基因總覽
FBXO9（F-box protein 9）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 F-box 蛋白家族。蛋白質全長 447 個胺基酸，含有 F-box 結構域，並具有 TPR 重複區域；序列註解亦標示一段可能無序的區域。FBXO9 的主要角色是作為 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分，協助複合體作用於特定目標蛋白。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000323557 ★ | 53,065,404–53,100,873 | 13 |
| ENST00000459845 | 53,051,991–53,073,638 | 5 |
| ENST00000498744 | 53,054,557–53,081,098 | 7 |
| ENST00000370939 | 53,064,998–53,101,045 | 13 |
| ENST00001137803 | 53,065,404–53,101,045 | 13 |
| ENST00000473337 | 53,066,037–53,081,018 | 6 |
| ENST00000244426 | 53,070,852–53,101,045 | 12 |
| ENST00000484436 | 53,092,811–53,098,368 | 6 |
| ENST00000473318 | 53,093,477–53,097,814 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO9 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分。此複合體可促使目標蛋白泛素化，繼而引導其經蛋白酶體降解；FBXO9 因而參與細胞週期、細胞增殖及染色體穩定性的維持等生物過程。
在生長因子缺乏後，CK2 會磷酸化與 mTORC1 結合的 TTI1 和 TELO2。FBXO9 介導這些磷酸化蛋白的泛素化，使其降解；但當 TTI1 和 TELO2 是 mTORC2 的一部分時，FBXO9 不會介導它們的泛素化。這種依複合體狀態而異的作用，使 mTORC1 失活，限制細胞生長與蛋白質轉譯；同時，mTORC1 對 mTORC2 的回饋抑制解除，mTORC2 因而活化。
FBXO9 也透過泛素化及蛋白酶體降解調節染色質調節因子 PRMT4 的周轉，並參與維持上皮細胞存活。此外，依據相似性資料，FBXO9 可促進 PPARgamma（PPARG）的泛素化、調節其穩定性，並因此參與脂肪細胞分化。這項 PPARgamma 相關功能的證據屬於相似性推論。
Promoter 與基因調控
>FBXO9 ENST00000323557 GRCh38 chr6:53064404-53065504 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTGGTGAGGCTGGTCTCGAACTCTTGACCTCGTGAGCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATT ACAGGCGTGGGCCACCGCGCCCAGCGGATATACTGCATTTTTAATCTCTCCAGAATAGAATGGATTAGAA ATTTAAACTCTGTAAACTCGTTGAATGTTTGGAAGCCTATTAGTCCCTGGCACCACTAGAAACTTTAAAA ACTCAGTAAATGTTTGCTAAATTAAAGTTATAGGCTATGAAGCCTATCAGTTTTCACAAAACAGGCAAAC CCGTAGTTAAAAAGATTTAAATTGTGTAAAAGCAAAGTATCACCTTATGAACAAGTACATTCACTCAAGA AGAAATCAGGTAGTTTGGGCTTTAAGAGGTGGGGCCGAGGACCAAGTGTAAGTTCCGGTGCTCAAACCTG AGCGGCCGACTACAAATCCCAGAGTGCCTCGCGGGCGCCGTCTCCACGGCACTTGGGTTTCAGGGCCATG GAATCGCAAGCCCTTTTCGCACTGCATTATGGGATCTGTAGTGAGACATGCCTTGCGTTGGCTCTTTCCT CCTGCTGGGCGCCAAAGCGCGTCTTTTCCTCAATCTCCAGTCTGTCTGTGCTCTCAAAAACTTTAGTCGT TATAACAACTGTGACTGTTGAGAAATTTCACTGTTTTCCTGCATTCCTGGCGCGGGACTCTAGCCAGAGG CTCCGAGGACTTTGTAGCGACTGTCCCAAGCGTCCAGTTCGATGCTTCTCAGGGCGGCTTGCTTTAAGGG CCCACCCCTAAATTTGGGTTGTAAAAATTTTTGAGGTAATGCTTGTTCAAGTTCGCTTAAGTGTTCACTC AGCCCAACACGCGGGTTGGGCTTGAGGTTCGGCACCCGGGCAGCCTCACCCCCCGCGTCAGGCGCGCGCA CACAGTAGGTCCGCGACCCTTAGCCCTCCACTAGGCAGCCCGCGGGGATGGGTGGCCGGGCCGCCCACAC GGGCAGCACCGGCACTGCGCATGCTCGGCGCGTCGGCGCAGGTTTCCGCAGCTGAGGGGGCAGCTCCGCG GCGGCGTCCGGGGTCTCCAGTAGGGCTGACGCTCCGGTGCTCGCACAATCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO9_1 ↗ | 6:53,065,404 | 正股 | 53,065,355–53,065,414 |
| FBXO9_2 ↗ | 6:53,065,749 | 正股 | 53,065,700–53,065,759 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_C796B · enhancer · 53060234–53061759 · regulatory
ENSR6_5GGZ6Q · CTCF_binding_site · 53060555–53060576 · regulatory
ENSR6_BDJBR · promoter · 53061760–53062314 · regulatory
ENSR6_C796L · promoter · 53064508–53065612 · regulatory
ENSR6_BDJCD · enhancer · 53065613–53066515 · regulatory
ENSR6_5GH23N · CTCF_binding_site · 53065721–53065742 · regulatory
ENSR6_5GH28S · CTCF_binding_site · 53066831–53066852 · regulatory
· motif · 53060557–53060573 · motif
· motif · 53061419–53061430 · motif
· motif · 53061863–53061876 · motif
· motif · 53061995–53062008 · motif
· motif · 53062005–53062020 · motif
· motif · 53062012–53062020 · motif
· motif · 53062012–53062027 · motif
· motif · 53064803–53064812 · motif
· motif · 53065326–53065341 · motif
· motif · 53065327–53065340 · motif
· motif · 53065373–53065386 · motif
· motif · 53065399–53065410 · motif
· motif · 53065399–53065410 · motif
· motif · 53065410–53065423 · motif
· motif · 53065723–53065739 · motif
· motif · 53066217–53066228 · motif
· motif · 53066833–53066849 · motif
· motif · 53067993–53067999 · motif
· motif · 53069630–53069641 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：447 aa
FBXO9 蛋白長 447 個胺基酸。序列註解標示第 94–127 位含有 TPR 重複區，第 185–236 位為 F-box 結構域；第 9–36 位則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXO9 的細胞內定位記錄為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- EEF2P13639 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- TELO2Q9Y4R8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TTI1O43156 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
FBXO9 與 CUL1、SKP1 及 RBX1 組成 SCF(FBXO9) E3 泛素蛋白連接酶複合體。它也與 TTI1、TELO2 互作；來源指出，當 TTI1 和 TELO2 經 CK2 磷酸化時，FBXO9 可作用於它們。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO9 是 SCF 型 E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分，促進目標蛋白泛素化及後續蛋白酶體降解，並參與細胞週期、細胞增殖與染色體穩定性維持。生長因子缺乏後，CK2 磷酸化與 mTORC1 結合的 TTI1、TELO2；FBXO9 促使其泛素化和降解，但不作用於 mTORC2 中的 TTI1、TELO2。其結果是 mTORC1 失活、細胞生長及蛋白質轉譯受限，而解除 mTORC1 的回饋抑制後 mTORC2 活化。FBXO9 也藉由調節 PRMT4 周轉參與上皮細胞存活；依相似性資料，亦可調節 PPARgamma 穩定性並參與脂肪細胞分化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins and plays a role in several biological processes such as cell cycle, cell proliferation, or maintenance of chromosome stability. Ubiquitinates mTORC1-bound TTI1 and TELO2 when they are phosphorylated by CK2 following growth factor deprivation, leading to their degradation. In contrast, does not mediate ubiquitination of TTI1 and TELO2 when they are part of the mTORC2 complex. As a consequence, mTORC1 is inactivated to restrain cell growth and protein translation, while mTORC2 is the activated due to the relief of feedback inhibition by mTORC1. Plays a role in maintaining epithelial cell survival by regulating the turn-over of chromatin modulator PRMT4 through ubiquitination and degradation by the proteasomal pathway. Regulates also PPARgamma stability by facilitating PPARgamma/PPARG ubiquitination and thereby plays a role in adipocyte differentiation (By similarity) PMID 23263282 ↗ · PMID 34480022 ↗ |
| 分子活性 | FBXO9 相關的分子活動包括蛋白質修飾，具體為蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXO9 是 SCF(FBXO9) E3 泛素蛋白連接酶複合體的一部分；複合體由 CUL1、SKP1、RBX1 和 FBXO9 組成。FBXO9 會與 TTI1、TELO2 互作，來源特別提及兩者經 CK2 磷酸化的情況。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complex SCF(FBXO9) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXO9. Interacts with TTI1 and TELO2; when TTI1 and TELO2 are phosphorylated by CK2 PMID 23263282 ↗ |
| 細胞定位 | FBXO9 的細胞內定位為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATGCTCGGCGCGTCGGCGCAGGTTTCCGCAGCTGAGGGGG40CAGCTCCGCGGCGGCGTCCGGGGTCTCCAGTAGGGCTGAC80GCTCCGGTGCTCGCACAATCCCCCGCCTCGGCTGGCAACG120GGCGTCCCTCCACTCCCCGAGTCCCCGGCAGCCGCCGCCA160CCCCAGCGCGCCCCGATCTGGCCCCCTGCCCCGCGAAGAT200GGCTGCCGTACGCCGGGCCCGCAGTTATTGCCGCTGCCTG240GTGCGCTTCTCCGACCGAGAACTCTGCTAAGCTCCGCTGC280AGAGACAGGCAGGAGTAGACACCCGGACACCCAGCACCCC320TCCTCCGGGGGGCGGTGCAGAGGGGGCACGGAGAGCCCCT360CGAGCGCAGCAGGCCGCCCCGCCAGCATGGCAGAAGCTGA400GGAAGATTGTCATTCTGATACTGTCAGAGCAGATGATGAT440GAAGAAAATGAAAGTCCTGCTGAAACAGATCTGCAGGCAC480AACTCCAGATGTTCCGAGCTCAGTGGATGTTTGAACTTGC520TCCAGGTGTAAGCTCTAGCAATTTAGAAAATCGACCTTGC560AGAGCAGCAAGAGGCTCTCTCCAGAAAACATCGGCAGATA600CCAAAGGAAAACAAGAACAGGCAAAAGAAGAAAAGGCTCG640AGAACTCTTCCTAAAAGCAGTAGAAGAAGAACAAAATGGA680GCTCTCTATGAAGCCATCAAGTTTTATCGTAGGGCTATGC720AACTTGTACCTGATATAGAGTTCAAGATTACTTATACCCG760GTCTCCAGATGGTGATGGCGTTGGAAACAGCTACATTGAA800GATAATGATGATGACAGCAAAATGGCAGATCTCTTGTCCT840ACTTCCAGCAGCAACTCACATTTCAGGAGTCTGTGCTTAA880ACTGTGTCAGCCTGAGCTTGAGAGCAGTCAGATTCACATA920TCAGTGCTGCCAATGGAGGTCCTGATGTACATCTTCCGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。