基因總覽
GLMN 是蛋白質編碼基因，產物為 glomulin。此蛋白是 cullin-RING 型 SCF（SKP1-Cullin-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的調節成分。其蛋白質序列具有一段與 HEAT repeats 在結構上相似的 alpha-helical region；另有一段與 RBX1 交互作用相關的區域。glomulin 也與血管正常發育有關。這些特徵概括了其作為複合體調節因子的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370360 ★ | 92,246,402–92,298,987 | 19 |
| ENST00000896608 | 92,245,788–92,299,009 | 11 |
| ENST00000896609 | 92,245,788–92,298,936 | 19 |
| ENST00000896610 | 92,245,788–92,299,009 | 18 |
| ENST00000896611 | 92,245,788–92,299,009 | 18 |
| ENST00000896612 | 92,245,788–92,299,009 | 19 |
| ENST00000931415 | 92,245,788–92,299,009 | 15 |
| ENST00000931416 | 92,245,788–92,299,009 | 6 |
| ENST00000931417 | 92,245,788–92,299,009 | 18 |
| ENST00000931418 | 92,245,788–92,299,009 | 4 |
| ENST00000931419 | 92,245,788–92,299,009 | 5 |
| ENST00000931420 | 92,245,788–92,299,009 | 17 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
glomulin 是 cullin-RING 型 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體的調節成分。來源指出，它可透過與 RBX1 的 RING domain 結合，抑制 RBX1 和 E2 泛素結合酶 CDC34 的交互作用，進而抑制 E3 泛素連接酶活性；它也會抑制由 RBX1 介導的 CUL1 neddylation。這些作用顯示 glomulin 可調節 SCF 複合體的活性。
依相似性推定，glomulin 對多種 SCF 泛素連接酶複合體關鍵成分的正常穩定性及細胞內正常含量是必要的，包括 FBXW7、RBX1、CUL1、CUL2、CUL3 和 CUL4A。藉由維持這些成分，glomulin 也參與調節 CCNE1 與 MYC 的含量；此項關係標示為依相似性推定，並非此處列出的直接實驗結論。
此外，glomulin 對血管正常發育不可或缺，並參與調節 RPS6KB1 的磷酸化。現有資料支持它與泛素連接酶複合體調節、血管發育及 RPS6KB1 磷酸化調控相關，但未進一步說明後兩項功能的分子機制。
Promoter 與基因調控
>GLMN ENST00000370360 GRCh38 chr1:92298887-92299987 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGTGTAAGTAGGCTGTACCATCTAGGTTTGTGTAAGTGCACTCGATGATGGTCACACAAGGATGAAATC GACTAACAACTTATTTCTCAAAATGCATCCCCGCAGTTAAGCTACACATGGTGGCAGTAGGTCAGGTCTA CACAAACACATTAGGTACAAGATAGATTCCTACACAAATAACAAACTGTAGACCACCTTTTCTTCTTTTC CACATATTTTATGTCCAATCGTGTGTAAATCAAAATGAAATAGGAAGGGAGAGCAATTTGTTTTTGCAAA TTGATTACTGTCTAATTTTTCTTGGTTAAAATGTATCTCTTTGGGGATTGAATTTTCTTCTGTATCATAG TTGCTTAATTAACCACTCCTGAAAATCTGAGATCTGGGTACTTTTAGGGGAAACCTCTCTCCGTCTGCCA AACGTCCTCTCTGGGGGAAGAGGGGAGTCCGGCACCTTAAAGAACTGGGCACCCAAGCAATCTGGAAAGG AGGACCGGTCCTAGGTTCAAGGCCAGCTGCCAACGCTGCCCTAGTCACTTGCCCCGAAACCCGGGGACCC CAGGCCTGGGTTCCCGGGGCCTCCACTGTCCTTTGTCTCAGAGGCTGGGGCCACAGTCCGCGTGAGGGAA ATCTTGGAACACTGGCGTAAAGGGGTGAGGGGCGGCCAGGAAATCTTTCCCAGGAGGTGCGGACGGCGGT GGGAAGCTTTCGGCCTACTCTACCTGGGAGAACCCCTCCCCTGAAGCAGCCTTTCAGGAGCGCCCGCGCG CTGCGGTCTATAACTCGAGATCGGGGCCCAGCTTTCAGGGTCCAAAAGTGGGAAGAGATCCTTGCTCCTA CCTGCGGCTTTTCGAGAGCAGCGGGGAGCCCCGGCCTTGCGGCCGGCAGAAGACGGCCCAGCGAAGTCCG CCATGGGGGAGAGTAGTCTGCCGGACGGGGACACGCTCCGGCGTCTCGCCCCGAGGCCCCGCCTCCCTAC GCGTAGCGCGGGGCGGGGCCAGAAGAGCGGGCTAAGACGCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCTGGGAGAGGCG AGGGTTCTGGCCGGTAAGTGGAGTTGTGGAGAGGTTCAGGGTGGCCAGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GLMN_1 ↗ | 1:92,298,987 | 負股 | 92,298,977–92,299,036 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_BNBKD · enhancer · 92298260–92298976 · regulatory
ENSR1_77FJKK · promoter · 92298977–92299069 · regulatory
ENSR1_CC69Q · enhancer · 92299070–92300177 · regulatory
· motif · 92299072–92299082 · motif
· motif · 92299209–92299224 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：594 aa
glomulin 長 594 個胺基酸。第 2–553 位胺基酸構成與 HEAT repeats 具有結構相似性的 alpha-helical region；第 300–594 位胺基酸區域則與 RBX1 交互作用有關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- EFSO43281-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FKBP4Q02790 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PEX5P50542-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBX1P62877 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SNAI1O95863 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
glomulin 與 FKBP4、FKBP1A 交互作用；isoform 1 透過 RING domain 與 RBX1 交互作用。它也被辨識於含 RBX1 及 CUL1、CUL2、CUL3 或 CUL4A 之一的複合體中，並是由 CUL1、RBX1、SKP1、FBXW7 組成的 SCF 複合體，以及含 CUL7、RBX1、SKP1、FBXW8 的 SCF-like 複合體成分。glomulin 與未磷酸化的 MET 交互作用，MET 磷酸化後則會釋出。
疾病與遺傳關聯
GLMN 變異與 glomuvenous malformations（GVMs）相關；來源描述此病具有位於擴張血管腔周圍中膜、類似平滑肌的 glomus cells。資料指出，影響 GLMN 的變異會造成此病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | glomulin 是 cullin-RING 型 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體的調節成分，可藉由與 RBX1 結合並妨礙其和 CDC34 的交互作用，抑制酵素活性及 RBX1 介導的 CUL1 neddylation。依相似性推定，它維持多種複合體成分的穩定性與正常含量，並參與調節 CCNE1、MYC 含量；此外，對血管正常發育及調節 RPS6KB1 磷酸化有所貢獻。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulatory component of cullin-RING-based SCF (SKP1-Cullin-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complexes. Inhibits E3 ubiquitin ligase activity by binding to RBX1 (via RING domain) and inhibiting its interaction with the E2 ubiquitin-conjugating enzyme CDC34. Inhibits RBX1-mediated neddylation of CUL1. Required for normal stability and normal cellular levels of key components of SCF ubiquitin ligase complexes, including FBXW7, RBX1, CUL1, CUL2, CUL3, CUL4A, and thereby contributes to the regulation of CCNE1 and MYC levels (By similarity). Essential for normal development of the vasculature. Contributes to the regulation of RPS6KB1 phosphorylation PMID 11571281 ↗ · PMID 11845407 ↗ · PMID 22405651 ↗ · PMID 22748924 ↗ |
| 交互作用 | glomulin 與 FKBP4、FKBP1A 交互作用；isoform 1 透過 RING domain 與 RBX1 交互作用，並出現在含 RBX1 與特定 cullin 的複合體、CUL1 型 SCF 複合體及 CUL7 型 SCF-like 複合體中。此外，它與未磷酸化的 MET 交互作用，MET 磷酸化後會釋出。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with FKBP4 and FKBP1A. Isoform 1: Interacts with RBX1 (via RING domain). Identified in complexes that contain RBX1 plus one of the cullins CUL1, CUL2, CUL3, and CUL4A. Identified in a SCF complex composed of CUL1, RBX1, SKP1, FBXW7 and GLMN. Component of a SCF-like complex consisting of CUL7, RBX1, SKP1, FBXW8 and GLMN. Interacts with unphosphorylated MET and is released upon MET phosphorylation PMID 11164950 ↗ · PMID 11571281 ↗ · PMID 12604780 ↗ · PMID 12904573 ↗ · PMID 22405651 ↗ · PMID 22748924 ↗ · PMID 8955134 ↗ |
| 疾病關聯 | GLMN 變異與 glomuvenous malformations（GVMs）的致病相關。此病的特徵包括擴張血管腔周圍中膜出現類似平滑肌的 glomus cells；來源指出，影響該基因的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Glomuvenous malformations GVMs Characterized by the presence of smooth-muscle-like glomus cells in the media surrounding distended vascular lumens. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 138000 PMID 11845407 ↗ · PMID 22405651 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAGAGCGGGCTAAGACGCCGGAGGAGGTGGCGGCGGCT40GGGAGAGGCGAGGGTTCTGGCCGATTTTAGCATCGAAACT80AGGAGAAATAAGAATGGCTGTAGAGGAACTTCAGTCTATA120ATAAAGAGATGTCAAATCCTAGAAGAGCAAGACTTTAAAG160AAGAGGATTTTGGCCTATTTCAGTTAGCTGGGCAAAGATG200CATAGAAGAAGGGCACACAGACCAGCTATTAGAAATTATT240CAAAATGAAAAGAATAAGGTCATCATCAAGAATATGGGCT280GGAATCTCGTTGGTCCTGTTGTTCGATGCCTTTTGTGTAA320AGATAAAGAGGATAGTAAAAGAAAAGTTTATTTTTTGATC360TTTGATTTATTGGTAAAGTTATGCAATCCAAAGGAATTAT400TGTTGGGTTTGCTTGAACTGATTGAAGAGCCCTCTGGAAA440ACAGATATCCCAAAGTATTCTTCTTTTGCTTCAGCCATTA480CAAACAGTGATTCAGAAACTTCATAACAAGGCATATTCAA520TTGGATTAGCATTGTCTACCCTTTGGAATCAGCTATCTCT560TCTTCCTGTTCCATACTCAAAAGAACAAATACAAATGGAT600GACTATGGCCTTTGTCAGTGTTGCAAGGCCTTAATAGAGT640TCACTAAGCCTTTTGTGGAAGAAGTCATTGATAACAAAGA680AAACTCACTGGAAAATGAAAAGTTAAAGGATGAATTACTG720AAATTTTGTTTCAAAAGCTTGAAATGCCCTTTGCTGACAG760CACAATTCTTTGAACAGTCTGAAGAAGGTGGAAATGATCC800TTTCAGGTATTTTGCATCAGAAATAATAGGTTTTTTATCA840GCAATTGGACACCCTTTCCCCAAAATGATTTTTAATCATG880GAAGGAAAAAGAGAACTTGGAATTACCTTGAATTTGAAGA920AGAAGAAAATAAACAGTTAGCAGACTCAATGGCTTCTCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。