基因總覽
FBXW2(F-box and WD repeat domain containing 2)是人類的蛋白質編碼基因,其產物亦稱 F-box/WD repeat-containing protein 2。這個蛋白質具有 F-box 與 WD 重複序列,是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase complex 的組成部分。來源資料指出,它在該複合體中負責底物辨識;其序列註解包含一個 F-box domain 與七個 WD repeats,構成辨識功能所屬的蛋白質架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000608872 ★ | 120,756,974–120,793,416 | 8 |
| ENST00001133074 | 120,756,974–120,793,438 | 8 |
| ENST00001041169 | 120,757,010–120,793,438 | 8 |
| ENST00000684047 | 120,757,720–120,793,367 | 7 |
| ENST00000684001 | 120,757,720–120,793,438 | 8 |
| ENST00000684405 | 120,757,720–120,793,438 | 8 |
| ENST00000882759 | 120,757,926–120,793,431 | 8 |
| ENST00000917243 | 120,759,199–120,793,367 | 8 |
| ENST00000955468 | 120,759,204–120,793,438 | 8 |
| ENST00000882760 | 120,762,194–120,793,431 | 7 |
| ENST00000882761 | 120,762,512–120,793,431 | 8 |
| ENST00000882762 | 120,763,424–120,793,438 | 7 |
顯示 12/40 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXW2 是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識組成部分。這表示它在該類泛素連接酶複合體中負責辨認底物,而不是單獨代表整個複合體的作用;可確認的功能資訊限於此一角色,來源未進一步列出被辨識的底物或其調控條件。
在分子組成上,SCF 名稱反映其由 SKP1、CUL1 與 F-box protein 等部分構成。FBXW2 屬於其中的 F-box 蛋白,因而參與複合體的底物辨識。來源未提供底物辨識後的具體分子事件、泛素化對象或其後續命運,因此不能據此指定特定細胞過程或生理結果。
可據現有資料描述的功能意義,是 FBXW2 為 SCF 型 E3 ubiquitin ligase complex 提供底物辨識部分;其作用脈絡來自所屬複合體,而非已知的獨立催化功能。來源沒有交代其辨識特異性、作用組織、實驗條件或相關生物學表型,這些面向均不宜延伸推論。
Promoter 與基因調控
>FBXW2 ENST00000608872 GRCh38 chr9:120793316-120794416 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCAGTGAGCCAAGATCGTGTCACTGTACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGATACGTTGCCTCAAAAAAAAA AAAAGGATAACTTGTGCTCTGAAGTCGGTTTGGGTTGAAATCCTATGACAGCCATTTACTATGACCTTAG GCAAGATGCCTAAACCTCTTTTGATTTCAGTTTCCCCATCTCTAAAAAGGGGCCTAATAATAGTTACTAG CTTGTGGGGTTGTTGTGGGAACTGAGTGAGATGGTACACAAAAAATGTTGAGAAAGAGTGCGTGGGATTT TTTAGCTCAGTTTTAGTTCTTGACGCCAAAAGGTTTGCATGCTTCATTTCCTTCAATCCTCAGAGCCTTC GGATGGGGACCTCACTATAATTGCTATGCAGATGAAGCAAAGTCTGAGAGGTTAAGTAACCGGGCCACAG CCAGAGTGTAAACGTTGTGATTCATTCAAATCTACATCACTTGACTGTCTCTTTTCATTCAACAACCTCC TTACCTTGCTTTATTTTTCTCCTTTGCACGAGCCTTAGTTTATCTGTCTTCCTCCTCCTAATAGATGTAA GGCCCAGGCGGTCAGGGGCTTTTGCGTTTTTTGTTCACTAACCCTATCCCCTAGAACAGCGTTCGGGATA AAGAGGTGCCCAACAGGTTGTATGAATTTGGACACGTCTCTTAACTTCTCTAAGCCACAGCTCCCTCTCC TCCGTAAAATGAGGATAATAAGAAAAACTACTGCAGAGCTGGTGCAAGATCAGATTGGAGGAGGGACATA AGCGCGCTGTGCAAACCTGGATGTACGGTACGAAAGGAACCTCCGTTCTAGGTTGCACCCAGCCTAAGCA CCGTGAGGGCCGCGCGGCACGCGTTCAGCTTCCCGGGACGCTCTTCTCCCCACCCCTACTCCCGGCCTCC AGCCTCCCACCACCCACCTCCGGGCGGGGACCGGAAGTGCAGCCGCTTCCGCCGGGAGCCGCGGAGCTGA GGGACGCGCGGAGATGACGCAGGCAGCACCGGAAGCCGCTCCCCTGTGAGGCTGCGGACCGGGAGCAGCG GCCGCAGGTCCGGGTCTGTATGCGAGGCGGGGCCGGTCGGGGAGGGGACTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXW2_1 ↗ | 9:120,793,404 | 負股 | 120,793,394–120,793,453 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BTZ8S · enhancer · 120792634–120793356 · regulatory
ENSR9_533F552 · CTCF_binding_site · 120793026–120793047 · regulatory
ENSR9_85JW2L · promoter · 120793357–120793513 · regulatory
ENSR9_BTZ8Z · enhancer · 120793514–120794338 · regulatory
· motif · 120792186–120792197 · motif
· motif · 120793028–120793044 · motif
· motif · 120793400–120793409 · motif
· motif · 120793468–120793477 · motif
· motif · 120793468–120793479 · motif
· motif · 120793468–120793479 · motif
· motif · 120793483–120793492 · motif
· motif · 120794167–120794182 · motif
· motif · 120795777–120795788 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:454 aa
FBXW2 蛋白質長 454 個胺基酸。其 F-box domain 位於第 54–101 個胺基酸;另有七個 WD repeats,依序涵蓋第 139–175、179–213、217–255、259–306、313–352、364–403 與 410–452 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CLVS2Q5SYC1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CUL1Q13616 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GCM1Q9NP62 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NUDCQ9Y266 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RACK1P63244 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TRIM54Q9BYV2 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
FBXW2 被註明可直接與 SKP1 及 CUL1 互作。此處描述的是直接互作;另有資料指出 FBXW2 是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識組成部分,但未提供其他結合夥伴或互作條件。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXW2 是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase complex 中負責辨識底物的組成部分。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex |
| 交互作用 | FBXW2 可直接與 SKP1 及 CUL1 互作。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGCAGCACCGGAAGCCGCTCCCCTGTGAGGCTGCGGACC40GGGAGCAGCGGCCGCAGGTCCGGGCGCCATGGCTGCGGAG80CGGACCCGGCCGCTGCAAGGCTCTGGCGGTCCGAGCGTGC120CTAGTAGCTGTGAACCCGGCGCGAGGTCCCGGGCCCCGGG160GCGCTCGCTCAGGTAAATTTTTCCATAACCTTATGGAGAG200AAAGGACTTTGAGACATGGCTTGATAACATTTCTGTTACA240TTTCTTTCTCTGACGGACTTGCAGAAAAATGAAACTCTGG280ATCACCTGATTAGTCTGAGTGGGGCAGTCCAGCTCAGGCA320TCTCTCCAATAACCTAGAGACTCTCCTCAAGCGGGACTTC360CTCAAACTCCTTCCCCTGGAGCTCAGTTTTTATTTGTTAA400AATGGCTCGATCCTCAGACTTTACTCACATGCTGCCTCGT440CTCTAAACAGTGGAATAAGGTGATAAGTGCCTGTACAGAG480GTGTGGCAGACTGCATGTAAAAATTTGGGCTGGCAGATAG520ATGATTCTGTTCAGGACGCTTTGCACTGGAAGAAGGTTTA560TTTGAAGGCTATTTTGAGAATGAAGCAACTGGAGGACCAT600GAAGCCTTTGAAACCTCGTCATTAATTGGACACAGTGCCA640GAGTGTATGCACTTTACTACAAAGATGGACTTCTCTGTAC680AGGGTCAGATGACTTGTCTGCAAAGCTGTGGGATGTGAGC720ACAGGGCAGTGCGTTTATGGCATCCAGACCCACACTTGTG760CAGCGGTGAAGTTTGATGAACAGAAGCTTGTGACAGGCTC800CTTTGACAACACTGTGGCTTGCTGGGAATGGAGTTCCGGA840GCCAGGACCCAGCACTTTCGGGGGCACACGGGGGCGGTAT880TTAGCGTGGACTACAATGATGAACTGGATATCTTGGTGAG920CGGCTCTGCAGACTTCACTGTGAAAGTATGGGCTTTATCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。