演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GOLGA6AGLP

golgin A6 family member A

GOLGA6A 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens15q24.1UniProt Q9NYA3
OFFICIAL SYMBOL
GOLGA6A
CHROMOSOME
15
UNIPROT
Q9NYA3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GOLGA6A 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 golgin A6 family member A。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 15q24.1。

Official symbol
GOLGA6A
Gene name
golgin A6 family member A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13567
UniProt
Q9NYA3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
GLPGOLGA6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q24.1
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegGOLGA6Apq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr15:74,069,857–74,082,550
Gene span
12,694 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290438 ★74,069,857–74,082,55018

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 74082550 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GOLGA6A ENST00000290438 GRCh38 chr15:74082450-74083550 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTAAAGAGCTTTGAGTGCTTATTAAATGGAAAGCTTTGTGTTTTTATTTATTTTTGACTATTTTATTTT
ATTTTTTTGAGATGGAGTCTCAGTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGACCTTGGCTCACTGCA
ACTTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACGGGTACCCA
CCACCACACCTGGCTAGTTTTTGTATTTCGAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTT
GAACTCCTGACCTAAGGTGATCCACCCACCTAGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACC
ACACCCGGCCCAAAAGCTTTGTGTTTTTAAAGATATTAGACATGTTTCTTGTTTTTTAAAAAATCTTAAT
AATGTAGGAGAATAAGAGAAATGTTTTTTCCAAAGCCGAGAAATCATTGTGATTATTTTACCTTATTGGG
ATGTTGGATAATATAGTCCACTTCATTCATTAATCATCAAACATGCTATGGATTTTCCATTTTTATAGGA
TTTGTGTCTTAACTGGGGTAATACTGGTAATTCTTATACTCCCTCTGAAGATGAAAAATGTAGGCCAAAA
TCATAGACCATGCATAGAAGCTGGATAATGAAGACAGCTCTGGAGGAACATGTAGACACACACACACTGA
CACACATATATATAAAGTATAAATACATATTTTTTTAAAGTTTATTTTTAACATTTTAAAGCAAAAACCA
GCCCTCCCCTCTCCCGGAGTAGGCAGGCCCCGCCCCTCTCCCCAAGTGGGCAGGGACAGCAGTCGCATGG
GCAGCTTTCCTTGTGATGTCACAGGTTCCTCTGGGCACACTGCTGCCTGGCCACGCCTCCTTTCCCTTTC
ATCTTTCTCATTGACCAATGGGATTGGAGCATTAAGGCCACACCCCTATTCTGCATTCTAGTGTGGCCCT
GGTTACGCCTCCTCTGGCTCAGTCACACAGCAGCCTTGTAGGTGACTGGAGGTGTTCGCTGATGTGGCCC
CAACCCTACCTCCCTCCCCACCCCATGATGTTAGAAGAATCTCGACAGAAT
GOLGA6A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GOLGA6A_1 ↗15:74,082,550負股74,082,540–74,082,599

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_934DWG · enhancer · 74080815–74081140 · regulatory

ENSR15_934DWZ · promoter · 74082540–74082841 · regulatory

ENSR15_BJNZJ · enhancer · 74086295–74086928 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:693 aa

1 aa693 aa功能區域
依 Q9NYA3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GOLGA6A 的蛋白質長 693 個胺基酸,屬於 GOLGA6 family。序列註解指出,胺基酸 20–69、497–547 與 661–693 為無序區域;這些區域依據 MobiDB-lite 註解。

功能區域Disordered20–69 aa
功能區域Disordered497–547 aa
功能區域Disordered661–693 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NYA3…

AlphaFold · Q9NYA3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 44 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GLPGOLGA6AAIRIMARHGAP9BAG5CBY2CDC7DEF6DUSP29ELOAENKD1FAM161BFHL2GADD45GIP1HOXB5IKZF3KANK2KCTD9KDM1AKIF9KLHL38MAPK9MGC50722MKRN3MORF4L1MOSMRPL38MYOZ1MYOZ3NEBLPOLR1CPPP2R1APRKAA2PSMA1SPATC1LSYT17TRAF4TRAPPC6ATSGA10IPTTC5TXLNAUSP15USP2UTP14CYJU2ZC2HC1C
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 44 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290438 · 3,176 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCACACAGCAGCCTTGTAGGTGACTGGAGGTGTTCGCT40
41GATGTGGCCCCAACCCTACCTCCCTCCCCACCCCATGATG80
81TTAGAAGAATCTCGACAGAATAAATTGGCAGCAGCCAAGA120
121AAAAGCTAAAAGAATATCAGCAAAGGAAGAGCCCTGGTAT160
161TCCAGCAGGAGCAAAGACAAAAAAGAAAAAAACTGACAGT200
201AGCCCTGAGACAACCACTTCCGGTGGTTGCCACTCACCTG240
241GGGATAGCCAGTACCAAGAACTAGCAGTAGCCCTGGAGTC280
281AAGCTCAGTGACAATCAGTCAACTCAATGAAAACATAGAA320
321TCATTGAAACAGCAGAAGAAACAAGTGGAACATCAGCTGG360
361AAGAAGCAAAGAAAACAAACAATGAAATACACAAAGCACA400
401AATGGAGCGGTTAGAGACAATCAACATCCTCACATTGGAA440
441AAGGCAGACTTGAAGACCACCCTTTACCATACTAAACGTG480
481CTGCCCGACACTTCGAAGAAGAGTCCAAGGATCTGGCTGG520
521CCGCCTGCAATACTCCTTACAGCGTATTCAAGAATTGGAG560
561CGGGCTCTCTGTGCTGTGTCTACACAGCAGCAGGAAGAGG600
601ACAGGTCCTCGAGCTGCAGAGAAGCGGTCCTCCAGCGGTG640
641GTTACAGCAGACCATAAAGGAGCGGGCGCTGCTGAACGCA680
681CACGTGACACAGGTGACAGAGTCACTAAAACAAGTCCAGC720
721TAGAGCGAGACGAATATGCTAAACACATAAAAGGAGAGAG760
761GGCCCGGTGGCAGGAGAGGATGTGGAAAATGTCGGTGGAG800
801GCTCGAACATTGAAGGAAGAGAAGAAGCGTGACATACATC840
841GGATACAGGAGCTGGAGAGGAGCTTGTCCGAACTCAAAAA880
881CCAGATGGCTGAGCCCCCATCCCTGGCGCCCCCAGCAGTG920
921ACCTCTGTGGTGGAACAGCTACAAGATGAGGCCAAACACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。