演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FCGBPFC(GAMMA)BP

Fc gamma binding protein

FCGBP 編碼 Fc gamma binding protein;此蛋白可能作為黏膜凝膠狀成分,參與維持黏膜結構。

Homo sapiens19q13.2UniProt Q9Y6R7
OFFICIAL SYMBOL
FCGBP
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y6R7
PDB / ALPHAFOLD
8QCI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FCGBP 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 Fc gamma binding protein。其產物為大型蛋白質,資料所列序列長度為 5,405 個胺基酸。現有功能註解指出,這種蛋白可能是黏膜中的凝膠狀成分,並參與維持黏膜結構;此描述保留了「可能參與」的不確定性。

Official symbol
FCGBP
Gene name
Fc gamma binding protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13572
UniProt
Q9Y6R7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FC(GAMMA)BPFcgammaBP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.2
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25FCGBPpq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:39,863,323–39,934,634
Gene span
71,312 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000616721 ★39,863,323–39,934,63428

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FCGBP 的產物可能參與維持黏膜結構。現有註解將它描述為黏膜中具有凝膠狀特性的成分,並以審慎語氣指出其可能參與此結構的維持;因此,資料支持的是可能的結構性角色,而非已確立的作用機制。來源未提供其如何形成或維持黏膜結構的細節,也未說明此作用發生的條件或涉及的其他分子。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39934634 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FCGBP ENST00000616721 GRCh38 chr19:39934534-39935634 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGATGCCCAGAGAGGCTGGTTTTGGTGTTCCCATTTTGCAGATGAGAAACCGCAGACGCCCCACTGGGCT
GCGGTGGAGGTCTTGTGTCCCACTCCATAGCCTCAGACTCCTGCCCATCCCAGACACCTGCCCCTAGTGG
TGTCTGGAAGCAGGATGTGGGTGGCTAGGGACTCCCCAGCCTGTGGGGACTGAGAAGGAACCAGGACCCG
GATATGGGTCCCTCACTGTTGTTCCTGGCAGGAGCCAAAGGAAGGAACCTAGCCACTAAGCCAGCAAATA
TGACCACATGCCACCTCCCACCCTCACTGCCCACACCCCCACCCTACCCCACCTCCACCCAGGGACCCAG
GTGCTCATCTGCCTGCTCCCCAGCTGTCTCCCTCAGGGACCCCACCCTTCCAGGACCAAACTCTCCAGAA
GGCTTCCAGGGAATGGCCACCAGCTGTCCTCACTCCCTTCTTGGAACCCAGGCATCCAGAATCACTGTCC
CTCCTTCCCAGGCCTTCACAGTTTCCCATTTCATCTGGCCATGAGGATGGCAGCCTCCTCCAGGAAGTTG
GCATCATCTGCCTGGCACGTGGCCCAGGGTGTGGCCCAGAAACTCCACTATATAGCCCTGCCACAGGGCT
GGCCCTGCAGCTCCAGGGACCTGCAGGTGAGAAGGGCTGGGGTCCCCTTTGGAAGTGGGACAGCAGGTCC
CCTACTCTTGCCCCTGACTGTAGGCCTCCTCATCCTACCCCTAGACCCACAAGACAGCCAACTCTCCACC
CCGTCCCTGGCTTCTGCCCTCCCCAACCCACCTCCAGACCCGCTGGACAGCCAGCCTCCCCTATACACAC
ACACTGGTCCTTGGATCCATACCCCCTGGCCCAATCTGCCCGACTTCTTTCCCCACCTCAGCCTTCATGG
TCCCAGGTGGCCCTTGTCATGAGAGTGGGCCCTTCTGCCCAGGACAGTCTCCAGCAGAGGCGGTGGATCA
GCCTTCTATGATCCTTTCTCTTTTCCTACTGCAGCCATGGGTGCCCTATGGAGCTGGTGGATACTCTGGG
CTGGAGCAACCCTCCTGTGGGGTAAGTCAGACCAAGACCCTCTCCATGTCC
FCGBP 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_74CDXD · promoter · 39936108–39936208 · regulatory

ENSR19_836NZ9 · enhancer · 39936209–39936420 · regulatory

ENSR19_B9WZZ · enhancer · 39937062–39937614 · regulatory

· motif · 39936106–39936119 · motif

· motif · 39936164–39936177 · motif

· motif · 39936164–39936177 · motif

· motif · 39937284–39937299 · motif

· motif · 39937322–39937335 · motif

· motif · 39937322–39937335 · motif

· motif · 39937331–39937346 · motif

· motif · 39937340–39937362 · motif

· motif · 39937340–39937362 · motif

· motif · 39937412–39937427 · motif

· motif · 39937995–39938004 · motif

· motif · 39938178–39938187 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:5405 aa

1 aa5405 aa結構域訊號胜肽
依 Q9Y6R7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Fc gamma binding protein 的序列長度為 5,405 個胺基酸。其 N 端具有訊號胜肽(第 1–23 位),並註記有 IgGFc-binding 結構域(第 131–419 位)。序列中另有 13 個 VWFD 結構域,並與 TIL 結構域交替排列;VWFD 1 位於第 470–650 位,VWFD 13 位於第 5233–5404 位。

訊號胜肽1–23 aa
結構域IgGFc-binding131–419 aa
結構域VWFD 1470–650 aa
結構域TIL 1745–799 aa
結構域VWFD 2862–1041 aa
結構域TIL 21136–1189 aa
結構域VWFD 31250–1429 aa
結構域TIL 31532–1585 aa
結構域VWFD 41671–1854 aa
結構域TIL 41950–2007 aa
結構域VWFD 52070–2253 aa
結構域TIL 52337–2390 aa
結構域VWFD 62451–2630 aa
結構域TIL 62733–2786 aa
結構域VWFD 72872–3055 aa
結構域TIL 73151–3208 aa
結構域VWFD 83271–3454 aa
結構域TIL 83538–3591 aa
結構域VWFD 93652–3831 aa
結構域TIL 93934–3987 aa
結構域VWFD 104073–4256 aa
結構域TIL 104352–4409 aa
結構域VWFD 114472–4655 aa
結構域TIL 114739–4792 aa
結構域VWFD 124854–5025 aa
結構域TIL 125121–5174 aa
結構域VWFD 135233–5404 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8QCI…

PDB · 8QCI

X-ray · 2.20 A · A=4073-4080, B=4081-4349

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

資料將 FCGBP 的產物註記為分泌型;未提供其他定位資訊或定位改變的條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FC(GAMMA)BPFCGBPTFF3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FCGBP 與 IgG 的 Fc 部分及 MUC2 有交互作用記錄。此註記指出分子間的交互作用,但未進一步說明其是否涉及特定複合體或交互作用的功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FCGBP 產物可能是黏膜中具有凝膠狀特性的成分,並可能參與維持黏膜結構。此描述保留可能性的限定,來源未進一步說明其作用機制或發生條件。含實驗來源
證據與來源

May be involved in the maintenance of the mucosal structure as a gel-like component of the mucosa

PMID 9182547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用FCGBP 與 IgG 的 Fc 部分以及 MUC2 有交互作用。來源未在此敘述中說明交互作用的條件、所處系統或其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with the Fc portion of IgG and with MUC2

PMID 19432394 ↗ · PMID 9182547 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000616721 · 12,795 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1TTTTCCTACTGCAGCCATGGGTGCCCTATGGAGCTGGTGG40
41ATACTCTGGGCTGGAGCAACCCTCCTGTGGGGATTGACCC80
81AGGAGGCTTCAGTGGACCTCAAGAACACTGGCAGAGAGGA120
121ATTCCTCACAGCCTTCCTGCAGAACTATCAGCTGGCCTAC160
161AGCAAGGCCTACCCCCGCCTCCTTATCTCCAGTCTGTCAG200
201AGAGCCCCGCTTCAGTCTCCATCCTCAGCCAGGCAGACAA240
241CACCTCAAAGAAGGTCACAGTGAGGCCCGGGGAGTCGGTC280
281ATGGTCAACATCAGTGCCAAGGCTGAGATGATAGGCAGCA320
321AGATCTTCCAGCATGCGGTGGTGATCCATTCTGACTATGC360
361CATCTCTGTGCAGGCACTAAATGCCAAGCCTGACACAGCG400
401GAGCTGACACTGCTGCGGCCCATCCAGGCCCTAGGCACCG440
441AGTATTTTGTGCTCACACCCCCCGGCACCTCAGCCAGGAA480
481TGTCAAGGAGTTTGCCGTGGTGGCCGGTGCCGCAGGTGCC520
521TCGGTCAGTGTCACGCTGAAGGGGTCAGTGACATTCAATG560
561GCAAGTTCTATCCAGCAGGCGATGTCCTAAGAGTGACTCT600
601ACAGCCCTACAATGTGGCCCAGCTACAGAGCTCAGTGGAT640
641CTCTCGGGGTCAAAGGTCACAGCTAGTAGCCCCGTGGCTG680
681TCCTCTCTGGCCACAGCTGTGCGCAGAAACATACGACCTG720
721CAACCATGTGGTTGAGCAGCTGCTACCCACGTCTGCCTGG760
761GGCACCCACTATGTAGTACCCACGCTGGCCTCCCAATCTC800
801GCTATGATTTGGCCTTCGTTGTGGCCAGCCAGGCCACAAA840
841GCTGACCTACAACCATGGGGGTATCACTGGCTCCCGTGGG880
881CTCCAGGCAGGTGATGTGGTAGAGTTTGAGGTCCGGCCAT920
921CCTGGCCACTCTACCTGTCTGCAAATGTGGGCATCCAGGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。