基因總覽
GLOD4 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 glyoxalase domain containing 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17p13.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000301329 ★ | 759,330–782,280 | 9 |
| ENST00000940416 | 759,320–782,341 | 9 |
| ENST00000940417 | 759,320–782,329 | 9 |
| ENST00001069880 | 759,320–782,341 | 9 |
| ENST00000891259 | 759,325–782,341 | 8 |
| ENST00000301328 | 759,330–782,341 | 10 |
| ENST00000940419 | 759,330–782,341 | 6 |
| ENST00001134878 | 759,330–782,341 | 9 |
| ENST00000940418 | 759,332–782,341 | 7 |
| ENST00000940420 | 759,333–782,341 | 9 |
| ENST00000956992 | 759,338–782,298 | 9 |
| ENST00000891260 | 759,444–782,341 | 10 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>GLOD4 ENST00000301329 GRCh38 chr17:782180-783280 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAATTTCACCTTAATGAGGCTGACACCTTTCAGCTTATCGACTGGCAACTCCTTTAGGTATTCTAGAC GGCTAAAGAAGAACATTTTTGGCACAGCTCCAGCCTTGAGAGCGTCTGAAATGAGCCTGCGACCTTCCAG CAGGATCTTCCCTTGTTTTTCCCGAAATGGCCTGGACTTTACTATTGTCATTACACTGCTGTAGATGGAA ATAAAAAAAAAAAACAGGTAACTATCAACATCCTTGTTACTGAGACACGCTTAGTTGTAACAGAAATAAA GAGCTACGGAGAGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCGAGGCGGGC GGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGATCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACAAAAACAACAACAAAGAGC TAAGGAGAAACAGAAGCTAATTCCAAAGACGCTTATTCGGCCCTCTGTGCATAATACAAAAACCAGCGGG CTGTACTGGAAGAAGTCCTCCATCGGAAGGAGGTTAAGGTTCCGCTGTGCGACGGGAAGGGAAACGAGAA CATTCGACAGGCTCAAGAACCACATCACCTCAGCCTCCTGTCCCCGGGATAAGCTTTATCGTAGCGAAGC CCAGACTCTTCCCAGGTGCTGGGAGCGCGGGATGCGGACTCCTCGAGCGGTTGTTTCTCTCGTTGCTCCT GGGCACTGGCCTCAGATGGTGCCTTGCGGGGCTGCTTCCCAGGAGCGCGCTTCTGTTCCACCACCTCTCC GGAAGGAAACACCACTTTCACTGGGCTCCGCCGCAGCGCCCGGACCCAGCGCCTCGCGTCAAGGTCCCAA GCCTGGACCACCTGCAGCAACGGTCGCACGACAAACCTCGCGGGTCTCACCAGCGCCGCCATGTTCCCTG AGACCCGGGCTGCGTCACGAAAGCGCGCCGTCGGCGGCTAGTGACGTCACGGCCCGTGGCGCCCTTCGTG GACTGGGCTGTACGGTGCGCGTGACGGCTGCGTGCGGCGGGAATCATGGCTGCTCGCAGAGCTCTGCACT TCGTATTCAAAGTGGGAAACCGCTTCCAGACGGCGCGTTTCTATCGGGACG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GLOD4_1 ↗ | 17:782,280 | 負股 | 782,270–782,329 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_B674 · enhancer · 781385–782244 · regulatory
ENSR17_738JF · promoter · 782245–782363 · regulatory
· motif · 781279–781287 · motif
· motif · 781810–781825 · motif
· motif · 782267–782283 · motif
· motif · 782319–782332 · motif
· motif · 782319–782332 · motif
· motif · 782377–782387 · motif
· motif · 782425–782434 · motif
· motif · 782718–782738 · motif
· motif · 783114–783125 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:313 aa
GLOD4 蛋白質長 313 個胺基酸,屬於 glyoxalase I family。其序列含有兩個 VOC 結構域:VOC 1 位於第 5–145 個胺基酸,VOC 2 位於第 152–273 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GLOD4 的細胞內定位記錄為粒線體;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
GLOD4 與 NUDT9 有互作記錄;來源未進一步說明這是否為直接結合、是否涉及複合體,或其功能後果。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | GLOD4 與 NUDT9 有互作關係;資料未進一步說明此關係是否為直接結合、是否涉及複合體,或具有何種功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | GLOD4 的細胞內定位記錄為粒線體;此項資料未提供特定細胞條件、異構型差異或定位變化等資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTGACGGCTGCGTGCGGCGGGAATCATGGCTGCTCGCAGA40GCTCTGCACTTCGTATTCAAAGTGGGAAACCGCTTCCAGA80CGGCGCGTTTCTATCGGGACGTCCTGGGGATGAAGGTTCT120GCGGCATGAGGAATTTGAAGAAGGCTGCAAAGCTGCCTGT160AATGGGCCTTATGATGGGAAATGGAGTAAAACAATGGTGG200GATTTGGGCCTGAGGATGATCATTTTGTCGCAGAACTGAC240TTACAATTATGGCGTCGGAGACTACAAGCTTGGCAATGAC280TTTATGGGAATCACGCTCGCTTCTAGCCAGGCTGTCAGCA320ACGCCAGGAAGCTGGAGTGGCCACTGACGGAAGTTGCAGA360AGGTGTTTTTGAAACCGAGGCCCCGGGAGGATATAAGTTC400TATTTGCAGAATCGCAGTCTGCCTCAGTCAGATCCTGTAT440TAAAAGTAACTCTAGCAGTGTCTGATCTTCAAAAGTCCTT480GAACTACTGGTGTAATCTACTGGGAATGAAAATTTATGAA520AAAGATGAAGAAAAGCAAAGGGCTTTGCTGGGCTATGCTG560ATAACCAGTGTAAGCTGGAGCTACAGGGCGTCAAGGGTGG600GGTGGACCATGCAGCAGCTTTTGGAAGAATTGCCTTCTCT640TGCCCCCAGAAAGAGTTGCCAGACTTAGAAGACTTGATGA680AAAGGGAGAACCAGAAGATTCTGACTCCCCTGGTGAGCCT720GGACACCCCAGGGAAAGCAACAGTACAGGTGGTCATTCTG760GCCGACCCTGACGGACATGAAATTTGCTTTGTCGGGGATG800AAGCATTTCGAGAACTTTCTAAGATGGATCCAGAGGGAAG840CAAATTGTTGGATGATGCAATGGCAGCAGATAAAAGTGAC880GAGTGGTTTGCCAAACACAATAAACCCAAAGCTTCAGGTT920AACGGAAGACATGATGCAGAGCAAGCCTCTGTGATTCCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。