基因總覽
FBXO25 是位於人類第 8 號染色體的蛋白質編碼基因，正式名稱為 F-box protein 25。其產物屬於 F-box 蛋白家族，具備 F-box 結構域，並作為 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）型 E3 ubiquitin ligase 複合體的底物辨識成分。這類基本特徵使 FBXO25 成為蛋白質泛素化系統中的辨識組件；其具體分子作用與相關生物學過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000350302 ★ | 406,958–477,967 | 10 |
| ENST00000518240 | 406,428–435,700 | 5 |
| ENST00000352684 | 406,808–477,967 | 9 |
| ENST00000382824 | 406,808–477,967 | 11 |
| ENST00000907984 | 406,808–477,967 | 11 |
| ENST00000907985 | 406,808–477,967 | 9 |
| ENST00000907986 | 406,808–477,967 | 10 |
| ENST00000912192 | 406,808–477,967 | 10 |
| ENST00000912193 | 406,808–477,967 | 9 |
| ENST00000956413 | 406,808–477,967 | 10 |
| ENST00001100681 | 406,808–477,967 | 9 |
| ENST00001100682 | 406,808–469,053 | 12 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO25 是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體的底物辨識成分。蛋白質泛素化是其來源註記所列的相關蛋白質修飾活動；在此複合體中，FBXO25 負責辨識底物，並與複合體的其他組成部分共同參與相關作用。現有資料未進一步指出 FBXO25 所辨識底物的普遍範圍，或說明其如何選擇不同底物，因此不宜將此角色延伸為特定的調控機制。
另有一項依相似性推論的註記指出，FBXO25 可能參與含有擴增型 polyglutamine（polyQ）的 huntingtin（HTT）蛋白累積。這是推論性描述，並非已確立的直接作用；資料也未提供此過程發生的條件、細胞情境或實驗讀出，因此只能保留「可能參與」的限定，不將它改寫成 FBXO25 已被證實會促進或抑制 HTT 累積。
總結而言，來源支持的主要功能定位是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 的底物辨識，以及與蛋白質泛素化相關的角色；對 HTT 的描述則仍屬依相似性提出的可能關聯。可據此說明 FBXO25 位於蛋白質修飾系統中，但現有資料不足以進一步界定其底物譜、調控方向或更廣泛的生物學效應。
Promoter 與基因調控
>FBXO25 ENST00000350302 GRCh38 chr8:405958-407058 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTATTTAAAAGCATGTGGTCAAGAAACACTATTATAATAAGCACTTCAGAAATAACTTCTAAAATTACTT TTCCAAAATATGAATCCATACTATACACTTCCTGTAATGTGCACCACATGTAGATGCACACATTTTAACA AGGAAAAGACTAATACTCATATTTGCTTGCTACACACCAGACACTGTTTTAAATGTTTTGCACACGCTAA CTCATTTGTTCTTATGGAAATCCTGTAGCGTGCACCGCCACCTCCATGTTTCTAGGCGGAAACTGAGGCA CGGGGGCTGCGGCTCCTGGACCCACCTGGCCTTCTCGGCCTGCCTCTCTCCCTCCAGCCGCCCCACATTC TTTTTTCCTAATTGGAAAAAACTATTCACGCTGCTCCTCCAGGGCATTTCAACCTTCTAGAAAGATTCGA CAAGATTCGAAACTGTTTATAAAGAGAACGTGCTTGTGCCCGAATGCTGAGTGTGAGCGCGCAGTGATGC CCTAGAGTGCAGTCATCCCGGGCTTGGCGCCCAGCGGGTGGAAATACGGCCGCAGGGTGGAAATGCGGCG GCGGGGCTGCCCAGGCTCCTGTGGGACCCGCGCGGCGCGGGCACGCACATTCTCAGGGACGCGCGTCCTC AGGCCACGAGAACACCTGAAGGCCCCGGCCAGCGTCCTCCCGTGAAGACCCGGACCGGCGTCGTCACCCG CCGCGCAGGCCTAAATCTCAGGTCTTCACCGTCATCTCCCAGCGATCGCAGGGATCTCAGGCACTGACCG CGCCCGTCCCTGCGCACCCGAGCCCCACCCCACGCCCCCACGCCCCCACGCCTCCACGCCCGGCACTCTG GACGCGCGCGGACGGAGGGGCAGTGCCTACTACGCAGGCGCACGCTGCGGGCGACAGGACCAGGCAGCAA CATTGCCACGCGGATCCGCGCCGGCCAATCAGCATGGCCAGGGGCGGGGCTTCCCTGAGGCGCGCCGGGA GGCGGCGGCCCACTTCCGGCAATAACCGCCTGGTCGCCGTCAGGTGCGGGCCCAGGTGGCCGGCGCGCCC GTTGGGCACTGGGGGACGCGGGCGCGTCAGGTGAAGACTGGGGGCCGCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO25_3 ↗ | 8:406,786 | 正股 | 406,737–406,796 |
| FBXO25_1 ↗ | 8:406,958 | 正股 | 406,909–406,968 |
| FBXO25_2 ↗ | 8:413,068 | 正股 | 413,019–413,078 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_C348 · enhancer · 403863–404998 · regulatory
ENSR8_B46S · promoter · 406318–406968 · regulatory
ENSR8_54KQZ · CTCF_binding_site · 406928–406949 · regulatory
ENSR8_B46X · enhancer · 406969–407869 · regulatory
· motif · 404066–404079 · motif
· motif · 404461–404469 · motif
· motif · 404614–404627 · motif
· motif · 404747–404764 · motif
· motif · 404787–404804 · motif
· motif · 404833–404848 · motif
· motif · 404833–404848 · motif
· motif · 404960–404968 · motif
· motif · 406828–406839 · motif
· motif · 406828–406839 · motif
· motif · 406930–406946 · motif
· motif · 406948–406957 · motif
· motif · 406948–406959 · motif
· motif · 406948–406959 · motif
· motif · 406951–406968 · motif
· motif · 407022–407033 · motif
· motif · 407051–407062 · motif
· motif · 407169–407185 · motif
· motif · 407227–407243 · motif
· motif · 409594–409608 · motif
· motif · 409594–409608 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：367 aa
FBXO25 蛋白質全長為 367 個胺基酸。其 F-box 結構域位於第 226 至 274 個胺基酸；第 1 至 83 個胺基酸區域則註記為與 beta-actin 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXO25 位於細胞核，並在核內與點狀的次核結構相關；其定位與 SKP1 共定位。 來源未提供不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- ACTBP60709 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDUFV1P49821 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
FBXO25 與 SKP1、CUL1 直接互作，並與 SKP1、CUL1 及 RBX1 組成 SCF 蛋白質 ligase 複合體。此外，FBXO25 的 C 端與 beta-actin 的 N 端互作；此處描述的是直接互作，不應與複合體組成混為一談。
疾病與遺傳關聯
涉及 FBXO25 的染色體異常與 X 聯鎖智能障礙（XLID）有關。資料指出，與 SHROOM4 相關的 t(X;8)(p11.22;p23.3) 易位是其中一種異常；此描述涉及染色體異常，並非 FBXO25 一般變異造成疾病的證據。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO25 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）型 E3 ubiquitin ligase 複合體中負責辨識底物的成分。依相似性推論，它可能參與含有擴增型 polyglutamine（polyQ）的 huntingtin（HTT）蛋白累積；此作用仍屬推論。 | 推論支持 | 證據與來源Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex. May play a role in accumulation of expanded polyglutamine (polyQ) protein huntingtin (HTT) (By similarity) |
| 分子活性 | FBXO25 的相關活動包括蛋白質修飾，具體列出的類別為蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXO25 與 SKP1、CUL1 及 RBX1 組成 SCF 蛋白質 ligase 複合體，並直接與 SKP1、CUL1 互作。另有直接互作關係：FBXO25 的 C 端與 beta-actin 的 N 端互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a SCF (SKP1-cullin-F-box) protein ligase complex consisting of FBXO25, SKP1, CUL1 and RBX1. Interacts directly with SKP1 and CUL1. Interacts (via C-terminus) with beta-actin (via N-terminus) PMID 16278047 ↗ · PMID 20473970 ↗ |
| 細胞定位 | FBXO25 位於細胞核，並與核內點狀次核結構相關；其與 SKP1 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; In the nucleus, associates with a subnuclear dot-like structure. Colocalized with SKP1 PMID 16278047 ↗ · PMID 18287534 ↗ |
| 疾病關聯 | 涉及 FBXO25 的染色體異常被描述為 X 聯鎖智能障礙（XLID）的原因之一。所列異常為與 SHROOM4 相關的 t(X;8)(p11.22;p23.3) 易位。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源A chromosomal aberration involving FBXO25 is a cause of X-linked intellectual disability (XLID). Translocation t(X;8)(p11.22;p23.3) with SHROOM4 |
核酸與蛋白質序列
AATAACCGCCTGGTCGCCGTCAGGTGCGGGCCCAGGTGGC40CGGCGCGCCCGTTGGGCACTGGGGGACGCGGGCGCGTCAG80GTGAAGACTGGGGGCCGCAGGCGCGCTAGGAGAACTATGC120CATTTTTGGGTCAGGACTGGAGATCTCCTGGATGGAGTTG160GATTAAGACAGAAGATGGCTGGAAGAGATGTGAATCTTGT200AGTCAGAAACTTGAAAGAGAGAATAACCGTTGTAACATCA240GTCACAGCATTATCTTAAATAGTGAAGATGGAGAAATATT280CAATAATGAAGAGCATGAATATGCATCGAAAAAAAGGAAA320AAGGACCATTTTAGAAATGACACAAATACTCAAAGTTTTT360ATCGTGAAAAATGGATCTATGTCCATAAAGAAAGCACAAA400GGAAAGGCATGGCTATTGCACCTTGGGAGAAGCCTTTAAT440CGGTTAGACTTCTCAAGTGCAATTCAAGATATCCGAAGGT480TCAATTATGTGGTCAAACTGTTGCAGCTAATTGCAAAATC520CCAGTTAACTTCATTGAGTGGCGTGGCACAGAAGAATTAC560TTCAACATTTTGGATAAAATCGTTCAAAAGGTTCTTGATG600ACCACCACAATCCTCGCTTAATCAAAGATCTTCTGCAAGA640CCTAAGCTCTACCCTCTGCATTCTTATTAGAGGAGTAGGG680AAGTCTGTATTAGTGGGAAACATCAATATTTGGATTTGCC720GATTAGAAACTATTCTCGCCTGGCAACAACAGCTACAGGA760TCTTCAGATGACTAAGCAAGTGAACAATGGCCTCACCCTC800AGTGACCTTCCTCTGCACATGCTGAACAACATCCTATACC840GGTTCTCAGACGGATGGGACATCATCACCTTAGGCCAGGT880GACCCCCACGTTGTATATGCTTAGTGAAGACAGACAGCTG920TGGAAGAAGCTTTGTCAGTACCATTTTGCTGAAAAGCAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。