基因總覽
FBXW10B 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 F-box and WD repeat domain containing 10B。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17p12。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000395906 ★ | 15,583,886–15,619,704 | 12 |
| ENST00000395667 | 15,565,484–15,619,512 | 13 |
| ENST00000583965 | 15,588,902–15,598,618 | 3 |
| ENST00000261644 | 15,605,224–15,615,694 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>FBXW10B ENST00000395906 GRCh38 chr17:15619604-15620704 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GATCCAAAGAGTCTGCTTCGGGCCTCCCTTCTCTTTGCCACCCTCCTTTGTCTGGCCTTCCCGATTAATT AAATATTAATCTACTCATGCCTTTTCTCCAGATTCCTCTTCAGACAGAAGAGGTTGAGCTGTGAGAACTG ATCTCATTCTTAACCTGATTCCTATTCCCCATTCTGACCCTAGTATGTGACTGCCATTGCCAACAAAACC CCAGCGATGGACTCCATTACCTTTCTCTGGTTGTGCCTGATCTTTCAACATGGGCATTAGAAAGGCACAC AATATTGTAAACCTTTTGATTTTATCTAGGGTAATAATACTTAGTAACAATAGCAGCAACAACTGATCTC ATATATTTAATGCAATCCTAGAAGGTAGTTATCATTTTTATTACCCACCTTTATCTTCTCCATCCTCATA ACTAGGATGGAGACACTGAGGCTCAGAGAGGACAGGTTGCTTGCTCAAGACCATATAGCTCCTAAGTACC AGAGTCAATGTTTGAACCGAGTCTTACCTGAAGTAGGAGAATTATCTCAGCATGACTTTGAAACTCTTTC TGTGAGCTGCCCAATATGTTTTGCCTGGGCACTTTGACTACAGTGAGATTTCTGGTTAGTATTGTGAAGC AGTTAAATAACTTAAATTTACATTAAACATTTCTGGTTTTACTTTGATGATGACTTAAGAAAATGAATAT AAACATATTTAGCATCATTGGGATAGCCACTTTGTAACTGAACAGATATAAACATAAGAAGTTTGCATCT TATTTTATATTCATGAATATTCAGAAGCCATATATAACAACAATAATTAAAGCGCAACACCAGTAATAGT CCACATATTACTTAAATTTGACTAACAGTATTCTTGTTGTTCTAGAAATGAGATGACCAGCTCTTTCAGA ATATACAGCAACTGCCTCCACATAAAGCAGTGCCAGGTTTAGGAGATTTACGGTAAAGCCATGTTTCCAA GGAGGTCTGTACAAAAAGCCAGACTTCTGCTGGCAGTTACTGAGAGAGATAGGCTTTCCATCCATGGCAG CCATTTACTTTTGCTCTGGGAGACGTTTGTAATAGAAAAGGCACAACTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CDRT1_1 ↗ | 17:15,619,704 | 負股 | 15,619,694–15,619,753 |
| CDRT1_2 ↗ | 17:15,628,950 | 負股 | 15,628,940–15,628,999 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_55N78D · CTCF_binding_site · 15619467–15619488 · regulatory
ENSR17_987DK · promoter · 15619502–15619871 · regulatory
ENSR17_8GDSN · enhancer · 15622217–15622385 · regulatory
ENSR17_8GDTL · enhancer · 15623813–15624016 · regulatory
· motif · 15619469–15619485 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:752 aa
F-box and WD repeat domain containing protein 10B 長 752 個胺基酸。序列註解列出六個 WD 重複區:第 1 個位於第 169–206 位,其餘五個分布於第 451–652 位;此資料未提供其他功能區域註解。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGACTTCTGCTGGCAGTTACTGAGAGAGATAGGCTTTCCA40TCCATGGCAGCCATTTACTTTTGCTCTGGGAGACGTTTGT80AATAGAAAAGGCACAACTGGGGTATTTATTCATTTCCCCC120CGTTCCTCTAGTGTTTGGTGGCGTTGCCGTTGCAAGTGCG160CAGGGCTAAAATGAACTGGTTATCTTAGGATCATGGAAAA200CCTGGAATCAAGGCTCAAGAATGCCCCCTATTTTCGTTGT240GAGAAGGGAACCGATTCCATCCCTCTATGCCGGAAGTGTG280AGACGCGTGTCTTAGCCTGGAAGATCTTCTCTACCAAAGA320GTGGTTCTGCAGGATCAATGACATATCACAGAGGAGGTTT360CTAGTTGGCATTCTGAAGCAGTTAAATAGCTTATATTTGT400TACACTATTTCCAAAATATCCTTCAGACCACACAGGGAAA440GGATTTCATCTATAACAGGTCCCGGATCGACCTCAGCAAG480AAAGAGGGGAAAGTTGTGAAGTCCTCCTTGAACCAAATGT520TGGATAAAACAGTAGAACAGAAGATGAAAGAGATCTTGTA560TTGGTTTGCGAACAGCACCCAGTGGACCAAGGCGAATTAT600ACTCTCTTACTGCTGCAGATGTGCAACCCCAAATTACTGC640TCACTGCTGCCAATGTGATCAGAGTCCTGTTTCTGAGAGA680GGAGAACAATATCTCAGGGCTCAATCAAGACATCACAGAT720GTGTGTTTTTCCCCTGAGAAAGACCACAGCTCCAAGTCTG760CGACCTCACAAGTCTATTGGACAGCCAAAACTCAGCACAC800ATCCCTTCCTTTGTCCAAAGCCCCAGAAAATGAACACTTC840CTTGGGGCAGCATCTAACCCTGAGGAACCATGGAGGAATT880CACTCCGGTGTATATCCGAAATGAATAGGCTGTTTTCTGG920AAAAGCAGACATAACCAAGCCAGGGTACGATCCCTGCAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。