基因總覽
FBXO8(F-box protein 8)是人類的蛋白質編碼基因,其產物具有 F-box 與 SEC7 兩個結構域。這兩種結構域是此蛋白質的主要序列特徵;來源資料未提供更詳細的蛋白質家族分類或其他結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000393674 ★ | 174,236,658–174,283,667 | 6 |
| ENST00000503293 | 174,236,526–174,283,676 | 7 |
| ENST00000851481 | 174,236,526–174,283,676 | 6 |
| ENST00000851482 | 174,236,526–174,283,676 | 7 |
| ENST00000851483 | 174,236,526–174,283,676 | 7 |
| ENST00000851484 | 174,236,526–174,283,676 | 7 |
| ENST00000851485 | 174,236,526–174,263,359 | 6 |
| ENST00000851486 | 174,236,526–174,263,514 | 6 |
| ENST00000927317 | 174,236,526–174,283,676 | 6 |
| ENST00000949149 | 174,236,526–174,283,676 | 5 |
| ENST00001136434 | 174,236,526–174,283,676 | 6 |
| ENST00000615392 | 174,236,658–174,263,092 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO8 的功能資料指出,這個蛋白質可能促進 ARF 的鳥嘌呤核苷酸交換。此作用與 ARF 的活化相關,但資料將其標示為可能功能,因此應視為潛在作用,而非已確立的結論。
來源描述的核苷酸交換方向,是以 GTP 取代 GDP。這種替換可促進 ARF 活化,呈現 FBXO8 可能參與調節 ARF 活性的一種方式;現有資訊未進一步說明此作用發生的細胞情境、調控條件或具體分子步驟。
資料僅支持上述潛在的核苷酸交換與活化關係,未提供其他生物過程、作用對象或功能後果的細節。因此,FBXO8 在更廣泛生物學過程中的角色,不能僅依此項註解加以延伸推論。
Promoter 與基因調控
>FBXO8 ENST00000393674 GRCh38 chr4:174283567-174284667 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACTGCTGTGTTCACACATAAAATTAAAAGGTCTGCAGATAATTCGGGAAAAAAACAGTCTAGCATGGCC ATAATTCCAGAGTAAAAGAGAATAACAACTTCAAGATTAACTTGTTACAGTGAGGGAAAAATCTGTAGCC TTCAATAAAGGTGGAGAAATATTTGAAAAGCTGGGGAAATGCCAACAAGGAAAACACGAACTGCTGTCCT GTCTTCCTTATAGTCAGGAGCCGTTTGTATCCTCACCCCAGAGGATCCAATAGGAATCAGTAAGCCTATA ACTTTCCAACCCTAAGTCACAACCTAATTCTGATAGGATGAGCTACCACGATACTTCCCACTTCGTTGTG ACTAAAAGCATATACTAGTTGGGTATATAAGCAAGGCTCCCCTCCCGCCATTTGATTTAAAAGAATGAAA AGGCGGATCTGGTCATTCGTCTCCGCCCGGGGTCTCTGTAAGGACGGCGGAGAGAGGCGACCTCCGCCCA ATACCAGGCGCAGCCTTGCCGTCTCCTCGGGGCTCACCAAGCAGCCACCAGCAAAGAAGCCGGTTTCAAA GGCCCAGCACGACAGGGAGAGGAAAACGGAGCATATGCAACCATACACAGTCACCAGAGTCCAGCCTCCC GCAACCAGTCGCTACAGCCAGGCGCCTGCGCCCAGAAGCGCTTCTCGCGCCGACCGTTTGTATTTGGAAT TGTGGGTTCCTGCCCGCCACGCACCACCGCAAGACCTTCAAAGCTGGGAGCTTCTCTGTGCTCCAGGATT CCTCGCTGCCGATTCCACACCGCGTTCAAGACTCCTGTGAAGAGCGACTCCGCTGAGAGCCTCCTCAATG GCCAGTCCACTTCTAACTTGCAGCTGAGAAGTTTTTCTGATCTTGATGGTCAGAGTGGCTCGTGCTACGA AGTGAGAAACAAGGAATCTATAGCGAATCGTAAACAACAGAAATAAAAATGCGTCTCCGTTAAGAGTCGG AGCCTAACGTCACTTCCGGCAACAATAGGAAACGTCAAAATTGGGATAGTCGGCAGTTCTGGCCCCTGCA GCTGGAGGTACCCTGAGTTCTGAGGGTCGTAGTGCTGTTTCTGGTATTCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO8_3 ↗ | 4:174,263,037 | 負股 | 174,263,027–174,263,086 |
| FBXO8_1 ↗ | 4:174,283,667 | 負股 | 174,283,657–174,283,716 |
| FBXO8_2 ↗ | 4:174,284,264 | 負股 | 174,284,254–174,284,313 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_B39KTK · enhancer · 174282861–174283656 · regulatory
ENSR4_94K6QC · promoter · 174283657–174283921 · regulatory
ENSR4_CM9XD · enhancer · 174283922–174285105 · regulatory
· motif · 174279723–174279735 · motif
· motif · 174283201–174283212 · motif
· motif · 174283666–174283677 · motif
· motif · 174283666–174283677 · motif
· motif · 174283668–174283677 · motif
· motif · 174284240–174284250 · motif
· motif · 174284265–174284275 · motif
· motif · 174284648–174284660 · motif
· motif · 174284860–174284875 · motif
· motif · 174284860–174284875 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:319 aa
F-box protein 8 長 319 個胺基酸。其 F-box 結構域位於第 68–111 位胺基酸,SEC7 結構域位於第 146–276 位胺基酸;來源提供的蛋白質特徵註解未描述其他結構區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- GSTP1P09211 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO8 可能促進 ARF 的鳥嘌呤核苷酸交換,作用方向是以 GTP 取代 GDP;這項替換可促進 ARF 活化。來源將此功能標示為可能性,未提供作用情境或其他實驗細節。 | 推論支持 | 證據與來源May promote guanine-nucleotide exchange on an ARF. Promotes the activation of ARF through replacement of GDP with GTP (Potential) |
核酸與蛋白質序列
AACAATAGGAAACGTCAAAATTGGGATAGTCGGCAGTTCT40GGCCCCTGCAGCTGGAGGTACCCTGAGTTCTGAGGGTCGT80AGTGCTGTTTCTGGTATTCTCATCGCGGTCACCTCTACCG120GTGTGGACAAGTAAAGTTTGAATCAGCTTCTCCATGGCCT160GGGCACCAGTTCCCGGCTGAGCCATTTTCCTTTTGGCTAA200AAGTCCCCGCCCAGAGGCCAATTCGTCGCGGCGGCGGTGG240AGATCGCAGGTCGCTCAGGCTTGCAGATGGGTCAAGGGTT280GTGGAGAGTGGTCAGAAACCAGCAGCTGCAACAAGAAGGC320TACAGTGAGCAAGGCTACCTCACCAGAGAGCAGAGCAGGA360GAATGGCTGCGAGCAACATTTCTAACACCAATCATCGTAA400ACAAGTCCAAGGAGGCATTGACATATATCATCTTTTGAAG440GCAAGGAAATCGAAAGAACAGGAAGGATTCATTAATTTGG480AAATGTTGCCTCCTGAGCTAAGCTTTACCATCTTGTCCTA520CCTGAATGCAACTGACCTTTGCTTGGCTTCATGTGTTTGG560CAGGACCTTGCGAATGATGAACTTCTCTGGCAAGGGTTGT600GCAAATCCACTTGGGGTCACTGTTCCATATACAATAAGAA640CCCACCTTTAGGATTTTCTTTTAGAAAATTGTATATGCAG680CTGGATGAAGGCAGCCTCACCTTTAATGCCAACCCAGATG720AGGGAGTGAACTACTTTATGTCCAAGGGTATCCTGGATGA760TTCGCCAAAGGAAATAGCAAAGTTTATCTTCTGTACAAGA800ACACTAAATTGGAAAAAACTGAGAATCTATCTTGATGAAA840GGAGAGATGTCTTGGATGACCTTGTAACATTGCATAATTT880TAGAAATCAGTTCTTGCCAAATGCACTGAGAGAATTTTTT920CGTCATATCCATGCCCCTGAAGAGCGTGGAGAGTATCTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。