01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
GPANK1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 G-patch domain and ankyrin repeats 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
Official symbol
GPANK1
Gene name
G-patch domain and ankyrin repeats 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13920
UniProt
O95872
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
G5D6S54EGPATCH10ANKRD59BAT4
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 66p21.33
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:31,661,228–31,666,283
Gene span
5,056 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375896 ★ | 31,661,228–31,664,997 | 3 |
| ENST00001138668 | 31,661,228–31,665,871 | 3 |
| ENST00000375906 | 31,661,229–31,666,283 | 4 |
| ENST00000375893 | 31,662,076–31,665,849 | 4 |
| ENST00000375895 | 31,662,076–31,665,871 | 4 |
| ENST00000375900 | 31,662,076–31,665,871 | 4 |
| ENST00000921266 | 31,662,076–31,666,283 | 4 |
| ENST00000921271 | 31,662,078–31,665,871 | 3 |
| ENST00000908857 | 31,662,080–31,666,283 | 3 |
| ENST00000908858 | 31,662,081–31,666,283 | 3 |
| ENST00000908861 | 31,662,081–31,665,871 | 3 |
| ENST00000921267 | 31,662,081–31,665,871 | 4 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GPANK1 ENST00000375896 GRCh38 chr6:31664897-31665997 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGAAAGAAACTGGCTAAATGAGAGAAAGCGAACTACCAATCCCAGGATGACCCGCGCACGACCTGGCTGT CACGAAGGCCCGGAGGAGGGCGCTTGCGGGCGGGGCACAACGAGAAGCCACCGGAAGCGGAAGCCAGGTA TGGCGTTCGGGGCCCGGGAGTCTGGGCAATACAGTTTTGTGCTCACTGGGTGAAGAGGCTGACTTAGGGC GGGGAAAGGAGGGAGCCAGGCTGGATCTCTTTCCGCAGCTCTCCTCACGTTCCCCTCTAGTCCCGGCGCG GCGCTGCTGCCCAGGGGACTGGCCTATCCTCGGCCAATCCGCTGGGTCCTTATTGCCTGTTGGGCCCCTA GTGCGAATCAGTCCCGCCAGAGACCCTTGACGGGCATACTGTTTCCTCCGGGCTCCTGCCTCATGAGGGG AGAGGTGCGGCTTGGCTCCGTGCGTAGGGACTTGGGTGGGGTGGGGTGGGCGGTGTGAGAACTGGAACGT CCCAGTGCGCTAACCTGAGGTGGTGCCAGCCATTCTGCTCGTCCCTTTGCACTTCTCCATTTCCCCTTAG GCTCTAAGTGTGACCTTCGAACCCTGGTCAGAGTAATGGTGAGGGGCAGGCGTGACGTTATTTCATTACA CGGCTTCTCGGCATTCCACAGGTTTCCCTCCGCCTCCTGAGGGCCTTTCCTAACCCACAGAGTGGATTCC TGGCTCCAGAAAATGGGCTTGGAGCGGGGGCCACGTTGAGGAAGGCGAAGGGCATTGTGGGGGCGTTATG TAAAAGTAGGACCCCAACCGACAGATCCTAGTGCTCGCGCCACCTGGGCGCGCGGAGCTTTGCTCGTTTA CTATTGAAAAAGTTCCAGCGCGGGAAACTGAACCCGGAGCTTTGCGCACGCCCGAGCCCTCAAGTAATGT GGGTTGTGGTTTTTGTTGTTGTTGTCGCCACGCATGCGTCTTCGTGCCGTGTGGCTATTTGATTGTGTCA ACTCTTCTGATTAGAATGGCGCCATTTTGCGGTACGGAAGCTACACAGCAACACGTATAGGAGACTCTCC CCGAGATCTTCTAGGGAGTGACCCATCTATTTTTGTTTGGGAAGAGGAAAC
GPANK1 位於負股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GPANK1_1 ↗ | 6:31,664,997 | 負股 | 31,664,987–31,665,046 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：356 aa
GPANK1 的蛋白質長 356 個胺基酸。序列第 1–98 位註記為無序區；第 111–141 位與第 142–172 位各有一個 ankyrin repeat。第 255–301 位為 G-patch 結構域，其註記依據 PROSITE-ProRule。
重複區ANK 1111–141 aa
重複區ANK 2142–172 aa
結構域G-patch255–301 aa
功能區域Disordered1–98 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95872…
09 / PROTEIN NETWORK
交互作用與訊號網絡
圖中 50 個夥伴 · 最多顯示 50 個
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 86 個夥伴
86 個夥伴
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKAP8LQ9ULX6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANAPC11Q9NYG5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AP1B1Q10567-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AP2B1P63010-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG4O95429 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1QTNF2Q9BXJ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CADPSA2RRN7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC184Q52MB2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CEACAM6P40199 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIMIP2BA8MTA8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDI1Q8WTU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DHX15O43143 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DISC1Q9NRI5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ECM1Q16610 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFSO43281-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FTOQ9C0B1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPRASP3Q6PI77 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNRNPH1P31943 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPB1P04792 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INKA1Q96EL1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
第 1 頁
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
0 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
GCCATTTTGCGGTACGGAAGCTACACAGCAACACGTATAG4041
GAGACTCTCCCCGAGATCTTCTAGGGAGTGACCCATCTAT8081
TTTTGTTTGGGAAGAGGAAACTCCGAAATGGGATCGCGGA120121
AGACTTAAAGGGCCAGGCTGATTTTTTTTTCCTACTGGTC160161
TCTGAGGCTGTGGTTGCTACAGGGTCACCACGAGCTTGGC200201
TTACTTGTCTCATCCTTCCCTTGCCTGGTATCATTTTCTC240241
AGTTCTCCCAAAAGCCATGTCCCGGCCCTTGCTCATCACC280281
TTCACCCCAGCCACTGACCCCAGCGACCTCTGGAAGGATG320321
GGCAGCAGCAGCCACAGCCCGAGAAGCCAGAGTCCACCCT360361
GGATGGGGCTGCAGCCCGAGCTTTCTATGAGGCCCTGATT400401
GGGGATGAGAGCAGCGCTCCTGACTCCCAGAGATCTCAGA440441
CTGAACCTGCCAGAGAAAGAAAGAGAAAGAAAAGAAGAAT480481
AATGAAGGCACCAGCAGCAGAAGCAGTGGCAGAAGGAGCA520521
TCAGGAAGACATGGACAAGGGAGATCCCTTGAGGCTGAGG560561
ATAAGATGACTCACCGGATACTGAGGGCAGCCCAGGAGGG600601
GGACCTGCCAGAACTTAGGAGACTGCTGGAACCGCATGAG640641
GCAGGAGGAGCTGGGGGGAATATCAACGCCCGGGATGCCT680681
TCTGGTGGACCCCACTGATGTGTGCTGCTCGAGCGGGCCA720721
GGGGGCAGCTGTGAGCTATCTCCTGGGCCGTGGGGCTGCC760761
TGGGTGGGGGTCTGTGAGCTGAGTGGCAGGGATGCGGCTC800801
AGCTCGCTGAAGAAGCTGGCTTCCCTGAGGTAGCCCGCAT840841
GGTCAGGGAGAGCCATGGAGAGACAAGGAGCCCGGAAAAC880881
CGGTCTCCTACTCCCTCCCTCCAGTACTGCGAGAACTGTG920921
ACACCCACTTCCAAGATTCCAACCACCGCACATCCACTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE