演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FRRS1LCG-6

ferric chelate reductase 1 like

FRRS1L(ferric chelate reductase 1 like)是蛋白質編碼基因,其產物為 glutamate signaling pathway 的重要調節因子,也是 AMPAR 複合體外核心的組成部分。

Homo sapiens9q31.3UniProt Q9P0K9
OFFICIAL SYMBOL
FRRS1L
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q9P0K9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FRRS1L(ferric chelate reductase 1 like)是位於人類第 9 號染色體的蛋白質編碼基因,產物為長 293 個胺基酸的蛋白質。其序列包含 N 端訊號序列、中央的 DOMON 結構域,以及靠近 C 端的跨膜螺旋;另有一段被註記為無序區域。FRRS1L 的蛋白質產物是 AMPAR 複合體外核心的組成成員,並與 glutamate signaling pathway 的調節相關。

Official symbol
FRRS1L
Gene name
ferric chelate reductase 1 like
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1362
UniProt
Q9P0K9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CG-6C9orf4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q31.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegFRRS1Lpq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:109,130,293–109,167,249
Gene span
36,957 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000561981 ★109,130,293–109,167,2495

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FRRS1L 是 glutamate signaling pathway 的重要調節因子。現有功能註記將其定位為訊號路徑的調節者,但未進一步說明其調節的分子步驟或作用方向,因此不宜據此推定更具體的機制。

FRRS1L 也被列為 AMPAR 複合體外核心的組成成員。依據相似性推論,AMPAR 複合體的內核心由四種形成孔道的 GluA/GRIA 蛋白(GRIA1、GRIA2、GRIA3 和 GRIA4)組成,並搭配四個主要輔助次單元,以二重對稱方式排列。內核心有兩組不同的結合位置:其中一組可由 CNIH2、CNIH3、CACNG2 或 CACNG3 占據;另一組則可由 CACNG2、CACNG3、CACNG4、CACNG8 或 GSG1L 占據。

內核心之外,外核心成員會直接結合 GluA/GRIA 蛋白,且結合位置不同於內核心成員。FRRS1L 與 PRRT1、PRRT2、CKAMP44/SHISA9 和 NRN1 同列為外核心成員。內外核心的輔助次單元可作為其他較周邊相關 AMPAR 成分的平台;這些輔助次單元單獨或共同作用時,會調控 AMPAR 複合體的閘控特性與藥理性質,並深刻影響其生合成和蛋白質處理。這些複合體層級的描述屬於相似性推論,並非此處逐項列出的 FRRS1L 特定實驗作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 109167249 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FRRS1L ENST00000561981 GRCh38 chr9:109167149-109168249 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTTTCTGCCTCCATAATTATTTTGTTTATGCAATAAAATAAAATAATAAAATAGGAAAAGCAGGTTAAA
ATGCTGGCTCTGCAACACCAGCCTGAAAGGAATTGCGTCCGCCTCTCTGATGGAAAACAGCTTAGCAATT
CGAATATATCACCCCAACAACCATCATCAAAAGAGAACCCTGGGACCTGCCATAAAGCAAATGCTTGGTG
TGAATCAATGGATGGCTGAGTAAATAGCCAAAAGTGAACTGCAAGCAGCAGGAATGGATTTGAGAAAAAT
CAACAATTCAGCATGGCCCTCAGATACGGTGTGGGCCTTCCAAGGCCTGCGCGTGCTTGCTGCAGGGAAA
GAGAGTAAACCAGAAGCCTAGTTTTGAAGGGGAACAGGTTACCTACTGGCACCAGCCTCTGTTGATTACA
CACCGCAAGAGCCTGGAGAGGAAGCAGGTGAATCCAGTTTTCTCTGTCTCTAAACACCTCAGTTTACCTA
GCTCTATTGTGGGGGTCTTGCAATTTCAAGTTCCTTCTGTGATGATCCAAGAAATAATAGGTCTAGCAAG
TGCTTTATGTAAACCAAAAAGTGCCGGCACAAGGTTGAGGAGGCAGCACTGACCAGGTGTGTCCAGGGTA
AACTCTCTAGAGGAGCGTTTCATAAATTGAACGTGCATTGGGATCTCCTGGGAATTTTGATGAAATGAAC
ATCCCGCTTCATGGGTCTGGAGTGGGGCCTCAGCGATGCTAACAAGCTTCCAGGTGATGCTGATGCTGCC
GGTCCGCGGACCACACTCCGGAGTAGCAAGGGGCCAGAAGGGCCAAATCTGCCTGCGTGGAGGGAAGTCG
GGGAGATGGGGAGAATGGAAAGAAGGACGGTAGAAGGGAAGCTGCTAGGAAGGAGAGATCGGTGCGGGGA
GGAGGGGGGTTCCAAGAAGAAGGGGGAGGCTGCGGTGCTGGAGCGAGGATGCGCAGACCGAGGCAGGGAG
GCGGGGGTGCGGGAGGCTCCGCGGCTGCGCGGGCGCGTGCTGGTGGCCTCGGCGGAGGCTCAGTCCCGGC
CCGCGCCCGCGGCGCCCCCGCTGCGGCCCGAGCGGCCTGGCTGCGGGATCT
FRRS1L 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FRRS1L_1 ↗9:109,167,208負股109,167,198–109,167,257

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_93LBWR · promoter · 109167239–109167498 · regulatory

ENSR9_857MXB · enhancer · 109172012–109172189 · regulatory

· motif · 109164325–109164338 · motif

· motif · 109166520–109166530 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:293 aa

1 aa293 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區
依 Q9P0K9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

FRRS1L 蛋白長 293 個胺基酸。序列註解包含第 1–28 位的訊號序列、第 29–61 位的無序區域、第 119–234 位的 DOMON 結構域,以及第 271–291 位的螺旋型跨膜區段。

訊號胜肽1–28 aa
跨膜區Helical271–291 aa
結構域DOMON119–234 aa
功能區域Disordered29–61 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9P0K9…

AlphaFold · Q9P0K9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Synapse

FRRS1L 的定位註記包括細胞膜與突觸;資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Synapse。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CG-6FRRS1L
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FRRS1L 被列為 AMPAR 複合體外核心成員,並被描述為直接結合 GluA/GRIA 蛋白的外核心成分之一。此複合體組成與輔助次單元的功能描述依相似性推論;來源未提供 FRRS1L 與其他個別蛋白的額外結合細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

FRRS1L 基因變異與發育性及癲癇性腦病變 37(DEE37)相關;來源將此病描述為由影響該基因的變異所致。DEE37 為常染色體隱性遺傳的嚴重疾病,通常在出生後最初數年發病。患者在癲癇發作前發育正常,發作後可出現認知與動作遲緩,並可能有過度動作障礙、手足徐動、痙攣、僵硬、智能障礙、無言語及自主動作受損。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FRRS1L 是 glutamate signaling pathway 的重要調節因子;來源未進一步交代調節的分子步驟、方向或具體作用方式。含實驗來源
證據與來源

Important modulator of glutamate signaling pathway

PMID 27236917 ↗

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交互作用依相似性推論,FRRS1L 是 AMPAR 複合體外核心成員之一;外核心成分直接結合 GluA/GRIA 蛋白,位置不同於內核心成員。內核心含四種形成孔道的 GRIA 蛋白及四個主要輔助次單元,按二重對稱排列;兩組結合位置可由指定的 CNIH、CACNG 或 GSG1L 成員占據。外核心另包括 PRRT1、PRRT2、CKAMP44/SHISA9 與 NRN1。內外核心輔助次單元可作為較周邊 AMPAR 成分的平台,並單獨或共同調控複合體閘控、藥理特性、生合成與蛋白質處理。推論支持
證據與來源

Component of the outer core of AMPAR complex. AMPAR complex consists of an inner core made of 4 pore-forming GluA/GRIA proteins (GRIA1, GRIA2, GRIA3 and GRIA4) and 4 major auxiliary subunits arranged in a twofold symmetry. One of the two pairs of distinct binding sites is occupied either by CNIH2, CNIH3 or CACNG2, CACNG3. The other harbors CACNG2, CACNG3, CACNG4, CACNG8 or GSG1L. This inner core of AMPAR complex is complemented by outer core constituents binding directly to the GluA/GRIA proteins at sites distinct from the interaction sites of the inner core constituents. Outer core constituents include at least PRRT1, PRRT2, CKAMP44/SHISA9, FRRS1L and NRN1. The proteins of the inner and outer core serve as a platform for other, more peripherally associated AMPAR constituents. Alone or in combination, these auxiliary subunits control the gating and pharmacology of the AMPAR complex and profoundly impact their biogenesis and protein processing (By similarity)

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細胞定位FRRS1L 的細胞內定位註記為細胞膜與突觸。推論支持
證據與來源

Cell membrane; Synapse

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疾病關聯影響 FRRS1L 基因的變異與發育性及癲癇性腦病變 37(DEE37)相關。此病為常染色體隱性遺傳的嚴重癲癇性腦病變,於出生後最初數年發病;發作前發育正常,之後認知及動作發展遲緩,可能伴隨過度動作障礙、手足徐動、痙攣、僵硬、智能障礙、無言語與自主動作受損。含實驗來源
證據與來源

Developmental and epileptic encephalopathy 37 DEE37 A form of epileptic encephalopathy, a heterogeneous group of severe early-onset epilepsies characterized by refractory seizures, neurodevelopmental impairment, and poor prognosis. Development is normal prior to seizure onset, after which cognitive and motor delays become apparent. DEE37 is an autosomal recessive, severe form manifesting in the first years of life. Affected individuals show hyperkinetic movement disorder with choreoathetosis, spasticity, rigidity, intellectual disability, absent speech, and impaired volitional movements. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616981

PMID 27236917 ↗ · PMID 27239025 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000561981 · 8,155 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCGGCTGCGCGGGCGCGTGCTGGTGGCCTCGGCGGAGGCT40
41CAGTCCCGGCCCGCGCCCGCGGCGCCCCCGCTGCGGCCCG80
81AGCGGCCTGGCTGCGGGATCTGTGCGCACGGATGGCGCGG120
121CCGCCCCGGCAGCACCCGGGGGTCTGGGCGTCGCTGCTCC160
161TGCTGCTACTGACGGGGCCCGCCGCCTGCGCAGCCAGCCC200
201CGCGGACGACGGTGCGGGCCCGGGGGGCCGGGGACCCCGG240
241GGACGCGCGCGGGGGGACACGGGCGCCGACGAGGCGGTGC280
281CGCGCCACGACTCCTCCTACGGCACCTTCGCGGGGGAGTT320
321CTACGACCTGCGCTACCTGTCGGAGGAGGGTTACCCCTTC360
361CCTACTGCTCCTCCTGTGGATCCATTTGCCAAAATCAAAG400
401TGGACGACTGTGGAAAAACTAAGGGATGCTTTAGATATGG440
441CAAACCAGGCTGTAATGCAGAGACCTGTGACTATTTCCTC480
481AGCTACCGGATGATAGGGGCTGATGTAGAATTTGAGCTGA520
521GTGCAGACACAGATGGTTGGGTAGCAGTTGGATTCTCTTC560
561AGACAAGAAAATGGGTGGTGATGATGTCATGGCCTGCGTC600
601CATGATGACAATGGCAGGGTCCGCATACAGCACTTCTATA640
641ATGTAGGCCAGTGGGCAAAGGAGATTCAGAGAAACCCTGC680
681CAGAGATGAAGAAGGAGTTTTTGAGAACAATCGCGTCACC720
721TGCAGATTTAAACGCCCTGTGAATGTTCCCAGAGATGAAA760
761CAATTGTTGATCTGCATTTGAGTTGGTATTATCTGTTTGC800
801TTGGGGTCCAGCCATTCAGGGCTCTATCACTCGACATGAT840
841ATAGACTCACCGCCGGCTTCAGAGCGTGTTGTCAGTATTT880
881ACAAGTATGAAGACATTTTTATGCCATCAGCTGCCTATCA920
921AACCTTCTCATCTCCATTTTGTTTGCTTCTGATTGTTGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。