · 147928434–147928443 · motif

· motif · 147928579–147928587 · motif

· motif · 147928902–147928911 · motif

· motif · 147928902–147928913 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:455 aa

1 aa455 aa跨膜區
依 P0CG08 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GPHRB 蛋白長 455 個胺基酸,屬於 Golgi pH regulator(TC 1.A.38)家族。序列註解列出九段螺旋型穿膜區,分別位於胺基酸 5–25、46–66、79–99、114–134、150–170、290–310、343–363、378–398 與 425–445。

跨膜區Helical5–25 aa
跨膜區Helical46–66 aa
跨膜區Helical79–99 aa
跨膜區Helical114–134 aa
跨膜區Helical150–170 aa
跨膜區Helical290–310 aa
跨膜區Helical343–363 aa
跨膜區Helical378–398 aa
跨膜區Helical425–445 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P0CG08…

AlphaFold · P0CG08

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Golgi apparatus membrane

GPHRB 位於高基氏體膜,屬多次穿膜蛋白。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型間差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GPHRBGPHRBWFS1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GPHRB 可形成同源三聚體。另有相似性證據指出,它會與 RABL3 互作,而此互作可穩定 GPHRB;來源未將這項互作描述為同一複合體的組成關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GPHRB 是電壓門控通道,可轉運碘離子、氯離子、溴離子及氟離子,並可能提供反離子傳導、參與高基氏體酸化。依相似性推定,它可能在造血細胞中作為 RABL3 效應因子參與淋巴球發育;在神經元中則有助維持高基氏體內腔酸性 pH 與結構完整性,支持小腦抑制性神經元的軸突運輸和突觸維持。高基氏體酸化也有助 SREBP2 活化及膽固醇生合成,對神經元形態與功能具有必要性。含實驗來源
證據與來源

Voltage-gated channel that enables the transfer of anions such as iodide, chloride, bromide and fluoride which may function in counter-ion conductance and participates in Golgi acidification. Plays a role in lymphocyte development, probably by acting as a RABL3 effector in hematopoietic cells (By similarity). Essential for maintaining the acidic luminal pH of the Golgi apparatus in neurons, which is important for preserving Golgi structural integrity (By similarity). This integrity supports proper axonal transport and synaptic maintenance in cerebellar inhibitory neurons, including Purkinje and basket cells (By similarity). Additionally, Golgi acidification facilitates the activation of SREBP2, thereby ensuring sufficient cholesterol biosynthesis necessary for normal neuronal morphology and function (By similarity)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性iodide(out) = iodide(in)含實驗來源
證據與來源

iodide(out) = iodide(in)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性bromide(in) = bromide(out)含實驗來源
證據與來源

bromide(in) = bromide(out)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性fluoride(in) = fluoride(out)含實驗來源
證據與來源

fluoride(in) = fluoride(out)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用GPHRB 可形成同源三聚體。依相似性證據,GPHRB 也會與 RABL3 互作,而此互作可穩定 GPHRB。含實驗來源
證據與來源

Homotrimer. Interacts with RABL3; the interaction stabilizes GPHRB (By similarity)

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GPHRB 位於高基氏體膜,屬於多次穿膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Golgi apparatus membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 18794847 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000314163 · 2,160 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCAGTCCCGGCTGCAGCACCTGGGAGAAGGCAGACCGTGT40
41GAGGGGGCCTGTGGCCCCAGCGTGCTGTGGCCTCCGGGAG80
81TGGGAAGTGGAGGCAGGAGCCTTCCTTACACTTCGCCATG120
121AGTTTCCTGATCGACTCCAGCATCATGATTACCTCCCAGA160
161TACTATTTTTTGGATTTGGGTGGCTTTTCTTCATGCGCCA200
201ATTGTTTAAAGACTATGAGATACGTCAGTATGTTGTACAG240
241GTGATCTTCTCCGTGACGTTTGCATTTTCTTGCACCATGT280
281TTGAGCTCATCATCTTTGAAATCTTAGGAGTATTGAATAG320
321CAGCTCCCGTTATTTTCACTGGAAAATGAACCTGTGTGTA360
361ATTCTGCTGATCCTGGTTTTCATGGTGCCTTTTTACATTG400
401GCTATTTTATTGTGAGCAATATCCGACTACTGCATAAACA440
441ACGACTGCTTTTTTCCTGTCTCTTATGGCTGACCTTTATG480
481TATTTCTTCTGGAAACTAGGAGATCCCTTTCCCATTCTCA520
521GCCCAAAACATGGGATCTTATCCATAGAACAGCTCATCAG560
561CCGGGTTGGTGTGATTGGAGTGACTCTCATGGCTCTTCTT600
601TCTGGATTTGGTGCTGTCAACTGCCCATACACTTACATGT640
641CTTACTTCCTCAGGAATGTGACTGACACGGATATTCTAGC680
681CCTGGAACGGCGACTGCTGCAAACCATGGATATGATCATA720
721AGCAAAAAGAAAAGGATGGCAATGGCACGGAGAACAATGT760
761TCCAGAAGGGGGAAGTGCATAACAAACCATCAGGTTTCTG800
801GGGAATGATAAAAAGTGTTACCACTTCAGCATCAGGAAGT840
841GAAAATCTTACTCTTATTCAACAGGAAGTGGATGCTTTGG880
881AAGAATTAAGCAGGCAGCTTTTTCTGGAAACAGCTGATCT920
921ATATGCTACCAAGGAGAGAATAGAATACTCCAAAACCTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。