基因總覽
FOXL2(forkhead box L2)是蛋白質編碼基因,其產物為轉錄調控因子,屬於 forkhead box 蛋白家族。蛋白質含有 Fork-head DNA 結合區,並具有兩段被註記為無序的區域。來源指出,FOXL2 對卵巢分化與維持至關重要;其具體轉錄調控作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000648323 ★ | 138,944,224–138,947,137 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FOXL2 是轉錄調控因子,對卵巢分化及其維持具有關鍵作用,也參與抑制體細胞睪丸決定相關的基因程式。依相似性推定,它可藉由轉錄抑制促進 Sertoli 細胞的基因 SOX9,防止卵巢向睪丸方向轉分化;此機制的證據註記為 By similarity,應視為依相似性推定的功能,而非此處列出的直接驗證結果。
在卵巢細胞中,FOXL2 具有促進細胞凋亡的活性。它也參與多種轉錄調控:可抑制 tamoxifen 刺激下由 ESR1 介導的 PTGS2(COX2)轉錄;可調節 CYP19 表現;並依相似性推定,透過內含子中的 SMAD 結合元件參與 SMAD3 依賴的 FST 轉錄。另有來源指出 FOXL2 可轉錄抑制 STAR,但未提供此作用的條件或詳細機制。
細胞受到壓力時,FOXL2 可活化 SIRT1 的轉錄;來源另指出它能活化 OSR2 轉錄,但未進一步限定條件。這些作用顯示 FOXL2 涉及卵巢相關基因表現及細胞反應的調節;現有資料並未提供各轉錄作用間的先後關係或彼此如何整合。
Promoter 與基因調控
>FOXL2 ENST00000648323 GRCh38 chr3:138947037-138948137 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGAAAAAGAGAAGATGCTATATCCACCAGCTACATTTACTCTAATACTTGATGAACATATTACATAACT ATCAGTATAAGTGTGTTTTACCTCGTAAATACAAATCTCACACCTTGTACATGTGCATACCTGTGTTTCT GAGCAGCACACATGCACCTGGTATCTCACCCATCTCAAGGACAGCTCCTCTCCATGACTTCCATATGTGA CCCCTGTGCACACACATACACAGTCCCGCAAAGTCCCGGGCAACAGCCCCGCCTGTGTTAGTGCAATAGC TGAGGGGCATCTACTTGGTGCTGTTAAAGCACACATCCAACCTTCACTCCAACCCCGTAGGATTAGTACA CGGATTCCTGGTTCCTAGATCCACTGGTAACGCAGGGAGAGGCAGAGGTGATTCAGGCGGCGCCCCTGAC GACTATTTCCAGAGATCCTCTCCCCTGCCCCATTCCAGCCCAGTCACTCTGAGAGCGCGAGGGACAGGCC AGGCCGAGGCTTCTTCGTACAGTCACACCCGTTTCTGGGCTGACTTTCCCAAAGCCTCAGAGCAGCTCTC CCCACCCTACCCCGTCCAGCCCCCTCGCCGTCTCGCCCCTCCCCAGCCCCGAGCTAGAAGTTCAGCCTCA AGACGGCAGCAAACGGCAGAGCAAAGGAGTCGTTTTCTTTCACCTGAAAGCCGCGAGGAGGCTTGGAGCG CCTTTCCTCGCTGGGGCCCGAGCTTCCTGGGCTTTGGCCGGGTGCGGGCAGACCCCACCGGGGTCCTCGT CATCTCCCAGCCCAGCCCGCAGAGCGAGTACCGGCAGATTTCAAGGGCGCGTGAGCCTGGCTGTCGGCTG GGCCCCTGAGGCTCGCTGGGCGGGGGCAGGCCGGTCCAGGCTGTGCGGGGCGTTTACAAAAAGTGACTTG GAGATGAACTCGCCCGTGCGCGGCTGGCCGCCCCGCTATAGGGGCGAAGGCGCCTGACGCAAGCGGAACT CGGTGGAGCCCATACGAATCAGAACAGAGCGAGGCTCCTGGCGCACTAGGGACTCCAGGAGGCAGCTCCG CCAGAGACGCGGGTCGTGCTTCGGGAAACCGGGGGGCGGGGGGAGGGGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR3_CHR8T · enhancer · 138942875–138944009 · regulatory
ENSR3_94362R · promoter · 138944010–138944510 · regulatory
ENSR3_537NDS8 · CTCF_binding_site · 138946361–138946382 · regulatory
ENSR3_7B6L8H · promoter · 138947127–138947227 · regulatory
· motif · 138945209–138945224 · motif
· motif · 138945357–138945369 · motif
· motif · 138945366–138945378 · motif
· motif · 138945368–138945375 · motif
· motif · 138945487–138945502 · motif
· motif · 138945495–138945502 · motif
· motif · 138945931–138945947 · motif
· motif · 138945931–138945947 · motif
· motif · 138946363–138946379 · motif
· motif · 138949059–138949069 · motif
在顆粒細胞樣細胞中,氧化壓力或熱休克條件會使 FOXL2 的轉錄本與蛋白質量上升;SIRT1 則會使其下調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:376 aa
FOXL2 蛋白質長 376 個胺基酸。第 54 至 148 位為 Fork-head DNA 結合區;第 1 至 53 位及第 276 至 342 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
FOXL2 與 ESR1、SMAD3、DDX20 及 UBE2I(UBC9)有交互作用;其中與 ESR1、SMAD3 的交互作用註記為依相似性推定。資料未說明這些關係是否形成特定複合體,亦未提供其結合條件。
疾病與遺傳關聯
FOXL2 變異與眼瞼下垂、眼裂狹小及內眥贅皮症候群(BPES)相關。第一型患者除眼瞼異常外,女性可能有原發性閉經或早發性卵巢功能不全;第二型則僅見眼瞼缺陷。poly-Ala 區域為突變熱點,來源指出,開放閱讀框中的突變有 30% 導致 poly-Ala 擴增,且主要造成第二型 BPES。
FOXL2 變異也與早發性卵巢功能不全 3(POF3)相關。此病症指 40 歲前卵巢功能停止,特徵包括月經稀發或閉經、血清促性腺激素升高及雌二醇偏低。來源將這些疾病描述為受 FOXL2 變異影響,未提供足以將所有病例歸因於單一變異的說明。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FOXL2 是轉錄調控因子,對卵巢分化與維持至關重要,並抑制體細胞睪丸決定相關基因程式;依相似性推定,它可抑制促進 Sertoli 細胞的 SOX9,避免卵巢向睪丸轉分化。它在卵巢細胞具促凋亡活性,也調節 ESR1 介導的 PTGS2/COX2、CYP19、SMAD3 依賴的 FST 及 STAR 轉錄;細胞壓力下可活化 SIRT1,並能活化 OSR2 轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional regulator. Critical factor essential for ovary differentiation and maintenance, and repression of the genetic program for somatic testis determination. Prevents trans-differentiation of ovary to testis through transcriptional repression of the Sertoli cell-promoting gene SOX9 (By similarity). Has apoptotic activity in ovarian cells. Suppresses ESR1-mediated transcription of PTGS2/COX2 stimulated by tamoxifen (By similarity). Is a regulator of CYP19 expression (By similarity). Participates in SMAD3-dependent transcription of FST via the intronic SMAD-binding element (By similarity). Is a transcriptional repressor of STAR. Activates SIRT1 transcription under cellular stress conditions. Activates transcription of OSR2 PMID 16153597 ↗ · PMID 19010791 ↗ · PMID 19429596 ↗ · PMID 19744555 ↗ |
| 交互作用 | FOXL2 與 ESR1、SMAD3、DDX20 及 UBE2I(UBC9)有交互作用。其中與 ESR1 及 SMAD3 的交互作用標註為依相似性推定;此資料未說明各互作是否形成特定複合體,也未提供互作條件或功能後果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ESR1 (By similarity). Interacts with SMAD3 (By similarity). Interacts with DDX20. Interacts with UBE2I/UBC9 PMID 16153597 ↗ · PMID 19744555 ↗ |
| 細胞定位 | FOXL2 的細胞內定位為細胞核。此註記未提供定位變化的條件,也未說明不同異構型之間是否有定位差異。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在顆粒細胞樣細胞中,氧化壓力與熱休克條件會使 FOXL2 的轉錄本及蛋白質量上升;SIRT1 則會使 FOXL2 下調。資料未提供變化幅度或其他細胞背景。 | 含實驗來源 | 證據與來源In granulosa-like cells, up-regulated at transcript and protein levels under oxidative stress and heat-shock conditions. Down-regulated by SIRT1 PMID 19010791 ↗ |
| 疾病關聯 | FOXL2 變異與 BPES 相關,患者有眼瞼發育異常、眼裂狹小、眼瞼下垂及內眥下方皮膚皺襞。第一型女性患者另有生育力問題,可因原發性閉經或早發性卵巢功能不全出現卵巢功能不足;第二型僅有眼瞼缺陷。poly-Ala 編碼區是突變熱點,約 30% 的開放閱讀框突變導致 poly-Ala 擴增,且主要與第二型相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Blepharophimosis, ptosis, and epicanthus inversus syndrome BPES A disorder characterized by eyelid dysplasia, small palpebral fissures, drooping eyelids and a skin fold curving in the mediolateral direction, inferior to the inner canthus. In type I BPSE (BPES1) eyelid abnormalities are associated with female infertility. Affected females show an ovarian deficit due to primary amenorrhea or to premature ovarian failure (POF). In type II BPSE (BPES2) affected individuals show only the eyelid defects. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry. There is a mutational hotspot in the region coding for the poly-Ala domain, since 30% of all mutations in the ORF lead to poly-Ala expansions, resulting mainly in BPES type II MIM: 110100 PMID 11175783 ↗ · PMID 11468277 ↗ · PMID 12400065 ↗ · PMID 12529855 ↗ · PMID 12630957 ↗ · PMID 12938087 ↗ · PMID 15257268 ↗ · PMID 16454982 ↗ · PMID 17089161 ↗ · PMID 18372316 ↗ · PMID 18484667 ↗ · PMID 18642388 ↗ · PMID 22159675 ↗ |
| 疾病關聯 | FOXL2 變異與早發性卵巢功能不全 3(POF3)相關。此卵巢疾病指 40 歲前卵巢功能停止,表現包括月經稀發或閉經、血清促性腺激素升高及雌二醇偏低;來源將其描述為受 FOXL2 變異影響。 | 含實驗來源 | 證據與來源Premature ovarian failure 3 POF3 An ovarian disorder defined as the cessation of ovarian function under the age of 40 years. It is characterized by oligomenorrhea or amenorrhea, in the presence of elevated levels of serum gonadotropins and low estradiol. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 608996 PMID 12149404 ↗ · PMID 19429596 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAACAGAGCGAGGCTCCTGGCGCACTAGGGACTCCAGGA40GGCAGCTCCGCCAGAGACGCGGGTCGTGCTTCGGGAAACC80GGGGGGCGGGGGGAGGGGAAGAGCGCAGAAAAGAAAACCC120ACCAAGGCGGGGACTGGCCTGAGCGGGGAGGGGCGGCGAG160GCCGGAGCCCCTCTCTGTTGGGCGGACTCCCCATGGCCAG200AGGCTGAGCTCCACTCCCGCCGGCCGCTCCCTAGGGGAAG240GGGAAGGAGAGGGGAGAGCAGCGACAGGCCTCCAGCAAGC280AAGCGCGGGCGGCATCCGCAGTCTCCAGAAGTTTGAGACT320TGGCCGTAAGCGGACTCGTGCGCCCCAACTCTTTGCCGCG360CCAGCGCCTGGAGCGGAGAGCAGAGGCGGCCCGGCCGCGG400CGCGCCGGCTTTGTCATGATGGCCAGCTACCCCGAGCCCG440AGGACGCGGCGGGGGCCCTGCTGGCCCCAGAGACCGGTCG480CACAGTCAAGGAGCCAGAAGGGCCGCCGCCGAGCCCAGGC520AAGGGCGGTGGGGGTGGCGGCGGGACAGCCCCGGAGAAGC560CGGACCCGGCGCAGAAGCCCCCGTACTCGTACGTGGCGCT600CATCGCCATGGCGATCCGCGAGAGCGCGGAGAAGAGGCTC640ACGCTGTCCGGCATCTACCAGTACATCATCGCGAAGTTCC680CGTTCTACGAGAAGAATAAGAAGGGCTGGCAAAATAGCAT720CCGCCACAACCTCAGCCTCAACGAGTGCTTCATCAAGGTG760CCGCGCGAGGGCGGCGGCGAGCGCAAGGGCAACTACTGGA800CGCTGGACCCGGCCTGCGAAGACATGTTCGAGAAGGGCAA840CTACCGGCGCCGCCGCCGCATGAAGAGGCCCTTCCGGCCG880CCGCCCGCGCACTTCCAGCCCGGCAAGGGGCTCTTCGGGG920CCGGAGGCGCCGCAGGCGGGTGCGGCGTGGCGGGCGCCGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。