基因總覽
FBXO24 是蛋白質編碼基因,產物為 F-box protein 24,屬於 F-box 蛋白。其蛋白質具有 F-box 結構域,並含有 RCC1 重複序列。這些結構特色與其作為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)E3 ubiquitin-protein ligase complex 組成成分的身分相符;在此複合體中,FBXO24 負責辨識特定底物。來源記載的底物包括 NME1、PRMT6、SLC25A26、DARS2 與 FOXK2,涵蓋細胞增殖、粒線體功能及細胞生物能量等相關面向。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000241071 ★ | 100,586,328–100,601,117 | 10 |
| ENST00000461079 | 100,583,982–100,590,357 | 4 |
| ENST00000883034 | 100,586,305–100,601,117 | 9 |
| ENST00000883035 | 100,586,305–100,601,117 | 8 |
| ENST00001138791 | 100,586,305–100,601,117 | 10 |
| ENST00000465843 | 100,586,626–100,595,621 | 7 |
| ENST00000466053 | 100,586,680–100,591,892 | 4 |
| ENST00000468962 | 100,589,573–100,601,117 | 10 |
| ENST00000427939 | 100,589,629–100,601,117 | 10 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO24 是 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex 的底物辨識成分。它辨識特定目標蛋白質,促進其泛素化,進而使其受到蛋白酶體降解。對 NME1 而言,FBXO24 特別辨識其去乙醯化形式,並促進該形式經泛素介導的降解。
FBXO24 也藉由促進 PRMT6 泛素化與蛋白酶體降解,調節細胞增殖;此作用會導致細胞週期受到抑制。這使 FBXO24 連結蛋白質周轉與細胞週期調控,但來源所述的結果限於這項特定底物及其降解作用。
在粒線體相關作用方面,FBXO24 可促進粒線體 S-adenosylmethionine transporter SLC25A26 的 Lys-6 連結多聚泛素化,使其被降解;依相似性推定,這項作用有助於精子形成期間維持粒線體功能。FBXO24 也促進粒線體 aspartyl-tRNA synthetase DARS2 的泛素化與降解,並與免疫抑制活性相關。
在肺上皮細胞中,核內的 FBXO24 會促進 FOXK2 經泛素介導降解。此過程對粒線體呼吸與細胞生物能量調節具有重要影響。上述例子顯示,FBXO24 可藉由辨識不同底物並促進其降解,參與多種細胞過程;各作用所涉底物與生物學情境並不相同。
Promoter 與基因調控
>FBXO24 ENST00000241071 GRCh38 chr7:100585328-100586428 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCCCATAGGCTGGAGAGCTGCGTGGACAGTGGAGAGGGCCAGGACCTTAGGGGGCGGGGTTGCGGCACA GAAAGCAGAAACCTCGGGCTTAGGGGCCAGTCACTGGGAAGGGGGTGCCCGGGGCTGCTCGGATCTCGGT GGGACGGGGGTTAAGAGGTGTAGATGAAGAGGGAGAGAAAGCAGTTATTAGAGGAGCTCGTGGGGACTGC TTCATAGACCGATTGGAGCTGAGGTTAAGAGATCATGTAAATAAGCCAACCAGGTGAGGGGCGGGACCAT CCTACAGGTGCGCAGATATGCAAATAAAGAGAAAGGAGGAATCTCTCCCAACGCTCGGAGGCGCAGGGCG TTCTGTGCAAACGAGAAGCACGTTCATTGTCTAGGGGGTTCTCAAAGATGGGAGAGGATGGCTGCAGGTT TAGGGCAATCAGGAGGGGCAGCAACCCTGGCCGCCAGGTGAAGGGGCGGGCCCGACTCCCGGGCCGGGCG GGGCCCGGGGTGGGGCTATGCAAATGAGGGACCCGGTTGGGCCCGGGGCCCGGCTGCACTCACCAGCCTG GGTGATGTCTGACAGGTCGTAGCTACGGGCCGCGCCCCGGGGGAAGTGCTTCAAGCGCCGGTTAGACAGG TTCAGGGTCCCGGTGGCCACGGCCTCCTCTAGGGCCCGCTCTGCACTGCGTCTCCCCGGCAGACCTGGAG ACCCGGGCACGGAGGTCGTGGCTGCCGCCTCCTCACCCCCGGCGGCGAGTGGAGCCGCTACGGCCGCCGC CATCCGCTCCCGGCGGCTCCCGCTGCCTGACTGACGGGACCGGCCGTCCCTCCTTCCCCCACCCCCTCCT TGGAGCCGCCGTAGTTGCCTCAAGGGGGAGGGAGCGGTGTCCGGGACCGGACGGACCAATCGTGGCCCCG AGACGCGTCAGAAGCGGCCAATCAGAACCCGTCAGTGGGGGTGGAGCTCCGGCGCCGGAGTCTGACGAGA GAAGGGAGGGGAACAAGGATAGAGCGCTCGCCAACGGCCGACGCTCCAGGCCGTCCCGCCCAGCGCAGCT GCACCCAATCACAATGCTCAGATCGGGAGGTGGAGCCAATCAGGTCCAACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO24_2 ↗ | 7:100,586,328 | 正股 | 100,586,279–100,586,338 |
| FBXO24_1 ↗ | 7:100,586,632 | 正股 | 100,586,583–100,586,642 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
來源指出 FBXO24 與細菌感染相關,但未提供感染如何影響其表現或活性的具體方向與機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:580 aa
F-box protein 24 長 580 個胺基酸。其 F-box 結構域位於第 36–82 個胺基酸,RCC1 重複序列位於第 376–425 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供不同條件下定位改變或異構型間定位差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NUDCD2Q8WVJ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRMT6Q96LA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXO24 與 SKP1、CUL1 有直接交互作用,並與 NME1、PRMT6、DARS2、FOXK2 及 RELA 交互作用。來源未進一步說明這些交互作用各自是否為直接結合,或是否均屬同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO24 是 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex 的底物辨識成分,可促進目標蛋白質泛素化與後續蛋白酶體降解;它辨識去乙醯化形式的 NME1,並促進 PRMT6 降解而抑制細胞週期。依相似性推定,FBXO24 也促使 SLC25A26 發生 Lys-6 連結多聚泛素化並降解,有助於精子形成期間維持粒線體功能;此外,它促進 DARS2 降解並與免疫抑制活性相關,也在肺上皮細胞中促進 FOXK2 降解,調節粒線體呼吸與細胞生物能量。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of an SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex that mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Specifically recognizes the deacetylated form of nucleoside diphosphate kinase A/NME1 and targets it for ubiquitin-mediated degradation. Functions as a key regulator of cell proliferation by targeting PRMT6 for ubiquitination and proteasomal degradation, leading to cell cycle inhibition. Also mediates 'Lys-6'-linked polyubiquitination of the mitochondrial S-adenosylmethionine transporter SLC25A26, targeting it for degradation and thereby maintaining mitochondrial function during spermiogenesis (By similarity). Promotes ubiquitination and degradation of mitochondrial aspartyl-tRNA synthetase DARS2, contributing to immunosuppressive activity. In the nucleus, targets FOXK2 for ubiquitin-mediated degradation, a process that critically modulates mitochondrial respiration and cellular bioenergetics in lung epithelial cells PMID 25582197 ↗ · PMID 32828318 ↗ · PMID 38735474 ↗ · PMID 39039092 ↗ |
| 交互作用 | FBXO24 與 SKP1、CUL1 有直接交互作用;來源另記載它與 NME1、PRMT6、DARS2、FOXK2 及 RELA 交互作用。除 SKP1 與 CUL1 外,該描述未指出其他交互作用是否為直接作用,也未交代這些分子間關係是否涉及同一複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Directly interacts with SKP1 and CUL1. Interacts with NME1. Interacts with PRMT6. Interacts with DARS2. Interacts with FOXK2. Interacts with RELA PMID 25582197 ↗ · PMID 32828318 ↗ · PMID 38735474 ↗ · PMID 39039092 ↗ |
| 細胞定位 | FBXO24 定位於粒線體與細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | FBXO24 與細菌感染相關;來源未說明此關聯的方向或具體調控方式。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGAGCGCTCGCCAACGGCCGACGCTCCAGGCCGTCCCGCC40CAGCGCAGCTGCACCCAATCACAATGCTCAGATCGGGAGG80TGGAGCCAATCAGGTCCAACCAAGAGGAGGGGACACCGGC120ACTCCACTAGCAGGAAAACGGGCCGAGGGACCGCAAGCAG160GGGGTGCCTAGTCCTCGTCCCCCAAAGACCAATCGTAAGC200CAGATACAGGCGAGTGACTGTCAAGAAGGCCAATTAGAGC240CTCCGAAGGGAATCTGGACCTGCCTCTTCTCTGAGGGACG280GCTCTACCTACCAATAGCATGGGCGAGAAGGCGGTCCCTT320TGCTAAGGAGGAGGCGGGTGAAGAGAAGCTGCCCTTCTTG360TGGCTCGGAGCTTGGGGTTGAAGAGAAGAGGGGGAAAGGA400AATCCGATTTCCATCCAGTTGTTCCCCCCAGAGCTGGTGG440AGCATATCATCTCATTCCTCCCAGTCAGAGACCTTGTTGC480CCTCGGCCAGACCTGCCGCTACTTCCACGAAGTGTGCGAT520GGGGAAGGCGTGTGGAGACGCATCTGTCGCAGACTCAGTC560CGCGCCTCCAAGATCAGGGTTCTGGAGTCCGGCCCTGGAA600GAGAGCTGCCATTCTGAACTACACGAAGGGCCTGTATTTC640CAGGCATTTGGAGGCCGCCGCCGATGTCTCAGCAAGAGCG680TGGCCCCCTTGCTAGCCCACGGCTACCGCCGCTTCTTGCC720CACCAAGGATCACGTCTTCATTCTTGACTACGTGGGGACC760CTCTTCTTCCTCAAAAATGCCCTGGTCTCCACCCTCGGCC800AGATGCAGTGGAAGCGGGCCTGTCGCTATGTTGTGTTGTG840TCGTGGAGCCAAGGATTTTGCCTCGGACCCAAGGTGTGAC880ACAGTTTACCGTAAATACCTCTACGTCTTGGCCACTCGGG920AGCCGCAGGAAGTGGTGGGTACCACCAGCAGCCGGGCCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。