基因總覽
FOLH1B 的正式名稱為 folate hydrolase 1B (pseudogene),基因類型為 pseudogene。這項分類界定了目前可據來源說明的基本性質;現有資料未提供其 RNA 或蛋白質產物的性質、家族歸屬或結構資訊,因此不據此推定它會產生具特定結構或功能的蛋白質。資料庫摘要另有功能與位置註記,但未提供這些註記所依據的實驗細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000529567 ★ | 89,639,237–89,698,599 | 18 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
資料庫摘要將 FOLH1B 註記為具有 Ac-Asp-Glu 結合活性及 metallocarboxypeptidase 活性,並列出其涉及一項已標記為過時的 glutamate 生合成過程。這些內容是摘要中的功能註記;來源未提供作用機制、實驗系統或因果證據,也未說明這些活性如何與該生物學過程相連,因此不宜據此延伸出更具體的分子作用解釋。
摘要亦將 FOLH1B 註記於 extracellular exosome。來源沒有說明此位置註記的實驗條件或證據細節。由於該基因被分類為 pseudogene,現有資料不足以據此認定其產物、功能機制或細胞位置;上述項目應理解為資料庫所列的註記,而非已由此摘要交代的完整功能描述。
Promoter 與基因調控
>FOLH1B ENST00000529567 GRCh38 chr11:89638237-89639337 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCAGATCTCAGTTAAAGCATCTCATCCTCAGTGTGGTGTTTCCTGATCCCTCACTCTAATCCAAGTCTT TCTGTTTTACGCACAGGTGGAATCTTATTTCCATTTGCGTCCAATCATGTATTTTAATATGCATGGATAT ATGTATATGCATTTGTATGCATGCGATTAAGAACTAGAATAATTAATAATTGGAAAGCTCCATGAAAGCT GGTTGGGCACTAATTTTGTAACTATTTTATTCCCAGATCCTGTAATTTCTCTAAATAAACCCTGGAATCT TGCCTTATCTCCTTCAGGTTAAAAGCCAACTGCAAGGTCTAGTGACTGCAGGATCTAGCTATCCATTGTT TCTGGCCGCCTATGCGTGCACTGGGTGTCTGGCAGAGAGGCTGGGTAAATTGTAGTTTCATTGTAGCTGT CTGAACTTGGATTTCTCAAGCCTACTTCACTGGAAACACAAACTCTCACAGCATTTTGTTTTAGTTTCAG AATCAGAGCAAATTAGAAGTCTGAATTTCCTTCAACACTTGGAAATAATTTATGTATTTGAAATATATTC ATAATTAATTCATTATAAAAATGTATTAAATGCTTATTCTGAGTCAGCAGAGGAAGATAGAAACTTTATG AAAGTAGAAGGTGGATCTCCTTTTTGCCTTCATTTTCAGAACATCTCATGTATACCCATTAGTTGAAACA TCAATGTCATTTTATTTTCGTCCTGATTATCTCATAAAACATTTCTTAGAGTAACAGCAATACCTATCAT TGAAGTTGGATAAAAAATATTTTGCAATTGGTTTGCAACTTAAAAATCTGTTTGCATGACTCTTTTTCAG TGAAAGTAGGCAAGAGAAATTAAAATTCAGAAATATCTCACCTAATGTCAGAGGTAATATTGATAATTTG TGTTTTACAAATGATACATACAACAATAATGAAAAATAAGTCCTATCTATAGGCTCATATCTCATGCCTA TTTTTGGATGTATTTTTCAGGGTGGTTTATAAAATCCTCCAATGAAGCTACTAACATTACTCCAAAGCAT AATATGAAAGCATTTTTGGATGAATTGAAAGCTGAGAACATCAAGAAGTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
FOLH1B 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000529567 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 2,135 nt | 18 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 資料庫摘要註記,FOLH1B 具有 Ac-Asp-Glu 結合活性與 metallocarboxypeptidase 活性,涉及一項已標記為過時的 glutamate 生合成過程,並位於 extracellular exosome;摘要未提供相關實驗條件或作用機制細節。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Enables Ac-Asp-Glu binding activity and metallocarboxypeptidase activity. Involved in obsolete glutamate biosynthetic process. Located in extracellular exosome. · CC BY 4.0 |
DNA 與 RNA 序列
GGTGGTTTATAAAATCCTCCAATGAAGCTACTAACATTAC40TCCAAAGCATAATATGAAAGCATTTTTGGATGAATTGAAA80GCTGAGAACATCAAGAAGTTCTTATATAATTTTACACAGA120TACCACATTTAGCAGGAACAGAACAAAACTTTCAGCTTGC160AAAGCAAATTCAATCCCAGTGGAAAGAATTTGGCCTGGAT200TCTGCTGAGCTAGCTCATTATGATGTCCTGTTGTCCTACC240CAAATAAGACACATCCCAACTACATCTCAATAATTAATGA280AGATGGAAATGAGATTTTCAACACATCATTATTTGAACCA320CCTCCTCCAGGATATGAAAATGTTTCGGATATTGTACCAT360CTTTCAGTGCTTTCTCTCCTCAAGGAATGCCAGAGGGTGA400TCTAGTGCATGTTAACTATGCACGAACTGAAGACTTCTTT440AAATTGGAACGGGACATGAAAATCAATTGCTCTGGGAAAA480TTGTAATTGCCAGATATAGGAAAGTTTTCAGAGGAAATAA520GGTTAAAAATGCCCAGCTGGCAGGGGCCAAAGGAGTCATT560CTCTACTCAGACCCTGCTGACTACTTTGCTCCTGGGGTGA600AGTCCTATCCAGACGGTTGGAATCTTCCTGGAGGTGGTGT640CCAGCGTGGAAATATCCTAAATCTGAATGGTGCAGGAGAC680CCTCTCACACCAGGTTACCCAGCAAATGAATACGCTTATA720GGCATGGAATTGCAGAGGCTGTTGGTCTTCCAAGTATTCC760TGTTCATCCAGTTGGATACTATGATGCACAGAAGCTCCTA800GAAAAAATGGGTGGCTCAGCACCACCAGATAGCAGCTGGA840GAGGAAGTCTCAAAGTGTCCTACAATGTTGGACCTGGCTT880TACTGGAAACTTTTCTACACAAAAAGTCAAGATGCACATC920CACTCTACCAATGAAGTGACGAGAATTTACAATGTGATAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。