演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXO21FBX21

F-box protein 21

FBXO21 編碼 F-box protein 21,為 SCF 型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分。

Homo sapiens12q24.22UniProt O94952
OFFICIAL SYMBOL
FBXO21
CHROMOSOME
12
UNIPROT
O94952
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXO21 是人類的蛋白質編碼基因,其產物為 F-box protein 21。這個蛋白屬於 F-box 蛋白家族,主要角色是作為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分。其蛋白質序列長 628 個胺基酸,並含有位於第 28 至 84 位胺基酸的 F-box 結構域。這些資料勾勒出 FBXO21 的基本特性:它是具有 F-box 結構域的蛋白質,並參與 SCF 型複合體的底物辨識。

Official symbol
FBXO21
Gene name
F-box protein 21
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13592
UniProt
O94952
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FBX21KIAA0875

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.22
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegFBXO21pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:117,141,975–117,190,527
Gene span
48,553 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000622495 ★117,141,991–117,190,47012
ENST00001001477117,141,975–117,190,50812
ENST00001139525117,141,991–117,190,50812
ENST00001001479117,141,999–117,190,50812
ENST00001001478117,142,000–117,190,50812
ENST00000923450117,143,781–117,190,50813
ENST00000923449117,143,783–117,190,50811
ENST00000880236117,143,944–117,190,50811
ENST00000550180117,145,049–117,190,28611
ENST00000330622117,145,068–117,190,45612
ENST00000948437117,145,068–117,190,50812
ENST00001058322117,145,068–117,190,50813

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXO21 的來源註解將其描述為 SCF 型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分。SCF 是由 SKP1、CUL1 與 F-box protein 組成的複合體;就此複合體而言,FBXO21 所承擔的功能角色,是參與辨認底物。這項資訊指出它在複合體中的分工,但未進一步說明它辨認哪些特定底物,或辨認過程所需的序列、修飾與細胞條件。

E3 ubiquitin ligase complex 的名稱表明該複合體屬於 E3 ubiquitin ligase 類型,而 FBXO21 被註記為其中的底物辨識成分。來源支持的功能重點因此是底物辨識角色,並未提供 FBXO21 對特定底物進行泛素化的實驗描述,也未指出底物後續命運或由此引發的細胞反應。依據現有資訊,不能將這項註解延伸為特定蛋白質降解、訊號路徑或生理效應的主張。

此功能註解提供了 FBXO21 在 SCF 型複合體中的定位方式:它與底物辨識相關,而非僅以一般的 E3 ligase 成分加以描述。至於其辨識選擇性、參與的生物過程,以及底物辨識如何影響細胞功能,現有來源均未交代;因此這些面向仍無法由此資料判定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 117190470 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXO21 ENST00000622495 GRCh38 chr12:117190370-117191470 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATTAGCCTAAAATCAGGGCACACATTTGAGGATTATTATTACTCCCCTACACCATCATAGAGGGCTTCC
CATAGCACCCACTCAAGAATATTGTTATTATTACATCATATGGTTAAGATTACTGACAAGCAAAAGTCAA
GTGGATCTGAAATAGAATCCAAGACAAGGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTG
GGAGGCCGAGGTGGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCT
GTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGCTGTGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGG
CTGACGCAGGATAATTGCTTGAACCAGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGCCGAGATCACGGCCACTGCACT
CCAACCTGGGTGGTGGCGCGCGCCTGTAATCCCATCCGCACGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAA
CCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATAGCGCCACTGCCCTCCAGCCTGGGTGAGAGCAAGACTC
CTTCCCAAAGGGGGAAAAAAAATCCAAGACAAGGGATCCTGAGCAAGCCCTCTCACTCTCCGAACCTGTT
TCCCCATCTGTAATATGGGGAGAAAGTTCGCAGGGTAATTCGGAAAGGTCCAATGCGCACAGAAAGCGCT
CAGCACGCGTGAGAATAGATACCATTTTTATTTGTTAATTTTAAACATTAATTACGTTTAAAAGAATCAG
TGCTACTATTGTTGTCCCGGACTAGAGGCGGCTTGCGCTGCCGGCTCCAAGCACAGAGCCCAATTATGTC
CTCCCTTTTGCGGCGCTGCCACCCGCGCAGCCCCCAGCCGATGCAGGGGAGGTGTGGCCCGCGGATGGGC
GGAGCGATCTCAGGACTCGCCCCCAAGACCAGTAGGCGGGGCCAGGCGGGGCGCCCGGGCACTCTCGCAC
GCGCGCGCGCGGCGGCCCCAGGTACGCGGACAAGATGGCGGCGGCAGCAGTCGACAGCGCGATGGAGGTG
GTGCCGGCGCTGGCGGAGGAGGCCGCGCCGGAGGTAGCGGGCCTCAGCTGC
FBXO21 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXO21_1 ↗12:117,190,470負股117,190,460–117,190,519

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BT8XN · promoter · 117190446–117190960 · regulatory

ENSR12_93PHWR · enhancer · 117192026–117192401 · regulatory

· motif · 117189528–117189540 · motif

· motif · 117189762–117189775 · motif

· motif · 117189783–117189795 · motif

· motif · 117190013–117190023 · motif

· motif · 117190220–117190231 · motif

· motif · 117190222–117190231 · motif

· motif · 117190279–117190288 · motif

· motif · 117190330–117190339 · motif

· motif · 117190385–117190394 · motif

· motif · 117190448–117190458 · motif

· motif · 117190480–117190491 · motif

· motif · 117190480–117190491 · motif

· motif · 117190482–117190493 · motif

· motif · 117190482–117190493 · motif

· motif · 117190486–117190497 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:628 aa

1 aa628 aa結構域
依 O94952 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

F-box protein 21 長 628 個胺基酸,含有 F-box 結構域,位於第 28 至 84 位胺基酸。來源未提供其他結構域或功能區域註解。

結構域F-box28–84 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O94952…

AlphaFold · O94952

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FBX21FBXO21EID1SKP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXO21 與 SKP1 和 CUL1 直接互作。此資訊指出的是直接分子互作;來源未提供更詳細的結合條件或其他互作對象。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXO21 是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分;這項註解指出其在複合體中的角色,但未說明特定辨識底物或相關條件。推論支持
證據與來源

Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用FBXO21 與 SKP1 及 CUL1 有直接互作;此敘述指出兩個直接互作對象,但未提供其他互作條件或功能結果。推論支持
證據與來源

Directly interacts with SKP1 and CUL1

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000622495 · 5,976 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGTACGCGGACAAGATGGCGGCGGCAGCAGTCGACAGCGC40
41GATGGAGGTGGTGCCGGCGCTGGCGGAGGAGGCCGCGCCG80
81GAGGTAGCGGGCCTCAGCTGCCTCGTCAACCTGCCGGGTG120
121AGGTGCTGGAGTACATCCTGTGCTGCGGCTCGCTGACGGC160
161CGCCGACATCGGCCGTGTCTCCAGCACCTGCCGGCGGCTG200
201CGCGAGCTGTGCCAGAGCAGCGGGAAGGTGTGGAAGGAGC240
241AGTTCCGGGTGAGGTGGCCTTCCCTTATGAAACACTACAG280
281CCCCACCGACTACGTCAATTGGTTGGAAGAGTATAAAGTT320
321CGGCAAAAAGCTGGGTTAGAAGCGCGGAAGATTGTAGCCT360
361CGTTCTCAAAGAGGTTCTTTTCAGAGCACGTTCCTTGTAA400
401TGGCTTCAGTGACATTGAGAACCTTGAAGGACCAGAGATT440
441TTTTTTGAGGATGAACTGGTGTGTATCCTAAATATGGAAG480
481GAAGAAAAGCTTTGACCTGGAAATACTACGCAAAAAAAAT520
521TCTTTACTACCTGCGGCAACAGAAGATCTTAAATAATCTT560
561AAGGCCTTTCTTCAGCAGCCAGATGACTATGAGTCGTATC600
601TTGAAGGTGCTGTATATATTGACCAGTACTGCAATCCTCT640
641CTCCGACATCAGCCTCAAAGACATCCAGGCCCAAATTGAC680
681AGCATCGTGGAGCTTGTTTGCAAAACCCTTCGGGGCATAA720
721ACAGTCGCCACCCCAGCTTGGCCTTCAAGGCAGGTGAATC760
761ATCCATGATAATGGAAATAGAACTCCAGAGCCAGGTGCTG800
801GATGCCATGAACTATGTCCTTTACGACCAACTGAAGTTCA840
841AGGGGAATCGAATGGATTACTATAATGCCCTCAACTTATA880
881TATGCATCAGGTTTTGATTCGCAGAACAGGAATCCCAATC920
921AGCATGTCTCTGCTCTATTTGACAATTGCTCGGCAGTTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。