基因總覽
FSD1L 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 fibronectin type III and SPRY domain containing 1 like。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 9q31.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000481272 ★ | 105,448,034–105,552,433 | 14 |
| ENST00000495708 | 105,447,796–105,530,963 | 11 |
| ENST00000469022 | 105,447,796–105,473,320 | 4 |
| ENST00000484973 | 105,447,796–105,552,433 | 13 |
| ENST00000394926 | 105,447,796–105,552,433 | 14 |
| ENST00000955870 | 105,447,796–105,552,433 | 15 |
| ENST00000955871 | 105,447,796–105,552,433 | 13 |
| ENST00000985831 | 105,447,796–105,552,433 | 13 |
| ENST00001081193 | 105,447,796–105,472,141 | 5 |
| ENST00001136876 | 105,447,796–105,552,433 | 14 |
| ENST00000374707 | 105,500,659–105,552,433 | 8 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FSD1L ENST00000481272 GRCh38 chr9:105447034-105448134 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGGCCTGGCACATGCCCTGTAACCCACACCTGTAATCCTAGCAATTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGACT GCCTGAGCTTAGGAGTTCGAGACCATCCTAAGCAACATGGCTAGAACCAGTCTCCGCTAAAAGTACAAAA AATTAGCCAGGTGTGGTGGGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCATGAGGCTGAGGCACGAGAATTCCTGG AACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATGGCACCACTGCACTCCAGCCTCGGTGACAGACCGAG ACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAATGACTATAATTTATTCACTACTAATTATG TACCATACGTTATTTAATCCTCACAATCCTCTGCAAAGTCCGCATTATTTCTCTCATTTTACAGATGAAA CAAGCTCAGGCAGACTGACTTGCTCAAAATCATACAGGTAGCGAGGTGCCGGGGAGGATGGGTGGGTCCC CGGGAAAAACTGTGCCAGGCCCCAAAGCTCATATTAATCCCACACCCACGTTTCCGCCACTCTCATCCCT ATATCCCTCCTCCCACGTTTCCACCACATCCCCTAAAGGTCTTTTCCCACGTTTTCGCTACATCCCCACC CCAGCCCTTTTCCTCCCTTTGGACCGCTGGGTCCGCTCAAGCCTGGCTGCCCCTCGAAGGATAGTGTGGG GAGGGGCTTCAGATGCGTGCTGGGTGGAGGGTGGGCTAATCCGTCTCCAGCACCAGATACTCTTTCCTTC CCGGGCCCTCCGCACCGGCCGGCTGCTGGATGCCCAGTGGCCTATTTCAGGGCCGGAGAGACCGCTATCG CTGGAGGAAAAAGGATGGGGGAAGGGAGTGCAGCCTGCAGAGGCACTAGCGGTAGACAGACGGGCGGCGC TCCCCACCCTCCACGGCTACTTCCCGGGAGCAGTCAGCCGCTGCGCGCAGGCGCGGTGCGCTCCTCAGCC CCTCCCTTCTGCGGGCCGCCCTTTCACCCTGGCAACCGCGGCGTGACTACGGCGCGCGCGGTCTGGGCGC GGACGGGTGGGGCCGGGCGGTGCCGGTGCGGGCTGGGGCAGTGCAGTGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FSD1L_1 ↗ | 9:105,448,123 | 正股 | 105,448,074–105,448,133 |
| FSD1L_2 ↗ | 9:105,500,705 | 正股 | 105,500,656–105,500,715 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_93JT2H · enhancer · 105444164–105444495 · regulatory
ENSR9_BQX2F · enhancer · 105445308–105445850 · regulatory
ENSR9_BQX2Q · promoter · 105447400–105448133 · regulatory
ENSR9_CDGHX · enhancer · 105448134–105449290 · regulatory
ENSR9_5WRN44 · CTCF_binding_site · 105448833–105448854 · regulatory
ENSR9_93JT4K · enhancer · 105451281–105451603 · regulatory
· motif · 105447853–105447870 · motif
· motif · 105447861–105447874 · motif
· motif · 105447987–105447998 · motif
· motif · 105447987–105447998 · motif
· motif · 105448030–105448043 · motif
· motif · 105448060–105448077 · motif
· motif · 105448142–105448157 · motif
· motif · 105448835–105448851 · motif
· motif · 105451661–105451670 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：530 aa
FSD1L 蛋白長 530 個胺基酸，含 COS 結構域（第 137–194 位）、fibronectin type-III 結構域（第 196–300 位）及 B30.2/SPRY 結構域（第 300–506 位）。第 322–366 位另註記為無序區。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTTTCACCCTGGCAACCGCGGCGTGACTACGGCGCGCGCG40GTCTGGGCGCGGACGGGTGGGGCCGGGCGGTGCCGGTGCG80GGCTGGGGCAGTGCAGTGAGTAGCGGTCTTGGGGTGTGCG120ATCTCGCTGAGCCTCCTCACACGGTTCGTCGTCTCGGGTT160CGAGCCCAGTGGGCTTAGCCACTCGCCATGGACTCCCAGA200AATACTGCTTTAAGGAGAATGAAAACGTTACAGTTGATAA240AGCCTGTTTTCTGATCTCTAACATCACTATTGGACCAGAG280TCTATTAACTTGCAGCAGGAAGCTCTACAGAGGATCATTT320CAACTCTGGCAAATAAAAATGATGAAATTCAGAACTTTAT360TGATACACTACATCATACACTAAAAGGAGTTCAGGAAAAT400TCGTCCAACATACTCTCAGAGTTAGATGAAGAATTTGATA440GTTTATACTCTATACTGGATGAAGTAAAAGAAAGTATGAT480TAACTGTATCAAGCAGGAACAAGCTCGTAAATCCCAAGAG520TTACAGAGTCAGATTAGTCAATGTAATAATGCCCTGGAGA560ACTCTGAAGAACTATTAGAATTTGCAACAAGGTCATTAGA600TATAAAGGAACCTGAAGAATTTTCAAAGGCTGCCAGACAG640ATCAAGGATAGAGTCACAATGGCTTCAGCCTTTCGCCTTT680CTTTGAAACCAAAGGTCAGTGACAACATGACTCATTTAAT720GGTGGATTTCTCACAGGAAAGACAGATGCTGCAAACTTTG760AAGTTTTTGCCAGTCCCCAAAGCTCCAGAGATAGATCCAG800TAGAGTGTTTGGTGGCAGATAACTCTGTAACAGTGGCTTG840GAGAATGCCAGAAGAAGATAATAAGATTGACCATTTTATA880CTGGAACATAGGAAGACTAATTTTGATGGACTTCCACGTG920TAAAGGATGAGCGATGCTGGGAGATAATTGATAATATTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。