基因總覽
FIGNL2(fidgetin like 2)是蛋白質編碼基因,其產物為 Fidgetin-like protein 2,屬於 AAA ATPase 家族。來源將此蛋白質描述為微管切割酵素,並註記其 ATP 水解反應可將 ATP 與水轉為 ADP、磷酸與氫離子。現有資料未提供更完整的蛋白質結構或家族比較,因此此處僅概述其家族歸屬與基本分子性質;微管切割所涉及的細胞功能另於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000618634 ★ | 51,817,899–51,848,718 | 2 |
| ENST00000938505 | 51,817,899–51,848,718 | 2 |
| ENST00000948593 | 51,817,899–51,831,827 | 2 |
| ENST00001135300 | 51,817,899–51,848,729 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FIGNL2 的產物可切割微管,並在細胞移動與傷口癒合中發揮負向調節作用。在移動中的細胞裡,它會作用於前緣的動態微管並將其切斷,因而抑制細胞移動能力。
微管切割也與細胞移動調控中的訊號關係相連:切割會釋放 ARHGEF2,後者活化 RHOA;RHOA 接著透過 focal adhesion kinase 調節 focal adhesion 的周轉,以抑制細胞移動。來源特別指出,這項抑制途徑不同於 F-actin 聚合所介導的方式。
在軸突中,FIGNL2 被描述為軸突再生的負向調節因子;依相似性推論,它可能藉由選擇性切割遠端軸突軸段與生長錐中的動態微管,抑制軸突生長。這項描述具有 By similarity 的證據限制,並非此處可視為已直接證實的機制。另依相似性資料,FIGNL2 也有助於內皮細胞與神經元發育期間形成適當的細胞分枝。
Promoter 與基因調控
>FIGNL2 ENST00000618634 GRCh38 chr12:51848618-51849718 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATGTCTTTGGACACTCTCAGTGGACTAGAGGTCTGGGATTCATCCCTCATCTTTTCTTCCTGCCAGTCAT CCTGCTTGGCCCAGTGTGACTGCCGCCTTCTGGGCAAGCCCTCCAGTGGAGCCCTCTGTTTAGATCTCAC ACCCTACACTCCGCTGCCCCCGTCCAGTGCTCGCCCTCCTCCCCCGCAGCCACCCGCTCCCGGAGTGGCA TCAGCGCAGAGCCGCGGCCTTGCCTGGCGGTGCGTCCTGCCCTCTGCAGCCCGGGAGGGCAGGCGCAGCA GAGTCCCGCGCGCAGTGGGTTCTCAGCTCACCTGGGGGCGGAGGAAGTGAGCAAGAGTCCTCCAGACTGG GGCCAGGGGGCCAAGGCAGTCCTGGGAAAGGGGGTCTGGGGCGGCCCGCGGACGGGGCGGGCCCAGGCCG GCTGCCTTCCCCTTTGCCCTTCGACCCAGGAAGCCGCCCACATCCAGCGGACACGCTCGACGGGCTGGGC TGCTCAGTCCCGGCCTCGGCCCCGTCCCCATGCCGTCCCCCACCCCTACCCGCCGGCCCGACCCCCACCC CAACCCCAGCTTCCCGCTCCGACGGCCGGGAGAGGCGGGGCGGACGGGTCTGAGAGTGGCGAAGGACACT CTCCACACCGAGGGTCACTTGCTCTTTTTTCCCCTCTGTGGCTAATTTATTTTAGAGCCAGGGGCGGGAG GGGGCGGGGCCAGCCGGGAGGGTGGCAAGGAGGGGCTGGGCGAGCCCAGGGGAGGTGGGGGCGGGGCGGG GGCGAGGTGGGGGAGGGCGGGGAAGAAGCCGGGGGTGGAGGGGCCAGAGAAGGGGCGGGAGCTGGGGGAA GAGAGGGGCACTAGGAGAGGGAGGAGCAGGGAAAGGGGAGGGGAGGGAGGGCCTGCGAGGGAGGGCCCTG GGGGCGGGCGAGGGGAGGCGGGGGTGGGGGTGGGGGTCTTTCCTGCGGGGGGAGCCGGGGCCGCCCCTTG TCCGGCCACCCCCACTGCCCAGTCCCGCTCCCGCCCGCGGCGGCCGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCGGCTC CAGGATGGTGAGCGCCACTGCCCCCCAGCCCAGGCCTGTCGCCCCCGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_9QKLT · enhancer · 51846277–51846662 · regulatory
ENSR12_5G794Q · CTCF_binding_site · 51847067–51847088 · regulatory
ENSR12_BD9S5 · promoter · 51847663–51848186 · regulatory
ENSR12_BD9S7 · enhancer · 51848187–51848707 · regulatory
ENSR12_9QKMK · promoter · 51848708–51849208 · regulatory
ENSR12_83J6DH · enhancer · 51852817–51853041 · regulatory
· motif · 51847069–51847085 · motif
· motif · 51849271–51849284 · motif
· motif · 51849278–51849291 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:653 aa
Fidgetin-like protein 2 長 653 個胺基酸,屬於 AAA ATPase 家族。序列註解將第 1–36、86–129 與 216–240 位胺基酸區段標示為無序區;這些區段資訊為資料庫註解,來源未提供其特定功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FIGNL2 位於細胞核及細胞質的細胞皮質;在移動中的細胞,另定位於細胞前緣。 來源未提供其他定位條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FIGNL2 產物可切割微管,並負向調節細胞移動與傷口癒合;在移動細胞前緣切割動態微管以抑制移動。切割會釋放 ARHGEF2,進而活化 RHOA,並透過 focal adhesion kinase 調節 focal adhesion 周轉,而非透過 F-actin 聚合抑制移動。依相似性推論,它也可能抑制軸突再生與生長,並有助於內皮細胞及神經元發育時的適當分枝。 | 含實驗來源 | 證據與來源Microtubule-severing enzyme that negatively regulates cell migration and wound healing. In migrating cells, targets dynamic microtubules (MTs) at the leading edge and severs them, thereby suppressing motility. Microtubule severing releases ARHGEF2 which activates RHOA, which in turn regulates focal adhesion turnover via focal adhesion kinase, as opposed to F-actin polymerization, to suppress cell motility. Negative regulator of axon regeneration that suppresses axonal growth by selectively severing dynamic MTs in the distal axon shaft and growth cone (By similarity). Contributes to proper cell branching during endothelial and neuronal development (By similarity) PMID 25756798 ↗ · PMID 36523161 ↗ |
| 分子活性 | ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+) | 推論支持 | |
| 細胞定位 | FIGNL2 的定位包括細胞核、細胞質中的細胞皮質,以及移動細胞的前緣;來源未指出其他條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cell cortex; Localizes at the leading edge of migrating cells PMID 25756798 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCGCTCCCGCCCGCGGCGGCCGCAGCAGCCGCAGCA40GCAGCGGCTCCAGGATGGTGAGCGCCACTGCCCCCCAGCC80CAGGCCTGTCGCCCCCGGCCCGCGCCGCCGCCCCGGTCCC120CGGGCCGGACGCGCCCCCAGGCCGCGCACACTCACCTAGG160ACCCGGCCGTGATGCCGAGCTCTGTTGAAGATGCACTGGA200CACCAGAACACGCCCAGCCCCTCAACCAGTGGCCAGAGCA240GCACCTGGACGTCTCCTCCACCACCCCGTCGCCGGCCCAC280AAGTTGGAGTTGCCCCCTGGGGGTCGCCAACGCTGCCACT320ACGCTTGGGCACACGACGACATCTCAGCCCTCACTGCCTC360CAACCTCCTAAAGCGCTATGCAGAGAAGTACTCTGGGGTC400TTGGATTCTCCCTACGAGCGTCCGGCCCTGGGCGGGTACA440GCGACGCCTCCTTCCTCAACGGCGCCAAAGGGGATCCCGA480GCCCTGGCCAGGGCCGGAGCCACCCTACCCCTTGGCCTCA520CTCCACGAAGGCCTCCCAGGAACCAAATCGGGCGGTGGCG560GCGGTTCCGGGGCCCTGGGGGGCTCCCCAGTTTTAGCCGG600GAACCTCCCTGAACCCCTCTACGCCGGCAATGCGTGCGGG640GGCCCATCGGCGGCGCCCGAGTACGCGGCCGGCTACGGCG680GGGGGTACCTGGCGCCGGGTTACTGCGCGCAGACGGGCGC720CGCGCTGCCCCCGCCGCCCCCGGCCGCGCTCCTGCAGCCC760CCACCGCCTCCGGGGTACGGGCCCTCAGCGCCGCTGTACA800ACTATCCCGCAGGGGGCTACGCAGCGCAGCCCGGCTATGG840CGCGCTCCCGCCGCCCCCAGGCCCACCCCCGGCCCCCTAC880CTGACCCCGGGCCTGCCCGCGCCCACGCCCCTGCCCGCGC920CGGCACCGCCCACCGCCTATGGCTTCCCCACGGCCGCGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。