基因總覽
FIGN 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 fidgetin, microtubule severing factor,屬於 AAA ATPase 家族。此蛋白質長 759 個胺基酸,具有多段預測為無序的區域。其基本特性是依賴 ATP 作用於微管,並參與微管排列的調整;細胞週期不同階段可見於特定細胞結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000333129 ★ | 163,602,611–163,736,008 | 3 |
| ENST00000409634 | 163,593,396–163,737,013 | 3 |
| ENST00001079382 | 163,602,611–163,737,013 | 3 |
| ENST00001139199 | 163,602,611–163,737,013 | 3 |
| ENST00000879555 | 163,608,326–163,735,385 | 3 |
| ENST00001114053 | 163,701,656–163,737,013 | 4 |
| ENST00001109973 | 163,730,673–163,737,013 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
fidgetin, microtubule severing factor 是 ATP 依賴性的微管切割蛋白。它能沿微管長度切開微管,並促進微管末端解聚,作用以負端為主。這些活動可能抑制微管從中心體生長,也可能減少微管與中心體的連接;來源以可能性描述這些結果,並未將其表述為必然效應。
切割微管可使細胞內的微管排列迅速重整。微管經成核形成後,若從中心體釋放,便可改變微管組織方式;因此,FIGN 所參與的切割與釋放過程,可能讓細胞調整微管陣列,而非持續維持由中心體連接與生長的狀態。
在有絲分裂期間,微管若從紡錘體兩極釋放,靠近紡錘體極的一端可能因此解聚。這種端部解聚可造成微管向極方向的通量,並帶動染色體朝紡錘體極移動。資料將此描述為微管釋放後可能導致的連續效應,說明微管動態變化與染色體移動之間的關聯;並未提供更廣泛的細胞週期功能或其他作用機制。
Promoter 與基因調控
>FIGN ENST00000333129 GRCh38 chr2:163735908-163737008 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCCTAACGTCTATGCCTGCGCACCAGCCGCCGACACCAGGGCCCCCCGGGCGCTGCTTTCTCCAGCCCG AGCCGCCTGGGGGAGGTAGGGAGGGGAGCCAGGGAGCGCGAGAGGGGACCGCACACCTAGACACTTAGGA TTTTATTTATTCACAGGGAGGCGGGGGAGGGGAACTGGGCGAACGCGAATTTTCTCCCCGAAGTTGCCTC TTCTAAGCAGATCAAGTCGTTTTCTGGCTGGTGCTGGGGGCCCCGGGGAGGGTGCCGGTGAGGTCCAGGC TCTCGAGACCAGATCCCGTCCCGTGCGCAGAGGGGGTGGGGAAGGGCGGACGGGCCGCAGCTGTCGAGAG GGCCGGGAACCGGCAGGGAAGAGCCCGCGGGCCGGGGAGCAGCGCGGCTCTGTCCCGGGCCCTCCAACGC AGGCCGGGGAGCGCAGGGGCCGGCTGGTCACGCGTGGGAAAGAAAGCCCCCTTCCCCCTACGGCGCTGCT CCCCTTTCCCCAGGCTGGGCCGCCAGAGAGTGCGTGCAGGGAGAGCTGCGAGTCCCCGCGCGCGTAATCA TGACCTCGGGGCCCCCTCCGGGCCGCGTGAGCGCATCGGCGAGGCTGGGCGGCCGCCGCGGCCCCGGCCG TGTAACATGACCCGAGCGGCCGGCCGGCCGGCGCGGCGCGGCCATTGAGCCCTCCCTGCCCATGAATCTC TGGCGCGTCTCTAGCTCGCTCGCCGGCTCGCCTCCCGCCTCCCTTTCTCCCCCTCCAGCTCCGCGGGCTC CGTGCGCCTCTCCCTCTCCCTCCTGGTCCTCCCGCTGCCCGTCTCTCTCCACTGCCCGCCTCTCGCCACT GCCTCCCGTCTTCTCTCCCTCACGGCAGCCTCCGTCTCTTTCTCCCTCTCTCCTTTGAAAACTGATCTTT GGCTCTTAGTGTGAAAGTGATTTGAATTTGGCTCTGCGGCGCTCTGCGCCTGCGCCCAGCCTCTGGCATG CTGGCTCCTTCCAAGCAGCTGTTTTGGGTTTGAAATTCCAACATGGCAGAGGCTGCAGTCCGTCTTCCCT TCAAAAACTTGGAATGATTTCAAATCATAGGCACCTTCACTTAACCCTAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FIGN_1 ↗ | 2:163,736,003 | 負股 | 163,735,993–163,736,052 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_86RZCS · enhancer · 163732802–163733028 · regulatory
ENSR2_B37HCB · enhancer · 163733358–163734018 · regulatory
ENSR2_CL8N9 · enhancer · 163734661–163735997 · regulatory
ENSR2_94DZPD · promoter · 163735998–163736502 · regulatory
· motif · 163734665–163734678 · motif
· motif · 163735610–163735624 · motif
· motif · 163735610–163735624 · motif
· motif · 163736043–163736054 · motif
· motif · 163736043–163736054 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:759 aa
fidgetin, microtubule severing factor 長 759 個胺基酸,屬於 AAA ATPase 家族。序列註解指出第 89–111、196–237、258–290 與 339–457 位胺基酸區段為無序區域;這些區域是序列特徵註解,來源未進一步說明其個別功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FIGN 蛋白位於細胞核基質,以及細胞質中的細胞骨架、微管組織中心與中心體。 其定位會隨有絲分裂階段改變:整個有絲分裂期間可見於中心體,末期則位於紡錘體中區。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CHERPQ8IWX8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FIGN 與 AKAP8 有交互作用,涉及 FIGN 的 C 端。來源未進一步說明此互作是否形成特定複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 此蛋白質依賴 ATP 切割微管,作用可沿微管進行,並促進末端解聚,以負端為主;這可能抑制微管從中心體生長或與中心體連接。微管切割可能加速細胞內微管排列重整,並使成核後的微管自中心體釋放。若微管從有絲分裂紡錘體極釋放,靠近極端的解聚可能造成微管向極方向通量,並帶動染色體朝紡錘體極移動。 | 含實驗來源 | 證據與來源ATP-dependent microtubule severing protein. Severs microtubules along their length and depolymerizes their ends, primarily the minus-end, that may lead to the suppression of microtubule growth from and attachment to centrosomes. Microtubule severing may promote rapid reorganization of cellular microtubule arrays and the release of microtubules from the centrosome following nucleation. Microtubule release from the mitotic spindle poles may allow depolymerization of the microtubule end proximal to the spindle pole, leading to poleward microtubule flux and poleward motion of chromosome PMID 22672901 ↗ |
| 交互作用 | FIGN 與 AKAP8 有交互作用,涉及 FIGN 的 C 端;來源未說明此互作的功能後果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | FIGN 位於細胞核基質,以及細胞質中的細胞骨架、微管組織中心與中心體。有絲分裂期間可定位於中心體;到了末期,則位於紡錘體中區。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus matrix; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Localizes to centrosomes throughout mitosis and to the spindle midzone during telophase PMID 22672901 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTTTTGGGTTTGAAATTCCAACATGGCAGAGGCTGCAGTC40CGTCTTCCCTTCAAAAACTTGGAATGATTTCAAATCATAG80GCACCTTCACTTAACCCTAGCTTCCATTCATCAGCAAACA120CATCGGATCGATGCTACGCTAACCTATCGGGTTCTCTCTC160CGCGCGTTCAGGTTAAATGAATACCTGACGAAAGGGCCCA200CGTTTCAAGGCAGTGACATTTGATAGCTGAGAGGAAAAGT240GGCTTTAATGAAAAGCAACCTTTGGAATTCCTGCTTGTGA280GAAATCCAATTCAGCTTTTTGTGCTGCCAGCAAGAAATGA320TCAGTAGCACCAGTGTTTATGGCTTGAAGATGCAGTGGAC360GCCAGAGCATGCCCAGTGGCCAGAACAGCACTTTGACATC400ACCTCAACCACTCGGTCTCCTGCCCACAAAGTTGAAGCCT440ACAGAGGTCATCTGCAGCGCACCTATCAGTACGCCTGGGC480GAATGATGACATATCTGCTCTGACTGCATCCAACCTACTA520AAAAAATATGCAGAGAAGTATTCCGGCATTTTGGAAGGTC560CTGTGGACCGACCCGTACTCAGCAACTATTCGGACACACC600ATCAGGACTAGTGAACGGTCGGAAAAATGAAAGTGAACCC640TGGCAGCCTTCCTTGAATTCAGAAGCTGTTTATCCCATGA680ACTGTGTTCCGGATGTTATCACTGCCAGCAAAGCTGGAGT720CAGTTCAGCCCTCCCTCCAGCAGATGTCTCTGCGAGTATA760GGAAGCTCTCCTGGGGTAGCCAGCAACCTGACAGAACCTA800GTTATTCAAGTAGTACCTGTGGAAGCCACACTGTACCCAG840TCTTCATGCAGGGCTCCCATCTCAGGAATATGCCCCAGGA880TACAACGGATCATATTTGCATTCTACTTATAGTAGCCAGC920CAGCACCTGCACTTCCTTCACCTCATCCGTCTCCTTTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。