基因總覽
FOSL1 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 FOS like 1, AP-1 transcription factor subunit。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q13.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312562 ★ | 65,892,049–65,900,388 | 4 |
| ENST00000448083 | 65,892,049–65,900,549 | 2 |
| ENST00000531493 | 65,892,049–65,900,549 | 3 |
| ENST00000532401 | 65,892,049–65,900,549 | 4 |
| ENST00000913991 | 65,892,049–65,900,549 | 3 |
| ENST00000913992 | 65,892,049–65,900,549 | 4 |
| ENST00000950881 | 65,892,049–65,900,549 | 3 |
| ENST00001137676 | 65,892,049–65,900,549 | 4 |
| ENST00000534222 | 65,893,004–65,900,573 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FOSL1 ENST00000312562 GRCh38 chr11:65900288-65901388 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGATGATACCTGCCTCACATTCACTCACCTTTGACATACTCTCCAAACAAGTCTGGTGGCCACAAGCCTC CGAAAGGCACTGACCGTAATGAAGATGGCGTTTATCAGACCTCAGGACACCTGTAGTGGCCCTGAATTAA AACTCGTTATAGCTCCTGAAATTATCCTGAGTAATACTATTATATTGCATTTTATGTGGGGTTAGTTCAA AGCATTACCTTATCGCAAACATTTAAAATATACCACCCAGCCTGGGCAATACGGCGAGACCCAATCCCTA CAAAAAACACAAAAATTACCTGGGTGTGGTGACGCGCGCCTGTAGTCCCACTTACTTGGAGGGGGCGCTG AGGCAGGAGAATCCCTTTAGCTCAGGAAGTTGAGCCTGCAGTGCGCCGAGATCGAGCCACTGCACTCCAG CCTGGGTGACAGAGACCCGGTCTCAAAAATATAAAGTAAAATAAAATATGCCACCATTTTTGTAACCCTG GTTTGTCATTTATTCACTTTTCATATACTCGAAGCCTTAAAACAAGGCCAGTGGAAAGACCTCACTCCAC GAAGCTTTGGGTGGCGGTTGGCGTGGCTCCTAGAGATGTGATTCTTTCGTGCTATTTTGTGGGAGCAGAA ACGGAGGTTAGCCCAGGCCTCGAGAGGGCTGGGGCGGGGCGCGGGCTCTGGCAGGTGCGTCAGTCCGCAG GGGAACCCGGGGCTCCACCTGGGCGCGGCGAGGAAGTTACACCATGTATGGGCAGCTACGTCAGGGGGGC GGGCCCGCAGCCTCCGGGGAACGCCGAGCCGGGCCCATCCCGGTGAAAAGGCTGCAGCCGGACTTGGGGA GGCGTCGCCAAGTTCGGGACCGACGGGCCAAGGCGGCGCGTCTCGGGGGTGGAGCCTGGAGGTGACCGCG CCGCTGCAACGCCCCCACCCCCCGCGGTCGCAGTGGTTCAGCCCGAGAACTTTTCATTCATAAAAAGAAA AGACTCCGCACGGCGCGGGTGAGTCAGAACCCAGCAGCCGTGTACCCCGCAGAGCCGCCAGCCCCGGGCA TGTTCCGAGACTTCGGGGAACCCGGCCCGAGCTCCGGGAACGGCGGCGGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FOSL1_1 ↗ | 11:65,900,388 | 負股 | 65,900,378–65,900,437 |
| FOSL1_2 ↗ | 11:65,900,613 | 負股 | 65,900,603–65,900,662 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_C8JJR · enhancer · 65895400–65897391 · regulatory
ENSR11_9Z67M · enhancer · 65897575–65897922 · regulatory
ENSR11_C8JK2 · enhancer · 65898655–65900377 · regulatory
ENSR11_5KHHMC · CTCF_binding_site · 65899502–65899523 · regulatory
ENSR11_9Z68G · promoter · 65900378–65900763 · regulatory
ENSR11_BH459 · enhancer · 65900764–65901331 · regulatory
ENSR11_75TLZW · enhancer · 65901454–65901562 · regulatory
ENSR11_BH45G · enhancer · 65901891–65902686 · regulatory
ENSR11_BH45M · enhancer · 65902892–65903833 · regulatory
· motif · 65896319–65896332 · motif
· motif · 65896319–65896332 · motif
· motif · 65899290–65899302 · motif
· motif · 65899293–65899300 · motif
· motif · 65899300–65899309 · motif
· motif · 65899300–65899311 · motif
· motif · 65899385–65899393 · motif
· motif · 65899454–65899463 · motif
· motif · 65899454–65899463 · motif
· motif · 65899486–65899495 · motif
· motif · 65899504–65899520 · motif
· motif · 65899571–65899578 · motif
· motif · 65899639–65899652 · motif
· motif · 65899639–65899652 · motif
· motif · 65899953–65899966 · motif
· motif · 65900180–65900187 · motif
· motif · 65900205–65900218 · motif
· motif · 65900205–65900218 · motif
· motif · 65900278–65900295 · motif
· motif · 65900440–65900457 · motif
· motif · 65900457–65900467 · motif
· motif · 65900463–65900473 · motif
· motif · 65900494–65900504 · motif
· motif · 65900614–65900624 · motif
· motif · 65900635–65900650 · motif
· motif · 65900635–65900650 · motif
· motif · 65900700–65900709 · motif
· motif · 65900719–65900729 · motif
· motif · 65900800–65900817 · motif
· motif · 65902224–65902238 · motif
· motif · 65902224–65902238 · motif
· motif · 65902886–65902895 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:271 aa
FOSL1 蛋白質長 271 個胺基酸,屬於 bZIP family 的 Fos subfamily。其 bZIP domain 位於第 105–168 位胺基酸,包含第 107–127 位的 basic motif 與第 133–161 位的 leucine-zipper 區域。序列另有數段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- ATF2P15336 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ATF4P18848 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BATF3Q9NR55 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC120Q96HB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHATP28329-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB5Q02930-3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FKBP1AQ0VDC6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GCC1Q96CN9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIN2CQ14957 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GSNP06396 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HRASP01112 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSPA2P54652 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JUNP05412 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- JUNBP17275 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- KIF1BO60333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIFC3Q9BVG8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LDOC1O95751 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NME7Q9Y5B8 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- PIN1Q13526 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TAB2Q9NYJ8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- USF1P22415 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FOSL1 被註記具有異源二聚體形式;另與 BAF 多蛋白染色質重塑複合體的次單元 SMARCB1、SMARCD1,以及 ARID1A 和 JUN 有交互作用。上述交互作用均為相似性推定。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | FOSL1 被註記可形成異源二聚體,並與 BAF 多蛋白染色質重塑複合體的次單元 SMARCB1、SMARCD1,以及 ARID1A、JUN 發生交互作用;這些互作資訊均標示為相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Heterodimer (By similarity). Interacts with the BAF multiprotein chromatin-remodeling complex subunits SMARCB1 and SMARCD1 (By similarity). Interacts with ARID1A and JUN (By similarity) |
| 細胞定位 | FOSL1 的細胞內定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAGTCAGAACCCAGCAGCCGTGTACCCCGCAGAGCCGCCA40GCCCCGGGCATGTTCCGAGACTTCGGGGAACCCGGCCCGA80GCTCCGGGAACGGCGGCGGGTACGGCGGCCCCGCGCAGCC120CCCGGCCGCAGCGCAGGCAGCCCAGCAGAAGTTCCACCTG160GTGCCAAGCATCAACACCATGAGTGGCAGTCAGGAGCTGC200AGTGGATGGTACAGCCTCATTTCCTGGGGCCCAGCAGTTA240CCCCAGGCCTCTGACCTACCCTCAGTACAGCCCCCCACAA280CCCCGGCCAGGAGTCATCCGGGCCCTGGGGCCGCCTCCAG320GGGTACGTCGAAGGCCTTGTGAACAGATCAGCCCGGAGGA360AGAGGAGCGCCGCCGAGTAAGGCGCGAGCGGAACAAGCTG400GCTGCGGCCAAGTGCAGGAACCGGAGGAAGGAACTGACCG440ACTTCCTGCAGGCGGAGACTGACAAACTGGAAGATGAGAA480ATCTGGGCTGCAGCGAGAGATTGAGGAGCTGCAGAAGCAG520AAGGAGCGCCTAGAGCTGGTGCTGGAAGCCCACCGACCCA560TCTGCAAAATCCCGGAAGGAGCCAAGGAGGGGGACACAGG600CAGTACCAGTGGCACCAGCAGCCCACCAGCCCCCTGCCGC640CCTGTACCTTGTATCTCCCTTTCCCCAGGGCCTGTGCTTG680AACCTGAGGCACTGCACACCCCCACACTCATGACCACACC720CTCCCTAACTCCTTTCACCCCCAGCCTGGTCTTCACCTAC760CCCAGCACTCCTGAGCCTTGTGCCTCAGCTCATCGCAAGA800GTAGCAGCAGCAGCGGAGACCCATCCTCTGACCCCCTTGG840CTCTCCAACCCTCCTCGCTTTGTGAGGCGCCTGAGCCCTA880CTCCCTGCAGATGCCACCCTAGCCAATGTCTCCTCCCCTT920CCCCCACCGGTCCAGCTGGCCTGGACAGTATCCCACATCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。