演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GP6GPVI

glycoprotein VI platelet

GP6 編碼 Platelet glycoprotein VI,是參與膠原誘發血小板反應的受體;其單次穿膜結構連接細胞外區域與細胞質端。

Homo sapiens19q13.42UniProt Q9HCN6
OFFICIAL SYMBOL
GP6
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9HCN6
PDB / ALPHAFOLD
5OU7
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GP6 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 glycoprotein VI platelet,產物名稱為 Platelet glycoprotein VI。此蛋白質具有單次穿膜結構,包含細胞外區域、跨膜區段與細胞質區域;細胞外部分含兩個 Ig-like C2-type 結構域。它是血小板的膠原受體,主要角色與膠原誘發的血小板黏附及活化相關。這些結構特徵使其具備位於細胞膜並參與細胞外訊號傳遞的基本架構。

Official symbol
GP6
Gene name
glycoprotein VI platelet
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14388
UniProt
Q9HCN6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
GPVI

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.42
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25GP6pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:55,012,055–55,038,264
Gene span
26,210 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000417454 ★55,013,705–55,038,2648
ENST0000031037355,012,055–55,038,2648
ENST0000033388455,012,055–55,038,2647
ENST0000090600655,012,055–55,038,2647
ENST0000114117955,012,055–55,038,2648
ENST0000046823955,027,605–55,032,8653

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GP6 的產物是膠原受體,參與膠原誘發的血小板黏附與活化。其功能與血小板促凝活性相關,並進一步涉及 thrombin 與 fibrin 的形成。來源指出,這種促凝作用可能有助於動脈及靜脈血栓形成,但並未將此描述為必然結果。

GP6 相關訊號傳遞涉及 FcR gamma-chain,並由 Src 激酶家族成員傳遞訊號;具體成員可能是 FYN 或 LYN。下游還包括 SYK 與接頭蛋白 LAT,最後促成 PLCG2 活化。來源對 Src 激酶的指認保留「可能」的不確定性,因此不宜將 FYN 或 LYN 視為唯一確定的參與者。

這些作用將膠原刺激與血小板活化及促凝反應連結起來。血小板促凝活性與 thrombin、fibrin 形成的關係,提供了 GP6 可能參與血栓形成的功能脈絡;然而來源僅指出其可能促進動脈與靜脈血栓形成,並未提供足以將該功能直接等同於疾病因果的結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 55038264 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GP6 ENST00000417454 GRCh38 chr19:55038164-55039264 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCACTGTGCCTGGCTGATTTTTATTCTTTTAGTTAAGGCTGGTTGATATTACCTTGTGTGTATATACCAC
ATGTTGTTTATCCATTGTTGTTGATGGACATGTGGGTGGTTTCACCTTTTGGCTATTGTGAATAAAGCTG
CTATGAACACTGTGTACAAATATGTTAGAGACCCTGTTTTCAGTTCTTTTAGGTGTGTACCCCGAAGTGG
AATTGCTGGATTTTATGGCAATCCCACGTTTAACTTCTGGAGGAGCTGCTGGAACTGTTTTCCACAGCAG
GGGCGCCATGTTACGTCCCTGCCAGCAATGCACGCGCAGTTCAATTTCTCTGCATACTCACCAATATCTG
CTGTTTTCCATTAAAAAAAATTATAGCCGGTCGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG
GAGACCGAGGCAGGTGGATCAACTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACACAGTGAAACCCCA
TCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCTGGTGTGGTACATACCTATAATCCCAGCCACTTGGGAGGCTGA
GGCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGGAGGTGGAGGTTGTAGTGGGCCGAGATGGCGCCACTGCACTCCAAC
CTGGGCAAAAAGAACGAGACTTTGTCTCAAAAGAAAAAAAAAAAATACAGCCATTCCAGAAGGTGTGAAG
TCATATCTCACTGTGGTTTTGATGCGTATTTTCCTAGTGACATCAGGGAGTTTATGGGAGCACGGGAACA
CAGACCAGGCCCCAGCAGGCGGACAAACGGTGCAACGCCAGGCTGGCCAGAGGAGATAAGCGCGGCTCCT
TGGAGCTTGTGTGCAAGTCACTGTACTGAGGAGCCGGCTACGGCTCGATGAGTCTCAATTAGGAAAGGCC
GGGGCTGGTGGAGGAAGGGAGGAGAGCATTCTTCATCCTCATCACATCCTGAGCCTGTGCCCCAGGCTCC
CACCACTTCCCTCCCTGGCCACAGAGCTCAGGACAGGGCTGAGGAACCATGTCTCCATCCCCGACCGCCC
TCTTCTGTCTTGGTGAGTCCTGAGGGTCAGATCTGGGAAATGCTGAAGGAC
GP6 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GP6_1 ↗19:55,038,264負股55,038,254–55,038,313

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BDWX8 · enhancer · 55041527–55042402 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:339 aa

1 aa339 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9HCN6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Platelet glycoprotein VI 長 339 個胺基酸。其 N 端訊號區為第 1–20 位,細胞外區域為第 21–267 位,包含兩個 Ig-like C2-type 結構域(第 26–104 位及第 114–196 位)。第 268–288 位是螺旋型跨膜區段;第 289–339 位位於細胞質,其中第 299–339 位註記為無序區域。

訊號胜肽1–20 aa
拓樸區域Extracellular21–267 aa
跨膜區Helical268–288 aa
拓樸區域Cytoplasmic289–339 aa
結構域Ig-like C2-type 126–104 aa
結構域Ig-like C2-type 2114–196 aa
功能區域Disordered299–339 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5OU7…

PDB · 5OU7

X-ray · 1.90 A · A/B/C/D=21-206

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

Isoform 1 與 Isoform 2 均註記為細胞膜上的單次穿膜蛋白。 現有資料未指出兩種異構型在定位上的差異,也未提供定位隨條件改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GPVIGP6FYNLYN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
  • FYNP06241 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
  • LYNP07948 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GP6 與 Fc receptor gamma chain 相關,GP6:FcRgamma 複合體亦與 Src 激酶 FYN、LYN 相關;此外,GP6 與 TRAF4 互作。依相似性資料,GP6 與 COL1A1 互作,但未與 COL4A4 互作。微生物感染情境下,GP6 也與 Staphylococcus aureus 蛋白 SSL5 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Platelet-type bleeding disorder 11(BDPLT11)為輕度至中度出血性疾病,特徵是血小板對膠原的活化與聚集有缺陷。資料指出,影響 GP6 的變異可造成此疾病;此關聯描述的是特定變異與疾病,不應延伸為所有 GP6 變異皆有相同後果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GP6 是膠原受體,參與膠原誘發的血小板黏附與活化,也與血小板促凝活性及後續 thrombin、fibrin 形成相關。此促凝作用可能有助於動脈與靜脈血栓形成;訊號傳遞涉及 FcR gamma-chain、可能為 FYN 或 LYN 的 Src 激酶、SYK、LAT,並促成 PLCG2 活化。含實驗來源
證據與來源

Collagen receptor involved in collagen-induced platelet adhesion and activation. Plays a key role in platelet procoagulant activity and subsequent thrombin and fibrin formation. This procoagulant function may contribute to arterial and venous thrombus formation. The signaling pathway involves the FcR gamma-chain, the Src kinases (likely FYN or LYN) and SYK, the adapter protein LAT and leads to the activation of PLCG2

PMID 10961879 ↗ · PMID 18955485 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用GP6 與 Fc receptor gamma chain 相關,GP6:FcRgamma 複合體也與 Src 激酶家族成員 FYN 和 LYN 相關。GP6 另與 TRAF4 互作;依相似性資料,它與 COL1A1 互作,但不與 COL4A4 互作。含實驗來源
證據與來源

Associated with Fc receptor gamma chain. The GPVI:FcRgamma complex is associated with the Src kinase family FYN and LYN. Interacts with TRAF4. Interacts with COL1A1, but not with COL4A4 (By similarity)

PMID 10961879 ↗ · PMID 9295288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,GP6 與 Staphylococcus aureus 蛋白 SSL5 互作。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Staphylococcus aureus protein SSL5

PMID 21552524 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 1 定位於細胞膜,屬於單次穿膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Isoform 1; Cell membrane / Single-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform 2 定位於細胞膜,屬於單次穿膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Isoform 2; Cell membrane / Single-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Platelet-type bleeding disorder 11(BDPLT11)是輕度至中度出血性疾病,患者血小板對膠原的活化與聚集有缺陷。來源指出,影響 GP6 的變異可造成此病。含實驗來源
證據與來源

Bleeding disorder, platelet-type, 11 BDPLT11 A mild to moderate bleeding disorder caused by defective platelet activation and aggregation in response to collagen. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614201

PMID 19549989 ↗ · PMID 19552682 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000417454 · 2,264 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAGAGCTCAGGACAGGGCTGAGGAACCATGTCTCCATCC40
41CCGACCGCCCTCTTCTGTCTTGGGCTGTGTCTGGGGCGTG80
81TGCCAGCGCAGAGTGGACCGCTCCCCAAGCCCTCCCTCCA120
121GGCTCTGCCCAGCTCCCTGGTGCCCCTGGAGAAGCCAGTG160
161ACCCTCCGGTGCCAGGGACCTCCGGGCGTGGACCTGTACC200
201GCCTGGAGAAGCTGAGTTCCAGCAGGTACCAGGATCAGGC240
241AGTCCTCTTCATCCCGGCCATGAAGAGAAGTCTGGCTGGA280
281CGCTACCGCTGCTCCTACCAGAACGGAAGCCTCTGGTCCC320
321TGCCCAGCGACCAGCTGGAGCTCGTTGCCACGGGAGTTTT360
361TGCCAAACCCTCGCTCTCAGCCCAGCCCGGCCCGGCGGTG400
401TCGTCAGGAGGGGACGTAACCCTACAGTGTCAGACTCGGT440
441ATGGCTTTGACCAATTTGCTCTGTACAAGGAAGGGGACCC480
481TGCGCCCTACAAGAATCCCGAGAGATGGTACAGGGCTAGT520
521TTTCCCATCATCACGGTGACCGCCGCCCACAGCGGAACCT560
561ACCGATGCTACAGCTTCTCCAGCAGGGACCCATACCTGTG600
601GTCAGCCCCCAGCGACCCCCTGGAGCTTGTGGTCACAGGA640
641ACCTCTGTGACCCCCAGCCGGTTACCAACAGAACCACCTT680
681CCCCGGTAGCAGAATTCTCAGAAGCCACCGCTGAACTGAC720
721CGTCTCATTCACAAACGAAGTCTTCACAACTGAGACTTCT760
761AGGAGTATCACCGCCAGTCCAAAGGAGTCAGACTCTCCAG800
801CTGGTCCTGCCCGCCAGTACTACACCAAGGGCAACCTGGT840
841CCGGATATGCCTCGGGGCTGTGATCCTAATAATCCTGGCG880
881GGGTTTCTGGCAGAGGACTGGCACAGCCGGAGGAAGCGCC920
921TGCGGCACAGGGGCAGGGCTGTGCAGAGGCCGCTTCCGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。