演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXW8FBX29

F-box and WD repeat domain containing 8

FBXW8 編碼 F-box and WD repeat domain containing 8,是 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分,參與目標蛋白質的泛素化與後續降解。

Homo sapiens12q24.22UniProt Q8N3Y1
OFFICIAL SYMBOL
FBXW8
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q8N3Y1
PDB / ALPHAFOLD
7Z8B
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXW8 是蛋白質編碼基因,產物名稱為 F-box and WD repeat domain containing 8。其蛋白質屬於 F-box 與 WD 重複序列相關的蛋白質,作為 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分。此定位使它能參與複合體對目標蛋白質的辨識;其序列具有 F-box 區域及多個 WD 重複序列,呈現與該名稱相符的結構特色。

Official symbol
FBXW8
Gene name
F-box and WD repeat domain containing 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13597
UniProt
Q8N3Y1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FBX29FBW6FBW8FBXO29

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.22
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegFBXW8pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:116,910,839–117,032,498
Gene span
121,660 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000652555 ★116,910,950–117,031,14811
ENST00000877977116,910,839–117,032,49810
ENST00000917719116,910,839–117,032,49810
ENST00000971032116,910,839–117,032,49810
ENST00000971033116,910,839–117,032,49810
ENST00000971034116,910,839–117,032,49811
ENST00001107032116,910,839–116,988,9597
ENST00001143082116,910,839–117,032,49811
ENST00000455858116,910,949–117,032,49811
ENST00000877976116,910,949–117,032,49810
ENST00000917720116,910,949–117,032,49810
ENST00000917721116,910,949–117,032,49810

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXW8 是 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分。該複合體可使目標蛋白質泛素化,並促進其後續由蛋白酶體降解。因此,FBXW8 參與以辨識特定底物為起點的蛋白質修飾與清除過程。

在高基氏體與神經突起相關的調控中,Cul7-RING(FBXW8) 複合體會促使 GORASP1 泛素化並降解。這項作用屬於調節腦部高基氏體形態形成及樹突模式的泛素連接酶途徑之一,將蛋白質周轉與細胞結構及神經突起組織的調控相連。

該複合體也以 mTOR 依賴方式促進 IRS1 泛素化與降解;其辨識的 IRS1 已先由 S6 kinase(RPS6KB1 或 RPS6KB2)磷酸化。對 MAP4K1/HPK1,複合體則辨識並結合自體磷酸化的蛋白質,促進其泛素化及降解,進而影響細胞增殖與分化。

Cul7-RING(FBXW8) 複合體亦可泛素化磷酸化的 cyclin-D1(CCND1);但依相似性資料,它並非 G1/S 轉換期間調節 CCND1 穩定性的主要因子。另有資料指出 FBXW8 是 3M 複合體的相關成分,暗示它可能參與該複合體的部分功能,但未進一步界定其作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 116910950 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXW8 ENST00000652555 GRCh38 chr12:116909950-116911050 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGAAAACATTTTTAAGTGGAACGCCATCGTATGTCATTTTCTTTCCCATCTTAAAGCCCTTGGATTTCCT
TCTGGAAATCTCTCTCCTAAGATCTGACCTTCCCTTGGCTGGTTTCTCTTTCAGATTTTTAAAAAAAAAT
TTTTATTTCCACAGGTTATTGGGAACAGGTGGTATTTGGTTACATGAGTAAGTTCTTTAGTGGTGATTTG
TGAGATTTTGGTGCACGCATCACCCGAGCAGTATACACTGAACCCAAGTTATAGTCTTTTATCCCTCCCC
ACCTTCCCACCCTCCCCTCGTCCCCCTCCCCTGTTCCAAAGTCCCATAAGTCATTCTTATGCTTTTGCAT
CCTCGTAGCTTAGCTCCCACTTATATGTGAGAACATACGATGTTTGGTTTTCCATTCCTGAGTTACTTCA
CTTAGAATAATAGTCTCCAATCCCATCCAGGTTGCTACGAATGCCATGAATTCATTCCTTTTTTATGGCT
GAGTAGTATTCCACCATATGTATATATCAGTTTCTTTATCCACCTGTTGATTCTCTTTTAGATTTTAATT
TAAATAACATCTTAAACAGACTTTCACTATCAATCCTTACTCCCCTTACCTTACCTTATTTTGTTTTCTT
CCTAATACCTATCACTGATTTAAATGTTCATATTTCTTTGTTTAAAGTCTCCCTACTTAAACGCATGCTC
CAAGACGTCAGAGTTTTTGTTTTGTTTTACAGATTTAAATGCTGAATTCTTGGTGCCTGGCATATAGTAG
TTGCTGAATGAATGTTTGTTGAATGAAGGAACAATGCTTGGCGCAAAGTCAGAGCTTAGCAAAAGTGATA
GGCAGCAGAGCTGACGGGCTGAGGGGCAGCTGCGTAAACCTCTGCTTTGGGCGCCACAAGCCACAAGCCG
GACCACCACGTGCGTACAGGGGCAGCGCCGGGGGCGTGGCGGGGGCGTGGACGCCCACCCGGAACCCTAG
AGCGGCGGCGGCAGCGGCTTCCGGCCGCGGCGGACACTTCCCTGGGCGGGACTGTCTCGTGGCACCCGGT
GGAACCGAGGAGAACGTGGAGCGCCGGGAGCGGCGAATATGGACGACTACA
FBXW8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXW8_1 ↗12:116,910,980正股116,910,931–116,910,990

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_93PDWC · promoter · 116910579–116910975 · regulatory

ENSR12_CFL8H · enhancer · 116915914–116917190 · regulatory

· motif · 116910840–116910855 · motif

· motif · 116910847–116910862 · motif

· motif · 116910864–116910873 · motif

· motif · 116910884–116910897 · motif

· motif · 116910895–116910908 · motif

· motif · 116910909–116910922 · motif

· motif · 116910928–116910941 · motif

· motif · 116910945–116910954 · motif

· motif · 116911151–116911160 · motif

· motif · 116911337–116911353 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:598 aa

1 aa598 aa結構域功能區域重複區
依 Q8N3Y1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

FBXW8 蛋白質長 598 個胺基酸。其 F-box 區域位於第 113–159 個胺基酸;第 201–561 個胺基酸間註解有八個 WD 重複序列。另有一段位於第 17–93 個胺基酸的區域被註解為無序區。

結構域F-box113–159 aa
重複區WD 1201–250 aa
重複區WD 2259–299 aa
重複區WD 3300–340 aa
重複區WD 4341–383 aa
重複區WD 5384–429 aa
重複區WD 6430–475 aa
重複區WD 7476–513 aa
重複區WD 8514–561 aa
功能區域Disordered17–93 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7Z8B…

PDB · 7Z8B

EM · 2.80 A · F=1-598

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm, perinuclear region;Golgi apparatus;Cytoplasm

FBXW8 位於細胞質、核周區域及高基氏體。 當其 Ser-85 磷酸化時,FBXW8 會定位至細胞質溶膠,並促進 IRS1 泛素化,顯示其定位可隨磷酸化狀態改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FBX29FBXW8MYCSKP1Gorasp1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXW8 與 CUL7、RBX1、SKP1 組成 Cul7-RING(FBXW8) 複合體,並在其中與 CUL7 和 SKP1 互作。另有互作紀錄包括 GLMN isoform 1、OBSL1、CUL1、CUL2、CCT6B、PFDN5、CCT2、CCT3、CCT6A、CCT7、VBP1、CCDC8、ARF1、TRIP13、PDCD5 與 GORASP1。FBXW8 也與自體磷酸化的 MAP4K1/HPK1 互作;與磷酸化於 Ser-355 的 POUF51 互作則依相似性資料。FBXW8 另被記載為 3M 複合體的相關成分。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXW8 是 Cul7-RING(FBXW8) 泛素連接酶複合體的底物辨識成分,該複合體促使目標蛋白質泛素化並進一步由蛋白酶體降解。它可促進 GORASP1 降解,參與調節腦部高基氏體形態與樹突模式的途徑;也以 mTOR 依賴方式辨識經 S6 kinase 磷酸化的 IRS1,並辨識自體磷酸化的 MAP4K1/HPK1,促進其降解而影響細胞增殖與分化。複合體亦可泛素化磷酸化的 CCND1,但依相似性資料,並非 G1/S 轉換時調節其穩定性的主要因子。FBXW8 也是 3M 複合體的相關成分,可能參與其部分功能。含實驗來源
證據與來源

Substrate-recognition component of the Cul7-RING(FBXW8) ubiquitin ligase complex, which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. The Cul7-RING(FBXW8) complex mediates ubiquitination and consequent degradation of GORASP1, acting as a component of the ubiquitin ligase pathway that regulates Golgi morphogenesis and dendrite patterning in brain. Mediates ubiquitination and degradation of IRS1 in a mTOR-dependent manner: the Cul7-RING(FBXW8) complex recognizes and binds IRS1 previously phosphorylated by S6 kinase (RPS6KB1 or RPS6KB2). The Cul7-RING(FBXW8) complex also mediates ubiquitination of MAP4K1/HPK1: recognizes and binds autophosphorylated MAP4K1/HPK1, leading to its degradation, thereby affecting cell proliferation and differentiation. The Cul7-RING(FBXW8) complex also mediates ubiquitination of phosphorylated cyclin-D1 (CCND1). The Cul7-RING(FBXW8) complex is however not a major regulator of CCND1 stability during the G1/S transition (By similarity). Associated component of the 3M complex, suggesting that it mediates some of 3M complex functions

PMID 17205132 ↗ · PMID 18498745 ↗ · PMID 21572988 ↗ · PMID 24362026 ↗ · PMID 24793695 ↗ · PMID 35982156 ↗

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分子活性FBXW8 相關的活動包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

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交互作用FBXW8 與 CUL7、RBX1、SKP1 組成 Cul7-RING(FBXW8) 複合體,並在其中與 CUL7、SKP1 互作。其他互作對象包括 GLMN isoform 1、OBSL1、CUL1、CUL2、CCT6B、PFDN5、CCT2、CCT3、CCT6A、CCT7、VBP1、CCDC8、ARF1、TRIP13、PDCD5、GORASP1,以及自體磷酸化時的 MAP4K1/HPK1。FBXW8 也是 3M 複合體的相關成分;與磷酸化於 Ser-355 的 POUF51 互作則依相似性資料。含實驗來源
證據與來源

Component of the Cul7-RING(FBXW8) complex consisting of CUL7, RBX1, SKP1 and FBXW8; within the complex interacts with CUL7 and SKP1. Interacts with GLMN isoform 1. Interacts with OBSL1, CUL1, CUL2, CCT6B, PFDN5, CCT2, CCT3, CCT6A, CCT7, VBP1, CCDC8, ARF1, TRIP13, PDCD5 and GORASP1. Interacts with MAP4K1/HPK1 (when autophosphorylated). Associated component of the 3M complex. Interacts with POUF51 (when phosphorylated on 'Ser-355') (By similarity)

PMID 12904573 ↗ · PMID 17205132 ↗ · PMID 17332328 ↗ · PMID 21572988 ↗ · PMID 24362026 ↗ · PMID 24793695 ↗ · PMID 35982156 ↗

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細胞定位FBXW8 位於細胞質、核周區域及高基氏體;當 Ser-85 磷酸化時,FBXW8 定位於細胞質溶膠,並促進 IRS1 泛素化。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm, perinuclear region; Golgi apparatus; Cytoplasm; Localizes to the cytosol when phosphorylated at Ser-85, promoting IRS1 ubiquitination

PMID 21572988 ↗ · PMID 17205132 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000652555 · 4,861 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCGGCCGCGGCGGACACTTCCCTGGGCGGGACTGTCTCGT40
41GGCACCCGGTGGAACCGAGGAGAACGTGGAGCGCCGGGAG80
81CGGCGAATATGGACGACTACAGCCTGGATGAGTTCCGTCG120
121GCGCTGGCAGGAGGAGCTGGCGCAGGCCCAGGCGCCGAAG160
161AAGCGGCGACGGCCCGAGGCTGCCGAGAGGCGGGCTCGGC200
201GGCCGGAGGTGGGCTCCGGGCGCGGCGAACAGGCCTCGGG240
241GGACCCGGCGCTGGCCCAGCGTCTCCTGGAGGGCGCGGGG280
281AGGCCCCCGGCGGCGCGGGCGACTCGGGCCGAGGGGCAGG320
321ACGTAGCGAGCCGCTCACGTTCTCCTCTGGCCCGCGAGGG360
361CGCCGGGGGCGGGGAGCAGCTGGTGGACCAGCTCATCCGC400
401GACCTGAATGAAATGAATGATGTGCCTTTCTTTGATATCC440
441AACTGCCTTACGAATTGGCAATCAATATATTTCAGTATCT480
481GGACAGGAAAGAACTAGGAAGATGTGCACAGGTGAGCAAG520
521ACGTGGAAGGTGATTGCAGAGGATGAGGTGCTGTGGTACA560
561GGCTGTGCCAGCAGGAAGGGCACCTTCCGGATAGCAGCAT600
601CTCTGACTATTCTTGCTGGAAGCTCATCTTCCAAGAGTGC640
641CGAGCCAAGGAACACATGTTACGAACCAACTGGAAGAATC680
681GCAAAGGTGCCGTGAGCGAGCTGGAGCATGTTCCTGACAC720
721AGTTTTGTGTGATGTGCATTCTCACGATGGTGTGGTCATT760
761GCGGGATATACATCAGGGGATGTGAGAGTGTGGGACACCC800
801GCACCTGGGACTACGTAGCCCCCTTCCTGGAATCAGAGGA840
841CGAGGAGGATGAGCCTGGAATGCAGCCAAATGTCTCCTTT880
881GTGAGGATAAACAGCTCGTTGGCAGTAGCAGCTTATGAGG920
921ATGGGTTTCTTAATATTTGGGATTTAAGGACCGGAAAGTA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。