基因總覽
FBXW8 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 F-box and WD repeat domain containing 8。其蛋白質屬於 F-box 與 WD 重複序列相關的蛋白質,作為 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分。此定位使它能參與複合體對目標蛋白質的辨識;其序列具有 F-box 區域及多個 WD 重複序列,呈現與該名稱相符的結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000652555 ★ | 116,910,950–117,031,148 | 11 |
| ENST00000877977 | 116,910,839–117,032,498 | 10 |
| ENST00000917719 | 116,910,839–117,032,498 | 10 |
| ENST00000971032 | 116,910,839–117,032,498 | 10 |
| ENST00000971033 | 116,910,839–117,032,498 | 10 |
| ENST00000971034 | 116,910,839–117,032,498 | 11 |
| ENST00001107032 | 116,910,839–116,988,959 | 7 |
| ENST00001143082 | 116,910,839–117,032,498 | 11 |
| ENST00000455858 | 116,910,949–117,032,498 | 11 |
| ENST00000877976 | 116,910,949–117,032,498 | 10 |
| ENST00000917720 | 116,910,949–117,032,498 | 10 |
| ENST00000917721 | 116,910,949–117,032,498 | 10 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXW8 是 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分。該複合體可使目標蛋白質泛素化,並促進其後續由蛋白酶體降解。因此,FBXW8 參與以辨識特定底物為起點的蛋白質修飾與清除過程。
在高基氏體與神經突起相關的調控中,Cul7-RING(FBXW8) 複合體會促使 GORASP1 泛素化並降解。這項作用屬於調節腦部高基氏體形態形成及樹突模式的泛素連接酶途徑之一,將蛋白質周轉與細胞結構及神經突起組織的調控相連。
該複合體也以 mTOR 依賴方式促進 IRS1 泛素化與降解;其辨識的 IRS1 已先由 S6 kinase(RPS6KB1 或 RPS6KB2)磷酸化。對 MAP4K1/HPK1,複合體則辨識並結合自體磷酸化的蛋白質,促進其泛素化及降解,進而影響細胞增殖與分化。
Cul7-RING(FBXW8) 複合體亦可泛素化磷酸化的 cyclin-D1(CCND1);但依相似性資料,它並非 G1/S 轉換期間調節 CCND1 穩定性的主要因子。另有資料指出 FBXW8 是 3M 複合體的相關成分,暗示它可能參與該複合體的部分功能,但未進一步界定其作用。
Promoter 與基因調控
>FBXW8 ENST00000652555 GRCh38 chr12:116909950-116911050 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGAAAACATTTTTAAGTGGAACGCCATCGTATGTCATTTTCTTTCCCATCTTAAAGCCCTTGGATTTCCT TCTGGAAATCTCTCTCCTAAGATCTGACCTTCCCTTGGCTGGTTTCTCTTTCAGATTTTTAAAAAAAAAT TTTTATTTCCACAGGTTATTGGGAACAGGTGGTATTTGGTTACATGAGTAAGTTCTTTAGTGGTGATTTG TGAGATTTTGGTGCACGCATCACCCGAGCAGTATACACTGAACCCAAGTTATAGTCTTTTATCCCTCCCC ACCTTCCCACCCTCCCCTCGTCCCCCTCCCCTGTTCCAAAGTCCCATAAGTCATTCTTATGCTTTTGCAT CCTCGTAGCTTAGCTCCCACTTATATGTGAGAACATACGATGTTTGGTTTTCCATTCCTGAGTTACTTCA CTTAGAATAATAGTCTCCAATCCCATCCAGGTTGCTACGAATGCCATGAATTCATTCCTTTTTTATGGCT GAGTAGTATTCCACCATATGTATATATCAGTTTCTTTATCCACCTGTTGATTCTCTTTTAGATTTTAATT TAAATAACATCTTAAACAGACTTTCACTATCAATCCTTACTCCCCTTACCTTACCTTATTTTGTTTTCTT CCTAATACCTATCACTGATTTAAATGTTCATATTTCTTTGTTTAAAGTCTCCCTACTTAAACGCATGCTC CAAGACGTCAGAGTTTTTGTTTTGTTTTACAGATTTAAATGCTGAATTCTTGGTGCCTGGCATATAGTAG TTGCTGAATGAATGTTTGTTGAATGAAGGAACAATGCTTGGCGCAAAGTCAGAGCTTAGCAAAAGTGATA GGCAGCAGAGCTGACGGGCTGAGGGGCAGCTGCGTAAACCTCTGCTTTGGGCGCCACAAGCCACAAGCCG GACCACCACGTGCGTACAGGGGCAGCGCCGGGGGCGTGGCGGGGGCGTGGACGCCCACCCGGAACCCTAG AGCGGCGGCGGCAGCGGCTTCCGGCCGCGGCGGACACTTCCCTGGGCGGGACTGTCTCGTGGCACCCGGT GGAACCGAGGAGAACGTGGAGCGCCGGGAGCGGCGAATATGGACGACTACA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXW8_1 ↗ | 12:116,910,980 | 正股 | 116,910,931–116,910,990 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_93PDWC · promoter · 116910579–116910975 · regulatory
ENSR12_CFL8H · enhancer · 116915914–116917190 · regulatory
· motif · 116910840–116910855 · motif
· motif · 116910847–116910862 · motif
· motif · 116910864–116910873 · motif
· motif · 116910884–116910897 · motif
· motif · 116910895–116910908 · motif
· motif · 116910909–116910922 · motif
· motif · 116910928–116910941 · motif
· motif · 116910945–116910954 · motif
· motif · 116911151–116911160 · motif
· motif · 116911337–116911353 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:598 aa
FBXW8 蛋白質長 598 個胺基酸。其 F-box 區域位於第 113–159 個胺基酸;第 201–561 個胺基酸間註解有八個 WD 重複序列。另有一段位於第 17–93 個胺基酸的區域被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXW8 位於細胞質、核周區域及高基氏體。 當其 Ser-85 磷酸化時,FBXW8 會定位至細胞質溶膠,並促進 IRS1 泛素化,顯示其定位可隨磷酸化狀態改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- MYCP01106 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- Gorasp1B1WBR1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
FBXW8 與 CUL7、RBX1、SKP1 組成 Cul7-RING(FBXW8) 複合體,並在其中與 CUL7 和 SKP1 互作。另有互作紀錄包括 GLMN isoform 1、OBSL1、CUL1、CUL2、CCT6B、PFDN5、CCT2、CCT3、CCT6A、CCT7、VBP1、CCDC8、ARF1、TRIP13、PDCD5 與 GORASP1。FBXW8 也與自體磷酸化的 MAP4K1/HPK1 互作;與磷酸化於 Ser-355 的 POUF51 互作則依相似性資料。FBXW8 另被記載為 3M 複合體的相關成分。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXW8 是 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分,該複合體促使目標蛋白質泛素化並進一步由蛋白酶體降解。它可促進 GORASP1 降解,參與調節腦部高基氏體形態與樹突模式的途徑;也以 mTOR 依賴方式辨識經 S6 kinase 磷酸化的 IRS1,並辨識自體磷酸化的 MAP4K1/HPK1,促進其降解而影響細胞增殖與分化。複合體亦可泛素化磷酸化的 CCND1,但依相似性資料,並非 G1/S 轉換時調節其穩定性的主要因子。FBXW8 也是 3M 複合體的相關成分,可能參與其部分功能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate-recognition component of the Cul7-RING(FBXW8) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. The Cul7-RING(FBXW8) complex mediates ubiquitination and consequent degradation of GORASP1, acting as a component of the ubiquitin ligase pathway that regulates Golgi morphogenesis and dendrite patterning in brain. Mediates ubiquitination and degradation of IRS1 in a mTOR-dependent manner: the Cul7-RING(FBXW8) complex recognizes and binds IRS1 previously phosphorylated by S6 kinase (RPS6KB1 or RPS6KB2). The Cul7-RING(FBXW8) complex also mediates ubiquitination of MAP4K1/HPK1: recognizes and binds autophosphorylated MAP4K1/HPK1, leading to its degradation, thereby affecting cell proliferation and differentiation. The Cul7-RING(FBXW8) complex also mediates ubiquitination of phosphorylated cyclin-D1 (CCND1). The Cul7-RING(FBXW8) complex is however not a major regulator of CCND1 stability during the G1/S transition (By similarity). Associated component of the 3M complex, suggesting that it mediates some of 3M complex functions PMID 17205132 ↗ · PMID 18498745 ↗ · PMID 21572988 ↗ · PMID 24362026 ↗ · PMID 24793695 ↗ · PMID 35982156 ↗ |
| 分子活性 | FBXW8 相關的活動包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXW8 與 CUL7、RBX1、SKP1 組成 Cul7-RING(FBXW8) 複合體,並在其中與 CUL7、SKP1 互作。其他互作對象包括 GLMN isoform 1、OBSL1、CUL1、CUL2、CCT6B、PFDN5、CCT2、CCT3、CCT6A、CCT7、VBP1、CCDC8、ARF1、TRIP13、PDCD5、GORASP1,以及自體磷酸化時的 MAP4K1/HPK1。FBXW8 也是 3M 複合體的相關成分;與磷酸化於 Ser-355 的 POUF51 互作則依相似性資料。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Cul7-RING(FBXW8) complex consisting of CUL7, RBX1, SKP1 and FBXW8; within the complex interacts with CUL7 and SKP1. Interacts with GLMN isoform 1. Interacts with OBSL1, CUL1, CUL2, CCT6B, PFDN5, CCT2, CCT3, CCT6A, CCT7, VBP1, CCDC8, ARF1, TRIP13, PDCD5 and GORASP1. Interacts with MAP4K1/HPK1 (when autophosphorylated). Associated component of the 3M complex. Interacts with POUF51 (when phosphorylated on 'Ser-355') (By similarity) PMID 12904573 ↗ · PMID 17205132 ↗ · PMID 17332328 ↗ · PMID 21572988 ↗ · PMID 24362026 ↗ · PMID 24793695 ↗ · PMID 35982156 ↗ |
| 細胞定位 | FBXW8 位於細胞質、核周區域及高基氏體;當 Ser-85 磷酸化時,FBXW8 定位於細胞質溶膠,並促進 IRS1 泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, perinuclear region; Golgi apparatus; Cytoplasm; Localizes to the cytosol when phosphorylated at Ser-85, promoting IRS1 ubiquitination PMID 21572988 ↗ · PMID 17205132 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCGGCCGCGGCGGACACTTCCCTGGGCGGGACTGTCTCGT40GGCACCCGGTGGAACCGAGGAGAACGTGGAGCGCCGGGAG80CGGCGAATATGGACGACTACAGCCTGGATGAGTTCCGTCG120GCGCTGGCAGGAGGAGCTGGCGCAGGCCCAGGCGCCGAAG160AAGCGGCGACGGCCCGAGGCTGCCGAGAGGCGGGCTCGGC200GGCCGGAGGTGGGCTCCGGGCGCGGCGAACAGGCCTCGGG240GGACCCGGCGCTGGCCCAGCGTCTCCTGGAGGGCGCGGGG280AGGCCCCCGGCGGCGCGGGCGACTCGGGCCGAGGGGCAGG320ACGTAGCGAGCCGCTCACGTTCTCCTCTGGCCCGCGAGGG360CGCCGGGGGCGGGGAGCAGCTGGTGGACCAGCTCATCCGC400GACCTGAATGAAATGAATGATGTGCCTTTCTTTGATATCC440AACTGCCTTACGAATTGGCAATCAATATATTTCAGTATCT480GGACAGGAAAGAACTAGGAAGATGTGCACAGGTGAGCAAG520ACGTGGAAGGTGATTGCAGAGGATGAGGTGCTGTGGTACA560GGCTGTGCCAGCAGGAAGGGCACCTTCCGGATAGCAGCAT600CTCTGACTATTCTTGCTGGAAGCTCATCTTCCAAGAGTGC640CGAGCCAAGGAACACATGTTACGAACCAACTGGAAGAATC680GCAAAGGTGCCGTGAGCGAGCTGGAGCATGTTCCTGACAC720AGTTTTGTGTGATGTGCATTCTCACGATGGTGTGGTCATT760GCGGGATATACATCAGGGGATGTGAGAGTGTGGGACACCC800GCACCTGGGACTACGTAGCCCCCTTCCTGGAATCAGAGGA840CGAGGAGGATGAGCCTGGAATGCAGCCAAATGTCTCCTTT880GTGAGGATAAACAGCTCGTTGGCAGTAGCAGCTTATGAGG920ATGGGTTTCTTAATATTTGGGATTTAAGGACCGGAAAGTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。