演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXW10BHREP

F-box and WD repeat domain containing 10B

FBXW10B 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens17p12UniProt O95170
OFFICIAL SYMBOL
FBXW10B
CHROMOSOME
17
UNIPROT
O95170
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXW10B 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 F-box and WD repeat domain containing 10B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17p12。

Official symbol
FBXW10B
Gene name
F-box and WD repeat domain containing 10B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14379
UniProt
O95170
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HREPSM25H2FBXW10P1CDRT1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p12
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegFBXW10Bpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:15,565,484–15,619,704
Gene span
54,221 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000395906 ★15,583,886–15,619,70412
ENST0000039566715,565,484–15,619,51213
ENST0000058396515,588,902–15,598,6183
ENST0000026164415,605,224–15,615,6945

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 15619704 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXW10B ENST00000395906 GRCh38 chr17:15619604-15620704 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GATCCAAAGAGTCTGCTTCGGGCCTCCCTTCTCTTTGCCACCCTCCTTTGTCTGGCCTTCCCGATTAATT
AAATATTAATCTACTCATGCCTTTTCTCCAGATTCCTCTTCAGACAGAAGAGGTTGAGCTGTGAGAACTG
ATCTCATTCTTAACCTGATTCCTATTCCCCATTCTGACCCTAGTATGTGACTGCCATTGCCAACAAAACC
CCAGCGATGGACTCCATTACCTTTCTCTGGTTGTGCCTGATCTTTCAACATGGGCATTAGAAAGGCACAC
AATATTGTAAACCTTTTGATTTTATCTAGGGTAATAATACTTAGTAACAATAGCAGCAACAACTGATCTC
ATATATTTAATGCAATCCTAGAAGGTAGTTATCATTTTTATTACCCACCTTTATCTTCTCCATCCTCATA
ACTAGGATGGAGACACTGAGGCTCAGAGAGGACAGGTTGCTTGCTCAAGACCATATAGCTCCTAAGTACC
AGAGTCAATGTTTGAACCGAGTCTTACCTGAAGTAGGAGAATTATCTCAGCATGACTTTGAAACTCTTTC
TGTGAGCTGCCCAATATGTTTTGCCTGGGCACTTTGACTACAGTGAGATTTCTGGTTAGTATTGTGAAGC
AGTTAAATAACTTAAATTTACATTAAACATTTCTGGTTTTACTTTGATGATGACTTAAGAAAATGAATAT
AAACATATTTAGCATCATTGGGATAGCCACTTTGTAACTGAACAGATATAAACATAAGAAGTTTGCATCT
TATTTTATATTCATGAATATTCAGAAGCCATATATAACAACAATAATTAAAGCGCAACACCAGTAATAGT
CCACATATTACTTAAATTTGACTAACAGTATTCTTGTTGTTCTAGAAATGAGATGACCAGCTCTTTCAGA
ATATACAGCAACTGCCTCCACATAAAGCAGTGCCAGGTTTAGGAGATTTACGGTAAAGCCATGTTTCCAA
GGAGGTCTGTACAAAAAGCCAGACTTCTGCTGGCAGTTACTGAGAGAGATAGGCTTTCCATCCATGGCAG
CCATTTACTTTTGCTCTGGGAGACGTTTGTAATAGAAAAGGCACAACTGGG
FBXW10B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CDRT1_1 ↗17:15,619,704負股15,619,694–15,619,753
CDRT1_2 ↗17:15,628,950負股15,628,940–15,628,999

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_55N78D · CTCF_binding_site · 15619467–15619488 · regulatory

ENSR17_987DK · promoter · 15619502–15619871 · regulatory

ENSR17_8GDSN · enhancer · 15622217–15622385 · regulatory

ENSR17_8GDTL · enhancer · 15623813–15624016 · regulatory

· motif · 15619469–15619485 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:752 aa

1 aa752 aa重複區
依 O95170 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

F-box and WD repeat domain containing protein 10B 長 752 個胺基酸。序列註解列出六個 WD 重複區:第 1 個位於第 169–206 位,其餘五個分布於第 451–652 位;此資料未提供其他功能區域註解。

重複區WD 1169–206 aa
重複區WD 2451–490 aa
重複區WD 3493–532 aa
重複區WD 4534–569 aa
重複區WD 5572–609 aa
重複區WD 6611–652 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95170…

AlphaFold · O95170

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000395906 · 7,540 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACTTCTGCTGGCAGTTACTGAGAGAGATAGGCTTTCCA40
41TCCATGGCAGCCATTTACTTTTGCTCTGGGAGACGTTTGT80
81AATAGAAAAGGCACAACTGGGGTATTTATTCATTTCCCCC120
121CGTTCCTCTAGTGTTTGGTGGCGTTGCCGTTGCAAGTGCG160
161CAGGGCTAAAATGAACTGGTTATCTTAGGATCATGGAAAA200
201CCTGGAATCAAGGCTCAAGAATGCCCCCTATTTTCGTTGT240
241GAGAAGGGAACCGATTCCATCCCTCTATGCCGGAAGTGTG280
281AGACGCGTGTCTTAGCCTGGAAGATCTTCTCTACCAAAGA320
321GTGGTTCTGCAGGATCAATGACATATCACAGAGGAGGTTT360
361CTAGTTGGCATTCTGAAGCAGTTAAATAGCTTATATTTGT400
401TACACTATTTCCAAAATATCCTTCAGACCACACAGGGAAA440
441GGATTTCATCTATAACAGGTCCCGGATCGACCTCAGCAAG480
481AAAGAGGGGAAAGTTGTGAAGTCCTCCTTGAACCAAATGT520
521TGGATAAAACAGTAGAACAGAAGATGAAAGAGATCTTGTA560
561TTGGTTTGCGAACAGCACCCAGTGGACCAAGGCGAATTAT600
601ACTCTCTTACTGCTGCAGATGTGCAACCCCAAATTACTGC640
641TCACTGCTGCCAATGTGATCAGAGTCCTGTTTCTGAGAGA680
681GGAGAACAATATCTCAGGGCTCAATCAAGACATCACAGAT720
721GTGTGTTTTTCCCCTGAGAAAGACCACAGCTCCAAGTCTG760
761CGACCTCACAAGTCTATTGGACAGCCAAAACTCAGCACAC800
801ATCCCTTCCTTTGTCCAAAGCCCCAGAAAATGAACACTTC840
841CTTGGGGCAGCATCTAACCCTGAGGAACCATGGAGGAATT880
881CACTCCGGTGTATATCCGAAATGAATAGGCTGTTTTCTGG920
921AAAAGCAGACATAACCAAGCCAGGGTACGATCCCTGCAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。