基因總覽
FCMR 是蛋白質編碼基因，其產物 Fc mu receptor 為 IgM 的高親和力 Fc 受體，可辨識分泌型及膜結合型 IgM。蛋白質具有細胞外區段、單次跨膜區段與細胞質區段；細胞外區含 Ig-like domain，構成其與 IgM 互動的部分。這些特徵使 Fc mu receptor 能在細胞表面及胞內膜系統中參與 IgM 的處理。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367091 ★ | 206,903,317–206,921,941 | 8 |
| ENST00000442471 | 206,903,267–206,922,009 | 7 |
| ENST00000628511 | 206,903,267–206,922,009 | 7 |
| ENST00000910307 | 206,903,267–206,922,009 | 7 |
| ENST00000910308 | 206,903,267–206,922,009 | 8 |
| ENST00000964736 | 206,903,267–206,922,009 | 8 |
| ENST00001007977 | 206,903,267–206,922,009 | 6 |
| ENST00001142873 | 206,903,267–206,922,009 | 8 |
| ENST00000525793 | 206,912,963–206,923,196 | 4 |
| ENST00000529560 | 206,912,973–206,923,247 | 4 |
| ENST00001129883 | 206,913,382–206,923,191 | 3 |
| ENST00000530505 | 206,913,801–206,921,997 | 3 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Fc mu receptor 是辨識 IgM 的高親和力受體，作用對象包括分泌型與膜結合型 IgM。它主要調節 IgM 的運輸與穩態，並將受體辨識與免疫細胞中的 IgM 處理及效應功能連結起來。
在淋巴細胞中，Fc mu receptor 可促進膜結合型 IgM 出現在細胞表面，也能使 IgM－抗原複合體經內吞送往溶酶體降解。於黏膜上皮，受體則介導 IgM－抗原複合體經黏膜 M 細胞逆向跨胞運輸，送往黏膜淋巴組織中的抗原呈現細胞。這些不同方向的運輸作用，分別涉及細胞內 IgM 處理及黏膜抗原傳遞。
Fc mu receptor 也會觸發共同刺激訊號，並介導多數與 B 細胞發育及感染初級免疫反應相關的 IgM 效應功能。它參與對 T 細胞依賴性及非依賴性抗原的抗體反應，並促進有效中和性 IgG 反應的誘發。受體與抗原受體訊號之間的交互作用涉及非典型 NF-kappa-B、MAP kinases 與 calcium signaling pathways。
此外，Fc mu receptor 可能限制 IgM BCR 對自身抗原的持續性基礎訊號，從而有助於骨髓中自體反應性 B 細胞的適當負向選擇，並維持周邊淋巴器官中的調節性 B 細胞族群。此處來源以可能性描述其作用，並未將其表述為確定機制。
Promoter 與基因調控
>FCMR ENST00000367091 GRCh38 chr1:206921841-206922941 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGGTGGGCAGGGTAGGGGCAATCCCTACTTTATCAAGGAAAAAACCGAGGCCCAGGGAAATTTGCCCAA AGCTAGAAAGTGCCAAGCCAGTACAAGACCTGAGGTCTTCTGACTTGCATCCAAAACTCTTCCCAAGATG CCCTGTGGCCTCAGCATCTCTCTCCATCAGTCATGGGCCTTACCCTTGGGCCCTTGGGGTCCTGAAGGAG AGCTCTACCAGGGTGCTGTGACTTCAGGCAAAGTGGCTGCATGACCTGTCACACCCCAGTTCTGGCATTG CCTTGGTGGTCACTGGACAGAGGCCTGAGCCCTTGCCACAGGGCAGCACCTTGTGGGGACACTTTGGGGA GATTAAGGGTGAAGGTTGGCTGAGGTGCTGGGGAGCTATGTGAAGTCCTCAGGAACTGTGTTCTGCAGGA GGGAATGGCAGGGATCATCTAGTCCCAGCTTCGTTTATTTCCTAGATGAAGAAATTCAGGCTCAGAGAAA AGTAATGGATTGCTCAAAGTCCTTAGTTAGTACCCCCACATAGAAGGTGCTCAAAAACTATTGTAAAGGT GAGTTAACTGGTGACTGGTAAGGACTACAGTCAGCATCTTCTGACTTCAGGCCCAAGCGTCTGCCCATAC AGCCTTTCTCAGGCAGGGAAAATTGGTGATAAGGCTCTTTTATCCTGAAGGCAGAATGAAAGCAAATGAC CCCAGCACGGAAGCCAATGAGTATACATAAAGCACGGGAGGCCCTGCTAAGAAAAAGCACCAAGACAAAG GAATATCAGGCCTGGTCACTGCTAATAGTCTGGAGGAACTTCTTAGATGCCTTTTGAACAGGGTGACCCT TTCTTACTCCACACAACATGTTTTCTCAGCTCCTGACTTCCGCTGTGGTTTGTCAGCACTCTCTTTTTAG CCTGAGAATAGTTAGCAAACAAGGGAGGTTGTCATTTCCTCATCGTCAAGCTTTGTTCCTCGTGGGGGCT AGAAATCTCTTTCCAGTTCCAGATTGTGAAGGGTTCCTGAGTAAGCAGCGTGTCTCCATCCCCCTCTCTA GGGGCTCTTGGATGGACCTTGCACTCTAGAAGGGACAATGGACTTCTGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FCMR_1 ↗ | 1:206,921,941 | 負股 | 206,921,931–206,921,990 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9535J6 · enhancer · 206921479–206921856 · regulatory
ENSR1_B3J3QM · promoter · 206921857–206922488 · regulatory
ENSR1_DD978 · enhancer · 206923489–206925837 · regulatory
ENSR1_53RN53P · CTCF_binding_site · 206925553–206925574 · regulatory
· motif · 206919545–206919557 · motif
· motif · 206920749–206920762 · motif
· motif · 206920795–206920806 · motif
· motif · 206921284–206921296 · motif
· motif · 206921307–206921319 · motif
· motif · 206921550–206921562 · motif
· motif · 206921584–206921596 · motif
· motif · 206921696–206921711 · motif
· motif · 206921788–206921803 · motif
· motif · 206921819–206921830 · motif
· motif · 206921821–206921830 · motif
· motif · 206921866–206921880 · motif
· motif · 206921866–206921881 · motif
· motif · 206921866–206921881 · motif
· motif · 206921886–206921899 · motif
· motif · 206921886–206921899 · motif
· motif · 206921988–206921999 · motif
· motif · 206922051–206922059 · motif
· motif · 206922056–206922067 · motif
· motif · 206922058–206922067 · motif
· motif · 206922580–206922593 · motif
· motif · 206922677–206922690 · motif
· motif · 206922680–206922693 · motif
· motif · 206922790–206922803 · motif
· motif · 206923073–206923080 · motif
· motif · 206923212–206923225 · motif
· motif · 206923217–206923239 · motif
· motif · 206923217–206923239 · motif
· motif · 206923290–206923299 · motif
· motif · 206923305–206923318 · motif
· motif · 206923309–206923322 · motif
· motif · 206923410–206923423 · motif
· motif · 206923774–206923789 · motif
· motif · 206923808–206923820 · motif
· motif · 206923819–206923834 · motif
· motif · 206923901–206923916 · motif
· motif · 206923967–206923982 · motif
· motif · 206923995–206924012 · motif
· motif · 206924035–206924050 · motif
· motif · 206924055–206924070 · motif
· motif · 206924111–206924126 · motif
· motif · 206924154–206924169 · motif
· motif · 206924236–206924251 · motif
· motif · 206924281–206924296 · motif
· motif · 206924326–206924341 · motif
· motif · 206924367–206924382 · motif
· motif · 206924449–206924464 · motif
· motif · 206924480–206924495 · motif
· motif · 206924508–206924525 · motif
· motif · 206924548–206924563 · motif
· motif · 206924568–206924583 · motif
· motif · 206924620–206924635 · motif
· motif · 206924690–206924705 · motif
· motif · 206924711–206924726 · motif
· motif · 206924736–206924751 · motif
· motif · 206924884–206924900 · motif
· motif · 206924884–206924900 · motif
· motif · 206925060–206925073 · motif
· motif · 206925136–206925147 · motif
· motif · 206925201–206925214 · motif
· motif · 206925201–206925214 · motif
· motif · 206925393–206925405 · motif
· motif · 206925396–206925411 · motif
· motif · 206925397–206925410 · motif
· motif · 206925526–206925539 · motif
· motif · 206925555–206925571 · motif
· motif · 206925609–206925621 · motif
· motif · 206925612–206925619 · motif
· motif · 206925723–206925731 · motif
· motif · 206925723–206925740 · motif
· motif · 206926134–206926149 · motif
· motif · 206926139–206926151 · motif
· motif · 206926142–206926157 · motif
FCMR 的表現受循環 IgM 水平及免疫細胞活化訊號調節。活化的 T 細胞、效應記憶與中央記憶 T 細胞，以及活化的 NK 細胞中，FCMR 表現下降；TLR9 訊號會使其轉錄下調，IL7 與 IL15 刺激也與表現降低相關。來源亦指出，FCMR 在老年時下調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：390 aa
Fc mu receptor 的蛋白質長度為 390 個胺基酸。其 N 端含訊號胜肽，細胞外區域位於第 17 至 251 個胺基酸，跨膜螺旋位於第 252 至 272 個胺基酸，後接細胞質區域。細胞外的 Ig-like domain 位於第 23 至 123 個胺基酸；註解另標示 CDR1、CDR2、CDR3 與 CDR4 區域。第 166 至 204 及第 293 至 348 個胺基酸區段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Fc mu receptor 是單次跨膜蛋白，定位於細胞膜，也出現在早期胞內體、高基氏體反式高基氏網絡及溶酶體膜。 它會在細胞質池與質膜之間持續循環，以增加結合 IgM 的機會。 Isoform 3 則為分泌型，並可在血清中檢出。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Fc mu receptor 透過自身的 Ig-like domain 與 IGHM 互動；對應的 IGHM 結合區為 CH4/Cmu4 domain。此作用可發生於分泌型及膜結合型 IgM，且不依賴醣鏈。互動具有多價性；理論上，對 IgM 五聚體最多可涉及八個結合位點。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Fc mu receptor 是辨識分泌型與膜結合型 IgM 的高親和力受體，主要調節 IgM 運輸與穩態。它在淋巴細胞中促進膜結合型 IgM 出現在細胞表面，並將 IgM－抗原複合體送往溶酶體降解；在黏膜上皮則介導複合體經 M 細胞逆向跨胞運輸至黏膜淋巴組織的抗原呈現細胞。它亦參與 B 細胞發育、感染初級免疫及抗體反應，並可能限制對自身抗原的持續性 IgM BCR 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源High-affinity Fc receptor for immunoglobulin M (IgM), both secreted and membrane-bound IgM. Primarily regulates IgM transport and homeostasis. In lymphoid cells, enables exocytosis of membrane-bound IgM on the plasma membrane as well as endocytosis of IgM-antigen complexes toward lysosomes for degradation. In mucosal epithelium, mediates retrotranscytosis of antigen-IgM complexes across mucosal M cells toward antigen-presenting cells in mucosal lymphoid tissues. Triggers costimulatory signaling and mediates most of IgM effector functions involved in B cell development and primary immune response to infection. Likely limits tonic IgM BCR signaling to self-antigens for proper negative selection of autoreactive B cells in the bone marrow and for the maintenance of regulatory B cell pool in peripheral lymphoid organs. Mediates antibody responses to T cell-dependent and T cell-independent antigens and promotes induction of an efficient neutralizing IgG response. Engages in cross-talk with antigen-receptor signaling via the non-canonical NF-kappa-B, MAP kinases and calcium signaling pathways PMID 19858324 ↗ · PMID 21908732 ↗ · PMID 22675200 ↗ · PMID 25601920 ↗ · PMID 28230186 ↗ · PMID 30840890 ↗ · PMID 36949194 ↗ · PMID 37095205 ↗ |
| 交互作用 | Fc mu receptor 透過其 Ig-like domain 與 IGHM 的 CH4/Cmu4 domain 互動，作用對象包括分泌型和膜結合型 IgM。此結合不依賴醣鏈，且具有多價性；理論上，與 IgM 五聚體的互動最多可涉及八個結合位點。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via Ig-like domain) with IGHM (via CH4/Cmu4 domain), both secreted and membrane-bound IgM; the interaction is glycan-independent and multivalent theoretically involving up to eight binding sites for the IgM pentamer PMID 28230186 ↗ · PMID 36949194 ↗ · PMID 37095205 ↗ |
| 細胞定位 | Fc mu receptor 是單次跨膜蛋白，位於細胞膜、早期胞內體膜、高基氏體反式高基氏網絡膜及溶酶體膜。它會持續在細胞質池與質膜之間循環，以增加可結合 IgM 的機會。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass membrane protein; Early endosome membrane / Single-pass membrane protein; Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane / Single-pass membrane protein; Lysosome membrane / Single-pass membrane protein; Continuously recycles between cytoplasmic pool and the plasma membrane to bind as much IgM as possible PMID 19858324 ↗ · PMID 21908424 ↗ · PMID 22675200 ↗ · PMID 30840890 ↗ · PMID 21908732 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 3 為分泌型，並可在血清中檢出。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | FCMR 受循環 IgM 水平與免疫細胞活化訊號調節；在活化的 T 細胞、效應記憶及中央記憶 T 細胞，以及活化的 NK 細胞中下調。TLR9 訊號會使其轉錄下調，IL7、IL15 刺激及老年狀態也與 FCMR 表現降低相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulated by circulating IgM levels and immune cell activation signaling. Down-regulated in activated T cells, effector memory and central memory T cells, as well as in activated NK cells. Transcriptionally down-regulated upon TLR9 signaling. Down-regulated in response to IL7 and IL15. Down-regulated in old age PMID 19858324 ↗ · PMID 21908732 ↗ · PMID 22675200 ↗ · PMID 30840890 ↗ · PMID 9586636 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGATTGTGAAGGGTTCCTGAGTAAGCAGCGTGTCTCCATC40CCCCTCTCTAGGGGCTCTTGGATGGACCTTGCACTCTAGA80AGGGACAATGGACTTCTGGCTTTGGCCACTTTACTTCCTG120CCAGTATCGGGGGCCCTGAGGATCCTCCCAGAAGTAAAGG160TAGAGGGGGAGCTGGGCGGATCAGTTACCATCAAGTGCCC200ACTTCCTGAAATGCATGTGAGGATATATCTGTGCCGGGAG240ATGGCTGGATCTGGAACATGTGGTACCGTGGTATCCACCA280CCAACTTCATCAAGGCAGAATACAAGGGCCGAGTTACTCT320GAAGCAATACCCACGCAAGAATCTGTTCCTAGTGGAGGTA360ACACAGCTGACAGAAAGTGACAGCGGAGTCTATGCCTGCG400GAGCGGGCATGAACACAGACCGGGGAAAGACCCAGAAAGT440CACCCTGAATGTCCACAGTGAATACGAGCCATCATGGGAA480GAGCAGCCAATGCCTGAGACTCCAAAATGGTTTCATCTGC520CCTATTTGTTCCAGATGCCTGCATATGCCAGTTCTTCCAA560ATTCGTAACCAGAGTTACCACACCAGCTCAAAGGGGCAAG600GTCCCTCCAGTTCACCACTCCTCCCCCACCACCCAAATCA640CCCACCGCCCTCGAGTGTCCAGAGCATCTTCAGTAGCAGG680TGACAAGCCCCGAACCTTCCTGCCATCCACTACAGCCTCA720AAAATCTCAGCTCTGGAGGGGCTGCTCAAGCCCCAGACGC760CCAGCTACAACCACCACACCAGGCTGCACAGGCAGAGAGC800ACTGGACTATGGCTCACAGTCTGGGAGGGAAGGCCAAGGA840TTTCACATCCTGATCCCGACCATCCTGGGCCTTTTCCTGC880TGGCACTTCTGGGGCTGGTGGTGAAAAGGGCCGTTGAAAG920GAGGAAAGCCCTCTCCAGGCGGGCCCGCCGACTGGCCGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。