演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXO2FBX2

F-box protein 2

FBXO2(F-box protein 2)是蛋白質編碼基因,其產物參與辨識醣蛋白底物,並具有 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識角色。

Homo sapiens1p36.22UniProt Q9UK22
OFFICIAL SYMBOL
FBXO2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9UK22
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXO2 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 F-box protein 2。其產物屬於 F-box 蛋白家族,主要角色是作為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分。蛋白質序列含有 F-box 與 FBA 結構域,另有一段被註記為無序區域。這些特徵構成 FBXO2 的基本分子架構;其辨識底物及參與蛋白質處理的方式詳述於功能段落。

Official symbol
FBXO2
Gene name
F-box protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13581
UniProt
Q9UK22
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FBX2Nfb42Fbs1Fbg1OCP1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.22
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegFBXO2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:11,637,018–11,655,785
Gene span
18,768 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000354287 ★11,648,387–11,654,4296
ENST0000085843911,648,360–11,654,6546
ENST0000085844011,648,360–11,654,6546
ENST0000085844111,648,360–11,654,6546
ENST0000114102311,648,360–11,654,6546
ENST0000046590111,650,547–11,655,7852

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXO2 在 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體中負責辨識底物。此類複合體可促使目標蛋白質泛素化,進而使其接受蛋白酶體降解;FBXO2 因而參與將特定蛋白質導向這項處理途徑。其功能描述也包括蛋白質修飾與蛋白質泛素化。

在內質網相關降解途徑(ERAD)中,FBXO2 參與處理錯誤摺疊的腔內蛋白質。這些未摺疊的醣蛋白會轉位至細胞質,FBXO2 能辨識並結合其醣鏈,促進底物泛素化及後續降解。來源指出,FBXO2 可辨識變性醣蛋白,且偏好高甘露糖型;此項偏好屬於依相似性推定的註記。

此辨識與降解作用也有助於避免已轉位至細胞質的未摺疊醣蛋白形成細胞質聚集體。來源所述的生物學意義因此包括清除這類錯誤摺疊蛋白,並減少其在細胞質聚集的情形;相關敘述未提供更進一步的實驗條件或量化結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 11654429 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXO2 ENST00000354287 GRCh38 chr1:11654329-11655429 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAGAACATGATGGGAGGAGGAGGCTAATTATCACTGCCTCCCGCGGAGGTCCAAAGGGCTCCAGCCACC
TTCTCAAGATCTCAGAGGACATGATCTCCTGCCTAGGTGGGAGTGGCAAGAGGGTGGGCGACAGGGAAGG
GCCCTTCCTATCTCCCCACCCCCACTCCCACCCCCAGCCCCGCGGCTGGGCTCCGCCAGCCCCAAGTCCG
CCAGCGCGCCTGCAGCCTCCCCTTCCCACGCTGTGCCTTAAAATGCCCCCCAAAGTCTGGGCTCGGACCC
CTGTACATCGATGGCGACCCCAGCCCCCGTTCGCAGCCGCGCAGCGCAGCCCGGGCAAGCTCGGCGGCCT
GGGCCTGGTCGGTGCCAGGCCTCCCTCGGCAACTGCGGCGCGACCCGGAACCCAGGAGCCTTCCCGGCAG
CCCCCGCCCAGCCGCGCCCCCTCCCCAGCGCCCCCCGCGCCCCCTCCTGCCGGTCACCTGCGCTCGGCCG
CCGCGGCACGATCCGTTGGGCCGCCCAAGCTGCACCGCCTGGACCTGCGCTTGCCTGGAAAGCGAGGCCC
CGCCCCGGCCCGCCAGGCCCCGCCCCCGCGCCCCGCGCCCCGCCCCGCGCAGCGCTGGGCCAGGGACGCA
CCCCCACCGCGTCGTAGGAAAATTACCTGGTGTGGGGGGTGGGGCGGAAGGCACCTCCTATACTCCGACT
CCGCCTGGGCCACCCGCCCCTCACCCTCGGCCTGACCCAGCCTCTCCGTGCCTCCCCTAGCCGCCTCCTC
CCAGCAGTCCCCCAGGAGCGAGCTGCGAGATGCCCCAAATCGGACCCCTCCCCAGTTGGAAAAAAAACGA
CTCCTGACCTTTCCCAGCCTCCTCGGTCCGCTGAGGAACCCGCAGCCCCGGGCCTCGAGCAGACTGCTGG
GACTGCGGGGCGGCCGGGCGCGGGGCCAGAGGCGGGGCGGGGCGGGTCGGGTCGGGGGCCTTTAAGAGGC
GCGGTCGCCGGGACCGACACAGACGCGGACAGCGCCGGGACTCGCCGCCCCGGGACTCGCGCAGCCCGCA
GCGCTCCGGCTCCTCCTCTCGCGACCGCCCTCCGCAGCGATGGACGGAGAC
FBXO2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXO2_1 ↗1:11,654,429負股11,654,419–11,654,478
FBXO2_2 ↗1:11,654,654負股11,654,644–11,654,703

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_54PZN3 · CTCF_binding_site · 11650391–11650412 · regulatory

ENSR1_54PZPM · CTCF_binding_site · 11650739–11650760 · regulatory

ENSR1_96LW5 · promoter · 11653885–11654385 · regulatory

ENSR1_96LWB · promoter · 11654419–11654920 · regulatory

ENSR1_B4BG8 · enhancer · 11654921–11655540 · regulatory

ENSR1_54Q2G6 · CTCF_binding_site · 11654956–11654977 · regulatory

ENSR1_54Q2KJ · CTCF_binding_site · 11655684–11655705 · regulatory

· motif · 11650151–11650164 · motif

· motif · 11650393–11650409 · motif

· motif · 11650741–11650757 · motif

· motif · 11654577–11654589 · motif

· motif · 11654958–11654974 · motif

· motif · 11655686–11655702 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:296 aa

1 aa296 aa結構域功能區域
依 Q9UK22 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

F-box protein 2 長 296 個胺基酸。其 F-box 結構域位於第 44–91 位胺基酸,FBA 結構域位於第 113–296 位;第 1–41 位則註記為無序區域。

結構域F-box44–91 aa
結構域FBA113–296 aa
功能區域Disordered1–41 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UK22…

AlphaFold · Q9UK22

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Microsome membrane

FBXO2 位於細胞質,也註記為微粒體膜周邊蛋白,位置在膜的細胞質側。 來源未描述定位隨條件或異構型改變的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Microsome membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FBX2FBXO2PAX4PFDN6SIAESKP1VSTM1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXO2 是由 CUL1、RBX1、SKP1 與 FBXO2 組成的 SCF(FBXO2) 複合體成員。另有描述指出,FBXO2 主要以與 SKP1 組成的異源二聚體被檢出;此異源二聚體並非 SCF(FBXO2) 複合體的一部分。相關資訊標註為依相似性推定。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXO2 是 SCF E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分,促進目標蛋白質泛素化及後續蛋白酶體降解。它參與 ERAD,辨識並結合轉位至細胞質的未摺疊醣蛋白醣鏈,促進其泛素化與降解,並避免這類蛋白質形成細胞質聚集體;對變性醣蛋白的辨識偏好高甘露糖型,屬依相似性推定。推論支持
證據與來源

Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex that mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Involved in the endoplasmic reticulum-associated degradation pathway (ERAD) for misfolded lumenal proteins by recognizing and binding sugar chains on unfolded glycoproteins that are retrotranslocated into the cytosol and promoting their ubiquitination and subsequent degradation. Prevents formation of cytosolic aggregates of unfolded glycoproteins that have been retrotranslocated into the cytosol. Able to recognize and bind denatured glycoproteins, preferentially those of the high-mannose type (By similarity)

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分子活性此紀錄列出 FBXO2 相關的蛋白質修飾活性,具體包括蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

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交互作用FBXO2 是由 CUL1、RBX1、SKP1 與 FBXO2 組成的 SCF(FBXO2) 複合體成員。FBXO2 主要以與 SKP1 形成的異源二聚體被檢出,但此二聚體不屬於 SCF(FBXO2) 複合體;相關描述為依相似性推定。推論支持
證據與來源

Component of the SCF(FBXO2) complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and FBXO2. Predominantly detected as heterodimer with SKP1; the heterodimer with SKP1 is not part of the SCF(FBXO2) complex (By similarity)

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細胞定位FBXO2 註記位於細胞質,也位於微粒體膜的周邊,且位於膜的細胞質側。推論支持
證據與來源

Cytoplasm; Microsome membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000354287 · 1,287 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACGCGGACAGCGCCGGGACTCGCCGCCCCGGGACTCGC40
41GCAGCCCGCAGCGCTCCGGCTCCTCCTCTCGCGACCGCCC80
81TCCGCAGCGATGGACGGAGACGGTGACCCAGAGAGCGTGG120
121GCCAGCCCGAGGAGGCAAGCCCGGAGGAGCAGCCAGAGGA160
161GGCGAGTGCTGAGGAGGAGCGGCCGGAGGACCAGCAGGAG200
201GAGGAGGCGGCGGCCGCCGCCGCGTACCTGGACGAGCTGC240
241CCGAGCCGCTGCTGCTGCGCGTGCTGGCCGCACTGCCGGC280
281CGCCGAGCTGGTGCAGGCCTGCCGCCTGGTGTGCCTGCGC320
321TGGAAGGAGCTGGTGGACGGCGCCCCGCTGTGGCTGCTCA360
361AGTGCCAGCAGGAGGGGCTGGTGCCCGAGGGCGGCGTGGA400
401GGAGGAGCGCGACCACTGGCAGCAGTTCTACTTCCTGAGC440
441AAGCGGCGCCGCAACCTTCTGCGTAACCCGTGTGGGGAAG480
481AGGACTTGGAAGGCTGGTGTGACGTGGAGCATGGTGGGGA520
521CGGCTGGAGGGTGGAGGAGCTGCCTGGAGACAGTGGGGTG560
561GAGTTCACCCACGATGAGAGCGTCAAGAAGTACTTCGCCT600
601CCTCCTTTGAGTGGTGTCGCAAAGCACAGGTCATTGACCT640
641GCAGGCTGAGGGCTACTGGGAGGAGCTGCTGGACACGACT680
681CAGCCGGCCATCGTGGTGAAGGACTGGTACTCGGGCCGCA720
721GCGACGCTGGTTGCCTCTACGAGCTCACCGTTAAGCTACT760
761GTCCGAGCACGAGAACGTGCTGGCTGAGTTCAGCAGCGGG800
801CAGGTGGCAGTGCCCCAAGACAGTGACGGCGGGGGCTGGA840
841TGGAGATCTCCCACACCTTCACCGACTACGGGCCGGGCGT880
881CCGCTTCGTCCGCTTCGAGCACGGGGGGCAGGACTCCGTC920
921TACTGGAAGGGCTGGTTCGGGGCCCGGGTGACCAACAGCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。