基因總覽
GAS8-AS1（GAS8 antisense RNA 1）是人類的非編碼 RNA 基因，產物屬於長鏈非編碼 RNA（lncRNA），而非蛋白質。現有資料未提供其 RNA 長度、結構特徵或家族分類；資料所述的主要可能角色是抑制腫瘤。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000408886 ★ | 90,028,908–90,029,901 | 1 |
| ENST00000623094 | 90,028,935–90,029,367 | 1 |
顯示 2/2 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GAS8-AS1 編碼的長鏈非編碼 RNA 可能具有腫瘤抑制作用。資料指出，這種 RNA 能抑制癌細胞生長，但未說明其分子作用方式或涉及的細胞過程，因此目前不能進一步界定它如何產生此效果。
在人類甲狀腺乳突癌患者中曾發現 GAS8-AS1 的突變。這些突變會使該 RNA 抑制癌細胞生長的能力受損，支持其功能可能與限制癌細胞增殖有關。資料未提供突變種類、實驗系統或其他腫瘤背景，因此此功能描述應限於來源所述的結果。
Promoter 與基因調控
>GAS8-AS1 ENST00000408886 GRCh38 chr16:90029801-90030901 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTCGCCTGCAACCCCAGCACTCTGGGAGGCTGAGGTTGAAGGATCCCTCGCGCCCAGGAGCTGAAGACC AGCTTGGGCAACATAGCAAGACCCCATCTCTGCAAAAACTTTTTTTCATTAACTAGGCATGATGGCACGC ACCTATAGTCTCAGCTACTGGGAGAGCTGAGGTGGGAGGGTCACTCAAGCTCAGGGGGTTGAGGCTGCGG TTAGTTATGATCATGCCACTACACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGAATCTGTCTCAAAAAATACACAA ACAGCCAGGCATGGTGGCTCCCACCACTTTGGGAGGATCTTTTGAGCCCCAGAGTTGAACAGCCTAGGCA ACATGGCAAAACCCTGTCTCTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGCCAGGAGTGGTGGCACATGCCT ATAGTCCCAGCTACTCAGAAGACTGAGGTAGGAGGATCGTTTGGACCTGGGAGGTCAAGGCTGCCGTGAG CCGTGATCACACCACTGCACTCCACCTGGGTGACAGAGCAGGACCCTGTCTCTAAACAATAAATAAATAA ATATGGAAATGGTTGAAAAATTAGAGTATATCAACTAGGAGAAATATCACATTAACCCAAAAAAAATATG CAAATGATGTAGCAGCATTTAAACAAATTCATATCATAATGCTAAATGAAAAAAAATTCACCTTTGAAGA TATAATGTTAAGCAAAAAATATACAAAACCAGTAGACTCTAAAATCTCAAGAGGGTTCAATTGCGAATCT GCAAATAGGTTAAAAAAAAATGTAGGACAGGCTTCCAGCTTTCTCGGGAGCTCATTTCCCTTAAGAATCA GTTACTGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCAGAGACAGGCAGATCATG AGGTCAGGAGATCAAGGCCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAATT AGCCGGGCGTGATGGCAGGCACCTGCAGTCCCAGCTACTGGGCAGCCTGAAGCAGCAGGATGGTGTGAAC CCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGGTCGCGCCACCGCACTCCAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_84MGKJ · enhancer · 90026183–90026425 · regulatory
ENSR16_5R6PLD · CTCF_binding_site · 90026285–90026306 · regulatory
ENSR16_84MGQ5 · enhancer · 90034094–90034310 · regulatory
· motif · 90026180–90026194 · motif
· motif · 90026287–90026303 · motif
· motif · 90032124–90032137 · motif
RNA 轉錄本與序列
GAS8-AS1 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000408886 ★ | lncRNA | 994 nt | 1 |
| ENST00000623094 | lncRNA | 433 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GAS8-AS1 產生的長鏈非編碼 RNA 可能具有腫瘤抑制作用。人類甲狀腺乳突癌患者中曾發現 GAS8-AS1 突變；這些突變會削弱該 RNA 抑制癌細胞生長的能力。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a long non-coding RNA (lncRNA) that may function as a tumor suppressor. Mutations in this gene have been identified in human papillary thyroid carcinoma (PTC) patients that abrogate the ability of encoded lncRNA to inhibit cancer cell growth. |
DNA 與 RNA 序列
ACCTGCAGTCCCAGCTACTGGGCAGCCTGAAGCAGCAGGA40TGGTGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGG80TCGCGCCACCGCACTCCAGCCTGGGCCACACAGCGAGATT120CCGTCAGAATCAGTTACTTTTCGGGCACAGCCCCAGGCCA160CTTACTGTGAGCCTTTTTCTTTCTCAACACCACATTCCCC200ACAGGGAAAACACATTTCTCACCTCAAAAGAAGACAAGAC240AACGAGCAAACAAGAAGGAGCAGCAGGAGGGGTTCTGAGC280CGAGGATGCCGGGCAGACATGAGGGAGACACGCACCCCCG320AATCCAACCAGTGCCTCGGCACAACGACAAATGTCTTCAC360GTCACAGACCTTTAGAGGCTCCTGGGCAGAGCCTGAACCA400GGGCTCCTGACTGGTCTGTTTGGCTCACATGGTGTTGAGA440TTTTGCCATCACTCAATATTCAGATTTCTTATAAATATCC480AGATTTCCAGCTTCTCTTGGAAAATCAGAAAAAAACAGCA520CTGAACTCCTAGGCCCACAAGGCACTCCCCAGTGAACAGA560TGAAACTGTCCTCTGCTGCGGGGCAGGAGTCTCCAGGTCA600CCCCCATCCCTCCCCACCTGCCTGGACCCTGAAGAAGCCT640TCTGAGTCTGTGGCTCAACGTGCGATGTGCAGTGCAAGGG680CCTGCCCCGTAGCCTGCCCCGTAGGCTGCCCCATAGCCTG720CCCCGTAAGCTGCCCCGTAGCCTGCCCCGTAGGCTGCCCC760GTAGGCTCCATGGCCACTGCCCCACAAGGCCTGTCTCCAC800AGGAATGGGAAGCGGACAGGGAGACGGGCAGCAGCTCACA840TGCTGGGACAACGCAGTGTTCAATCCATTCTCCATCCAGC880AGCTCCAGACATCTTTCCAGAACACAAACCTGACCCCATC920ACCTCTCTGCTTAGCCACTGGCTTAAACTGCCAATGGTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。