基因總覽
FLACC1 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 flagellum associated containing coiled-coil domains 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2q33.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392257 ★ | 201,288,271–201,357,345 | 15 |
| ENST00000286190 | 201,287,397–201,351,451 | 14 |
| ENST00000405148 | 201,287,397–201,357,378 | 15 |
| ENST00000439709 | 201,287,397–201,357,398 | 15 |
| ENST00001139468 | 201,287,397–201,357,378 | 15 |
| ENST00000415745 | 201,288,356–201,309,249 | 5 |
| ENST00000425488 | 201,309,154–201,348,301 | 5 |
| ENST00000418364 | 201,350,749–201,352,082 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FLACC1 ENST00000392257 GRCh38 chr2:201357245-201358345 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTTGAGTCCAGGAGGTCAAGGCTGCAGTGAGCTATGCATGCAGCCTGCACTGCCACTGCCACTGCACCG CAGCCTGGGTAACAGAGTGAGCTACTGTCTCAAAGGAAAAAAAAATTAATTATGCTTTTATTGAGCTTTT TTATTGTCTGTTTTCTCATTGGTCTCTAAGTTGTATTGAGTATAAGAACTGAGGTATATCCCCACACCTA GCAATAGTGCCTGGCACACAGTAGACAACAAATGTGAAGTTGAGTGAATAGATGAATTTATAACAATATT TTGTAAGCTAGGGGTTGTGACCCACCAGGATCATGAAATCAATCTAGTGGATTATAATCAGCTTTAATTT AAAGAAGAAAAAGAAATAGAAGAGAATAGCAAATAATAAGAGTATTATTTCATGAAATTTTTTTATTACA AAATTTGTAAAATGTATTTCTTATAATGAGTGGCAGTAAAACTAAAATGAAAGCCACTGGGTTGTAATAA GCAAGTACTTTTTTCTATAGTAAGAAAAAGCAGCTTTATTTAAAAAAAAAAATCGGAAAACCTTGTGACT GCAAAAGATTCCTGCCTTGGGGGATTTTTACTTTCACAGATTTCAAAGCCTTAAACTCGAGGGAAAAAAG TGTCTAGAGTTTTAGGTTTCTGTGAGTAGATCACAGAGGAATTAAAAATCCATCACAGATCCTGCCTGGT AACTATTGCCATAGACCAATGAAGCCTAAAAGTGCTGTTGAATTCTATTTCCTCTGAAGATATATCTTAA ACTTTTTTGTCCCATGACTGATGACGAAAGTGGAAATCCAGTGTTAAAAGTATGAATTCTTTGCTGTTGA GGGTGGTCACTGATTTGTGTCTTGGAGAATTTAATTGGCTGTTTCTCCCAACCTTCTCTCTTGAAGAAAA GAGCCCTGAGCCAATGAGGAGCTACTGTTCTGTGTCCATAGCAACAAAATAAACAAACTTTGGCCTGCCA TCTCCCAAGGGCAAACCTCACAACTCAGGCCCAAGTCACAGGAATCTGAATGGTGGGGTGACCTTCTCCT CTAGTTTAATTTCATTGCAATACTGAGAAACTTCAACTGTTTTGTCTTTAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ALS2CR12_1 ↗ | 2:201,357,344 | 負股 | 201,357,334–201,357,393 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_94XWW4 · enhancer · 201357050–201357334 · regulatory
ENSR2_94XWW6 · promoter · 201357335–201357778 · regulatory
ENSR2_94XWWK · enhancer · 201358736–201359052 · regulatory
· motif · 201361543–201361552 · motif
· motif · 201361543–201361552 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:445 aa
FLACC1 產物為 445 個胺基酸的蛋白質。序列註解指出第 26 至 47 位胺基酸構成一段無序區域;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FLACC1 位於細胞質、細胞質顆粒及纖毛/鞭毛等細胞突起。 另有定位註記指出,此蛋白質表現在精子尾部的主段,位置靠近精子頭部。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Cytoplasmic granule;Cell projection, cilium, flagellum。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- STK16O75716 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SULT2B1O00204 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 2 筆來源紀錄
- TCL1AP56279 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TXNDC5Q86UY0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP6V1HQ9UI12 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BLKP51451 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CRKP46108 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DISC1Q9NRI5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- INO80BQ9C086 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LGALS14Q8TCE9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LONRF1Q17RB8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPF31Q8WWY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPG21Q9NZD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSX2BQ16385-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SSX4BO60224 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEPSINQ96N21 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YES1P07947 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | FLACC1 的定位包括細胞質、細胞質顆粒及纖毛或鞭毛等細胞突起;另有註記指出,它表現在精子尾部主段中靠近精子頭部的位置。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasmic granule; Cell projection, cilium, flagellum; Expressed in the principal piece of the sperm tail, nearest the sperm head |
核酸與蛋白質序列
CAACTCAGGCCCAAGTCACAGGAATCTGAATGGTGGGGTG40ACCTTCTCCTCTAGTTTAATTTCATTGCAATACTGAGAAA80CTTCAACTGTTTTGTCTTTAGAAGGGAAATTCATGTTTGT120GCCAGGCCAGCCTTTGTAAAAGCCTTTGATTGGATTCACT160AGAAGTCTGTCTTCCCGCAGTACATATACTGTGAATTTTC200TCCTTCGGCATTTCAACCACTTGGAATGGCCACTAAAGTG240GCTTTTGATCTAAAGTAAACTCTGATTCTGTGTTGATGGG280GAACCATTTCTCTCTAACATGGTGGTTTCTTTAAGATGTT320TGACTTGGGCCACATGAGAATAACAGATCTTTGGGCAGTC360CAAGCAAGAGCCTCCTGATCTAGCAGCCAAGACTCCCCCT400GACCTTTGGCCATGTACCCCAACCCTCTCATCTACTGCAC440CTGCTGGGACCCCTGGAACTTGGGACCACGGAAGCTAATC480AAGACCCCTCAACTACCACGCAAGAACTCCACAGGGAGTT520CCAAGCTAACTCCTCTTGTACCAGCTCCAAAAAATCACAA560TTACCTCCAACCAACAAAACCTGTTGTTTCCCCAAAAATG600AAAATCCATTCAGCAAGGCAAGAAGAGACTAATAAATCAT640TTTATGAAGTGATCAACGTGTCACCTGGCTATCAACTTGT680TCGGAATCGGGAACAGATTTCTGTCACCTTAGGGGATGAG720ATGTTTGATAGGAAAAAGCGGTGGGAATCGGAGATCCCGG760ACAAAGGCAGATTTTCCAGGACCAACATCATTTCTGACCT800AGAAGAGCAAATCTCAGAGCTGACAGCAATAATTGAACAA840ATGAACAGAGACCACCAGTCTGCCCAGAAATTGCTCTCCA880GTGAAATGGATCTCCGCTGTGCTGAGATGAAACAGAACTT920TGAAAACAAGAACAGGGAGCTCAAAGAGGCCCATGAAGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。