基因總覽
GIGYF2 的正式名稱為 GRB10 interacting GYF protein 2，屬於蛋白質編碼基因，其產物歸入 GIGYF 家族。此蛋白質長 1299 個胺基酸，含有 GYF domain；序列中另有多個被註記為無序的區域，以及與不同分子作用相關的短序列基序。GIGYF2 是 4EHP-GYF2 複合體的重要成分，這個多蛋白質複合體參與抑制翻譯起始。其蛋白質特徵與複合體角色，構成理解 GIGYF2 分子功能的基本背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373563 ★ | 232,697,331–232,860,605 | 29 |
| ENST00000476995 | 232,697,259–232,736,214 | 5 |
| ENST00000629305 | 232,697,259–232,863,338 | 30 |
| ENST00000409480 | 232,697,259–232,863,338 | 31 |
| ENST00000492910 | 232,697,259–232,736,234 | 4 |
| ENST00000464402 | 232,697,259–232,735,961 | 5 |
| ENST00000490612 | 232,697,259–232,736,037 | 5 |
| ENST00000475359 | 232,697,259–232,738,681 | 5 |
| ENST00000409547 | 232,697,259–232,863,338 | 31 |
| ENST00000409196 | 232,697,259–232,863,338 | 28 |
| ENST00000488734 | 232,697,259–232,736,268 | 5 |
| ENST00000409451 | 232,697,259–232,863,338 | 31 |
顯示 12/72 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GIGYF2 是 4EHP-GYF2 複合體的重要成分；該複合體能抑制翻譯起始。GIGYF2 在複合體中可橋接 EIF4E2 與 ZFP36/TTP，將翻譯抑制與 mRNA 降解連結起來。它也能招募並橋接 4EHP 複合體與去帽效應蛋白 DDX6 的關聯；此作用對 ZFP36/TTP 介導的 AU-rich mRNA 下調是必要的。
GIGYF2 與 EIF4E2 也參與核糖體相關品質控制（RQC）。兩者藉由封存 mRNA 的帽端，阻止核糖體起始，降低問題訊息上的翻譯負荷。這條作用路徑與 RQC 介導的停滯新生多肽降解平行運作。GIGYF2 和 EIF4E2 位於 ZNF598 下游，且其作用獨立於 ZNF598；ZNF598 似乎可作為支架，將兩者招募至有缺陷的 mRNA，但來源指出也可能存在其他招募機制。
GIGYF2 可能與 GRB10 協同調節酪胺酸激酶受體訊號，包括 IGF1 受體與 insulin 受體。此處的功能關係帶有可能性，來源未進一步描述其作用機制。
SARS-CoV-2 感染時，病毒非結構蛋白 2（nsp2）與 GIGYF2 的交互作用會增強 GIGYF2 對 EIF4E2 的結合，並提高對參與抗病毒先天免疫反應之基因的翻譯起始抑制，例如 IFNB1。
Promoter 與基因調控
>GIGYF2 ENST00000373563 GRCh38 chr2:232696331-232697431 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGATTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTGGTCTCGATCTCCTGACCTC GTGATCCGCCCACCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCCGGCATGAGAA TTGGAGTTTTTAACATTCCATTTTAAGATGGGAGACACAAGTAATCTTTAAAGCTGACAGGAAGGATCCT GTAGGAAGGAAGAAGTTGGAGACACAGGCAAGAATGGGATGCCTAAGGATAGAGTTGCTAGATTTAGCAA ACACAGGACGCCCAATTAAATTTGAATTTCAGAAAAACAACGAACAATTTTTCAGTGTGTGCCCCAAATA TTGCTGGGTGTCTTGTATTTTATCTGTCAATTCCAAAATAGTTCATCTCTAGGTAAAAGGGTTATAGCCC CAGATGTCCTAGGAAGGAATCAGAGCTCTCAAGTCCTTTCCAGCTGTCCCAGTACAACACTCTGAAATGA ATTCCCAGTTCTACCAGAACTGTTAACAAGTAGAGAAACTGCTTTGAATTTCAGCTTTTGCGGCTTTCCC ATTCGCTCTAGGATGGCAACTGCGAAGAAAAATGCCGGACTAAAAGCTGTGGAAAAGTTCTAATTTGGAA AACCAGCCCGCAAGTGATGCAGAGGCTTTTGAACTGCAAAAGAGCTCTGGGCGTACAGGACAGTGAGTCA CACGGTGCCTGGTCCGGGCCCAACCCTGGACACCAACACCACTCAACTCAAGGGCAGGTACCCGGCTGCT GCCAAGGGGTCAGCGGGAGCCTGCGCACTGCCACGGCCCCGCCCTCTTCCAACCTTTCATCCGGGTCTCG GGCAGGGGCGTGTCTGGGCAGAGGGGCGGGTGGTGGCGGAAAGGAAGGATGTCGTGGGAGACTGGAGAGT GGGGAGGGAAGCGGGAAGGGGCGGGGGCGGAGCAGGGGGCGTGGCGGAGCGGGAGCGCGGTCACGTGACG TGCGTGGCGACGTGTCGGCCATCTTGTGTTGTTGAGGCTGAGGACTGACTGGGGTTCTGAGACTCCCTGT CCCGGACCGCAGGTAACCAGCCGTTCCGTGTCGCTCCCCTGCCCGGCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GIGYF2_1 ↗ | 2:232,697,331 | 正股 | 232,697,282–232,697,341 |
| GIGYF2_2 ↗ | 2:232,858,276 | 正股 | 232,858,227–232,858,286 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_B3P6TN · promoter · 232696809–232697393 · regulatory
ENSR2_B3P6TR · enhancer · 232697394–232698409 · regulatory
ENSR2_88SPJL · enhancer · 232698626–232698847 · regulatory
ENSR2_88SPJW · enhancer · 232699139–232699275 · regulatory
· motif · 232696882–232696902 · motif
· motif · 232697116–232697127 · motif
· motif · 232697240–232697260 · motif
· motif · 232697258–232697271 · motif
· motif · 232697300–232697309 · motif
· motif · 232697300–232697309 · motif
· motif · 232697870–232697879 · motif
· motif · 232699883–232699894 · motif
· motif · 232700325–232700339 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1299 aa
GIGYF2 蛋白質長 1299 個胺基酸，屬於 GIGYF 家族，含有 GYF domain。序列註記的作用區域包括 EIF4E2 結合基序、DDX6 結合基序，以及與 GRB10 結合所需的區域；另有多段被預測為無序的區域。與 SARS-CoV-2 nsp2 交互作用所需區域位於胺基酸 860–919。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- EIF4E2O60573-1 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- YWHAZP63104 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
GIGYF2 是 4EHP-GYF2 複合體的成分；已列出的組成至少包括 EIF4E2、GIGYF2 與 ZNF598。GIGYF2 透過 4EHP-binding motif 直接結合 EIF4E2，並透過 P-P-P-P-G repeats 直接結合 ZFP36/TTP；它也經 DDX6 motif 與 DDX6 的 RecA-like domain 2 交互作用。與 GRB10 的交互作用則屬於相似性推定。SARS-CoV-2 感染時，nsp2 會與 GIGYF2 交互作用，並增強其與 EIF4E2 的結合。
疾病與遺傳關聯
GIGYF2 曾被列入 Parkinson disease 11（PARK11）的易感性關聯，但其與 Parkinson disease 的關聯仍不明確。來源指出，影響此基因的變異可能與疾病易感性有關；然而，多項研究認為這類變異並非 Parkinson disease 的常見原因，因此 GIGYF2 可能不是該疾病病因中的主要角色。這些資料不支持將基因變異與疾病寫成確定的因果關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GIGYF2 是 4EHP-GYF2 翻譯起始抑制複合體的重要成分，可橋接 EIF4E2 與 ZFP36/TTP，連結翻譯抑制和 mRNA 降解，並協助 DDX6 參與 AU-rich mRNA 下調。它也與 EIF4E2 參與 RQC；另可能與 GRB10 協同調節受體訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Key component of the 4EHP-GYF2 complex, a multiprotein complex that acts as a repressor of translation initiation. In the 4EHP-GYF2 complex, acts as a factor that bridges EIF4E2 to ZFP36/TTP, linking translation repression with mRNA decay. Also recruits and bridges the association of the 4EHP complex with the decapping effector protein DDX6, which is required for the ZFP36/TTP-mediated down-regulation of AU-rich mRNA. May act cooperatively with GRB10 to regulate tyrosine kinase receptor signaling, including IGF1 and insulin receptors. In association with EIF4E2, assists ribosome-associated quality control (RQC) by sequestering the mRNA cap, blocking ribosome initiation and decreasing the translational load on problematic messages. Part of a pathway that works in parallel to RQC-mediated degradation of the stalled nascent polypeptide. GIGYF2 and EIF4E2 work downstream and independently of ZNF598, which seems to work as a scaffold that can recruit them to faulty mRNA even if alternative recruitment mechanisms may exist PMID 12771153 ↗ · PMID 22751931 ↗ · PMID 31439631 ↗ · PMID 32726578 ↗ · PMID 35878012 ↗ |
| 功能 | SARS-CoV-2 感染時，病毒非結構蛋白 2（nsp2）與 GIGYF2 交互作用，增強 GIGYF2 對 EIF4E2 的結合，並提高對抗病毒先天免疫相關基因翻譯起始的抑制，例如 IFNB1。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Upon SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 infection, the interaction with non-structural protein 2 (nsp2) enhances GIGYF2 binding to EIF4E2 and increases repression of translation initiation of genes involved in antiviral innate immune response such as IFNB1 PMID 35878012 ↗ |
| 交互作用 | GIGYF2 是至少包含 EIF4E2、GIGYF2 與 ZNF598 的 4EHP-GYF2 複合體成員。它直接結合 EIF4E2 與 ZFP36/TTP，並透過 DDX6 motif 和 DDX6 交互作用；與 GRB10 的交互作用則是依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the 4EHP-GYF2 complex, at least composed of EIF4E2, GIGYF2 and ZNF598. Interacts (via the 4EHP-binding motif) with EIF4E2; the interaction is direct. Interacts with ZFP36/TTP (via P-P-P-P-G repeats); the interaction is direct. Interacts with GRB10 (By similarity). Interacts (via DDX6 motif) with DDX6 (via RecA-like domain 2) PMID 22751931 ↗ · PMID 31439631 ↗ · PMID 32726578 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，SARS-CoV-2 非結構蛋白 2（nsp2）會與 GIGYF2 交互作用；此交互作用會增強 GIGYF2 與 EIF4E2 的結合。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with SARS coronavirus-2/SARS-CoV-2 non-structural protein 2 (nsp2); the interaction enhances GIGYF2 binding to EIF4E2 PMID 35878012 ↗ |
| 疾病關聯 | GIGYF2 變異可能與 Parkinson disease 易感性相關，但其疾病關聯仍不明確。多項研究指出，影響此基因的變異並非 Parkinson disease 的常見原因，故 GIGYF2 可能不是其病因中的主要角色。Parkinson disease 的特徵包括動作遲緩、靜止性震顫、肌肉僵硬及姿勢不穩。 | 含實驗來源 | 證據與來源Parkinson disease 11 PARK11 A complex neurodegenerative disorder characterized by bradykinesia, resting tremor, muscular rigidity and postural instability, as well as by a clinically significant response to treatment with levodopa. The pathology involves the loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra and the presence of Lewy bodies (intraneuronal accumulations of aggregated proteins), in surviving neurons in various areas of the brain. Disease susceptibility may be associated with variants affecting the gene represented in this entry. Its association with Parkinson disease is however unclear. According to a number of studies, variations affecting this gene are not a frequent cause of Parkinson disease, suggesting that GIGYF2 does not play a major role in Parkinson disease etiology MIM: 607688 PMID 19279319 ↗ · PMID 19321232 ↗ · PMID 19429085 ↗ · PMID 19482505 ↗ · PMID 19638301 ↗ · PMID 20004041 ↗ · PMID 20060621 ↗ · PMID 18358451 ↗ · PMID 20178831 ↗ · PMID 26134514 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATCTTGTGTTGTTGAGGCTGAGGACTGACTGGGGTTCTGA40GACTCCCTGTCCCGGACCGCAGCGTTAAAAGGATCTGAAC80AAAGTCTGCTCAAATCTCCTGCTGTGAACCAGCAGAATTT120TTGAACAGGTTTCTTCACATATAAAAATCTATTGTAAAAA160TACGGAAAAGAATGGCAGCGGAAACGCAGACACTGAACTT200TGGGCCTGAATGGCTCCGAGCTCTGTCCAGTGGTGGGAGT240ATTACATCCCCTCCTCTTTCTCCAGCATTGCCGAAGTATA280AATTAGCAGATTATCGTTACGGCAGAGAAGAAATGTTAGC320ACTTTTCCTTAAAGACAACAAGATACCTTCAGACCTTCTG360GATAAAGAATTTCTGCCTATCCTCCAGGAGGAACCCCTTC400CACCATTGGCTCTGGTACCCTTTACAGAAGAAGAACAGAG440AAACTTTTCCATGTCTGTAAATAGTGCTGCTGTCCTGCGA480TTGACAGGACGAGGAGGAGGAGGAACAGTGGTGGGGGCTC520CTAGAGGTCGAAGTTCTTCAAGAGGGCGAGGCAGAGGCAG560AGGTGAATGTGGTTTCTACCAAAGAAGTTTTGATGAAGTA600GAGGGTGTTTTTGGTCGAGGAGGTGGCAGAGAAATGCATA640GATCGCAGAGCTGGGAGGAAAGGGGTGACAGACGTTTTGA680AAAACCAGGACGAAAAGATGTAGGGAGACCAAATTTTGAG720GAAGGTGGACCAACATCAGTAGGGAGAAAGCATGAATTTA760TACGCTCAGAAAGTGAAAATTGGCGCATCTTTAGAGAGGA800ACAAAATGGAGAAGATGAAGATGGAGGTTGGCGACTAGCT840GGATCAAGGAGGGATGGAGAGAGGTGGCGACCTCACAGTC880CTGATGGCCCTCGTTCTGCAGGCTGGCGGGAACACATGGA920ACGACGTCGGAGGTTTGAGTTTGATTTTCGAGATAGAGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。