演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FEZF2FLJ10142

FEZ family zinc finger 2

FEZF2 編碼 FEZ family zinc finger 2,是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族的轉錄抑制因子,與皮質脊髓運動神經元及其他皮質下投射神經元的指定有關。

Homo sapiens3p14.2UniProt Q8TBJ5
OFFICIAL SYMBOL
FEZF2
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q8TBJ5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FEZF2 是位於人類第 3 號染色體、屬於蛋白質編碼基因的基因,其產物 FEZ family zinc finger 2 長 459 個胺基酸,歸屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質含有六個 C2H2 型鋅指,並帶有 Engrailed homology 1 repressor motif;其 N 端另有一段預測為無序的區域。這些特徵構成其蛋白質基本輪廓。來源將 FEZF2 產物描述為轉錄抑制因子,並指出它與特定神經元類型的形成及神經投射發育相關;具體生物學作用與證據限制見功能說明。

Official symbol
FEZF2
Gene name
FEZ family zinc finger 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13506
UniProt
Q8TBJ5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ10142FKSG36TOFFEZLZfp312ZNF312

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33p14.2
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegFEZF2pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:62,369,672–62,374,473
Gene span
4,802 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000283268 ★62,369,681–62,373,5505
ENST0000048681162,369,672–62,374,4736
ENST0000047583962,369,672–62,373,0764
ENST0000095199362,369,672–62,374,4736
ENST0000114041762,369,672–62,373,5575

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FEZF2 的產物被描述為轉錄抑制因子,並且是皮質脊髓運動神經元及其他皮質下投射神經元得以指定所必需的因子。這表示它與神經元身分的建立相關;現有資料未進一步交代其直接調控的基因或分子作用步驟,因此不宜由此延伸出特定下游機制。

在神經投射的發育方面,FEZF2 可能參與皮質下投射的層次特異性與神經元亞型特異性模式建立,也可能參與軸突束集。這些描述以「可能」限定,指出其與投射路徑組織的關聯,但未將相關作用表述為已確定的機制。

此外,FEZF2 會控制大型第五層錐體神經元的樹突分枝與樹突棘發育。這項作用涉及神經元樹突結構的形成;來源沒有提供具體實驗條件或調控途徑,故可支持的結論限於其對這些發育過程的控制。

資料亦指出 FEZF2 可能參與先天免疫,但此項註記標為 By similarity,屬於相似性推論,不能視為已在此處列出直接驗證的功能。整體而言,來源支持的主要角色集中於神經元身分指定、皮質下投射模式與神經元形態發育,免疫相關功能則保留推論性質。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 62373550 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FEZF2 ENST00000283268 GRCh38 chr3:62373450-62374550 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCTCCCTCTCCTCTCTGATAATCCTTCTCTTTATTTTAGAAAAACACAAAACCCGGTTCCACGCGGTGC
TTTAGTGGCTAAAAGTGAAAGAGCTGCCTTGGCAGAATTCAGCTCTATGAATCACTTCGGAAAATTGGTT
CGACTGAATGGCCTTAGGAGGAAAAACGTTTTAATAGGATCCAGGGGGAGGTTCTGCTGTTTCAATCTGC
TCCTTAAACAGGTGGAGATGGGACCTTCTCAATTATACAAACAGTAAGTACCCATCAGCTGGGAGAGCTG
CCCTCCGAATCCTCCCCGCACGCAGCCCTAAACCAGAAGCAGAACTCGGCTTTGCCTCAGAAACCCGATC
ATAAATCAACAATTCTGATCTATTAGGATCTCCGAAAGTCTTCCAGCTCTCGGTTTAGTCTCCCCCAGCC
TCAGACCCAGAGCTGGCCATAAAGCTGGAGGCGCACCTGCGCGGCGCCGAGGCCCCCGAGATGCCGGCGA
GCGGCCTTGCTCTCCGTGACGCTTCGGGGTCGTCCTTAGTCAGTGGGAGCTTTCTCCCGACCTCCGACGC
CAGCCAAGGCGAGCTCATTGCTTTTGCATAAATTAATATTTCCCCATTAACAAGTTCCCCCCTCCAAACG
CGGCGCCCGCGTCCATGCGCCACATCCTAATGAGGTAATTATCATTTGCGCGTGTTCGGGGCTGGCGCCG
GTTCCGTGGGTAAATGGCAGTTTATTAGCACGATGCCCAGCTCGGCTGCGGAGGGCTAAGGGATACTTCG
GCTACTAGACTGATACCCAGGGGCCCTTTGGGGGCGCCGCGTCCGGGACCCTCCGCCCTCCCCGCGTCCC
CCAAACCTGCAGGCCTCCAAAGTTGTGAATCACGCACGGAACTCTGCCTAGGTTTGGGTTTGGGTCCCCC
CCCCCCTTTCCTTCCACCGGCAAAACCATCACGATTCCTCCCCCTCCCCCTCCCGTCTCTTCCCTCTTTC
CCTATTCGCAAACCGCTCGCACTTTCCCGAGAGGAGCGCGGGCGCCAGTTGCCTCCTTTTAAAGTTTGAG
GGGCGGTGGTGGCGGCGGCCGGCAGGCGCGGGGGAACACAGGGGCCGCTAC
FEZF2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FEZF2_2 ↗3:62,373,075負股62,373,065–62,373,124
FEZF2_1 ↗3:62,373,550負股62,373,540–62,373,599

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR3_9WQDL · enhancer · 62368783–62369276 · regulatory

ENSR3_5JN49S · CTCF_binding_site · 62369087–62369108 · regulatory

ENSR3_9WQDP · promoter · 62369277–62369564 · regulatory

ENSR3_9WQF6 · enhancer · 62370901–62371239 · regulatory

ENSR3_75N2Q2 · promoter · 62373005–62373105 · regulatory

ENSR3_9WQFT · enhancer · 62373238–62373539 · regulatory

ENSR3_75N2QM · promoter · 62373540–62373640 · regulatory

ENSR3_83SHWB · promoter · 62374314–62374533 · regulatory

ENSR3_9WQG8 · enhancer · 62374538–62374936 · regulatory

ENSR3_9WQGZ · enhancer · 62377107–62377536 · regulatory

ENSR3_BGD8N · enhancer · 62378318–62378892 · regulatory

· motif · 62369089–62369105 · motif

· motif · 62372393–62372406 · motif

· motif · 62372408–62372421 · motif

· motif · 62374224–62374238 · motif

· motif · 62374230–62374244 · motif

· motif · 62376436–62376450 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:459 aa

1 aa459 aa功能區域基序鋅指
依 Q8TBJ5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

FEZ family zinc finger 2 長 459 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列含六個 C2H2 型鋅指,位置約在第 277–440 個胺基酸;第 27–42 位有 Engrailed homology 1 repressor motif。第 1–22 位則被註記為無序區域。

鋅指C2H2-type 1277–299 aa
鋅指C2H2-type 2305–327 aa
鋅指C2H2-type 3333–355 aa
鋅指C2H2-type 4361–383 aa
鋅指C2H2-type 5389–411 aa
鋅指C2H2-type 6417–440 aa
功能區域Disordered1–22 aa
基序Engrailed homology 1 repressor27–42 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8TBJ5…

AlphaFold · Q8TBJ5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

FEZ family zinc finger 2 的定位資料為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也未區分不同異構型。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ10142FEZF2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FEZF2 是轉錄抑制因子,為皮質脊髓運動神經元及其他皮質下投射神經元的指定所必需。它可能參與皮質下投射的層次與神經元亞型特異性模式建立,以及軸突束集;並控制大型第五層錐體神經元的樹突分枝與樹突棘發育。其參與先天免疫的可能性標註為 By similarity,屬相似性推論。推論支持
證據與來源

Transcription repressor. Required for the specification of corticospinal motor neurons and other subcerebral projection neurons. May play a role in layer and neuronal subtype-specific patterning of subcortical projections and axonal fasciculation. Controls the development of dendritic arborization and spines of large layer V pyramidal neurons. May be involved in innate immunity (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位FEZ family zinc finger 2 的定位資料指出其位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000283268 · 2,112 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTTCCCGAGAGGAGCGCGGGCGCCAGTTGCCTCCTTTT40
41AAAGTTTGAGGGGCGGTGGTGGCGGCGGCCGGCAGGCGCG80
81GGGGAACACAGGGGCCGCTACGGGAGCCGCGCCGCCGCCC120
121ATGTCATTCCACTTCAAGTGACTTCATGTGATGTCAGCTG160
161AATGTAAAAGACAGTGATCTCACGCGGAGGGGAAGATGTT200
201TGCCATCAAAATGTGACAGAAGAGACACGCTGCATGGCTC240
241GGAACGCATCTCCTTGGTGGTGGGGGAAAGAGACTTAGAG280
281GAGAGAGGCTGCGCCCTGGCCCAGCCTGGCTCGGCTCAGC320
321TCCGCGCGCCATGGCAAGCTCGGCTTCCCTGGAGACCATG360
361GTGCCCCCGGCCTGCCCGCGCGCCGGAGCGTCGCCGGCCA400
401CTTCCAAGACACTGGCCTTTTCCATCGAGCGCATCATGGC440
441CAAGACGTCGGAGCCCCGTGCGCCCTTTGAGCCCCGGCCT480
481GGAGCGCTAGAGGCGGACGGCAGCCAGGGCAAGAAACTGC520
521TCAACCTCTGCTCGCCGCTGCCCTGTATGATCCCCCTCCA560
561GCCCCTAGGCTACGAGGTGCCGTCAAAGACACTGCTCAGT600
601TACTCGGAGCTCTGGAAAAGCAGCCTCCGGGCGGGCGGCG640
641GCGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGGGG680
681GGCCCCAGTGTGCGGCGCCAGCGGCTTGTGCAAAACCAAC720
721TGTGGCGTGTGCTGCAAGGCCGAGCTGGGCCTGGCGCCGT760
761CCGCGCTGCCCGCGGGCAGGGTCATCAAGCCGCAGGTCAT800
801CAACCAGGCTGTGGGGCTGCCGGCCAGCGGCTCGCTCTAC840
841TACTTCAACTACCTGGACTCGACCGCGTACCCGCCGTCTG880
881AGCTCCTCAGCGGCCACCTCTTCCCGTCTGGCCTCCTCAA920
921TGCGCAGGCCCCCGCCGCCCTGGCTGCTCACCCCAAGCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。