演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GLOD4CGI-150

glyoxalase domain containing 4

GLOD4 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens17p13.3UniProt Q9HC38
OFFICIAL SYMBOL
GLOD4
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9HC38
PDB / ALPHAFOLD
9CSJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GLOD4 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 glyoxalase domain containing 4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17p13.3。

Official symbol
GLOD4
Gene name
glyoxalase domain containing 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14111
UniProt
Q9HC38
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CGI-150HC71C17orf25

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.3
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegGLOD4pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:757,097–782,341
Gene span
25,245 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000301329 ★759,330–782,2809
ENST00000940416759,320–782,3419
ENST00000940417759,320–782,3299
ENST00001069880759,320–782,3419
ENST00000891259759,325–782,3418
ENST00000301328759,330–782,34110
ENST00000940419759,330–782,3416
ENST00001134878759,330–782,3419
ENST00000940418759,332–782,3417
ENST00000940420759,333–782,3419
ENST00000956992759,338–782,2989
ENST00000891260759,444–782,34110

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 782280 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GLOD4 ENST00000301329 GRCh38 chr17:782180-783280 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAAATTTCACCTTAATGAGGCTGACACCTTTCAGCTTATCGACTGGCAACTCCTTTAGGTATTCTAGAC
GGCTAAAGAAGAACATTTTTGGCACAGCTCCAGCCTTGAGAGCGTCTGAAATGAGCCTGCGACCTTCCAG
CAGGATCTTCCCTTGTTTTTCCCGAAATGGCCTGGACTTTACTATTGTCATTACACTGCTGTAGATGGAA
ATAAAAAAAAAAAACAGGTAACTATCAACATCCTTGTTACTGAGACACGCTTAGTTGTAACAGAAATAAA
GAGCTACGGAGAGGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACATTGGGAGGCCGAGGCGGGC
GGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCCAGATCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACAAAAACAACAACAAAGAGC
TAAGGAGAAACAGAAGCTAATTCCAAAGACGCTTATTCGGCCCTCTGTGCATAATACAAAAACCAGCGGG
CTGTACTGGAAGAAGTCCTCCATCGGAAGGAGGTTAAGGTTCCGCTGTGCGACGGGAAGGGAAACGAGAA
CATTCGACAGGCTCAAGAACCACATCACCTCAGCCTCCTGTCCCCGGGATAAGCTTTATCGTAGCGAAGC
CCAGACTCTTCCCAGGTGCTGGGAGCGCGGGATGCGGACTCCTCGAGCGGTTGTTTCTCTCGTTGCTCCT
GGGCACTGGCCTCAGATGGTGCCTTGCGGGGCTGCTTCCCAGGAGCGCGCTTCTGTTCCACCACCTCTCC
GGAAGGAAACACCACTTTCACTGGGCTCCGCCGCAGCGCCCGGACCCAGCGCCTCGCGTCAAGGTCCCAA
GCCTGGACCACCTGCAGCAACGGTCGCACGACAAACCTCGCGGGTCTCACCAGCGCCGCCATGTTCCCTG
AGACCCGGGCTGCGTCACGAAAGCGCGCCGTCGGCGGCTAGTGACGTCACGGCCCGTGGCGCCCTTCGTG
GACTGGGCTGTACGGTGCGCGTGACGGCTGCGTGCGGCGGGAATCATGGCTGCTCGCAGAGCTCTGCACT
TCGTATTCAAAGTGGGAAACCGCTTCCAGACGGCGCGTTTCTATCGGGACG
GLOD4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GLOD4_1 ↗17:782,280負股782,270–782,329

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B674 · enhancer · 781385–782244 · regulatory

ENSR17_738JF · promoter · 782245–782363 · regulatory

· motif · 781279–781287 · motif

· motif · 781810–781825 · motif

· motif · 782267–782283 · motif

· motif · 782319–782332 · motif

· motif · 782319–782332 · motif

· motif · 782377–782387 · motif

· motif · 782425–782434 · motif

· motif · 782718–782738 · motif

· motif · 783114–783125 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:313 aa

1 aa313 aa結構域
依 Q9HC38 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GLOD4 蛋白質長 313 個胺基酸,屬於 glyoxalase I family。其序列含有兩個 VOC 結構域:VOC 1 位於第 5–145 個胺基酸,VOC 2 位於第 152–273 個胺基酸。

結構域VOC 15–145 aa
結構域VOC 2152–273 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9CSJ…

PDB · 9CSJ

X-ray · 2.33 A · A/B/C=1-313

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

GLOD4 的細胞內定位記錄為粒線體;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CGI-150GLOD4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GLOD4 與 NUDT9 有互作記錄;來源未進一步說明這是否為直接結合、是否涉及複合體,或其功能後果。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用GLOD4 與 NUDT9 有互作關係;資料未進一步說明此關係是否為直接結合、是否涉及複合體,或具有何種功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with NUDT9

PMID 12897971 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GLOD4 的細胞內定位記錄為粒線體;此項資料未提供特定細胞條件、異構型差異或定位變化等資訊。推論支持
證據與來源

Mitochondrion

PMID 12897971 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000301329 · 1,765 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTGACGGCTGCGTGCGGCGGGAATCATGGCTGCTCGCAGA40
41GCTCTGCACTTCGTATTCAAAGTGGGAAACCGCTTCCAGA80
81CGGCGCGTTTCTATCGGGACGTCCTGGGGATGAAGGTTCT120
121GCGGCATGAGGAATTTGAAGAAGGCTGCAAAGCTGCCTGT160
161AATGGGCCTTATGATGGGAAATGGAGTAAAACAATGGTGG200
201GATTTGGGCCTGAGGATGATCATTTTGTCGCAGAACTGAC240
241TTACAATTATGGCGTCGGAGACTACAAGCTTGGCAATGAC280
281TTTATGGGAATCACGCTCGCTTCTAGCCAGGCTGTCAGCA320
321ACGCCAGGAAGCTGGAGTGGCCACTGACGGAAGTTGCAGA360
361AGGTGTTTTTGAAACCGAGGCCCCGGGAGGATATAAGTTC400
401TATTTGCAGAATCGCAGTCTGCCTCAGTCAGATCCTGTAT440
441TAAAAGTAACTCTAGCAGTGTCTGATCTTCAAAAGTCCTT480
481GAACTACTGGTGTAATCTACTGGGAATGAAAATTTATGAA520
521AAAGATGAAGAAAAGCAAAGGGCTTTGCTGGGCTATGCTG560
561ATAACCAGTGTAAGCTGGAGCTACAGGGCGTCAAGGGTGG600
601GGTGGACCATGCAGCAGCTTTTGGAAGAATTGCCTTCTCT640
641TGCCCCCAGAAAGAGTTGCCAGACTTAGAAGACTTGATGA680
681AAAGGGAGAACCAGAAGATTCTGACTCCCCTGGTGAGCCT720
721GGACACCCCAGGGAAAGCAACAGTACAGGTGGTCATTCTG760
761GCCGACCCTGACGGACATGAAATTTGCTTTGTCGGGGATG800
801AAGCATTTCGAGAACTTTCTAAGATGGATCCAGAGGGAAG840
841CAAATTGTTGGATGATGCAATGGCAGCAGATAAAAGTGAC880
881GAGTGGTTTGCCAAACACAATAAACCCAAAGCTTCAGGTT920
921AACGGAAGACATGATGCAGAGCAAGCCTCTGTGATTCCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。