基因總覽
FBXO3（F-box protein 3）是蛋白質編碼基因，產物屬於 F-box 蛋白家族。其蛋白質是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 的組成部分，負責辨識底物。蛋白質序列具有 F-box 與 ApaG 結構域，另有一段被註記為無序區域。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265651 ★ | 33,740,944–33,774,520 | 11 |
| ENST00000526785 | 33,739,834–33,774,347 | 10 |
| ENST00000531080 | 33,739,834–33,753,400 | 6 |
| ENST00000532057 | 33,739,834–33,753,399 | 6 |
| ENST00000958856 | 33,739,834–33,774,543 | 11 |
| ENST00001000799 | 33,739,834–33,774,543 | 10 |
| ENST00001000800 | 33,739,834–33,774,543 | 11 |
| ENST00001128196 | 33,739,834–33,774,543 | 10 |
| ENST00001139349 | 33,739,834–33,774,543 | 11 |
| ENST00001042186 | 33,740,948–33,774,543 | 11 |
| ENST00000530401 | 33,740,965–33,774,543 | 10 |
| ENST00000873667 | 33,741,160–33,774,543 | 11 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO3 作為 SCF(FBXO3) E3 ubiquitin ligase 的底物辨識組成部分，參與目標蛋白質的泛素化，並促進其後續由 proteasome 降解。此作用涉及不同底物：FBXO3 可介導 HIPK2 的泛素化，也可能作用於 EP300，兩者的降解均被描述為快速發生。
對 HIPK2 而言，PML 的存在會改變泛素化之後的結果：HIPK2 仍可被泛素化，但其降解受到阻止。PML、HIPK2 與 FBXO3 可能協同促進 p53/TP53 依賴的轉錄活化；來源對此協同關係保留「可能」的限定。
在發炎調節方面，lipopolysaccharide（LPS）刺激時，SCF(FBXO3) 會促進 FBXL2 泛素化及降解。此複合體可特異辨識在 Thr-404 磷酸化的 FBXL2，並促進其泛素化，將底物的磷酸化狀態與其辨識連結起來。
微生物感染情境下，FBXO3 可與 Rift valley fever virus 的 NSs 結合，形成重塑的絲狀 E3 ligase，促進目標蛋白質的 proteasomal 降解。該絲狀 ligase 以 TFIIH complex 為目標，並造成強烈的抗病毒免疫抑制，且增強病毒致病性。
Promoter 與基因調控
>FBXO3 ENST00000265651 GRCh38 chr11:33774420-33775520 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTAGTGAAATAAATGACGGGCGTGTGAAGTCCAGGTCTGTCTGGATTCCCCAAAGCCCCTTACACCATAC TACCTTTGGAAAAGCAATGGAAAAGAAGAAATCAGGCAAGTGATGTATGGACCCATTATACTTCCCCCAC TCTCATTTTAATATCACCTTGGCAAAGCTGAAGAGCAGACATCTTCGTGCCTCCATCAGTTATGCCCTCT GGGAGTCTCAGTTCATCCCTTCACACGCGGGATACTTAACTCTGCGGGATCTAAACCCTGGCCAAAATAA ATTTTAAAGCTGGAAAAAATCCACACTGTACCCTTTGCATTGCCCTAATAGGCTGAAAATAGCCATGATA ACCAAATTAAGGGACAGCGGCTGAGACTCAGACTCACTCCTTGTACACATTTTACTTAGGAAGGCGGGGA GGGGCGTGAAGTTAAGCCCTCAACAATTATTTCCTTAATTTGGGAGAAGGGCCTTCAGCTGGCGTCCCTG GCTGATTCTCAGCTCTGCTCTTGCTGAGTGGACAAGTCTCGGAGCGGCCCTGCTGTGTGCGGGGGACAAG CGGGGTGGGGAAGGCTGAGCGGGGAAAACGAGGGGTTCTCGGGTTGGAAAACAAAGAGAAGGAATGGATT TGGGGACCAAGGGCGTGGAGGAGTGTCAGATTTTGAGCGAGGCTTCCTGCATACTGAGTGTAAAATTTCG CAGGAGGAGTTGGGCAGACCGAGGCAGATTTGGCAACAAAAGGGTCCCGGGCTGGGCAAGTTTACGAACC GGGATGCGAGAACAGAGCTGGAGAGATTTGACGCGGAGCGCGAAGAAAGCGGGCTGAACTCGCACTGCGC CGCTGGCTCCCGGCTAGCGGGCGGGGTCTCCAGGGAGCCGCACCTCAGCCCACCCTGAGGGCGGGGCTGG CCCGGCGGTTACATAACAAACCTGTGAGAGCGGCTGGGGGCGGTTCGGGCGCTGGTGGGGGCGGGGCAGG GGCGGGGCCAGGGCGGGGCCAGACCTGCACCGGGCCAGGCAAGATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCG CCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTTATCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO3_1 ↗ | 11:33,774,520 | 負股 | 33,774,510–33,774,569 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_8ZRRM · enhancer · 33769595–33769843 · regulatory
ENSR11_9HDX5 · enhancer · 33772334–33772642 · regulatory
ENSR11_59XGXW · CTCF_binding_site · 33772862–33772883 · regulatory
ENSR11_B8NZ9 · enhancer · 33773343–33774336 · regulatory
ENSR11_59XH49 · CTCF_binding_site · 33773590–33773611 · regulatory
ENSR11_59XH7F · CTCF_binding_site · 33774271–33774292 · regulatory
ENSR11_9HDXP · promoter · 33774337–33774711 · regulatory
ENSR11_B8NZF · enhancer · 33774712–33775489 · regulatory
ENSR11_B8NZZ · enhancer · 33778225–33779244 · regulatory
· motif · 33770353–33770368 · motif
· motif · 33772743–33772749 · motif
· motif · 33772832–33772838 · motif
· motif · 33772864–33772880 · motif
· motif · 33773592–33773608 · motif
· motif · 33773613–33773623 · motif
· motif · 33773770–33773781 · motif
· motif · 33773772–33773781 · motif
· motif · 33774273–33774289 · motif
· motif · 33774489–33774499 · motif
· motif · 33774643–33774656 · motif
· motif · 33774643–33774656 · motif
· motif · 33774996–33775010 · motif
· motif · 33774996–33775010 · motif
· motif · 33775083–33775098 · motif
· motif · 33775808–33775819 · motif
· motif · 33775972–33775983 · motif
· motif · 33778107–33778119 · motif
· motif · 33778138–33778152 · motif
· motif · 33778138–33778152 · motif
· motif · 33778145–33778156 · motif
· motif · 33778241–33778252 · motif
· motif · 33778771–33778781 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：471 aa
FBXO3 蛋白質長 471 個胺基酸。F-box 位於第 10–56 位，ApaG 結構域位於第 278–408 位；第 419–455 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXO3 位於細胞核，並與 PML 共定位於核小體周邊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CUL1Q13616 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- tatP04608 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXO3 與 SKP1、CUL1 和 RBX1 組成 SCF(FBXO3) 蛋白質 ligase 複合體。FBXO3 也可直接與 PML 互作，無論是單獨存在或位於 SCF 複合體中皆可發生。感染情境下，FBXO3 透過 ApaG 結構域與 Rift valley fever virus NSs 的螺旋絲狀結構互作；所形成的絲狀 E3 ligase 再透過與 GT2H1 的互作介導 TFIIH complex 降解。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO3 是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 的底物辨識組成部分，促進目標蛋白質泛素化及後續 proteasomal 降解。它介導 HIPK2、可能也介導 EP300 的泛素化；PML 存在時，HIPK2 雖仍被泛素化，降解卻受到阻止。PML、HIPK2 與 FBXO3 可能協同促進 p53/TP53 依賴的轉錄活化。此外，LPS 刺激時，SCF(FBXO3) 特異辨識 Thr-404 磷酸化的 FBXL2，促進其泛素化與降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex, SCF(FBXO3), which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Mediates the ubiquitination of HIPK2 and probably that of EP300, leading to rapid degradation by the proteasome. In the presence of PML, HIPK2 ubiquitination still occurs, but degradation is prevented. PML, HIPK2 and FBXO3 may act synergically to activate p53/TP53-dependent transactivation. The SCF(FBXO3) also acts as a regulator of inflammation by mediating ubiquitination and degradation of FBXL2 in response to lipopolysaccharide (LPS). The SCF(FBXO3) complex specifically recognizes FBXL2 phosphorylated at 'Thr-404' and promotes its ubiquitination PMID 18809579 ↗ · PMID 26037928 ↗ · PMID 27010866 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境下，FBXO3 與 Rift valley fever virus 的 NSs 結合，形成重塑的 E3 ligase，促進目標蛋白質由 proteasome 降解。該絲狀 E3 ligase 以 TFIIH complex 為目標，造成強烈的抗病毒免疫抑制，並增強病毒致病性。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Associates with the Rift valley fever virus NSs to form a remodeled E3 ligase that triggers efficient proteasomal degradation of targeted proteins. The filamentous E3 ligase targets the TFIIH complex leading to robust inhibition of antiviral immunity and enhances viral pathogenesis PMID 39366381 ↗ |
| 分子活性 | FBXO3 相關的分子活性包括蛋白質修飾，具體為蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXO3 是 SCF(FBXO3) 蛋白質 ligase 複合體的一員，該複合體由 FBXO3、SKP1、CUL1 與 RBX1 組成。FBXO3 也可直接與 PML 互作，此互作可在 FBXO3 單獨存在時或位於 SCF 複合體內時發生。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a SCF (SKP1-cullin-F-box) protein ligase complex SCF(FBXO3) consisting of FBXO3, SKP1, CUL1 and RBX1. Interacts with PML, interaction is direct and takes place either alone or within the SCF complex PMID 18809579 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，FBXO3 透過 ApaG 結構域與 Rift valley fever virus NSs 的螺旋絲狀結構互作，形成絲狀 E3 ligase。此 ligase 透過與 GT2H1 的互作介導 TFIIH complex 降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via ApaG domain) with Rift valley fever virus NSs helical filament; this interaction forms a filamentous E3 which mediates degradation of TFIIH complex through interaction with GT2H1 PMID 24403578 ↗ · PMID 39366381 ↗ |
| 細胞定位 | FBXO3 位於細胞核，並與 PML 共定位於核小體周邊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGACCTGCACCGGGCCAGGCAAGATGGCGGCCATGGAGAC40CGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGAT80CCCCTGCTCCTCATCTTATCCTTTTTGGACTATCGGGATC120TAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCT160ATCAAGTCATGATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAA200TACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATC240AGTGTTGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGT280AGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGCC320TGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTC360GGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAGAGGAAGA400CCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCT440GACGATTATCGATGTTCATACCGAATTCACAATGGACAGA480AGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTC520TAATCACTATCGTTCTGAAGATTTGTTAGACGTCGATACA560GCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACT600GTCTCCCTTTAACTTTTTGCATACATACTGGTTTGAGTCA640GTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAAT680GAAGTTTTCTACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATC720CAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTAC760TGACTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGT800GGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATGTTC840ACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGT880GTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTTAGCTCTGTA920CATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。