基因總覽
FKBPL 的正式名稱為 FKBP prolyl isomerase like,屬於蛋白質編碼基因。來源將其產物描述為可能參與 X 射線反應,並指出它與 Hsp90、p21 的結合和 p21 蛋白穩定性調控相關。現有資料未提供更完整的家族分類或整體結構描述,因此不進一步推定其分子特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375156 ★ | 32,128,707–32,130,288 | 2 |
| ENST00000887777 | 32,128,697–32,130,333 | 2 |
| ENST00000930347 | 32,128,697–32,131,070 | 2 |
| ENST00000930348 | 32,128,697–32,130,682 | 2 |
| ENST00000958763 | 32,128,697–32,130,346 | 2 |
| ENST00001137398 | 32,128,697–32,130,294 | 2 |
| ENST00000930349 | 32,128,707–32,130,294 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FKBPL 產物可能參與細胞對 X 射線的反應;來源未進一步說明此關聯涉及哪些細胞過程或生理結果,因此其作用範圍仍不明確。
資料指出,FKBPL 可藉由結合 Hsp90 與 p21,調節 p21 蛋白的穩定性。這項描述支持 FKBPL 與兩種蛋白質的結合,以及其對 p21 穩定性的調控關係;但未說明穩定性變化的方向、調節步驟或其他分子條件,故不宜延伸推論其具體機制。
Promoter 與基因調控
>FKBPL ENST00000375156 GRCh38 chr6:32130188-32131288 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGGATTACAGGCGTGCGCGATGCCCGGCTTTTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGAGGCGGGAATCTT GCTCTGTCGCCAGGCTGGATTGCAGTGGCACCATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGACTCCCTGGTTCAAG CGATTCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACACGCCACCATGCCCAGCTAACTTTT TGTATTTTTAGTAGAGACGAGATTTCACCATGTTGCCAGGATGGTCTCGATCACCTGACCTCGTGATCCG CCCACCTCAGCCTCCCAGAGTCTCAGTTGCCAAAGCTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAA CCTCCGCTTCCCAGGTAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGGGTAGCTGGGATATAGGCGCCCGCCAT CACGCCGAGCTATTTTTGCATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACT CCTGACCTCAACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCACCTTTTTTTTT TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTGAGACGGAGTCTCTAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAAT GGTGTGATCTCGGCTCACTGCAACGTCTGTCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGTTTCAGCCTTCCGAG TAGTTGGGATTACAGGCGCGCGCCACCATGACCTACTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTCTCA CCATGTTGGCCCACTTTGACTCTTGAGCAGCCTGGCCAGCCCGACCGCGCCAAATTCTGTTCGATTCTGC CTAGTTCGGTTGCTCTGGCCTAGTTCAGTTGCTAAGGCCTGGAGCTTCATGGTTGCGGAGGAAATGATGT CACGTTCAATAGGCGGGCTAACCAGATTCCTCCCTTCTCCCGATTGGCTGCCAGGAATTTGACTAGATTC GGAGTCTCGCGGGCTCCAGGGTTAGTTGTCAGTATCTTTCCCAGTTGTTCCGCCCCCTACCCCCGCCTCC CGCACCGCGCCCCTCTCCGGCTGCCCTCTCCGCGTGGGGCAAGGCTCCGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FKBPL_2 ↗ | 6:32,130,177 | 負股 | 32,130,167–32,130,226 |
| FKBPL_1 ↗ | 6:32,130,285 | 負股 | 32,130,275–32,130,334 |
| FKBPL_3 ↗ | 6:32,130,992 | 負股 | 32,130,982–32,131,041 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:349 aa
FKBPL 蛋白長 349 個胺基酸。其序列註解包含三段 TPR 重複區:TPR 1 位於第 210–243 位、TPR 2 位於第 252–285 位,TPR 3 位於第 286–319 位;另有一段位於第 36–55 位的無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- ANKRD49Q8WVL7 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- CALCOCO2Q13137 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FKBPL 與 CDKN1A/p21、HSP90AB1/Hsp90 共同形成三元複合體。另有資料描述 FKBPL 透過結合 Hsp90 與 p21 調節 p21 蛋白穩定性;此為功能關係的說明,與三者形成複合體的註記相互呼應。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FKBPL 可能參與細胞對 X 射線的反應;此外,它可藉由結合 Hsp90 與 p21,調節 p21 蛋白的穩定性。來源未說明 X 射線反應的具體環節,也未指出穩定性變化的方向。 | 含實驗來源 | 證據與來源May be involved in response to X-ray. Regulates p21 protein stability by binding to Hsp90 and p21 PMID 15664193 ↗ |
| 交互作用 | FKBPL 與 CDKN1A/p21 及 HSP90AB1/Hsp90 共同形成三元複合體;此敘述指出三者構成複合體,但未提供其形成條件或功能結果。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTTAGTTGTCAGTATCTTTCCCAGTTGTTCCGCCCCCTAC40CCCCGCCTCCCGCACCGCGCCCCTCTCCGGCTGCCCTCTC80CGCGTGGGGCAAGGCTCCGAGGGCAGCATTCAGTAGCCAT120TTAGCTTTGGAAGGAGAGGTGATTCGAATGGCCCGGCTCC160TCCTGTCACCATGCTAGGCACTTTGGCCGCGCAGGTGCTG200ACCTGAACCTGGTTCATCCCTTTCTGACCAAAACTGTTCA240CTCACCGTGGAAGGGACTAAGCATCCATATGGAGACGCCA280CCAGTCAATACAATTGGAGAAAAGGACACCTCTCAGCCGC320AACAAGAGTGGGAAAAGAACCTTCGGGAGAACCTTGATTC360AGTTATTCAGATTAGGCAGCAGCCCCGAGACCCTCCTACC400GAAACGCTTGAGCTGGAAGTAAGCCCAGATCCAGCCAGCC440AAATTCTAGAGCATACTCAAGGAGCTGAAAAACTGGTTGC480TGAACTTGAAGGAGACTCTCATAAGTCTCATGGATCAACC520AGTCAGATGCCAGAGGCCCTTCAAGCTTCTGATCTCTGGT560ACTGCCCCGATGGGAGCTTTGTCAAGAAGATCGTAATCCG600TGGCCATGGCTTGGACAAACCCAAACTAGGCTCCTGCTGC640CGGGTACTGGCTTTGGGGTTTCCTTTCGGATCAGGGCCGC680CAGAGGGCTGGACAGAGCTAACTATGGGCGTAGGGCCATG720GAGGGAGGAAACTTGGGGGGAGCTCATAGAGAAATGCTTG760GAGTCCATGTGTCAAGGTGAGGAAGCAGAGCTTCAGCTGC800CTGGGCACTCTGGACCTCCTGTCAGGCTCACACTGGCATC840CTTCACTCAAGGCCGAGACTCCTGGGAGCTGGAGACTAGC880GAGAAGGAAGCCCTGGCCAGGGAAGAACGTGCAAGGGGCA920CAGAACTATTTCGAGCTGGGAACCCTGAAGGAGCTGCCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。