演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXO8FBX8

F-box protein 8

FBXO8 編碼的 F-box protein 8 含有 F-box 與 SEC7 結構域;來源指出它可能促進 ARF 的鳥嘌呤核苷酸交換,並藉由 GDP 換成 GTP 促進 ARF 活化。

Homo sapiens4q34.1UniProt Q9NRD0
OFFICIAL SYMBOL
FBXO8
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q9NRD0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXO8(F-box protein 8)是人類的蛋白質編碼基因,其產物具有 F-box 與 SEC7 兩個結構域。這兩種結構域是此蛋白質的主要序列特徵;來源資料未提供更詳細的蛋白質家族分類或其他結構資訊。

Official symbol
FBXO8
Gene name
F-box protein 8
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13587
UniProt
Q9NRD0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FBX8FBS

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q34.1
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25FBXO8pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:174,236,526–174,283,978
Gene span
47,453 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000393674 ★174,236,658–174,283,6676
ENST00000503293174,236,526–174,283,6767
ENST00000851481174,236,526–174,283,6766
ENST00000851482174,236,526–174,283,6767
ENST00000851483174,236,526–174,283,6767
ENST00000851484174,236,526–174,283,6767
ENST00000851485174,236,526–174,263,3596
ENST00000851486174,236,526–174,263,5146
ENST00000927317174,236,526–174,283,6766
ENST00000949149174,236,526–174,283,6765
ENST00001136434174,236,526–174,283,6766
ENST00000615392174,236,658–174,263,0926

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXO8 的功能資料指出,這個蛋白質可能促進 ARF 的鳥嘌呤核苷酸交換。此作用與 ARF 的活化相關,但資料將其標示為可能功能,因此應視為潛在作用,而非已確立的結論。

來源描述的核苷酸交換方向,是以 GTP 取代 GDP。這種替換可促進 ARF 活化,呈現 FBXO8 可能參與調節 ARF 活性的一種方式;現有資訊未進一步說明此作用發生的細胞情境、調控條件或具體分子步驟。

資料僅支持上述潛在的核苷酸交換與活化關係,未提供其他生物過程、作用對象或功能後果的細節。因此,FBXO8 在更廣泛生物學過程中的角色,不能僅依此項註解加以延伸推論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 174283667 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXO8 ENST00000393674 GRCh38 chr4:174283567-174284667 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACTGCTGTGTTCACACATAAAATTAAAAGGTCTGCAGATAATTCGGGAAAAAAACAGTCTAGCATGGCC
ATAATTCCAGAGTAAAAGAGAATAACAACTTCAAGATTAACTTGTTACAGTGAGGGAAAAATCTGTAGCC
TTCAATAAAGGTGGAGAAATATTTGAAAAGCTGGGGAAATGCCAACAAGGAAAACACGAACTGCTGTCCT
GTCTTCCTTATAGTCAGGAGCCGTTTGTATCCTCACCCCAGAGGATCCAATAGGAATCAGTAAGCCTATA
ACTTTCCAACCCTAAGTCACAACCTAATTCTGATAGGATGAGCTACCACGATACTTCCCACTTCGTTGTG
ACTAAAAGCATATACTAGTTGGGTATATAAGCAAGGCTCCCCTCCCGCCATTTGATTTAAAAGAATGAAA
AGGCGGATCTGGTCATTCGTCTCCGCCCGGGGTCTCTGTAAGGACGGCGGAGAGAGGCGACCTCCGCCCA
ATACCAGGCGCAGCCTTGCCGTCTCCTCGGGGCTCACCAAGCAGCCACCAGCAAAGAAGCCGGTTTCAAA
GGCCCAGCACGACAGGGAGAGGAAAACGGAGCATATGCAACCATACACAGTCACCAGAGTCCAGCCTCCC
GCAACCAGTCGCTACAGCCAGGCGCCTGCGCCCAGAAGCGCTTCTCGCGCCGACCGTTTGTATTTGGAAT
TGTGGGTTCCTGCCCGCCACGCACCACCGCAAGACCTTCAAAGCTGGGAGCTTCTCTGTGCTCCAGGATT
CCTCGCTGCCGATTCCACACCGCGTTCAAGACTCCTGTGAAGAGCGACTCCGCTGAGAGCCTCCTCAATG
GCCAGTCCACTTCTAACTTGCAGCTGAGAAGTTTTTCTGATCTTGATGGTCAGAGTGGCTCGTGCTACGA
AGTGAGAAACAAGGAATCTATAGCGAATCGTAAACAACAGAAATAAAAATGCGTCTCCGTTAAGAGTCGG
AGCCTAACGTCACTTCCGGCAACAATAGGAAACGTCAAAATTGGGATAGTCGGCAGTTCTGGCCCCTGCA
GCTGGAGGTACCCTGAGTTCTGAGGGTCGTAGTGCTGTTTCTGGTATTCTC
FBXO8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXO8_3 ↗4:174,263,037負股174,263,027–174,263,086
FBXO8_1 ↗4:174,283,667負股174,283,657–174,283,716
FBXO8_2 ↗4:174,284,264負股174,284,254–174,284,313

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_B39KTK · enhancer · 174282861–174283656 · regulatory

ENSR4_94K6QC · promoter · 174283657–174283921 · regulatory

ENSR4_CM9XD · enhancer · 174283922–174285105 · regulatory

· motif · 174279723–174279735 · motif

· motif · 174283201–174283212 · motif

· motif · 174283666–174283677 · motif

· motif · 174283666–174283677 · motif

· motif · 174283668–174283677 · motif

· motif · 174284240–174284250 · motif

· motif · 174284265–174284275 · motif

· motif · 174284648–174284660 · motif

· motif · 174284860–174284875 · motif

· motif · 174284860–174284875 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:319 aa

1 aa319 aa結構域
依 Q9NRD0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

F-box protein 8 長 319 個胺基酸。其 F-box 結構域位於第 68–111 位胺基酸,SEC7 結構域位於第 146–276 位胺基酸;來源提供的蛋白質特徵註解未描述其他結構區域。

結構域F-box68–111 aa
結構域SEC7146–276 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NRD0…

AlphaFold · Q9NRD0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FBX8FBXO8GSTP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXO8 可能促進 ARF 的鳥嘌呤核苷酸交換,作用方向是以 GTP 取代 GDP;這項替換可促進 ARF 活化。來源將此功能標示為可能性,未提供作用情境或其他實驗細節。推論支持
證據與來源

May promote guanine-nucleotide exchange on an ARF. Promotes the activation of ARF through replacement of GDP with GTP (Potential)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000393674 · 1,980 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACAATAGGAAACGTCAAAATTGGGATAGTCGGCAGTTCT40
41GGCCCCTGCAGCTGGAGGTACCCTGAGTTCTGAGGGTCGT80
81AGTGCTGTTTCTGGTATTCTCATCGCGGTCACCTCTACCG120
121GTGTGGACAAGTAAAGTTTGAATCAGCTTCTCCATGGCCT160
161GGGCACCAGTTCCCGGCTGAGCCATTTTCCTTTTGGCTAA200
201AAGTCCCCGCCCAGAGGCCAATTCGTCGCGGCGGCGGTGG240
241AGATCGCAGGTCGCTCAGGCTTGCAGATGGGTCAAGGGTT280
281GTGGAGAGTGGTCAGAAACCAGCAGCTGCAACAAGAAGGC320
321TACAGTGAGCAAGGCTACCTCACCAGAGAGCAGAGCAGGA360
361GAATGGCTGCGAGCAACATTTCTAACACCAATCATCGTAA400
401ACAAGTCCAAGGAGGCATTGACATATATCATCTTTTGAAG440
441GCAAGGAAATCGAAAGAACAGGAAGGATTCATTAATTTGG480
481AAATGTTGCCTCCTGAGCTAAGCTTTACCATCTTGTCCTA520
521CCTGAATGCAACTGACCTTTGCTTGGCTTCATGTGTTTGG560
561CAGGACCTTGCGAATGATGAACTTCTCTGGCAAGGGTTGT600
601GCAAATCCACTTGGGGTCACTGTTCCATATACAATAAGAA640
641CCCACCTTTAGGATTTTCTTTTAGAAAATTGTATATGCAG680
681CTGGATGAAGGCAGCCTCACCTTTAATGCCAACCCAGATG720
721AGGGAGTGAACTACTTTATGTCCAAGGGTATCCTGGATGA760
761TTCGCCAAAGGAAATAGCAAAGTTTATCTTCTGTACAAGA800
801ACACTAAATTGGAAAAAACTGAGAATCTATCTTGATGAAA840
841GGAGAGATGTCTTGGATGACCTTGTAACATTGCATAATTT880
881TAGAAATCAGTTCTTGCCAAATGCACTGAGAGAATTTTTT920
921CGTCATATCCATGCCCCTGAAGAGCGTGGAGAGTATCTTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。