基因總覽
FBXW5（F-box and WD repeat domain containing 5）是蛋白質編碼基因，產物屬於 FBXW5 family。其蛋白質具有 F-box 與多個 WD repeat，並含有 D-box motif；這些結構特色與其作為 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體組成成員的角色相符。FBXW5 可成為 SCF 與 DCX 兩類複合體的底物辨識成分，參與辨認特定蛋白質，將其送入泛素化調控途徑。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000325285 ★ | 136,940,435–136,944,738 | 9 |
| ENST00000858260 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000858262 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000858264 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000858266 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000858267 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000858269 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
| ENST00000940105 | 136,940,434–136,944,734 | 9 |
| ENST00000940106 | 136,940,434–136,944,734 | 9 |
| ENST00000940107 | 136,940,434–136,944,788 | 7 |
| ENST00000940108 | 136,940,434–136,944,788 | 8 |
| ENST00000970223 | 136,940,434–136,944,788 | 9 |
顯示 12/34 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXW5 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）與 DCX（DDB1-CUL4-X-box）兩類 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體的底物辨識成分。它協助複合體選擇特定底物，進而促進底物泛素化；部分底物在此作用後會經蛋白酶體降解。來源指出，這些作用具有細胞週期階段與底物特異性。
在 S phase，SCF(FBXW5) 促進 SASS6 泛素化及其後續蛋白酶體降解，因而防止中心粒重複形成。這項調控將 SASS6 的降解與中心粒複製限制連結，作用描述明確涵蓋 S phase。
在 G2 phase，SCF(FBXW5) 也促進 actin regulator EPS8 泛素化與降解。EPS8 的降解是短暫性的，並伴隨後續細胞形狀改變；這些改變是細胞進入有絲分裂所需。此處所述的功能因此不只是調節底物含量，也涉及有絲分裂進程所需的細胞形態變化。
在另一類複合體中，FBXW5 是 DCX(FBXW5) E3 ubiquitin-protein ligase 的底物特異性接頭，促進 TSC2 多聚泛素化及其後續降解。來源另指出，FBXW5 可能在 interleukin-1B（IL1B）訊號路徑中負向調節 MAP3K7/TAK1 訊號；此作用以可能性表述，不能視為已確立的結論。
Promoter 與基因調控
>FBXW5 ENST00000325285 GRCh38 chr9:136944638-136945738 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCCTGGGGAGCCACATGCAGTGTGGTGGCCTCGGCCCGGTGGCCCTGCTCCTGCAGGAAACGGCAAGCG GAGCCCACAGCCACAAGGAGCCAGGTCCCTGCAAACTGGGGGCAGACCATGGGAGAACTCGAGGGCACTG TGGGAGGGCCCCTCACCTGCTTCCCTCTACACCCCCCACAACTTCACCTGCTTCCCTCTCCCCCGCAACA ACTTCTACCTGTCTCCCTCTACCCCTCCCACAACTTCTACCTGCCTCCCTCTACCCCCCCCAACTTCTAC CTGCTGAGCATCAAAATTGGCCTTGGGCTGGATGGTGCTGATGGGGGATGCGGGCCGGCGTGGCCTCTGA GGCTTCTGGCCCAGCGAGCCAGCTGCCAGGAGCAGAGTCAAGAGGGTCGCAGTCCCAGGGGGCAGCATGG TGGCGGCAGCAGGGTGGCAGGACTGTGGGAGGCCAAGGGTAGCACCACCAAGTCCCAGGACAGAGTCTAC TCTGCTGTCACAGAGCCCAGCCCAGGAAGTCCATGTCCATCCGTTGCCTCCCCACCCCCCACCTCCAGCC TCCTCGTGAGCCTAGCTTCGATCTGCACTTCCTGGCAGGGCCCTGGCACCATGTCCTATGTACAAAGTCC GAGTTGACCTCTGGCTGTTTATCCATTTCTCCTGCACCCCTGATTTCCACCGACAGTCCTTAGCCCTTTA CACGTTATCTTCCTTAAACCATCACCCAGTGGTCTTATCTCCATGGCCAACGTCACGGGGTTCATGAAGC CACTTGCTCAGGGCCCGGCAACAGGGAGCGCCGGAGGCGGGTCCCGAACCAGCGTTCGTTGAGCCTCGCC TGCAACCCCGCCCACGACCGCCGCCCGCTGGCCACAAGGGGCGCTGTTCCCAATGCGCCCGAGTGCGCGC AGGCGCACAAAGAAAAGCCGGCCAGGCCGCCGGAGCCCAAGGCGCAGGCGCACGAGGGGCGGATGCGGGC TACCCGCGCGCTCTGCCTTCCTCGGCCATCGATGCCTCGGGGCTCGTGGCGTCGGGCCTGGCGGGCTCCC CGTTGGGCGGGGGCGGCGGTCCGAGCGGCTGCGGCAGCGGAAGCGGGTCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXW5_2 ↗ | 9:136,942,687 | 負股 | 136,942,677–136,942,736 |
| FBXW5_1 ↗ | 9:136,944,658 | 負股 | 136,944,648–136,944,707 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_942CJW · enhancer · 136940024–136940519 · regulatory
ENSR9_5377NJR · CTCF_binding_site · 136944377–136944398 · regulatory
ENSR9_B326RM · promoter · 136944728–136945253 · regulatory
ENSR9_5377NM3 · CTCF_binding_site · 136944864–136944885 · regulatory
ENSR9_5377P5L · CTCF_binding_site · 136947796–136947817 · regulatory
ENSR9_5377P7C · CTCF_binding_site · 136948168–136948189 · regulatory
ENSR9_CHKWN · enhancer · 136949176–136951176 · regulatory
· motif · 136939973–136939987 · motif
· motif · 136940140–136940155 · motif
· motif · 136940145–136940157 · motif
· motif · 136940217–136940224 · motif
· motif · 136940257–136940270 · motif
· motif · 136940260–136940272 · motif
· motif · 136940263–136940270 · motif
· motif · 136943443–136943452 · motif
· motif · 136943694–136943709 · motif
· motif · 136943821–136943828 · motif
· motif · 136944379–136944395 · motif
· motif · 136944505–136944516 · motif
· motif · 136944577–136944588 · motif
· motif · 136944598–136944611 · motif
· motif · 136944616–136944629 · motif
· motif · 136944658–136944675 · motif
· motif · 136944672–136944685 · motif
· motif · 136944777–136944788 · motif
· motif · 136944777–136944788 · motif
· motif · 136944822–136944833 · motif
· motif · 136944822–136944833 · motif
· motif · 136944862–136944877 · motif
· motif · 136944866–136944882 · motif
· motif · 136944879–136944892 · motif
· motif · 136944884–136944894 · motif
· motif · 136944926–136944936 · motif
· motif · 136944968–136944981 · motif
· motif · 136944968–136944981 · motif
· motif · 136944999–136945005 · motif
· motif · 136945106–136945121 · motif
· motif · 136945107–136945121 · motif
· motif · 136945142–136945153 · motif
· motif · 136945144–136945153 · motif
· motif · 136945183–136945193 · motif
· motif · 136945190–136945200 · motif
· motif · 136947798–136947814 · motif
· motif · 136948170–136948186 · motif
· motif · 136948192–136948207 · motif
· motif · 136948197–136948209 · motif
· motif · 136948808–136948830 · motif
· motif · 136948808–136948830 · motif
· motif · 136948990–136949003 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：566 aa
FBXW5 蛋白質長 566 個胺基酸，屬於 FBXW5 family。其 N 端含 F-box（第 3–49 位），並註記有七個 WD repeat：WD 1–4 位於第 83–281 位，WD 5–7 位於第 394–539 位；另有一段 D-box motif，位於第 303–311 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位隨細胞週期、處理條件或異構型而改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- ADAMTSL4Q6UY14-3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFEMP2O95967 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBLN2P98095 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT31Q15323 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRT34O76011 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRT37O76014 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP4-1Q9BYQ7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP6-3Q3LI67 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-3Q9BYQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-4Q9BYQ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTCH2NLCP0DPK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 2 筆來源紀錄
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- VWC2Q2TAL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDB1Q16531 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXW5 是 SCF(FBXW5) 複合體成員，該複合體由 CUL1、SKP1、RBX1 與 FBXW5 組成；它也屬於 DCX(FBXW5) 複合體，後者至少包含 CUL4A 或 CUL4B、DDB1、FBXW5 與 RBX1。另有資料指出 FBXW5 與 CDC20、EPS8、TSC1、TSC2 及 SASS6 互作。TIPE1 也與 FBXW5 結合，並與 TSC2 競爭結合；TIPE1 因此可藉由阻止 TSC2 泛素化而提高其穩定性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXW5 是 SCF 與 DCX 兩類 E3 ubiquitin-protein ligase 複合體的底物辨識成分；SCF(FBXW5) 在 S phase 促進 SASS6 泛素化及蛋白酶體降解，以防止中心粒重複形成，並在 G2 phase 促進 actin regulator EPS8 短暫降解，引發有助於有絲分裂進程的細胞形狀改變。DCX(FBXW5) 則促進 TSC2 多聚泛素化與降解；FBXW5 也可能負向調節 IL1B 路徑中的 MAP3K7/TAK1 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of both SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) and DCX (DDB1-CUL4-X-box) E3 ubiquitin-protein ligase complexes. Substrate recognition component of the SCF(FBXW5) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of SASS6 during S phase, leading to prevent centriole reduplication. The SCF(FBXW5) complex also mediates ubiquitination and degradation of actin-regulator EPS8 during G2 phase, leading to the transient degradation of EPS8 and subsequent cell shape changes required to allow mitotic progression. Substrate-specific adapter of the DCX(FBXW5) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the polyubiquitination and subsequent degradation of TSC2. May also act as a negative regulator of MAP3K7/TAK1 signaling in the interleukin-1B (IL1B) signaling pathway PMID 18381890 ↗ · PMID 19232515 ↗ · PMID 21725316 ↗ |
| 分子活性 | FBXW5 參與蛋白質修飾，特別是蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXW5 是 SCF(FBXW5) 複合體的一部分，該複合體由 CUL1、SKP1、RBX1 與 FBXW5 組成；它也屬於至少含有 CUL4A 或 CUL4B、DDB1、FBXW5 與 RBX1 的 DCX(FBXW5) 複合體。FBXW5 與 CDC20、EPS8、TSC1、TSC2、SASS6 及 TIPE1 互作；TIPE1 與 TSC2 競爭結合 FBXW5，並藉由阻止 TSC2 泛素化提高其穩定性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complex SCF(FBXW5) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXW5. Component of the DCX(FBXW5) E3 ubiquitin ligase complex, at least composed of (CUL4A or CUL4B), DDB1, FBXW5 and RBX1. Interacts with CDC20, EPS8, TSC1, TSC2 and SASS6. Interacts with TIPE1; TIPE1 competes with TSC2 to bind FBXW5 increasing TSC2 stability by preventing its ubiquitination PMID 18381890 ↗ · PMID 21725316 ↗ |
| 細胞定位 | FBXW5 位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCGGCCATCGATGCCTCGGGGCTCGTGGCGTCGGGCCTG40GCGGGCTCCCCGTTGGGCGGGGGCGGCGGTCCGAGCGGCT80GCGGCAGCGGAAGCGGGTCCGGGTCGCGCAGGGCGGGGGC120GGCGCAGCGGGCGGAGGCGGCCGTGGGCCGCCTGGGCAGA160ATGTCACGATGGACGAGGGCGGCACGCCCCTGCTCCCCGA200CAGCCTGGTCTACCAGATCTTCCTGAGCCTGGGCCCGGCC240GACGTGCTGGCCGCCGGGCTGGTGTGCCGCCAATGGCAGG280CCGTGTCGCGGGACGAGTTCCTGTGGAGGGAGCAGTTCTA320CCGCTACTACCAGGTGGCCCGCGACGTGCCCCGACACCCA360GCGGCCATGTCCTGGTACGAGGAGTTCCAGCGGCTGTATG400ACACGGTGCCCTGCGTGGAGGTGCAGACGCTGCGGGAACA440CACAGACCAGGTCCTGCACCTCAGCTTCTCCCATTCCGGG480TACCAGTTCGCGTCCTGCTCCAAGGACTGCACTGTGAAGA520TCTGGAGCAACGACCTGACCATCTCGCTGCTGCACAGCGC560GGACATGCGGCCCTACAACTGGAGCTACACCCAGTTCTCC600CAGTTCAACAAGGACGACTCGCTACTGCTGGCCTCGGGGG640TGTTCCTGGGGCCGCACAACTCCTCATCCGGCGAGATTGC680TGTCATCAGCCTAGACTCCTTCGCGCTGCTGTCCCGCGTG720CGGAACAAGCCCTATGACGTGTTTGGCTGTTGGCTCACCG760AGACCAGCCTCATCTCGGGGAACCTGCACCGCATCGGAGA800TATCACCTCCTGCTCGGTGCTGTGGCTCAACAATGCCTTC840CAGGATGTGGAGTCAGAGAACGTCAACGTGGTGAAGCGGC880TGTTCAAGATCCAGAACCTCAATGCCAGCACCGTCCGCAC920GGTGATGGTGGCCGACTGCAGCCGCTTCGACAGCCCTGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。