基因總覽
GAB2(GRB2 associated binding protein 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 GAB 家族,具有接頭蛋白的性質。它可在多種膜受體下游參與訊息傳遞調節,涉及細胞激素、抗原、荷爾蒙、細胞基質與生長因子受體。GAB2 蛋白長 676 個胺基酸,含有 N 端 PH 結構域,並具有多個註解為無序區的區段,以及 SH3 結合基序。這些結構特徵為其參與受體下游訊息調節提供基本分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361507 ★ | 78,215,293–78,417,820 | 10 |
| ENST00000340149 | 78,215,293–78,341,880 | 10 |
| ENST00001141884 | 78,215,293–78,417,963 | 10 |
| ENST00001015179 | 78,245,930–78,417,963 | 3 |
| ENST00000528886 | 78,250,271–78,418,348 | 3 |
| ENST00000530915 | 78,250,357–78,417,779 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
GAB2 是位於多種膜受體下游的接頭蛋白,參與調節多條訊息傳遞路徑。相關受體包括細胞激素、抗原、荷爾蒙、細胞基質與生長因子受體;來源指出它可調節受體下游的多種訊息,但未進一步限定各受體所連結的路徑或作用方式。
在骨骼相關的生物學過程中,GAB2 透過 TNFRSF11A/RANK 訊息傳遞調節破骨細胞分化。這項描述指出其作用與 RANK 訊息有關,但未提供分化調節的方向或更具體的分子步驟,因此不宜延伸為促進或抑制破骨細胞形成。
在過敏反應中,GAB2 參與肥大細胞活化與脫顆粒,並涉及 PI-3-kinase 的調節。這說明 GAB2 與肥大細胞反應及 PI-3-kinase 調節相連,但來源未細述兩者之間的完整因果順序,也未限定其對活化或脫顆粒的影響方向。
此外,GAB2 也參與細胞增殖與造血的調節。這些作用與其作為受體下游接頭蛋白、參與多條訊息傳遞的角色相符;但現有資料未指出特定細胞類型、訊息路徑或調節結果,故其在增殖與造血中的具體機制仍無法由此來源確定。
Promoter 與基因調控
>GAB2 ENST00000361507 GRCh38 chr11:78417720-78418820 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGAAGTGCTGGGGTTGTGTGCTTCCACGTACATCTGGGATACCATTATATTTACAAACAGAGGTCTCAT AGCCTGTGTCAATGAGCGGGAACGTTGGGGAATTTGGACCCCAATTTCTTGTTCTTCTGCACTTGACCTT GCCTTCCAATTCGTTATGAAATACATTGACTAGTTTTGCTTCTTCCATTCTACAAATCATGCGAATTTTC TATACTAAACTGTGTTTTCCCAGAGGCAGTGTAGGAGGGAGTCAGCTGGACTTGGTTTCCAGGCAATGAG AGGCTCCCAGGTCGATCCCATTAAGGCAATGCCCTCATTTTGAATAGCAGATGACCGGGACCCCTCCTCC CCCACACACCTGAATTGGAAAATTGGCTCGGCTTTGTACAAGCCCTTGCCCTTAGGCTGTCCATAAAATA GGAACAATACTGAAGACAATCCTGTAAGCTACAAAAGCAAAGGCTCCGGCGCGTAGTAGGTCCGTCTCCT CCTCCCGCCGAGGGACGCCAGAGTTAAGGAGCTTCTTGCTGGGAAGGGGTCCCTCCTTTCAGCCGGAACC TGACCCGCAGAATGTATCGGAAATGTGAGCAGCCCTAGTATCCCTTCCCCGTCGACGCTCGGTGAAAAAT CGATCGACGACCGAGGGCGCGCAGTCCCTTCCCCTCACACCCGCCAGCGCCAGGGGCGCGGTCGCCTCCC TGGCCTCCGCGCCCGCGGCTTGGGGCCTCAGGAGAAAGCGAGACTCCGGGGCGCGCCGGCGGCGGTGGCT TTCTGTATCCTCGCGGGTCCCTAGCCCCGCGTCCGCGTGCGCGGCGGCCTCGGGGGCGCGGCGGGAGCGG GCGTGGCGAGCGAGCCGGCCTTCCTGCTGCAGCTGCTCCCCCGGCGGCCGGGCGGAGAGTGCGGATTGCG CGCGCTCGGGGCGGGGGAGCGGGCGCGCGCGAGGCTGCCGGGCTCGCGCCGCGCCGCGCCGCCTAGTCCC CGCCGGGCCGCCCGCCCCGCCCCTGGCCTCCCGCGAGCTGCGCACCGCCGGCCGCTGCCCCAGCTGCCCG AGCCCGCGCCCTCGTCCGCGCGACCCGGCGGGGGGCTCCAGGCCGGCAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| GAB2_2 ↗ | 11:78,311,806 | 負股 | 78,311,796–78,311,855 |
| GAB2_3 ↗ | 11:78,341,894 | 負股 | 78,341,884–78,341,943 |
| GAB2_1 ↗ | 11:78,417,820 | 負股 | 78,417,810–78,417,869 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_9365CD · enhancer · 78414331–78414771 · regulatory
ENSR11_5NFZJP · CTCF_binding_site · 78414409–78414430 · regulatory
ENSR11_BKK6T · enhancer · 78415317–78415917 · regulatory
ENSR11_C9R4J · enhancer · 78416127–78417809 · regulatory
ENSR11_84B8QQ · promoter · 78417810–78418035 · regulatory
ENSR11_5NG275 · CTCF_binding_site · 78418168–78418189 · regulatory
ENSR11_9365DQ · promoter · 78418991–78419491 · regulatory
ENSR11_9365DW · promoter · 78419505–78420005 · regulatory
ENSR11_5NG2KW · CTCF_binding_site · 78420497–78420518 · regulatory
ENSR11_9365FB · promoter · 78420969–78421422 · regulatory
· motif · 78414411–78414427 · motif
· motif · 78414672–78414683 · motif
· motif · 78415493–78415506 · motif
· motif · 78415493–78415506 · motif
· motif · 78416385–78416399 · motif
· motif · 78416701–78416712 · motif
· motif · 78416732–78416747 · motif
· motif · 78416733–78416747 · motif
· motif · 78416734–78416747 · motif
· motif · 78416760–78416773 · motif
· motif · 78416760–78416773 · motif
· motif · 78416831–78416841 · motif
· motif · 78418093–78418108 · motif
· motif · 78418170–78418186 · motif
· motif · 78418319–78418330 · motif
· motif · 78420499–78420515 · motif
· motif · 78420556–78420572 · motif
· motif · 78420776–78420789 · motif
· motif · 78420875–78420890 · motif
· motif · 78420882–78420897 · motif
· motif · 78420893–78420902 · motif
· motif · 78420987–78421000 · motif
· motif · 78421052–78421065 · motif
· motif · 78421364–78421379 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:676 aa
GAB2 蛋白長 676 個胺基酸,屬於 GAB family。其 N 端第 6–117 位胺基酸為 PH 結構域;序列另有多段註解為無序區,分布於第 127–178、341–430、492–531、556–643 及 656–676 位。第 351–358 與 510–519 位各有一個 SH3-binding 基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
GAB2 的定位包括細胞質、細胞膜與膜筏。 現有資料未提供特定刺激條件下的定位改變、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
- ACP2P11117 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRAP2O75791 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 16 experiments · 2 筆來源紀錄
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYO15BQ96JP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN11Q06124 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RFFLQ8WZ73-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPSAP08865 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHABP31946 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
GAB2 與 TNFRSF11A/RANK、PLCG2、TEC、BTK 及 EEIG1 同屬一個複合體;有 TNFSF11/RANKL 時,該複合體形成增加。另有資料指出 GAB2 與 GRB2、PI-3 kinase、HCK、SHC1、SYK 及 TNFRSF11A 互作,其中 SHC1 可能協助其與受體互作,但此項為相似性推論。GAB2 磷酸化後可與 PTPN11 及 14-3-3 家族蛋白互作;與 14-3-3 家族蛋白的互作會阻止 GAB2 與 GRB2 互作,並減弱 GAB2 訊息傳遞。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | GAB2 是接頭蛋白,作用於多種膜受體下游,包括細胞激素、抗原、荷爾蒙、細胞基質與生長因子受體,並調節多條訊息傳遞路徑。它透過 TNFRSF11A/RANK 訊息調節破骨細胞分化;在過敏反應中,則透過 PI-3-kinase 調節參與肥大細胞活化與脫顆粒。此外,GAB2 也參與細胞增殖與造血的調節。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter protein which acts downstream of several membrane receptors including cytokine, antigen, hormone, cell matrix and growth factor receptors to regulate multiple signaling pathways. Regulates osteoclast differentiation mediating the TNFRSF11A/RANK signaling. In allergic response, it plays a role in mast cells activation and degranulation through PI-3-kinase regulation. Also involved in the regulation of cell proliferation and hematopoiesis PMID 15750601 ↗ · PMID 19172738 ↗ |
| 交互作用 | GAB2 與 EEIG1、TNFRSF11A/RANK、PLCG2、TEC 及 BTK 組成複合體,TNFSF11/RANKL 存在時複合體形成增加。GAB2 也與 SHC1、SYK、PI-3 kinase、GRB2、TNFRSF11A 及 HCK 互作;SHC1 可能協助其與受體互作,此項為相似性推論。磷酸化的 GAB2 可與 PTPN11 及 14-3-3 家族蛋白互作;後者會阻止 GAB2 與 GRB2 互作並減弱 GAB2 訊息傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a complex composed of EEIG1, TNFRSF11A/RANK, PLCG2, GAB2, TEC and BTK; complex formation increases in the presence of TNFSF11/RANKL. Interacts with SHC1; may mediate interaction with receptors (By similarity). Interacts with SYK (By similarity). Interacts with PI-3 kinase. Interacts with GRB2 (via SH3 2 domain). Interacts (phosphorylated) with PTPN11. Interacts with TNFRSF11A (via cytoplasmic domain). Interacts (phosphorylated) with 14-3-3 family proteins SFN, YWHAB, YWHAE, YWHAG, YWHAH, YWHAQ and YWHAZ; prevents interaction with GRB2 and attenuates GAB2 signaling. Interacts with HCK PMID 10068651 ↗ · PMID 15010462 ↗ · PMID 15750601 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 19523899 ↗ · PMID 23478294 ↗ |
| 細胞定位 | GAB2 的定位包括細胞質、細胞膜與膜筏。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCTGGCCTCCCGCGAGCTGCGCACCGCCGGCCGCTGCCC40CAGCTGCCCGAGCCCGCGCCCTCGTCCGCGCGACCCGGCG80GGGGGCTCCAGGCCGGCAGCATGAGCGGCGGCGGCGACGT120GGTGTGCACCGGCTGGCTGAGGAAATCGCCTCCCGAGAAG160AAGTTGAGGCGCTATGCCTGGAAGAAACGCTGGTTTATCC200TGCGGAGTGGCCGGATGAGCGGTGACCCAGATGTTCTGGA240ATACTACAAGAACGATCACTCCAAGAAGCCTCTGCGGATC280ATCAACCTGAACTTCTGTGAGCAGGTAGATGCAGGCCTGA320CCTTTAACAAGAAGGAGCTGCAGGATAGTTTTGTGTTTGA360CATCAAGACCAGTGAACGCACCTTTTACCTGGTGGCTGAG400ACAGAAGAGGACATGAATAAGTGGGTCCAGAGCATCTGCC440AGATCTGTGGCTTCAATCAGGCTGAGGAGAGCACAGACTC480CCTGAGAAATGTTTCCTCAGCCGGTCATGGCCCCCGCTCT520TCTCCAGCTGAGCTCAGCAGCTCTAGCCAGCACCTTCTCC560GAGAGCGCAAGTCCTCAGCCCCATCACACTCCAGCCAGCC600AACTCTGTTCACGTTTGAACCCCCTGTGTCAAACCACATG640CAGCCCACCTTGTCCACCAGCGCACCTCAGGAGTATCTCT680ACTTGCACCAGTGCATAAGCCGAAGAGCAGAAAATGCAAG720GAGTGCCAGCTTCTCTCAGGGCACCAGAGCCTCTTTTCTC760ATGAGGAGTGACACAGCTGTACAAAAACTTGCCCAGGGCA800ATGGACACTGTGTCAACGGGATCAGTGGTCAAGTCCATGG840CTTCTATAGCCTTCCCAAGCCGAGCCGGCACAATACAGAA880TTCAGAGACAGTACCTACGACCTCCCCCGCAGCCTGGCCT920CCCATGGCCACACCAAGGGCAGCCTCACAGGCTCCGAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。