演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXW4Fbw4

F-box and WD repeat domain containing 4

FBXW4 是蛋白質編碼基因,產物具有 F-box 與 WD 重複序列,可能參與蛋白質泛素化及肢體發育相關訊號。

Homo sapiens10q24.32UniProt P57775
OFFICIAL SYMBOL
FBXW4
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P57775
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXW4(F-box and WD repeat domain containing 4)是人類的蛋白質編碼基因。其蛋白質產物屬於含 F-box 與 WD 重複序列的蛋白質,所提供的序列註解顯示蛋白質長 412 個胺基酸,包含一個 F-box 區域及六個 WD 重複序列。資料指出,FBXW4 可能辨識並結合部分磷酸化蛋白質,並與蛋白質泛素化及降解有關;它也可能參與肢體正常發育所需的訊號途徑。這些功能描述具有推測性,且目前提供的資料未進一步界定其辨識的蛋白質或各訊號途徑中的具體作用。

Official symbol
FBXW4
Gene name
F-box and WD repeat domain containing 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10847
UniProt
P57775
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Fbw4dactylinSHFM3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q24.32
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegFBXW4pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:101,610,663–101,695,298
Gene span
84,636 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000331272 ★101,610,666–101,695,1709
ENST00000664783101,610,663–101,695,2599
ENST00000919944101,610,663–101,695,2598
ENST00000919945101,610,663–101,695,2598
ENST00000919946101,610,663–101,695,2595
ENST00000945850101,610,663–101,695,25910
ENST00000945851101,610,663–101,695,2599
ENST00000945852101,610,663–101,695,2599
ENST00000945853101,610,663–101,695,2599
ENST00001143013101,610,663–101,695,2599

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXW4 可能辨識並結合部分磷酸化蛋白質,促進這些蛋白質的泛素化與降解。來源以推測語氣描述此作用,沒有指出被辨識的蛋白質種類,也未提供泛素化或降解的實驗細節,因此不宜將其延伸為對特定標的或分子步驟的確定描述。

FBXW4 也可能參與對肢體正常發育至關重要的訊號途徑,並可能涉及 Wnt 訊號。現有資訊沒有明確說明它在 Wnt 訊號中的位置,或其蛋白質辨識及降解作用如何連結至肢體發育;因此,這些關係應保留為可能的功能參與,而非已確立的因果機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 101695170 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXW4 ENST00000331272 GRCh38 chr10:101695070-101696170 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACAGACAGAAATTGGCATCTTCCTCCCCTCCTCCAAGTTTTACTGCCTAGCCCAATGCTAATAGAAAAA
TAACCCGAGCCACAAATGCAAGTCCCATGTATAATTTTAAATTTTCTAGTAGTTACATTAAAATATATTG
TATTTAGCCCAATACAGCGTATCCAAAATATTAACACTTCAACACGTAATCAATATAAAATTATTAATGA
GATATTTTGCATTCTTTTTTTTGTATGGCTTCAAAATCTGGTGTGCATTTCTCACTTATAGCTCATTTCA
ATTTGTATTAGCCACATTTCAAATGCTCAGCAGCCACATGTGACGAGGGAGGACACTGTTGGACAGCACA
GGTCTAGACCTCAGTAGCTCTCCCTTCAGATTAATGCCATGTGAATCGAATGGGTGGTATGAAGAATGGA
TGCTGAGTCCTTGGAGAATCCACTTGCACTTGGGTGGTGACTGATAAGAAGCCCTAGCTGTGCCATTTCC
TGATACATGACTGTTTTTGAAGTTATGGACTCAGGATCTAGAAGACTGCAAATCCCCAAATACGTCTAAC
ACCCAAGCTCACGCCAGGACCGTGCTTCCGGGCCTGTGTGAGAACCTAAGCTATGGAACCTGTCAACTTC
TAGGGCTGCAGATTCGTTGGGCCCTCACATGTGGCCCGTGGAAAGGAGGCATCACTCGAGGAAGAGGAGG
GCTTCTAGAGGGGCAAGGCCACCCAACTAGGGGCTTCTTGAGGGCAGGTGCTCCAAATGGCCGCTTCCTG
AGGGCAGCGGGTCCTCTTGTGGCCTCAGGCAGGGCCCTGAAACCGGCCTCACGTGTTTGCAGCGCGAACT
CCTGTGCTTCCACCAAGCGCTCTCGGGGATGCGGGGGTGGTGTCAGCGCCCCGGCCCCAGCCCGCACCCC
GAAGTGGCTCCAAGGCTGCAGGTGTGAGGGGCGTGCCCAGGGCTCGGCCCGCGCCGCCCCATGTGACCCG
GTCCGACATGGTGTCGCCTCCTCCCGGGGCGGCGGCGGTGGCGGCTCGGGCTGGGCTCCGCGTCGGGCCG
GCCCCGCGGCCGCTCATGGGCAGCCAGGGCCGCTCGGGGCCCCCCGGGAAC
FBXW4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXW4_2 ↗10:101,695,004負股101,694,994–101,695,053
FBXW4_1 ↗10:101,695,170負股101,695,160–101,695,219

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_93HCS9 · promoter · 101693578–101693908 · regulatory

ENSR10_93HCSD · promoter · 101693911–101694411 · regulatory

ENSR10_BQ6WT · promoter · 101695160–101695749 · regulatory

· motif · 101692838–101692849 · motif

· motif · 101693102–101693117 · motif

· motif · 101693842–101693855 · motif

· motif · 101693842–101693855 · motif

· motif · 101694239–101694252 · motif

· motif · 101694249–101694261 · motif

· motif · 101694251–101694258 · motif

· motif · 101694331–101694344 · motif

· motif · 101694477–101694486 · motif

· motif · 101694674–101694681 · motif

· motif · 101694875–101694889 · motif

· motif · 101694910–101694925 · motif

· motif · 101694943–101694957 · motif

· motif · 101694949–101694960 · motif

· motif · 101694949–101694960 · motif

· motif · 101694972–101694992 · motif

· motif · 101694978–101694992 · motif

· motif · 101694984–101694998 · motif

· motif · 101695043–101695056 · motif

· motif · 101695111–101695124 · motif

· motif · 101695152–101695165 · motif

· motif · 101695235–101695244 · motif

· motif · 101695290–101695303 · motif

· motif · 101695335–101695351 · motif

· motif · 101695335–101695351 · motif

· motif · 101695344–101695353 · motif

· motif · 101695344–101695353 · motif

· motif · 101695419–101695428 · motif

· motif · 101695545–101695558 · motif

· motif · 101696805–101696818 · motif

· motif · 101696805–101696818 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:412 aa

1 aa412 aa結構域重複區
依 P57775 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

FBXW4 蛋白質長 412 個胺基酸。序列註解包含位於第 25–71 個胺基酸的 F-box,以及六個 WD 重複序列:WD 1 至 WD 6 分別位於第 154–190、193–229、236–277、283–321、327–366 與 373–409 個胺基酸。

結構域F-box25–71 aa
重複區WD 1154–190 aa
重複區WD 2193–229 aa
重複區WD 3236–277 aa
重複區WD 4283–321 aa
重複區WD 5327–366 aa
重複區WD 6373–409 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P57775…

AlphaFold · P57775

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Fbw4FBXW4PRKNSKP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXW4 可能是 SCF(SKP1-cullin-F-box)蛋白質連接酶複合體的一部分;來源將此描述為可能的複合體關係。另有依相似性推定 FBXW4 與 POUF51 互作的註記,並非此處提供的直接互作證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

FBXW4 條目所列疾病為分手/分足畸形 3(SHFM3),其特徵涉及自足部中央射線,可表現為指(趾)蹼合、手足中央裂隙,以及指骨、掌骨或蹠骨缺如和/或發育不全。部分患者另有智能障礙、外胚層與顱顏表徵或口顏裂。來源指出,影響此條目所代表基因的變異會造成此病;未提供特定變異詳情。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXW4 可能辨識並結合部分磷酸化蛋白質,促進其泛素化與降解;也可能參與肢體正常發育所需的關鍵訊號途徑,並涉及 Wnt 訊號。原文以可能性描述這些功能,未指定標的或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

Probably recognizes and binds to some phosphorylated proteins and promotes their ubiquitination and degradation. Likely to be involved in key signaling pathways crucial for normal limb development. May participate in Wnt signaling

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用FBXW4 可能是 SCF(SKP1-cullin-F-box)蛋白質連接酶複合體的一部分;此外,來源依相似性註記其與 POUF51 互作,該互作並非此處提供的直接證據。推論支持
證據與來源

Part of a SCF (SKP1-cullin-F-box) protein ligase complex (Probable). Interacts with POUF51 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 FBXW4 條目所代表基因的變異與分手/分足畸形 3(SHFM3)相關。此肢體畸形涉及自足部中央射線,可有指(趾)蹼合、手足中央裂隙及指骨、掌骨或蹠骨缺如或發育不全;部分患者另見智能障礙、外胚層或顱顏表徵及口顏裂。含實驗來源
證據與來源

Split-hand/foot malformation 3 SHFM3 A limb malformation involving the central rays of the autopod and presenting with syndactyly, median clefts of the hands and feet, and aplasia and/or hypoplasia of the phalanges, metacarpals, and metatarsals. Some patients have been found to have intellectual disability, ectodermal and craniofacial findings, and orofacial clefting. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 246560

PMID 12913067 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000331272 · 2,394 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTCCCGGGGCGGCGGCGGTGGCGGCTCGGGCTGGGCTCCG40
41CGTCGGGCCGGCCCCGCGGCCGCTCATGGGCAGCCAGGGC80
81CGCTCGGGGCCCCCCGGGAACGGCGGGCCCGGCGAGGGCG120
121AGGGCGGAGAGGCGAGGAAGCTGCAGGAAGGGAGGGTGGC160
161GAGGGGGAAGCGAAGGAAGGGGAAGGGGAAGGGAAAAGCG200
201AGAGCGGGGCAAGGCGGAAGAGGAAGCGGGGCGGAAGGGA240
241AGCCCGGGCCGCAGACGGCGAAGGAGGCAGCCGGGCCGGG280
281GGCTGACGCGGGAGCGAGGGCATGCCCAAGGGAGGAAGCA320
321GAGGGAGGCAGAAGCGTGGAGGAAGGGGCGAGAGGCATCG360
361TCAAGGGAGTCGAGGGGAGCGCAGGGGCCGGGAAGGAGGC400
401ACAAGGAAGAGAGTATGGGAAGAAGGAGGAATGGAGGGTC440
441AGGGCTAGGCGGCGGGAGGGCGCCAGGCCGGGAAGAGCAC480
481AGGGACGAGGGGGTCAGGCTTGGGCCGACATCGCGGGGAC520
521AGGGGTGGCCATGGCGGCGGCGGCCGGGGAGGAGGAGGAG560
561GAGGAGGAGGCGGCTCGGGAGTCGGCTGCCCGCCCGGCCG600
601CGGGGCCTGCGCTCTGGCGCCTGCCGGAGGAGCTGCTGCT640
641GCTCATCTGCTCCTACCTGGACATGCGGGCCCTCGGCCGC680
681CTGGCCCAGGTGTGCCGCTGGCTGCGGCGCTTCACCAGCT720
721GCGATCTGCTCTGGCGCCGGATAGCCCGGGCCTCGCTCAA760
761CTCCGGCTTCACGCGGCTCGGCACCGACCTGATGACCAGT800
801GTCCCAGTGAAGGAACGAGTGAAGGTGTCTCAGAACTGGA840
841GACTGGGGCGCTGCCGAGAGGGGATTCTGCTGAAGTGGAG880
881ATGCAGTCAGATGCCCTGGATGCAGCTAGAGGATGATTCT920
921CTGTACATATCCCAGGCTAATTTCATCCTGGCCTACCAGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。