演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GET1CHD5

guided entry of tail-anchored proteins factor 1

GET1 是一種多次跨膜蛋白,與 CAMLG/GET2 協同參與尾錨定蛋白送往內質網的過程。

Homo sapiens21q22.2UniProt O00258
OFFICIAL SYMBOL
GET1
CHROMOSOME
21
UNIPROT
O00258
PDB / ALPHAFOLD
6SO5
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GET1(guided entry of tail-anchored proteins factor 1)是蛋白質編碼基因,產物屬於 WRB/GET1 family。這種多次跨膜蛋白參與細胞內膜系統中的蛋白質運送,並與 CAMLG/GET2 一同作為相關運送機制的膜受體組成部分。其跨膜構造使它能嵌入膜中,並在複合體中與其他成員協作。

Official symbol
GET1
Gene name
guided entry of tail-anchored proteins factor 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12790
UniProt
O00258
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CHD5WRB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.2
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegGET1pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr21:39,377,698–39,428,533
Gene span
50,836 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000649170 ★39,380,326–39,397,8895
ENST0000041584739,377,698–39,406,6155
ENST0000064767839,379,539–39,397,8874
ENST0000065037639,379,571–39,397,7435
ENST0000107137739,380,235–39,408,6774
ENST0000107137839,380,235–39,406,8905
ENST0000109050139,380,235–39,428,5334
ENST0000109050239,380,235–39,410,9375
ENST0000109050339,380,235–39,397,8894
ENST0000039875339,380,458–39,397,1165
ENST0000044277339,380,487–39,390,8032
ENST0000038071339,386,093–39,393,2804

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GET1 參與尾錨定(tail-anchored,TA)蛋白質在翻譯後送往內質網(ER)的過程。TA 蛋白質的跨膜區域由細胞質中的 GET3/TRC40 辨識並選擇性結合;GET1 與 CAMLG/GET2 共同作為膜受體,協助這類蛋白質被送至 ER。這項功能將細胞質中的辨識與膜上的接收連結起來。

GET1 的作用也涉及蛋白質在 ER 膜中的正確插入。來源指出,GET1 是確保 CAMLG 具有正確拓撲並插入 ER 所必需的因子。因此,它不僅參與 TA 蛋白質的送達,也與 CAMLG 在 ER 膜中的正確定位相關;來源未進一步說明此作用的分子步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39380326 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GET1 ENST00000649170 GRCh38 chr21:39379326-39380426 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATTTTGATTAGGAATTAGTCCTCAGAAACCAGTCATGGCAGCATGGCAGAAGAGACAGTTGAACATGTC
TTGCTTTATCCACTAGGCATACTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCAGAGCTGGAG
TGCAGTGGCGCGATCTTGGCTAACTGCAACCTCCGTCTTCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCT
CCGGAGTAGCTGGGACTACAGGCGCGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATCGTAGAGACGGGGTTT
CACCATGTTGGCCAGGCTGGTTTCAATCTCTTGACCTCATGACCTGCCCGCCTCGGCCTCTCAAAGTGCT
GGGATTACAGGCGTGAGCCACCTCGCCCTGCTCACTTTGCATACATTTGAGTTGGGATTCTTTCGCTGCA
AAACCTGATCTTCACCTAGATTCAGGTTAATTTATTAACTATTACTAATGATTGTGAACAGTGCATTCTA
TTAAACTTATTTTTCAGGTATGCAGTTGTGTAAATTGGTTAGACTTACTACAGTGTTTAGATCTGGAACG
AAAACGTAAGGCATTTTCCATGTAACTGCTTGGAACACGACAGTTACCTGCTACTATAAAAACGGTAGTT
TTCTATTTATGGAAGAGTTTTTCTTAAACTTATCTAGAATTAAAAGTTAATTTAAAGAAAGTACTAATTA
TGACAAAAGCAGGGAGTCGTTAGCACTTGAAACCAGAGTTTGGTACTATGAGAAGGTTTTTAATTTTAAA
AAGAAGGAAAAAAAGAAACACGGACGTCAGAAAACTGGTTCAGTAGGGATGGGTGCTAGAAGGCTACGGA
ACCGCCGAAGGCCCAGGAGAAACCCGGAACGTGTTAACCGCTCCAACTGGAGCCGGACGAAAAAACGGCC
CCGCCTCCCGCGAGGGCGACGCAGTTCGCAGGCGCGTCGGCGCGCCTGTTCTGGGGCGCTTGGCTTCACC
GCGCAGGCGCGGTCGCCGCTGTTGTTGTGGTCCCCATGGAGCTGCCGTAGCGGACCCAGCACAGCCAGGA
GCGTCCGGGATGAGCTCAGCCGCGGCCGACCACTGGGCGTGGTTGCTGGTG
GET1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WRB_2 ↗21:39,387,781正股39,387,732–39,387,791
WRB_1 ↗21:39,387,792正股39,387,743–39,387,802

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_5C93XP · CTCF_binding_site · 39377378–39377399 · regulatory

ENSR21_8368ZZ · promoter · 39377499–39377708 · regulatory

ENSR21_836924 · enhancer · 39377709–39377922 · regulatory

ENSR21_5C942S · CTCF_binding_site · 39377836–39377857 · regulatory

ENSR21_B9S2C · promoter · 39379836–39380468 · regulatory

ENSR21_C5WHQ · enhancer · 39380469–39381517 · regulatory

ENSR21_9KM44 · enhancer · 39384746–39385116 · regulatory

ENSR21_C5WJ4 · enhancer · 39385240–39386694 · regulatory

· motif · 39377380–39377396 · motif

· motif · 39377838–39377854 · motif

· motif · 39380260–39380271 · motif

· motif · 39380305–39380316 · motif

· motif · 39380305–39380316 · motif

· motif · 39380321–39380338 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:174 aa

1 aa174 aa功能區域跨膜區拓樸區域
依 O00258 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

GET1 蛋白長 174 個胺基酸,屬於 WRB/GET1 family,具有三段螺旋型跨膜區域。註解將第 1–8、121–148 個胺基酸列為腔內區域,第 30–99、170–174 個胺基酸列為細胞質區域;第 9–29、100–120、149–169 個胺基酸為跨膜區域。第 39–97 個胺基酸區域與 GET3/TRC40 互作相關。

拓樸區域Lumenal1–8 aa
跨膜區Helical9–29 aa
拓樸區域Cytoplasmic30–99 aa
跨膜區Helical100–120 aa
拓樸區域Lumenal121–148 aa
跨膜區Helical149–169 aa
拓樸區域Cytoplasmic170–174 aa
功能區域Interaction with GET3/TRC4039–97 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6SO5…

PDB · 6SO5

EM · 4.20 A · C/D=1-174

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum membrane

GET1 位於內質網膜,為多次跨膜蛋白。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 29 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CHD5GET1ABHD5APOA2APOL2AQP1CAMLGCCL4L2CD302CD53CLCN7COMTCOX20ERG28HMOX2HTATIP2ORMDL3PLPP4PTPN9RASGRP3RTP2SERP2SLC19A3SLC35E3SLC7A1SPTSSASTX2TECRTFRCTM4SF19TMEM42
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 29 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GET1 是 Golgi to ER traffic(GET)複合體的組成成員;該複合體由 GET1/WRB、CAMLG/GET2 與 GET3/TRC40 組成。GET1 透過 C 端與 CAMLG 互作;兩者形成由磷脂醯肌醇結合所穩定的異源四聚體,並與 GET3 同源二聚體結合。GET3 對 CAMLG 的親和力高於對 GET1 的親和力。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GET1 是尾錨定(TA)蛋白質翻譯後送往內質網(ER)所需的因子。GET1 與 CAMLG/GET2 共同作為膜受體;細胞質中的可溶性 GET3/TRC40 會辨識並選擇性結合 TA 蛋白質的跨膜區域。此外,GET1 對確保 CAMLG 的正確拓撲及其插入 ER 是必要的。含實驗來源
證據與來源

Required for the post-translational delivery of tail-anchored (TA) proteins to the endoplasmic reticulum (ER). Together with CAMLG/GET2, acts as a membrane receptor for soluble GET3/TRC40, which recognizes and selectively binds the transmembrane domain of TA proteins in the cytosol. Required to ensure correct topology and ER insertion of CAMLG

PMID 21444755 ↗ · PMID 23041287 ↗ · PMID 24392163 ↗ · PMID 27226539 ↗ · PMID 31417168 ↗ · PMID 32187542 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用GET1 是由 GET1/WRB、CAMLG/GET2 與 GET3/TRC40 組成的 Golgi to ER traffic(GET)複合體成員。在複合體中,GET1 與 CAMLG 形成由磷脂醯肌醇結合所穩定的異源四聚體,並結合 GET3 同源二聚體;GET1 透過 C 端與 CAMLG 互作。GET3 對 CAMLG 的親和力高於對 GET1。含實驗來源
證據與來源

Component of the Golgi to ER traffic (GET) complex, which is composed of GET1/WRB, CAMLG/GET2 and GET3/TRC40. Within the complex, GET1 and CAMLG form a heterotetramer which is stabilized by phosphatidylinositol binding and which binds to the GET3 homodimer. Interacts with CAMLG (via C-terminus). GET3 shows a higher affinity for CAMLG than for GET1

PMID 21444755 ↗ · PMID 23041287 ↗ · PMID 24392163 ↗ · PMID 31417168 ↗ · PMID 32187542 ↗ · PMID 32910895 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GET1 位於內質網膜,並被註解為多次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Endoplasmic reticulum membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 21444755 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000649170 · 1,534 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTGTTGTGGTCCCCATGGAGCTGCCGTAGCGGACCCAGC40
41ACAGCCAGGAGCGTCCGGGATGAGCTCAGCCGCGGCCGAC80
81CACTGGGCGTGGTTGCTGGTGCTCAGCTTCGTGTTTGGAT120
121GCAATGTTCTTAGGATCCTCCTCCCGTCCTTCTCATCCTT160
161CATGTCCAGGGTGCTGCAGAAGGACGCGGAGCAGGAGTCA200
201CAGATGAGAGCGGAGATCCAGGACATGAAGCAGGAGCTCT240
241CCACAGTCAACATGATGGACGAGTTTGCCAGATATGCCAG280
281GCTGGAAAGAAAGATCAACAAGATGACGGATAAGCTCAAA320
321ACCCATGTGAAAGCTCGGACAGCTCAATTAGCCAAGATAA360
361AATGGGTGATAAGTGTCGCTTTCTACGTATTGCAGGCTGC400
401CCTGATGATCTCACTCATTTGGAAGTATTATTCTGTCCCT440
441GTGGCTGTCGTGCCGAGTAAATGGATAACCCCTCTAGACC480
481GCCTGGTAGCCTTTCCTACTAGAGTAGCAGGTGGTGTTGG520
521AATTACCTGTTGGATTTTAGTCTGTAACAAAGTTGTCGCT560
561ATTGTGCTTCATCCGTTCAGCTGAACAGGAGGATGGATAC600
601AGCCGCGAGGCTAAAAAACGGATTTCCTCTTCCTAGCTTA640
641AAATCTGATTTACACTGTTTTGTTTTTTAAGAAACAAAAG680
681TGCATAGTTTAGATTTTTTTTTTGTTGAATATGTTTGTTC720
721TTGGACTTTATGAGAGAGTCTTATAAGAATCACGATTTTC760
761TACACCTGTCATTGAGCCAAGAAAGTCCAGTTTATGACAC800
801GTATGTACTAGTGAACACCGTCCTCGATCTGTACGAAATG840
841TGAAATGTTTAGGGACATCTCCATGCTGTCACTTGTGATT880
881TGCCCTCTTATGTATTTTGGTCATATTGCCAACTGGAAAG920
921TCAAAATTTTCTAACAACTTTAAGTAAGTTCTTTGAAGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。