演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FRA10AC1C10orf4

FRA10A associated CGG repeat 1

FRA10AC1 是蛋白質編碼基因,其產物可能參與 pre-mRNA 剪接。

Homo sapiens10q23.33UniProt Q70Z53
OFFICIAL SYMBOL
FRA10AC1
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q70Z53
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FRA10AC1(FRA10A associated CGG repeat 1)是位於人類第 10 號染色體的蛋白質編碼基因。現有資料指出,其產物可能參與 pre-mRNA 剪接;此描述保留了可能性,未進一步界定其作用方式或生物學過程。

Official symbol
FRA10AC1
Gene name
FRA10A associated CGG repeat 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1162
UniProt
Q70Z53
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C10orf4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q23.33
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegFRA10AC1pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:93,667,126–93,703,294
Gene span
36,169 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000359204 ★93,667,883–93,702,59214
ENST0000090575493,667,126–93,702,58814
ENST0000090575593,667,126–93,702,59515
ENST0000090575693,667,126–93,703,16514
ENST0000090575793,667,126–93,702,59515
ENST0000090575893,667,126–93,702,59515
ENST0000090575993,667,126–93,702,55613
ENST0000090576093,667,126–93,702,55614
ENST0000090576193,667,126–93,702,59513
ENST0000090576293,667,126–93,702,58815
ENST0000092071993,667,126–93,702,59515
ENST0000092072093,667,126–93,702,5959

顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FRA10AC1 的產物可能參與 pre-mRNA 剪接。現有資料僅支持這項可能的功能,未說明其具體分子作用方式、參與剪接的階段或調控條件,因此不宜據此推定更詳細的機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 93702592 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FRA10AC1 ENST00000359204 GRCh38 chr10:93702492-93703592 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACATTCAGTGCAATGGATAAAGCAGAATGTATCTATAATTTATTGTCAGGGTTAGAGACTTGAACTGAT
AAGGATATCGTTATCTACTGTTTAGGGCAAAAGATGTAAAATGACTGTGCATTAAGTGCCAAGGTTTTCT
CTAAAAAGGGCCCACTGTAAACGCCAGAAGCGTGCCAGTTCAATTCAACAAATATTTAATTAGCACTTGT
GATTTCCAAGGCACCGTTTTGGGTACTGAGGAGGAAGCAAAAAATGAATAGCTGCTAATGCCAGCGAGAG
ACAAGACATGAACCAAACAACTAGAGTGGAAAGAGTGGGGCGTCGTGATGTAGAAAACGCAAAGCACAGG
AAGAACCTAGTGGCGCTTAAAATAATCCAACTTTTCCTGCCTTTTTTCTTCTTCTTTTTAAGATTCTATT
TTGGATCCCTTTTCGCATGTGCCAGGTCGCTTGTCGGCAGAGAATCCTCAACCCTGAGAAATCTCTCCTC
CTATTCTTTCTTTCCTCACAAATTCGATGAGCTCTTCTGCCATCAGCACTGCTTTTGGAATGGTATCTAT
TGTGTGGGTGGCGAAACGATGGAGAGATATTTTTGTTCTAATTATGAGAACTGTTTTACTGGGGGAAGGA
GGGAGAGGCTGATCTGAAGCGCTGATGAGCTGCTCTGAGAGGATCCTCCGAGGAGGCGTTACTAAGGTTA
CTAGAGAGAGGACGGCAGGTGATAGGCACGGTAAAACAAAATATATTTTCAAATGAGAGGCGTGGGCTAA
GCAGCAAGCAGTGCCAGCGGTACTAGATGCCGGATTCCCTAGAGGGGAAAGGAAGGAGGCCCAGGGAAAA
ACTGGGAGCCGCGACTTGGCGAAAGCTGGAAGCCTCTTCGTCCCTTTCCGGGCCGTTTCTCCCGCTGCCC
TTGTTTCCCGGAGCTGTTCTGGCTGTAGCACAAGGTCGGCGCACTCGGGGGACGGTGCCATTTAGATGTA
ACACGTGGCCGTGTCGGACCGGAAGTGGTGCCCAGTCGGGACCCGTAGGGAGAGGCGGGTTGCGGGCGGC
GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTTGTGGCGAGGCTGTGCGGCAGGGC
FRA10AC1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FRA10AC1_2 ↗10:93,702,406負股93,702,396–93,702,455
FRA10AC1_1 ↗10:93,702,562負股93,702,552–93,702,611

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BNL4F · enhancer · 93701602–93702581 · regulatory

ENSR10_93D774 · promoter · 93702582–93703082 · regulatory

· motif · 93702266–93702280 · motif

· motif · 93702402–93702415 · motif

· motif · 93702508–93702525 · motif

· motif · 93702522–93702535 · motif

· motif · 93702537–93702550 · motif

· motif · 93702545–93702560 · motif

· motif · 93702586–93702595 · motif

· motif · 93702586–93702597 · motif

· motif · 93702586–93702597 · motif

· motif · 93702600–93702613 · motif

· motif · 93702604–93702613 · motif

· motif · 93702604–93702613 · motif

· motif · 93702776–93702789 · motif

· motif · 93702776–93702789 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:315 aa

1 aa315 aa功能區域
依 Q70Z53 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein FRA10AC1 長 315 個胺基酸。序列註解指出,胺基酸 1–28 與 226–315 為無序區域;目前提供的特徵資料未列出其他結構域或功能區域。

功能區域Disordered1–28 aa
功能區域Disordered226–315 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q70Z53…

AlphaFold · Q70Z53

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 FRA10AC1 定位於細胞核;未提供定位隨條件改變、異構型差異或動態變化的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C10orf4FRA10AC1CHERPESS2IKKASH5MAP3K12MOB2SF3B2TRIM41
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 FRA10AC1 與 ESS2 互作,但未進一步說明此互作是否代表直接結合、是否同屬某一複合體,或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

FRA10AC1 的變異與 NEDGFC(神經發育障礙伴生長遲滯、異常面容及胼胝體異常)相關;資料將此病描述為常染色體隱性神經發育障礙。患者可有發育遲緩、智能障礙、缺乏語言、頭小症、胼胝體發育不全或缺如、生長遲滯及顱顏異常。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FRA10AC1 可能參與 pre-mRNA 剪接。這項敘述指出的是可能的功能,未提供其作用機制、參與剪接的階段或其他條件,因此不能據此確定更具體的分子角色。含實驗來源
證據與來源

May be involved in pre-mRNA splicing

PMID 34694367 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用資料指出 FRA10AC1 與 ESS2 互作,但未進一步界定互作是否為直接結合、是否涉及特定複合體,或這項互作對細胞功能有何影響;因此僅能保留互作這一層次的描述。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ESS2

PMID 34694367 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位FRA10AC1 的定位資料標示為細胞核。此項資訊未說明定位會否因細胞條件改變,也未提供異構型差異或蛋白質在細胞核內的動態分布情形。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 15203205 ↗ · PMID 34694367 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯FRA10AC1 的變異被列為 NEDGFC 的致病原因。此病為常染色體隱性神經發育障礙,可見發育遲緩、智能障礙、缺乏語言、頭小症、胼胝體發育不全或缺如、生長遲滯及顱顏異常;資料未詳述變異類型。含實驗來源
證據與來源

Neurodevelopmental disorder with growth retardation, dysmorphic facies, and corpus callosum abnormalities NEDGFC An autosomal recessive neurodevelopmental disorder characterized by developmental delay, intellectual disability, and absent speech. Patients have microcephaly, hypoplasia or agenesis of the corpus callosum, growth retardation, and craniofacial dysmorphism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620113

PMID 34694367 ↗ · PMID 35821753 ↗ · PMID 35871492 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000359204 · 3,109 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAAGTGGTGCCCAGTCGGGACCCGTAGGGAGAGGCGGGT40
41TGCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGTTGT80
81GGCGAGGCTGTGCGGCAGGGCGCACGGGACCTGTGCTGCA120
121GCGGCTCTCTCAGGCCGTGGGTCGTCGCTGCAGCTGCCGG160
161GAAAGAAGGAAACGACGACTCCGGGGGCGAACTTGGCACA200
201CAGGGAGGAAGGGAAAGGATGCATGGTCATGGAGGCTATG240
241ATTCTGATTTTAGTGATGATGAACGCTGTGGAGAATCCAG280
281CAAAAGGAAAAAAAGGACAGTTGAAGATGACTTACTGCTC320
321CAAAAACCATTTCAGAAAGAAAAACATGGAAAGGTGGCCC360
361ATAAACAAGTTGCAGCAGAATTGCTGGATAGGGAAGAAGC400
401AAGAAATAGAAGGTTTCATCTCATAGCTATGGATGCTTAT440
441CAAAGACATACAAAGTTCGTAAATGACTATATTTTATACT480
481ATGGTGGCAAAAAAGAAGACTTCAAGCGTTTGGGGGAAAA520
521TGACAAGACAGACTTGGATGTTATACGAGAAAATCATAGA560
561TTCCTATGGAATGAGGAGGACGAAATGGACATGACTTGGG600
601AGAAGAGACTTGCTAAGAAATACTATGATAAATTATTTAA640
641GGAATACTGCATAGCAGATCTCAGTAAATATAAAGAAAAT680
681AAGTTTGGATTTAGGTGGCGAGTAGAAAAAGAAGTAATTT720
721CAGGAAAAGGTCAATTTTTCTGTGGAAATAAATATTGTGA760
761TAAAAAAGAAGGCTTAAAGAGTTGGGAAGTTAATTTTGGT800
801TATATTGAGCATGGTGAGAAGAGAAATGCACTTGTTAAAT840
841TAAGGTTATGCCAAGAATGTTCCATTAAATTAAATTTCCA880
881TCACAGGAGAAAAGAAATCAAGTCAAAAAAAAGAAAAGAT920
921AAAACCAAAAAAGACTGTGAAGAGTCATCACATAAAAAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。