演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

FOLH1BPSMAL

folate hydrolase 1B (pseudogene)

FOLH1B 是一個名為 folate hydrolase 1B (pseudogene) 的人類偽基因;現有摘要另列出若干功能與位置註記。

Homo sapiens11q14.3
OFFICIAL SYMBOL
FOLH1B
CHROMOSOME
11
LOCUS TYPE
transcribed_unprocessed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FOLH1B 的正式名稱為 folate hydrolase 1B (pseudogene),基因類型為 pseudogene。這項分類界定了目前可據來源說明的基本性質;現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質、家族歸屬或結構資訊,因此不據此推定它會產生具特定結構或功能的蛋白質。資料庫摘要另有功能與位置註記,但未提供這些註記所依據的實驗細節。

Official symbol
FOLH1B
Gene name
folate hydrolase 1B (pseudogene)
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:13636
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PSMALFOLH2FOLHP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q14.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegFOLH1Bpq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:89,639,237–89,698,599
Gene span
59,363 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000529567 ★89,639,237–89,698,59918

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

資料庫摘要將 FOLH1B 註記為具有 Ac-Asp-Glu 結合活性及 metallocarboxypeptidase 活性,並列出其涉及一項已標記為過時的 glutamate 生合成過程。這些內容是摘要中的功能註記;來源未提供作用機制、實驗系統或因果證據,也未說明這些活性如何與該生物學過程相連,因此不宜據此延伸出更具體的分子作用解釋。

摘要亦將 FOLH1B 註記於 extracellular exosome。來源沒有說明此位置註記的實驗條件或證據細節。由於該基因被分類為 pseudogene,現有資料不足以據此認定其產物、功能機制或細胞位置;上述項目應理解為資料庫所列的註記,而非已由此摘要交代的完整功能描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 89639237 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FOLH1B ENST00000529567 GRCh38 chr11:89638237-89639337 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCAGATCTCAGTTAAAGCATCTCATCCTCAGTGTGGTGTTTCCTGATCCCTCACTCTAATCCAAGTCTT
TCTGTTTTACGCACAGGTGGAATCTTATTTCCATTTGCGTCCAATCATGTATTTTAATATGCATGGATAT
ATGTATATGCATTTGTATGCATGCGATTAAGAACTAGAATAATTAATAATTGGAAAGCTCCATGAAAGCT
GGTTGGGCACTAATTTTGTAACTATTTTATTCCCAGATCCTGTAATTTCTCTAAATAAACCCTGGAATCT
TGCCTTATCTCCTTCAGGTTAAAAGCCAACTGCAAGGTCTAGTGACTGCAGGATCTAGCTATCCATTGTT
TCTGGCCGCCTATGCGTGCACTGGGTGTCTGGCAGAGAGGCTGGGTAAATTGTAGTTTCATTGTAGCTGT
CTGAACTTGGATTTCTCAAGCCTACTTCACTGGAAACACAAACTCTCACAGCATTTTGTTTTAGTTTCAG
AATCAGAGCAAATTAGAAGTCTGAATTTCCTTCAACACTTGGAAATAATTTATGTATTTGAAATATATTC
ATAATTAATTCATTATAAAAATGTATTAAATGCTTATTCTGAGTCAGCAGAGGAAGATAGAAACTTTATG
AAAGTAGAAGGTGGATCTCCTTTTTGCCTTCATTTTCAGAACATCTCATGTATACCCATTAGTTGAAACA
TCAATGTCATTTTATTTTCGTCCTGATTATCTCATAAAACATTTCTTAGAGTAACAGCAATACCTATCAT
TGAAGTTGGATAAAAAATATTTTGCAATTGGTTTGCAACTTAAAAATCTGTTTGCATGACTCTTTTTCAG
TGAAAGTAGGCAAGAGAAATTAAAATTCAGAAATATCTCACCTAATGTCAGAGGTAATATTGATAATTTG
TGTTTTACAAATGATACATACAACAATAATGAAAAATAAGTCCTATCTATAGGCTCATATCTCATGCCTA
TTTTTGGATGTATTTTTCAGGGTGGTTTATAAAATCCTCCAATGAAGCTACTAACATTACTCCAAAGCAT
AATATGAAAGCATTTTTGGATGAATTGAAAGCTGAGAACATCAAGAAGTTC
FOLH1B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

FOLH1B 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000529567 ★transcribed_unprocessed_pseudogene2,135 nt18

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能資料庫摘要註記,FOLH1B 具有 Ac-Asp-Glu 結合活性與 metallocarboxypeptidase 活性,涉及一項已標記為過時的 glutamate 生合成過程,並位於 extracellular exosome;摘要未提供相關實驗條件或作用機制細節。資料庫紀錄
證據與來源

Enables Ac-Asp-Glu binding activity and metallocarboxypeptidase activity. Involved in obsolete glutamate biosynthetic process. Located in extracellular exosome.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000529567 · 2,135 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTGGTTTATAAAATCCTCCAATGAAGCTACTAACATTAC40
41TCCAAAGCATAATATGAAAGCATTTTTGGATGAATTGAAA80
81GCTGAGAACATCAAGAAGTTCTTATATAATTTTACACAGA120
121TACCACATTTAGCAGGAACAGAACAAAACTTTCAGCTTGC160
161AAAGCAAATTCAATCCCAGTGGAAAGAATTTGGCCTGGAT200
201TCTGCTGAGCTAGCTCATTATGATGTCCTGTTGTCCTACC240
241CAAATAAGACACATCCCAACTACATCTCAATAATTAATGA280
281AGATGGAAATGAGATTTTCAACACATCATTATTTGAACCA320
321CCTCCTCCAGGATATGAAAATGTTTCGGATATTGTACCAT360
361CTTTCAGTGCTTTCTCTCCTCAAGGAATGCCAGAGGGTGA400
401TCTAGTGCATGTTAACTATGCACGAACTGAAGACTTCTTT440
441AAATTGGAACGGGACATGAAAATCAATTGCTCTGGGAAAA480
481TTGTAATTGCCAGATATAGGAAAGTTTTCAGAGGAAATAA520
521GGTTAAAAATGCCCAGCTGGCAGGGGCCAAAGGAGTCATT560
561CTCTACTCAGACCCTGCTGACTACTTTGCTCCTGGGGTGA600
601AGTCCTATCCAGACGGTTGGAATCTTCCTGGAGGTGGTGT640
641CCAGCGTGGAAATATCCTAAATCTGAATGGTGCAGGAGAC680
681CCTCTCACACCAGGTTACCCAGCAAATGAATACGCTTATA720
721GGCATGGAATTGCAGAGGCTGTTGGTCTTCCAAGTATTCC760
761TGTTCATCCAGTTGGATACTATGATGCACAGAAGCTCCTA800
801GAAAAAATGGGTGGCTCAGCACCACCAGATAGCAGCTGGA840
841GAGGAAGTCTCAAAGTGTCCTACAATGTTGGACCTGGCTT880
881TACTGGAAACTTTTCTACACAAAAAGTCAAGATGCACATC920
921CACTCTACCAATGAAGTGACGAGAATTTACAATGTGATAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。