演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GNG13h2-35

G protein subunit gamma 13

GNG13 編碼 G protein subunit gamma 13,屬於 G protein gamma family,是 G protein 三個組成單元之一。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9P2W3
OFFICIAL SYMBOL
GNG13
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9P2W3
PDB / ALPHAFOLD
25ST
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GNG13 是一個蛋白質編碼基因,產物為 G protein subunit gamma 13,屬於 G protein gamma family。G protein 由 alpha、beta 與 gamma 三個單元組成;其中 beta 與 gamma 鏈共同參與 G protein 的若干基本活動。G proteins 可在不同的跨膜訊號系統中擔任調節者或訊號轉導者。這些來源資訊呈現 GNG13 蛋白所屬的家族及其在 G protein 組成中的位置;未提供其序列長度或更細部的結構特色。

Official symbol
GNG13
Gene name
G protein subunit gamma 13
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14131
UniProt
Q9P2W3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
h2-35G(gamma)13

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegGNG13pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr16:798,020–800,770
Gene span
2,751 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000248150 ★798,041–800,7343
ENST00000851007798,020–800,5133
ENST00000851008798,020–800,7703
ENST00001139135798,020–800,7703

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GNG13 的產物屬於 G protein gamma family。G proteins 可在多種跨膜訊號系統中作為調節者或訊號轉導者,協助傳遞或調節跨膜訊號。來源描述的是 G proteins 的整體作用,並未指出 GNG13 專屬的訊號系統或特定生理情境。

在 G protein 中,beta 與 gamma 鏈共同參與多項分子活動:它們是 GTPase 活性所需的組成部分,也參與 GDP 被 GTP 取代,以及 G protein 與效應分子的交互作用。這些敘述說明 beta、gamma 鏈在核苷酸轉換與效應分子作用中的必要性;來源沒有進一步交代各鏈的個別貢獻或具體反應步驟,因此不宜將整體描述解讀為 GNG13 單獨完成這些活動。

由此可知,GNG13 所屬的 gamma 鏈是 G protein 組成的一部分,而該蛋白複合體參與跨膜訊號調節與轉導。現有資訊支持其家族歸屬及 gamma 鏈在 G protein 相關活動中的一般角色,但不足以指定 GNG13 參與哪些效應途徑,或描述其在特定細胞過程中的功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 800734 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GNG13 ENST00000248150 GRCh38 chr16:800634-801734 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGTGACCTGCTCACAGGCCCCTGGCCCTGCCAGCACCCACCGAGGGCCTGGCCCACGCTTCCCCGGGGGT
GGCCCAGCTTCTGCAGGGACTGTTTGGGGAGCTTGGCCCTGTGCCCCCAGAGGCTGCTGTTGCTGCCTGG
GCGCCCCCACCTAGGATGCAGCCTGGTATGTACGTCACCTGCTGGTACATAGGGCACAGCTCCCACAGGA
GCCCAAGGGGTACACCCAAGGGCAGGGTGGGAGGAGACACGGGGAAACGTGTCAGAGGAAAAGGGGCCAG
TCTCAGCTCTGCAGGCTGACAGGTGCGGAGCCCCAAAGGGAAGCCCTCTCCCCAGAGCCTTGAGGTCACA
CAACCCGAGCCCAAGTGCTGCAGCTGGGGGCACCTCTCCCGAGGCAGCGTGCCCCAGAGCACCCACAGTG
GACCGGTGTTGGGGACGCCTCAGGCCGCCACTCTCAGCTCAGATCAGACTGAAAAGCACGGCACTCTCCT
GCCCTCGGGAGCTGCCCCGTGCCGGCCACTGGTCTGGGAACAGGGGATCGGGCTGGAGCAGGGAGCTCCA
CAGAGCCCCGGGGCCCCTAGCAGTAAGAGGCTCACATCCCAGGGTGAGCCACATGGCCCACACAGGATGC
CTCTGTCAGGGGGGCACAGCTGAGTGTCACCTGAACCCTGCAGGCTGCAGAGGCTTCAGAGGGCAAAGGG
TCCCAGCCCCATCCCCACTCCTCCCGGCTGGCCCAGGACACTGGAGGGGGAACCCACCCCCTCAAGTGGA
AGGAGACCTCTCCACCAGGGCCCAAGCTGGCCCCTCAGGGAAAATGGACCAGCCCCACACTGGCCCCTGG
CTGCATGTCCATCCGCTGGGTGAGCCCAGGGGAGGGGGCAGCACAGGCTATCTCTGGGGTCAGCCCAGCC
CTGAGGAGGGTGTGGGGGCGGCGCCAGGGCCCAGGTGGCGGGAGGGGCGGGGCACAGCCAGGGCTCTGCC
TGGCGGACTCCCGGAACATCACTTGGCCCTCGCTCTCACTCGCGGTCGCCTGGCCGTTGTCATTGTCCCT
CCGCTGTCACCTTTTCAAGGTAGGTCCGATGAACAGGCGCCCGGGGCTAGG
GNG13 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GNG13_1 ↗16:800,734負股800,724–800,783

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_573G8 · CTCF_binding_site · 795785–795806 · regulatory

ENSR16_C45T · enhancer · 798958–800723 · regulatory

ENSR16_9BKQ · promoter · 800724–801224 · regulatory

ENSR16_C463 · enhancer · 802198–803309 · regulatory

ENSR16_B6BF · enhancer · 804198–805046 · regulatory

· motif · 795787–795803 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:67 aa

GNG13 的產物屬於 G protein gamma family。來源未提供其蛋白質序列、長度、結構域或其他功能區域的註解,因此無法進一步描述其蛋白質結構特徵。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 25ST…

PDB · 25ST

EM · 3.00 A · G=1-67

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

GNG13 蛋白位於細胞膜,並以脂質錨定方式定位於細胞膜的細胞質側。 來源未說明定位是否會隨條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 29 個夥伴 · 最多顯示 50 個
h2-35GNG13ABI3ADAMTSL4BEX5CCHCR1CTAG1BCYSRT1DISC1EMILIN1FTOGLRX3HAUS3HOXA10KRT27KRT34KRT37KRT38KRTAP9-2MEOX2PAX5PLSCR2RASSF10RPRMRSPO4TEAD2TEPSINTRIM54UQCC2VPS16WASHC3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 29 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

G protein 由 alpha、beta 與 gamma 三個單元組成,GNG13 所屬的 gamma 單元因而位於此組成架構中。來源僅說明 G protein 的組成,未提供 GNG13 與特定蛋白質直接結合或形成特定複合體的證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能G proteins 在多種跨膜訊號系統中可作為調節者或訊號轉導者。beta 與 gamma 鏈是 GTPase 活性、GDP 被 GTP 取代,以及 G protein 與效應分子交互作用所需的組成部分;這段描述未指定 GNG13 專屬的途徑。資料庫紀錄
證據與來源

Guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) are involved as a modulator or transducer in various transmembrane signaling systems. The beta and gamma chains are required for the GTPase activity, for replacement of GDP by GTP, and for G protein-effector interaction

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用G proteins 由 alpha、beta 與 gamma 三個單元組成;此敘述說明其組成架構,未指出 GNG13 與特定蛋白質的直接結合關係。資料庫紀錄
證據與來源

G proteins are composed of 3 units, alpha, beta and gamma

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GNG13 蛋白定位於細胞膜,並以脂質錨定方式位於細胞膜的細胞質側;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Lipid-anchor / Cytoplasmic side

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000248150 · 985 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTTGGCCCTCGCTCTCACTCGCGGTCGCCTGGCCGTTGT40
41CATTGTCCCTCCGCTGTCACCTTTTCAAGCCCCAGGCTGG80
81CTGCTTCAGAAGCCCCTGACCCCATGGAGGAGTGGGACGT120
121GCCACAGATGAAGAAAGAGGTGGAGAGCCTCAAGTACCAG160
161CTGGCCTTCCAGCGGGAGATGGCGTCCAAGACCATCCCCG200
201AGCTGCTGAAGTGGATCGAGGACGGGATCCCCAAGGACCC240
241CTTCCTGAACCCCGACCTGATGAAGAACAACCCATGGGTG280
281GAAAAGGGCAAATGCACCATCCTGTGAGCCCCGCACCCGG320
321CCCCTCTCACACCATCCTGTGAGACCACGCCCGGCCCCAC360
361TCCCACCATCTTGTAAGACTGTGCCCAGCCCCACTCACTC400
401CATCCTGTGAGTCCCACTCCCAGCCCCACTCCCACCATCC440
441TGTGAGCCCATGCCCGGCCCCACTCACACCAACCTGTGAG480
481CCCCACTCCCGGCCCCACTCACTCCATCTTGTAAGACTAT520
521GCCCAGCCCCATTCACTCCATCCTGTGAGTCCCACTCCCA560
561GCCCCACTCCCACCATCCTGTGAGCCCCACTTCCAGCCCC600
601ACTCCCACCATCCTGTGAGCCCCACTCCCAGCCCCACTCC640
641CACCATCCTGTGAGCCCCACTCCCGGCCCCACTCACTCCA680
681TCCTGTGAGCCCCACTCCCAGCCCCACTCACACCAACCTG720
721TGAGCCCCACTCCCGGCCCCACTCACAACATCTTGTAAGA760
761CTGTGCCCGGCCCCATTCACTCCATCCTGTGAGACCACGC800
801CCGGCCCCACTCACTCTATCCTGTGAGACCACGCCTGGCC840
841CCACTCCCACCATCCTGTGAGCCCCACTCCTGGCCCCACT880
881CACACCATCCTATGAGCCCACGCCCGGCCCCACTCCCACC920
921ATCCTGTGAACCCCACTCCACTCGCACGTGATTACAGTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。