基因總覽
GLYAT 是蛋白質編碼基因,其產物 glycine-N-acyltransferase 屬於 glycine N-acyltransferase 家族,定位於粒線體。這種酰基轉移酶可作用於多種底物,形成不同的 N-acylglycines;來源指出其對 glycine 的作用較有效,對 glutamine 的作用效率低得多。這些基本特性界定了此蛋白質的家族歸屬、所在位置與底物範圍。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344743 ★ | 58,708,757–58,731,943 | 6 |
| ENST00000586098 | 58,640,426–58,712,849 | 3 |
| ENST00000529732 | 58,708,052–58,728,729 | 6 |
| ENST00001142505 | 58,708,052–58,732,010 | 6 |
| ENST00000611865 | 58,708,758–58,724,496 | 5 |
| ENST00000278400 | 58,710,083–58,732,010 | 5 |
| ENST00001109175 | 58,713,021–58,732,010 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
glycine-N-acyltransferase 的主要作用是把酰基轉移至 glycine 的 N 端,形成 N-acylglycine。反應以酰基輔酶 A(acyl-CoA)為酰基供體,產生 N-acylglycine、CoA 與 H⁺。其中,benzoyl-CoA 可與 glycine 反應生成 N-benzoylglycine、CoA 與 H⁺。蛋白質也能將酰基轉移至 glutamine 的 N 端,但效率遠低於作用於 glycine。
此酶可利用多種底物,生成多種 N-acylglycines;在酰基供體方面,來源描述其偏好 benzoyl-CoA,而非 phenylacetyl-CoA。這項底物偏好與其能處理多種底物的特性,共同說明其催化反應並非只限於單一酰基來源。
這些結合反應可協助處理外源性化合物與內源性有機酸。來源列舉 benzoic acid、salicylic acid 等外源性化合物,以及 isovaleric acid 等內源性有機酸,指出 glycine-N-acyltransferase 可藉由形成相應的 N-acylglycines 促進其解毒。來源並未提供其他生理作用或反應條件的細節。
Promoter 與基因調控
>GLYAT ENST00000344743 GRCh38 chr11:58731843-58732943 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAAGAGTAATGGAAGGTTATAATGACTTCAATCTCAGGGGAAAAGATGGAGAATTAATGTTCTAGGAGTG GCAGGGCTCCTAGACAGTACAGAGAAAAATATGTGAAAACTTGCTCTGTGCTGATCCATTAAGTGAAGGA ACACACACACACTTTTTGTCCCTCTTTCTCAACCTAGCCTCTTGTGTCCCTGCTCCTCTGATTAGAGTGT CTGTTGCTTCCTCTACAATAAAGATATTTACTAACCTGGGAATGAGGTGGTGAGAACAAGGACCTGGAGA GTGTCAAACTCCCCATCTTGGCTGTTTTACACAGTGAAATTGAGGCTCAAATTATCTTTGCTGTGAACCC TCCTTTCTTTTCTGAGCAAGTGGAAAGTATAGTAATTAGGACTTCGGAGTGAAAAAGCTCTGGGCTTAAC ATCTAACCAGTTCAACCATGCTGAGATCTCAATGGTCCTTCTCTATAAAAGTGAGACTAAGAAGTGCTCA CATTGAATCATTGTCAGAATGTTTCACTGCAGCTTCAAAATGGGCATGGGAGGGGGCACAACTTGTCTTT AAAAAGGAAGATTCTAACAGCTTTCATCACTCCATGCAAGTAATTTGCTATTTTATTGCATTCTGCAAAT CAGATATCATTCATATCTTTCCCACTGCCTTGCTTCTATTACAGATACTTGAATGGGAAAGAGGTGAGGG TAGTGCCTACATAATCTGACCCTCCTTCCAGTATCTGGCCTGTTGGTTTCACACAGCTTTGGTTTTCATG GTATTTCCATGACCTGTGAGGACAAAAAGCATTGTGATGTTTTAAAAAGAGAAGCTCAGGGGCATACAGC CAGCCTCTCAACCATGCAGAGCCAATTACTTCAACATGGGCCCGTGAGAGGCAGGGCTGAATTCCACTAG AACTGACACCAGATTCTTTTGCCAGCCTAGTACAAGGTCCACATTACAAGCCAAAGCTCAGAAATTTCTG GAGGTGGTGTATCAAAATTTACTCTGCGAGACTCTGCTGAACTGGCTGCATCAGGGAGAAATTTCATCTC CCAGAAGGGTGTTGCTCATCGTTTCTTCCCGGAAACATCTGCAGAGACTAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GLYAT_1 ↗ | 11:58,731,943 | 負股 | 58,731,933–58,731,992 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:296 aa
glycine-N-acyltransferase 屬於 glycine N-acyltransferase 家族。提供的來源未列出其結構域、功能區域或序列特徵。
蛋白質三維結構
細胞內定位
glycine-N-acyltransferase 定位於粒線體。 來源未提供其定位改變條件或異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLCP0DPK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | glycine-N-acyltransferase 是粒線體酰基轉移酶,主要將酰基接至 glycine 的 N 端;對 glutamine 也有作用,但效率低得多。它能利用多種底物形成不同的 N-acylglycines,且偏好 benzoyl-CoA 而非 phenylacetyl-CoA 作為酰基供體。此反應可協助解毒 benzoic acid、salicylic acid 等外源性化合物,以及 isovaleric acid 等內源性有機酸。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial acyltransferase which transfers an acyl group to the N-terminus of glycine and glutamine, although much less efficiently. Can conjugate numerous substrates to form a variety of N-acylglycines, with a preference for benzoyl-CoA over phenylacetyl-CoA as acyl donors. Thereby detoxify xenobiotics, such as benzoic acid or salicylic acid, and endogenous organic acids, such as isovaleric acid PMID 22475485 ↗ · PMID 7802672 ↗ |
| 分子活性 | an acyl-CoA + glycine = an N-acylglycine + CoA + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | benzoyl-CoA + glycine = N-benzoylglycine + CoA + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | glycine-N-acyltransferase 定位於粒線體;此項定位資料未進一步說明其他細胞位置、定位條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCTGCGAGACTCTGCTGAACTGGCTGCATCAGGGAGAA40ATTTCATCTCCCAGAAGGGTGTTGCTCATCGTTTCTTCCC80GGAAACATCTGCAGAGACTAGCTTTTCAGGCTAAGGTATC120CTCCATGATGTTACCATTGCAAGGTGCCCAGATGCTGCAG160ATGCTGGAGAAATCCTTGAGGAAGAGCCTCCCAGCATCCT200TAAAGGTTTATGGAACTGTCTTTCACATAAACCATGGAAA240TCCATTCAATCTGAAGGCTGTGGTGGACAAGTGGCCTGAT280TTTAATACAGTGGTTGTCTGCCCTCAGGAGCAGGATATGA320CAGATGACCTTGATCACTATACCAATACTTACCAAATCTA360CTCCAAAGATCCCCAAAACTGTCAGGAATTCCTTGGATCA400CCAGAACTCATCAACTGGAAACAGCATTTACAGATTCAAA440GTTCACAGCCTAGCCTGAATGAGGCTATACAAAATCTTGC480AGCCATTAAGTCCTTCAAAGTCAAACAAACACAACGCATT520CTCTATATGGCAGCTGAAACAGCCAAGGAACTGACTCCTT560TCCTGCTGAAATCAAAGATTTTATCTCCCAATGGTGGCAA600ACCCAAGGCCATCAACCAAGAGATGTTTAAACTCTCATCC640ATGGATGTTACCCATGCTCACTTGGTGAATAAATTCTGGC680ATTTTGGTGGTAATGAGAGGAGCCAGAGATTCATTGAGCG720CTGCATTCAGACCTTTCCCACCTGCTGTCTCCTGGGGCCT760GAGGGGACCCCTGTGTGCTGGGATCTAATGGACCAGACTG800GAGAGATGAGAATGGCAGGCACCTTGCCGGAATACCGGCT840CCATGGCCTTGTGACGTATGTCATCTATTCCCACGCCCAG880AAATTGGGCAAACTTGGGTTTCCTGTCTATTCTCATGTAG920ACTACAGCAATGAAGCTATGCAAAAAATGAGTTACACACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。