基因總覽
FCGBP 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 Fc gamma binding protein。其產物為大型蛋白質,資料所列序列長度為 5,405 個胺基酸。現有功能註解指出,這種蛋白可能是黏膜中的凝膠狀成分,並參與維持黏膜結構;此描述保留了「可能參與」的不確定性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000616721 ★ | 39,863,323–39,934,634 | 28 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FCGBP 的產物可能參與維持黏膜結構。現有註解將它描述為黏膜中具有凝膠狀特性的成分,並以審慎語氣指出其可能參與此結構的維持;因此,資料支持的是可能的結構性角色,而非已確立的作用機制。來源未提供其如何形成或維持黏膜結構的細節,也未說明此作用發生的條件或涉及的其他分子。
Promoter 與基因調控
>FCGBP ENST00000616721 GRCh38 chr19:39934534-39935634 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGATGCCCAGAGAGGCTGGTTTTGGTGTTCCCATTTTGCAGATGAGAAACCGCAGACGCCCCACTGGGCT GCGGTGGAGGTCTTGTGTCCCACTCCATAGCCTCAGACTCCTGCCCATCCCAGACACCTGCCCCTAGTGG TGTCTGGAAGCAGGATGTGGGTGGCTAGGGACTCCCCAGCCTGTGGGGACTGAGAAGGAACCAGGACCCG GATATGGGTCCCTCACTGTTGTTCCTGGCAGGAGCCAAAGGAAGGAACCTAGCCACTAAGCCAGCAAATA TGACCACATGCCACCTCCCACCCTCACTGCCCACACCCCCACCCTACCCCACCTCCACCCAGGGACCCAG GTGCTCATCTGCCTGCTCCCCAGCTGTCTCCCTCAGGGACCCCACCCTTCCAGGACCAAACTCTCCAGAA GGCTTCCAGGGAATGGCCACCAGCTGTCCTCACTCCCTTCTTGGAACCCAGGCATCCAGAATCACTGTCC CTCCTTCCCAGGCCTTCACAGTTTCCCATTTCATCTGGCCATGAGGATGGCAGCCTCCTCCAGGAAGTTG GCATCATCTGCCTGGCACGTGGCCCAGGGTGTGGCCCAGAAACTCCACTATATAGCCCTGCCACAGGGCT GGCCCTGCAGCTCCAGGGACCTGCAGGTGAGAAGGGCTGGGGTCCCCTTTGGAAGTGGGACAGCAGGTCC CCTACTCTTGCCCCTGACTGTAGGCCTCCTCATCCTACCCCTAGACCCACAAGACAGCCAACTCTCCACC CCGTCCCTGGCTTCTGCCCTCCCCAACCCACCTCCAGACCCGCTGGACAGCCAGCCTCCCCTATACACAC ACACTGGTCCTTGGATCCATACCCCCTGGCCCAATCTGCCCGACTTCTTTCCCCACCTCAGCCTTCATGG TCCCAGGTGGCCCTTGTCATGAGAGTGGGCCCTTCTGCCCAGGACAGTCTCCAGCAGAGGCGGTGGATCA GCCTTCTATGATCCTTTCTCTTTTCCTACTGCAGCCATGGGTGCCCTATGGAGCTGGTGGATACTCTGGG CTGGAGCAACCCTCCTGTGGGGTAAGTCAGACCAAGACCCTCTCCATGTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_74CDXD · promoter · 39936108–39936208 · regulatory
ENSR19_836NZ9 · enhancer · 39936209–39936420 · regulatory
ENSR19_B9WZZ · enhancer · 39937062–39937614 · regulatory
· motif · 39936106–39936119 · motif
· motif · 39936164–39936177 · motif
· motif · 39936164–39936177 · motif
· motif · 39937284–39937299 · motif
· motif · 39937322–39937335 · motif
· motif · 39937322–39937335 · motif
· motif · 39937331–39937346 · motif
· motif · 39937340–39937362 · motif
· motif · 39937340–39937362 · motif
· motif · 39937412–39937427 · motif
· motif · 39937995–39938004 · motif
· motif · 39938178–39938187 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:5405 aa
Fc gamma binding protein 的序列長度為 5,405 個胺基酸。其 N 端具有訊號胜肽(第 1–23 位),並註記有 IgGFc-binding 結構域(第 131–419 位)。序列中另有 13 個 VWFD 結構域,並與 TIL 結構域交替排列;VWFD 1 位於第 470–650 位,VWFD 13 位於第 5233–5404 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 FCGBP 的產物註記為分泌型;未提供其他定位資訊或定位改變的條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TFF3Q07654 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
FCGBP 與 IgG 的 Fc 部分及 MUC2 有交互作用記錄。此註記指出分子間的交互作用,但未進一步說明其是否涉及特定複合體或交互作用的功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FCGBP 產物可能是黏膜中具有凝膠狀特性的成分,並可能參與維持黏膜結構。此描述保留可能性的限定,來源未進一步說明其作用機制或發生條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源May be involved in the maintenance of the mucosal structure as a gel-like component of the mucosa PMID 9182547 ↗ |
| 交互作用 | FCGBP 與 IgG 的 Fc 部分以及 MUC2 有交互作用。來源未在此敘述中說明交互作用的條件、所處系統或其功能後果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
TTTTCCTACTGCAGCCATGGGTGCCCTATGGAGCTGGTGG40ATACTCTGGGCTGGAGCAACCCTCCTGTGGGGATTGACCC80AGGAGGCTTCAGTGGACCTCAAGAACACTGGCAGAGAGGA120ATTCCTCACAGCCTTCCTGCAGAACTATCAGCTGGCCTAC160AGCAAGGCCTACCCCCGCCTCCTTATCTCCAGTCTGTCAG200AGAGCCCCGCTTCAGTCTCCATCCTCAGCCAGGCAGACAA240CACCTCAAAGAAGGTCACAGTGAGGCCCGGGGAGTCGGTC280ATGGTCAACATCAGTGCCAAGGCTGAGATGATAGGCAGCA320AGATCTTCCAGCATGCGGTGGTGATCCATTCTGACTATGC360CATCTCTGTGCAGGCACTAAATGCCAAGCCTGACACAGCG400GAGCTGACACTGCTGCGGCCCATCCAGGCCCTAGGCACCG440AGTATTTTGTGCTCACACCCCCCGGCACCTCAGCCAGGAA480TGTCAAGGAGTTTGCCGTGGTGGCCGGTGCCGCAGGTGCC520TCGGTCAGTGTCACGCTGAAGGGGTCAGTGACATTCAATG560GCAAGTTCTATCCAGCAGGCGATGTCCTAAGAGTGACTCT600ACAGCCCTACAATGTGGCCCAGCTACAGAGCTCAGTGGAT640CTCTCGGGGTCAAAGGTCACAGCTAGTAGCCCCGTGGCTG680TCCTCTCTGGCCACAGCTGTGCGCAGAAACATACGACCTG720CAACCATGTGGTTGAGCAGCTGCTACCCACGTCTGCCTGG760GGCACCCACTATGTAGTACCCACGCTGGCCTCCCAATCTC800GCTATGATTTGGCCTTCGTTGTGGCCAGCCAGGCCACAAA840GCTGACCTACAACCATGGGGGTATCACTGGCTCCCGTGGG880CTCCAGGCAGGTGATGTGGTAGAGTTTGAGGTCCGGCCAT920CCTGGCCACTCTACCTGTCTGCAAATGTGGGCATCCAGGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。