演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FIGNL2

fidgetin like 2

FIGNL2 編碼 AAA ATPase 家族蛋白,能切割微管,並負向調節細胞移動與傷口癒合。

Homo sapiens12q13.13UniProt A6NMB9
OFFICIAL SYMBOL
FIGNL2
CHROMOSOME
12
UNIPROT
A6NMB9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FIGNL2(fidgetin like 2)是蛋白質編碼基因,其產物為 Fidgetin-like protein 2,屬於 AAA ATPase 家族。來源將此蛋白質描述為微管切割酵素,並註記其 ATP 水解反應可將 ATP 與水轉為 ADP、磷酸與氫離子。現有資料未提供更完整的蛋白質結構或家族比較,因此此處僅概述其家族歸屬與基本分子性質;微管切割所涉及的細胞功能另於功能段說明。

Official symbol
FIGNL2
Gene name
fidgetin like 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13287
UniProt
A6NMB9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q13.13
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegFIGNL2pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:51,817,899–51,848,729
Gene span
30,831 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000618634 ★51,817,899–51,848,7182
ENST0000093850551,817,899–51,848,7182
ENST0000094859351,817,899–51,831,8272
ENST0000113530051,817,899–51,848,7292

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FIGNL2 的產物可切割微管,並在細胞移動與傷口癒合中發揮負向調節作用。在移動中的細胞裡,它會作用於前緣的動態微管並將其切斷,因而抑制細胞移動能力。

微管切割也與細胞移動調控中的訊號關係相連:切割會釋放 ARHGEF2,後者活化 RHOA;RHOA 接著透過 focal adhesion kinase 調節 focal adhesion 的周轉,以抑制細胞移動。來源特別指出,這項抑制途徑不同於 F-actin 聚合所介導的方式。

在軸突中,FIGNL2 被描述為軸突再生的負向調節因子;依相似性推論,它可能藉由選擇性切割遠端軸突軸段與生長錐中的動態微管,抑制軸突生長。這項描述具有 By similarity 的證據限制,並非此處可視為已直接證實的機制。另依相似性資料,FIGNL2 也有助於內皮細胞與神經元發育期間形成適當的細胞分枝。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 51848718 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FIGNL2 ENST00000618634 GRCh38 chr12:51848618-51849718 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATGTCTTTGGACACTCTCAGTGGACTAGAGGTCTGGGATTCATCCCTCATCTTTTCTTCCTGCCAGTCAT
CCTGCTTGGCCCAGTGTGACTGCCGCCTTCTGGGCAAGCCCTCCAGTGGAGCCCTCTGTTTAGATCTCAC
ACCCTACACTCCGCTGCCCCCGTCCAGTGCTCGCCCTCCTCCCCCGCAGCCACCCGCTCCCGGAGTGGCA
TCAGCGCAGAGCCGCGGCCTTGCCTGGCGGTGCGTCCTGCCCTCTGCAGCCCGGGAGGGCAGGCGCAGCA
GAGTCCCGCGCGCAGTGGGTTCTCAGCTCACCTGGGGGCGGAGGAAGTGAGCAAGAGTCCTCCAGACTGG
GGCCAGGGGGCCAAGGCAGTCCTGGGAAAGGGGGTCTGGGGCGGCCCGCGGACGGGGCGGGCCCAGGCCG
GCTGCCTTCCCCTTTGCCCTTCGACCCAGGAAGCCGCCCACATCCAGCGGACACGCTCGACGGGCTGGGC
TGCTCAGTCCCGGCCTCGGCCCCGTCCCCATGCCGTCCCCCACCCCTACCCGCCGGCCCGACCCCCACCC
CAACCCCAGCTTCCCGCTCCGACGGCCGGGAGAGGCGGGGCGGACGGGTCTGAGAGTGGCGAAGGACACT
CTCCACACCGAGGGTCACTTGCTCTTTTTTCCCCTCTGTGGCTAATTTATTTTAGAGCCAGGGGCGGGAG
GGGGCGGGGCCAGCCGGGAGGGTGGCAAGGAGGGGCTGGGCGAGCCCAGGGGAGGTGGGGGCGGGGCGGG
GGCGAGGTGGGGGAGGGCGGGGAAGAAGCCGGGGGTGGAGGGGCCAGAGAAGGGGCGGGAGCTGGGGGAA
GAGAGGGGCACTAGGAGAGGGAGGAGCAGGGAAAGGGGAGGGGAGGGAGGGCCTGCGAGGGAGGGCCCTG
GGGGCGGGCGAGGGGAGGCGGGGGTGGGGGTGGGGGTCTTTCCTGCGGGGGGAGCCGGGGCCGCCCCTTG
TCCGGCCACCCCCACTGCCCAGTCCCGCTCCCGCCCGCGGCGGCCGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCGGCTC
CAGGATGGTGAGCGCCACTGCCCCCCAGCCCAGGCCTGTCGCCCCCGGCCC
FIGNL2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_9QKLT · enhancer · 51846277–51846662 · regulatory

ENSR12_5G794Q · CTCF_binding_site · 51847067–51847088 · regulatory

ENSR12_BD9S5 · promoter · 51847663–51848186 · regulatory

ENSR12_BD9S7 · enhancer · 51848187–51848707 · regulatory

ENSR12_9QKMK · promoter · 51848708–51849208 · regulatory

ENSR12_83J6DH · enhancer · 51852817–51853041 · regulatory

· motif · 51847069–51847085 · motif

· motif · 51849271–51849284 · motif

· motif · 51849278–51849291 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:653 aa

1 aa653 aa功能區域
依 A6NMB9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Fidgetin-like protein 2 長 653 個胺基酸,屬於 AAA ATPase 家族。序列註解將第 1–36、86–129 與 216–240 位胺基酸區段標示為無序區;這些區段資訊為資料庫註解,來源未提供其特定功能。

功能區域Disordered1–36 aa
功能區域Disordered86–129 aa
功能區域Disordered216–240 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · A6NMB9…

AlphaFold · A6NMB9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm, cell cortex

FIGNL2 位於細胞核及細胞質的細胞皮質;在移動中的細胞,另定位於細胞前緣。 來源未提供其他定位條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FIGNL2FIGNL2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FIGNL2 產物可切割微管,並負向調節細胞移動與傷口癒合;在移動細胞前緣切割動態微管以抑制移動。切割會釋放 ARHGEF2,進而活化 RHOA,並透過 focal adhesion kinase 調節 focal adhesion 周轉,而非透過 F-actin 聚合抑制移動。依相似性推論,它也可能抑制軸突再生與生長,並有助於內皮細胞及神經元發育時的適當分枝。含實驗來源
證據與來源

Microtubule-severing enzyme that negatively regulates cell migration and wound healing. In migrating cells, targets dynamic microtubules (MTs) at the leading edge and severs them, thereby suppressing motility. Microtubule severing releases ARHGEF2 which activates RHOA, which in turn regulates focal adhesion turnover via focal adhesion kinase, as opposed to F-actin polymerization, to suppress cell motility. Negative regulator of axon regeneration that suppresses axonal growth by selectively severing dynamic MTs in the distal axon shaft and growth cone (By similarity). Contributes to proper cell branching during endothelial and neuronal development (By similarity)

PMID 25756798 ↗ · PMID 36523161 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)推論支持
證據與來源

ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位FIGNL2 的定位包括細胞核、細胞質中的細胞皮質,以及移動細胞的前緣;來源未指出其他條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Cytoplasm, cell cortex; Localizes at the leading edge of migrating cells

PMID 25756798 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000618634 · 4,705 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCCCGCTCCCGCCCGCGGCGGCCGCAGCAGCCGCAGCA40
41GCAGCGGCTCCAGGATGGTGAGCGCCACTGCCCCCCAGCC80
81CAGGCCTGTCGCCCCCGGCCCGCGCCGCCGCCCCGGTCCC120
121CGGGCCGGACGCGCCCCCAGGCCGCGCACACTCACCTAGG160
161ACCCGGCCGTGATGCCGAGCTCTGTTGAAGATGCACTGGA200
201CACCAGAACACGCCCAGCCCCTCAACCAGTGGCCAGAGCA240
241GCACCTGGACGTCTCCTCCACCACCCCGTCGCCGGCCCAC280
281AAGTTGGAGTTGCCCCCTGGGGGTCGCCAACGCTGCCACT320
321ACGCTTGGGCACACGACGACATCTCAGCCCTCACTGCCTC360
361CAACCTCCTAAAGCGCTATGCAGAGAAGTACTCTGGGGTC400
401TTGGATTCTCCCTACGAGCGTCCGGCCCTGGGCGGGTACA440
441GCGACGCCTCCTTCCTCAACGGCGCCAAAGGGGATCCCGA480
481GCCCTGGCCAGGGCCGGAGCCACCCTACCCCTTGGCCTCA520
521CTCCACGAAGGCCTCCCAGGAACCAAATCGGGCGGTGGCG560
561GCGGTTCCGGGGCCCTGGGGGGCTCCCCAGTTTTAGCCGG600
601GAACCTCCCTGAACCCCTCTACGCCGGCAATGCGTGCGGG640
641GGCCCATCGGCGGCGCCCGAGTACGCGGCCGGCTACGGCG680
681GGGGGTACCTGGCGCCGGGTTACTGCGCGCAGACGGGCGC720
721CGCGCTGCCCCCGCCGCCCCCGGCCGCGCTCCTGCAGCCC760
761CCACCGCCTCCGGGGTACGGGCCCTCAGCGCCGCTGTACA800
801ACTATCCCGCAGGGGGCTACGCAGCGCAGCCCGGCTATGG840
841CGCGCTCCCGCCGCCCCCAGGCCCACCCCCGGCCCCCTAC880
881CTGACCCCGGGCCTGCCCGCGCCCACGCCCCTGCCCGCGC920
921CGGCACCGCCCACCGCCTATGGCTTCCCCACGGCCGCGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。