基因總覽
FBXO7 是蛋白質編碼基因，其產物為 F-box protein 7。這種蛋白質屬於 F-box 蛋白家族，並作為 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識成分。它的基本角色是參與複合體對目標蛋白的辨識；蛋白質結構包含 F-box 區域，也具有 ubiquitin-like 區域。來源指出，FBXO7 所參與的蛋白質調控與細胞週期、細胞增殖及染色體穩定性等生物過程相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000266087 ★ | 32,474,811–32,498,829 | 9 |
| ENST00000886522 | 32,474,704–32,499,787 | 8 |
| ENST00000886523 | 32,474,704–32,499,787 | 8 |
| ENST00000886524 | 32,474,704–32,499,787 | 10 |
| ENST00000920428 | 32,474,704–32,499,787 | 9 |
| ENST00001007367 | 32,474,704–32,499,787 | 3 |
| ENST00001041985 | 32,474,704–32,499,787 | 9 |
| ENST00001041986 | 32,474,704–32,499,787 | 9 |
| ENST00001106584 | 32,474,704–32,489,674 | 5 |
| ENST00001114701 | 32,474,704–32,494,956 | 7 |
| ENST00001119544 | 32,474,704–32,499,787 | 8 |
| ENST00001119546 | 32,474,704–32,487,530 | 5 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO7 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識成分。該複合體可促使目標蛋白泛素化，並進一步導向蛋白酶體降解；FBXO7 因而參與蛋白質修飾與周轉，也與細胞週期、細胞增殖及染色體穩定性的維持有關。已列出的底物包括 BIRC2 與細胞週期調節因子 DLGAP5。
在粒線體品質控制方面，FBXO7 位於 PINK1 下游，參與受損粒線體的選擇性自噬（mitophagy）：它促使 PRKN 移至功能失常且去極化的粒線體，並促進 MFN1 泛素化。這些作用與細胞清除受損粒線體的過程相關。
FBXO7 也可調節 NF-κB 訊息傳遞。它介導 UXT 異構型 2 的泛素化及蛋白酶體降解，並促進 TRAF2 泛素化；來源指出，這些作用會抑制 NF-κB 路徑。
另有資料指出，FBXO7 可透過 Lys-63 連結的多聚泛素鏈使蛋白酶體次單元 PSMA2 泛素化，影響細胞（包括神經元）中蛋白酶體的組裝狀態與活性；此項註解標示為相似性推論。FBXO7 也會促進 SIRT7 的 Lys-48 連結多聚泛素化，並與過氧化氫誘發的細胞死亡相關。
Promoter 與基因調控
>FBXO7 ENST00000266087 GRCh38 chr22:32473811-32474911 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGAAGCCAGCTGCCATGTCATGGGGACACTCAAACAGCCCTATGGGGAGGTTCACGTGGTGAAAACAGGT CTCTGGCCAACAGTCATGACTGTGCCATCCTGGAGGCCGATCCTCCAGCCCTAGTCAATAACTGCTGCCC TGGCCTACAGTTTGTAATCTCATGGGAGACCTGGAGACAGAACCACCCAGCCACGCATCCCCAAATCCCT TTACCTCTAAAACCTGTGGGACAACAAATGTTTATTGCGTTAAACTTTGGGGTGATTGTTATGCAGCCAC AGAGTTCTAATAAACTGTCGGACATAGATTACTGGCTACAAATAGTTCTACTTTTTTTTTGAGACAGGGT CTCGTTCTGTGGAACCAGGCTGAGGTGCAGTGGTGCGATCACAGCTCATTGAGGCCTCGACCTCCGGGCT CAATCGACCCTCCCGCCTCAGCCACCCAACTAGCTGGGACTACAGGCAGGCGCCACCACACCTAATTTTT TGTATTTTTTGTAGAGATGGGGGGGGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTC AAACGATCCACCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCAACC TAAGGATTAACCTAAGGCTTCTCAGAGCAGATGCCGCTGGAACTGAGGGCCACGGAAGAAAGGGGGTGAC ACTTGGTCCTGGGGAGTGGCGACTGTATTGTCTGTCTGCAGCATCCCTATCAGCGCTACCGTTGTTCCAC GCACACAGGGAGTAAGTACTGGGAGTCCCAGCCACCGCCGCGGAAAATCTGGGATGCCAGCGAGCGGCCG CATCTCGGCGCCTGCGCACTGTGCCCGCGCTCTCAGGCAGCGCCGTTGCGCGCGGAGTCATCGATCGGCC GACCCCGAGAGGCCCGGTTCCTTTAGGCCGCCTGCCCGCCTCCAGCTCTCGGGGTCGGCTCCAGGAGGCG CCCTCAGGAGAGGGGCGGGCGCTCTATTCCAGAGACCGAGTGGCAGGGCGGCCACTGTGGCGGGGCTCTT TCCCCGTTTCGCCTCAGCTACCCCTCAGCTCCGGTAGTCGCCAGTCCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO7_1 ↗ | 22:32,474,811 | 正股 | 32,474,762–32,474,821 |
| FBXO7_2 ↗ | 22:32,487,289 | 正股 | 32,487,240–32,487,299 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：522 aa
F-box protein 7 長 522 個胺基酸。其 N 端含 ubiquitin-like 區域（第 1–88 位），第 329–375 位為 F-box domain。第 85–144 位及第 483–522 位被註記為無序區域；第 92–129 位與 PINK1 互作相關，第 129–169 位及第 381–522 位與 CDK6 互作相關。第 180–324 位則與二聚化及 PSMF1 互作有關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXO7 主要位於細胞質，少量可在細胞核中檢出。 當粒線體去極化時，FBXO7 會由細胞質溶膠轉移至去極化粒線體，呈現與條件相關的定位變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PINK1Q9BXM7 · UniProt INTERACTION · 8 experiments · 2 筆來源紀錄
- PRKNO60260 · UniProt INTERACTION · 10 experiments · 2 筆來源紀錄
- PSMA3P25788 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PSME3P61289 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSMF1Q92530 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- Q9Y649Q9Y649 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXO7 是由 CUL1、SKP1、RBX1 與 FBXO7 組成的 SCF(FBXO7) E3 泛素蛋白連接酶複合體成員。它可透過 C 端富含脯胺酸的區域與 DLGAP5 互作，也與 BIRC2、CDK6 及 PSMF1 互作；FBXO7 與 CDK6 的互作可促進 CDK6 與 D 型 cyclin 的互作。此外，FBXO7 透過 N 端 Ubl domain 與 PRKN 互作，並透過 N 端區域與 PINK1 互作。
疾病與遺傳關聯
FBXO7 基因變異與 Parkinson disease 15（PARK15）相關，來源將該疾病描述為由影響此基因的變異所致。其臨床表現包括帕金森症狀與錐體束徵象，例如顫抖、動作遲緩、僵硬、姿勢不穩，以及主要出現在下肢的痙攣和反射亢進。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO7 是 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識成分，可促進目標蛋白泛素化及後續蛋白酶體降解，參與細胞週期、細胞增殖與染色體穩定性等過程。其底物包括 BIRC2 和 DLGAP5；它也參與 PINK1 下游的受損粒線體清除、MFN1 泛素化及 NF-κB 路徑抑制。PSMA2 相關作用標示為相似性推論；SIRT7 泛素化則與過氧化氫誘發的細胞死亡相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins and plays a role in several biological processes such as cell cycle, cell proliferation, or maintenance of chromosome stability. Recognizes and ubiquitinates BIRC2 and the cell cycle regulator DLGAP5. Plays a role downstream of PINK1 in the clearance of damaged mitochondria via selective autophagy (mitophagy) by targeting PRKN to dysfunctional depolarized mitochondria. Promotes MFN1 ubiquitination. Mediates the ubiquitination and proteasomal degradation of UXT isoform 2, thereby impairing the NF-kappa-B signaling pathway. Inhibits NF-kappa-B pathway also by promoting the ubiquitination of TRAF2. Affects the assembly state and activity of the proteasome in the cells including neurons by ubiquitinating the proteasomal subunit PSMA2 via 'Lys-63'-linked polyubiquitin chains (By similarity). Promotes 'Lys-48'-linked polyubiquitination SIRT7, leading to the hydrogen peroxide-induced cell death PMID 15145941 ↗ · PMID 16510124 ↗ · PMID 22212761 ↗ · PMID 23933751 ↗ · PMID 33010352 ↗ · PMID 34791250 ↗ · PMID 36646384 ↗ |
| 分子活性 | FBXO7 具有蛋白質修飾相關活性，參與蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXO7 與 CUL1、SKP1、RBX1 組成 SCF(FBXO7) E3 泛素蛋白連接酶複合體。它透過 C 端富含脯胺酸的區域與 DLGAP5 互作，也與 BIRC2、CDK6 和 PSMF1 互作；FBXO7 與 CDK6 的互作可促進 CDK6 和 D 型 cyclin 的互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complex SCF(FBXO7) formed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXO7. Interacts via its C-terminal proline-rich region with DLGAP5. Interacts with BIRC2. Interacts with CDK6 and promotes its interaction with D-type cyclin. Interacts with PSMF1 PMID 12527899 ↗ · PMID 15145941 ↗ · PMID 16096642 ↗ · PMID 16510124 ↗ · PMID 18495667 ↗ · PMID 23933751 ↗ |
| 交互作用 | FBXO7 透過 N 端 Ubl domain 與 PRKN 互作，並透過 N 端區域與 PINK1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via the N-terminal Ubl domain) with PRKN. Interact (via N-terminal region) with PINK1 PMID 23933751 ↗ |
| 交互作用 | FBXO7 透過其 N 端區域與 PINK1 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | FBXO7 主要位於細胞質，少量可在細胞核中檢出；當粒線體去極化時，FBXO7 會由細胞質溶膠轉移至去極化粒線體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Mitochondrion; Cytoplasm, cytosol; Predominantly cytoplasmic. A minor proportion is detected in the nucleus. Relocates from the cytosol to depolarized mitochondria PMID 16096642 ↗ · PMID 18495667 ↗ · PMID 33010352 ↗ · PMID 23933751 ↗ |
| 疾病關聯 | FBXO7 基因變異與 Parkinson disease 15（PARK15）相關，來源描述該病為神經退化性疾病，具有帕金森症狀與錐體束徵象。臨床表現可包括顫抖、動作遲緩、僵硬、姿勢不穩、主要位於下肢的痙攣，以及反射亢進。 | 含實驗來源 | 證據與來源Parkinson disease 15 PARK15 A neurodegenerative disorder characterized by parkinsonian and pyramidal signs. Clinical manifestations include tremor, bradykinesia, rigidity, postural instability, spasticity, mainly in the lower limbs, and hyperreflexia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 260300 PMID 18513678 ↗ · PMID 23933751 ↗ · PMID 32892229 ↗ · PMID 36646384 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTCTATTCCAGAGACCGAGTGGCAGGGCGGCCACTGTGG40CGGGGCTCTTTCCCCGTTTCGCCTCAGCTACCCCTCAGCT80CCGGTAGTCGCCAGTCCGGGGTCGTCGCCGTTTGGGGCGG120GAGCTGCTCGGCCCCGCCGCCGTCCCCGTCGCCGCTTCCG160GGTCCAGGCCCCTCGGGCCGCCTGCCGCCGTCATGAGGCT200GCGGGTGCGGCTTCTGAAGCGGACCTGGCCGCTGGAGGTG240CCCGAGACGGAGCCGACGCTGGGGCATTTGCGCTCGCACC280TGAGGCAGTCCCTGCTGTGCACCTGGGGGTACAGTTCTAA320TACCCGATTTACAATTACATTGAACTACAAGGATCCCCTC360ACTGGAGATGAAGAGACCTTGGCTTCATATGGGATTGTTT400CTGGGGACTTGATATGTTTGATTCTTCAAGATGACATTCC440AGCGCCTAATATACCTTCATCCACAGATTCAGAGCATTCT480TCACTCCAGAATAATGAGCAACCCTCTTTGGCCACCAGCT520CCAATCAGACTAGCATGCAGGATGAACAACCAAGTGATTC560ATTCCAAGGACAGGCAGCCCAGTCTGGTGTTTGGAATGAC600GACAGTATGTTAGGGCCTAGTCAAAATTTTGAAGCTGAGT640CAATTCAAGATAATGCGCATATGGCAGAGGGCACAGGTTT680CTATCCCTCAGAACCCATGCTCTGTAGTGAATCGGTGGAA720GGGCAAGTGCCACATTCATTAGAGACCTTGTATCAATCAG760CTGACTGTTCTGATGCCAATGATGCCTTGATAGTGTTGAT800ACATCTTCTCATGTTGGAGTCAGGTTACATACCTCAGGGC840ACCGAAGCCAAAGCACTGTCCATGCCGGAGAAGTGGAAGT880TGAGCGGGGTGTATAAGCTGCAGTACATGCATCCTCTCTG920CGAGGGCAGCTCCGCTACTCTCACCTGTGTGCCTTTGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。