演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

GABRQ

gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit theta

GABRQ 編碼 GABA(A) 受體的 theta 次單元,參與形成由 GABA 門控的五聚體氯離子通道。

Homo sapiensXq28UniProt Q9UN88
OFFICIAL SYMBOL
GABRQ
CHROMOSOME
X
UNIPROT
Q9UN88
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

GABRQ 是蛋白質編碼基因,其產物為 gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit theta,屬於配體門控離子通道家族中的 GABA 受體亞家族。這類受體由五個次單元組成,環繞中央孔道排列;GABRQ 所編碼的 theta 次單元是可參與組成受體的多種次單元之一。不同次單元具有各自的生理與藥理特性。此蛋白質具有多個跨膜區段,符合膜通道次單元的結構特徵。

Official symbol
GABRQ
Gene name
gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit theta
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14454
UniProt
Q9UN88
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq28
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegGABRQpq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:152,637,895–152,684,285
Gene span
46,391 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000598523 ★152,637,895–152,657,5429

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

GABRQ 編碼的 theta 次單元參與構成由 γ-aminobutyric acid(GABA)門控的異源五聚體氯離子通道。GABA 是腦中的主要抑制性神經傳遞物質;由 GABA 門控的氯離子通道也稱為 GABA(A) 受體(GABAAR)。受體由五個次單元圍繞中央孔道排列而成,GABRQ 是可納入這類受體的次單元之一。

GABA 的活性結合位點位於 alpha 與 beta 次單元的交界處;這項結構關係屬於相似性推論。當 GABA 活化 GABAAR 時,受體會選擇性地讓氯離子沿電化學梯度跨越細胞膜流動。這種離子通透是此受體作為配體門控通道的直接功能描述。

資料另列有「chloride(in) = chloride(out)」的活性註記,但未提供足以界定其條件或生理意義的說明,因此不據此延伸解讀。現有資料支持 theta 次單元參與受體組成及 GABA 活化後的氯離子通道功能,未進一步說明 GABRQ 對受體特定生理效應的獨立貢獻。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 152637895 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>GABRQ ENST00000598523 GRCh38 chrX:152636895-152637995 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTGCTTTGTCATGGGATAGGAAGGACATAGGAAATTGGGTGGAGGCATTTCTTATCCTCCACGATTTTT
CTGTCCCATAGGGGCAGAGTCTGAGGTAGTGGAAAGAATAAGAGCCCTCTAGTCAAGATGTCAGGCTTTT
CCATATGATGGGGTCAGAACCCAGGAACATTGGCATACCCTGGTCTCCAGTGCCTAACTCCCTTGAACAC
CCCAAACACTGACCTTGGCCTTTTTTTCCCCTTCTATGGTGTCAGCCATGAACCTTCATTCTGCATCCCC
TGGCTGATGAGACACAACCACATCTCAGAGAGACCCCAGTTGGTGAGCCCTTCCAGTTCCTTGAGTCTTT
TTCCTGAGTACCCAAAGTTGGGGTGAAGAGCACTCTAGGAAATTTAAGTCTTAAGCAACTCTTGGGCTCC
TGTAGCCCAATGTCCATCCTGAGGGAGGAGCAGTCCTGCTGTGGCCAGAGCCCTGTAACAAAACCCATTA
GGATCCTCCTTGACCTTATCCAGAGACAAGGCACGCGGGGTTACTGGAGGCTCAAGGGTACGGAGTCACC
AGCCGTTGGGTACCTCCTGACGCCCAAAATTGTCCAAGTCTTTCAGAATGCAGATTCAGCCATGGCGGTC
AAATTACCACACTCCCTTCACCATCAAATACAACTCTCGGGCACAGGCCCTTTCTTCCAAGAAAAACACA
CATTTCGCATTTTGCAGAGAAGAGACAGGACCCAGTGCCCCTTGAGGCGGATTCCTGGCCCAGCCCCCAA
GGAGCCAGCCCTCCTCCCCCTCCCCCAGCCCGGCCCCGCCCTGCCTGTGTCTGGAGATGGCCGGGGGATG
ACTGCAGAAGCCTGAAGGGGCGGGGGCCGGGCGGCGCGCAGGCTACGGGCGGAGGCAGGAGCGCGCGCCT
TTTTGTGCGGCTCCTGGCAGCTGTCCGATTGGCTGGGCCTGCGATGCCGTCGGAGTGGGCGGAGCCAGCA
GCGAGCTGGGATCTGTGCCCAGTCGCAGCCAGGAGCGGCCGCAGACGGAGCGCACCTCGCAGCTGCCGGG
CGGGCCCTGGGGGGAGCTGCGTCCAGCAGAGCTGCTGGGTGGTTGCTCCTC
GABRQ 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
GABRQ_1 ↗X:152,637,895正股152,637,846–152,637,905

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_53BWBN4 · CTCF_binding_site · 152633173–152633194 · regulatory

ENSRX_948KQJ · enhancer · 152635950–152636284 · regulatory

ENSRX_948KR2 · promoter · 152637498–152637905 · regulatory

ENSRX_53BWCT4 · CTCF_binding_site · 152640079–152640100 · regulatory

ENSRX_86H6LG · enhancer · 152640138–152640327 · regulatory

ENSRX_86H6MK · enhancer · 152642051–152642287 · regulatory

ENSRX_53BWD7M · CTCF_binding_site · 152642149–152642170 · regulatory

· motif · 152633175–152633191 · motif

· motif · 152640081–152640097 · motif

· motif · 152641625–152641638 · motif

· motif · 152641725–152641738 · motif

· motif · 152641726–152641739 · motif

· motif · 152641726–152641739 · motif

· motif · 152642151–152642167 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:632 aa

1 aa632 aa功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q9UN88 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

gamma-aminobutyric acid type A receptor subunit theta 長 632 個胺基酸,屬於配體門控離子通道家族的 GABA 受體亞家族。其序列註解包含四段螺旋跨膜區,並有位於細胞外側與細胞質側的區域;另有兩段區域被註記為無序區。資料亦註記 N 端訊號序列。

訊號胜肽1–21 aa
拓樸區域Extracellular22–268 aa
跨膜區Helical269–289 aa
拓樸區域Cytoplasmic290–297 aa
跨膜區Helical298–315 aa
拓樸區域Extracellular316–326 aa
跨膜區Helical327–347 aa
拓樸區域Cytoplasmic348–611 aa
跨膜區Helical612–632 aa
功能區域Disordered410–458 aa
功能區域Disordered491–523 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UN88…

AlphaFold · Q9UN88

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Postsynaptic cell membrane;Cell membrane

GABRQ 蛋白質被註記為多次跨膜蛋白,定位於細胞膜及突觸後細胞膜。 資料未提供定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
GABRQGABRQGNMT
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

GABRQ 可與多種受體次單元共同組成異源五聚體,包括 alpha(GABRA1-6)、beta(GABRB1-3)、gamma(GABRG1-3)、delta(GABRD)、epsilon(GABRE)、rho(GABRR1-3)、pi(GABRP)及 theta(GABRQ)次單元。來源描述的是複合體組成,並指出各次單元具有不同的生理與藥理特性;未列出 GABRQ 與特定單一蛋白質的直接結合關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能GABRQ 編碼的 theta 次單元參與由 GABA 門控的異源五聚體氯離子通道;GABA 是腦中的主要抑制性神經傳遞物質。GABA(A) 受體由五個次單元環繞中央孔道排列,GABA 活性結合位點位於 alpha 與 beta 次單元交界處,此位置關係為相似性推論。GABA 活化受體後,氯離子會沿電化學梯度選擇性地跨膜流動。含實驗來源
證據與來源

Theta subunit of the heteropentameric ligand-gated chloride channel gated by gamma-aminobutyric acid (GABA), a major inhibitory neurotransmitter in the brain. GABA-gated chloride channels, also named GABA(A) receptors (GABAAR), consist of five subunits arranged around a central pore and contain GABA active binding site(s) located at the alpha and beta subunit interfaces (By similarity). When activated by GABA, GABAARs selectively allow the flow of chloride anions across the cell membrane down their electrochemical gradient

PMID 10449790 ↗ · PMID 16412217 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性chloride(in) = chloride(out)含實驗來源
證據與來源

chloride(in) = chloride(out)

PMID 10449790 ↗ · PMID 16412217 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用GABA(A) 受體由五個次單元組成,可由 alpha(GABRA1-6)、beta(GABRB1-3)、gamma(GABRG1-3)、delta(GABRD)、epsilon(GABRE)、rho(GABRR1-3)、pi(GABRP)及 theta(GABRQ)鏈組合形成;各次單元具有不同的生理與藥理特性。含實驗來源
證據與來源

Heteropentamer, formed by a combination of alpha (GABRA1-6), beta (GABRB1-3), gamma (GABRG1-3), delta (GABRD), epsilon (GABRE), rho (GABRR1-3), pi (GABRP) and theta (GABRQ) chains, each subunit exhibiting distinct physiological and pharmacological properties

PMID 10449790 ↗ · PMID 16412217 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位GABRQ 蛋白質被註記為多次跨膜蛋白,定位於突觸後細胞膜及細胞膜。推論支持
證據與來源

Postsynaptic cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000598523 · 6,468 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCGCAGCCAGGAGCGGCCGCAGACGGAGCGCACCTCGC40
41AGCTGCCGGGCGGGCCCTGGGGGGAGCTGCGTCCAGCAGA80
81GCTGCTGGGTGGTTGCTCCTCCCGGGCTCTCATCTCCGGT120
121ATCCGGGCCGACCCCCGCACCCCCTACTTCCCTTGCCCTC160
161GCTGCTCTCTCCTTAGAGGCGACTCTTTGGGGAAGGGCCA200
201GCAATCCCGCCTTCCCCGGCCCCAGTAGTCACCCACTCTC240
241CCACCCCACCTCTGTTCCTTTTCGCGGCCCCGTCTCCCGC280
281GCCCTCAGGCGCCCAGAACGCCCCGGCCATGGGCATCCGA320
321GGCATGCTGCGAGCCGCAGTGATCCTGCTGCTCATCAGGA360
361CCTGGCTCGCGGAGGGCAACTACCCCAGTCCCATCCCGAA400
401ATTCCACTTCGAGTTCTCCTCTGCTGTGCCCGAAGTCGTC440
441CTGAACCTCTTCAACTGCAAAAATTGTGCAAATGAAGCTG480
481TGGTTCAAAAGATTTTGGACAGGGTGCTGTCAAGATACGA520
521TGTCCGCCTGAGACCGAATTTTGGAGGTGCCCCTGTGCCT560
561GTGAGAATATCTATTTATGTCACGAGCATTGAACAGATCT600
601CAGAAATGAATATGGACTACACGATCACGATGTTTTTTCA640
641TCAGACTTGGAAAGATTCACGCTTAGCATACTATGAGACC680
681ACCCTGAACTTGACCCTGGACTATCGGATGCATGAGAAGT720
721TGTGGGTCCCTGACTGCTACTTTCTGAACAGCAAGGATGC760
761TTTCGTGCATGATGTGACTGTGGAGAATCGCGTGTTTCAG800
801CTTCACCCAGATGGAACGGTGCGGTACGGCATCCGACTCA840
841CCACTACAGCAGCTTGTTCCCTGGATCTGCATAAATTCCC880
881TATGGACAAGCAGGCCTGCAACCTGGTGGTAGAGAGCTAT920
921GGTTACACGGTTGAAGACATCATATTATTCTGGGATGACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。