基因總覽
FBXO16 是蛋白質編碼基因，產物 F-box protein 16 屬於 F-box 蛋白家族，參與 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 ubiquitin-protein ligase 複合體。它在複合體中的主要角色是辨識底物，使特定蛋白質得以進入泛素化及後續降解流程。來源指出其作用涉及多種不同蛋白質，呈現其作為底物辨識成分的功能特性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380254 ★ | 28,428,412–28,490,229 | 9 |
| ENST00000346498 | 28,428,380–28,490,315 | 7 |
| ENST00000518734 | 28,428,380–28,490,315 | 8 |
| ENST00000902912 | 28,428,380–28,490,315 | 9 |
| ENST00000987009 | 28,428,380–28,490,315 | 8 |
| ENST00001030099 | 28,428,380–28,490,315 | 8 |
| ENST00001073453 | 28,428,380–28,490,315 | 7 |
| ENST00001073455 | 28,428,380–28,490,315 | 8 |
| ENST00001137156 | 28,428,380–28,490,315 | 9 |
| ENST00000518248 | 28,428,408–28,456,806 | 3 |
| ENST00001109920 | 28,444,662–28,490,315 | 8 |
| ENST00001115948 | 28,446,962–28,490,315 | 6 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO16 是 SCF E3 ubiquitin-protein ligase 複合體的底物辨識成分，可促使目標蛋白質泛素化，並進而促進其蛋白酶體降解。來源列出的底物包括 CTNNB1、hnRNPL、RELA 與 ULK1；這些例子顯示 FBXO16 參與不同蛋白質的調控，而非只作用於單一目標。
FBXO16 可使細胞核中的 beta-catenin／CTNNB1 降解，且此作用不依賴上游活化訊號。來源據此將 FBXO16 描述為可能的腫瘤抑制因子，並指出 CTNNB1 降解會抑制上皮—間質轉化（epithelial-to-mesenchymal transition）。這些敘述限定於所述的底物調控及其相關結果，未表示 FBXO16 對所有上游訊號或腫瘤情境均有相同作用。
FBXO16 也控制 hnRNPL 的泛素化與降解，並透過促進 RELA 多聚泛素化及降解，負向調節 NF-kappa-B 訊號傳遞。這些作用均涉及目標蛋白質的穩定性調控，但來源未進一步說明它們之間是否存在共同的下游機制。
在自噬調控方面，FBXO16 促進絲胺酸／蘇胺酸蛋白激酶 ULK1 的 Lys-48 連結多聚泛素化，並抑制自噬。此例將 FBXO16 的底物調控連結至自噬過程；來源支持的是透過 ULK1 泛素化與自噬受抑制的關係，未提供更廣泛的條件或適用範圍。
Promoter 與基因調控
>FBXO16 ENST00000380254 GRCh38 chr8:28490129-28491229 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTAAGTGGAAGGGGAGTGCATTCTTATTTATTTTGAGAAAAAAAGATAGTAAGGAAAGTCTCTTTTTG CTGTTGTTTTGCTTTTTGTTGTTGTTGACTGCTGCCTATAAGACCTGCTTTACATTGACCAAAGGACCTC TGTTCCGGAATTTTGAACTTTTTGGTATCCTCCAGCACTTGTTCATAACTCTATAACAGCTGTTACCCGT GTGAGCCTTCCATTAAATATTTGTATATTGCACCTTCCAGTCTTCCTCTTTAGATTTCTTTTTTATCTTT GTATTCTCATTTTGCTTCGTATTACAAGACAGGCGCTCAATAAATTTAATGAATTGGACGGGATTCTAAG AGTTCCTAAATTTAGTTATTCTTATTAGGGCATGCCATCTGCTGGTTCCCTGGTGTATCTGTCAGTCAGC CTGAATTCTATAATCCAATAAATTGAAATTTGCATTGAAGCATTTGTGTGTCTCTGTGTTGGGCAATTCC TCCTGGCCCCATCCTTCCACTTCCTGTTGCAGGTGCTATTCTTTCATTGAACCAGTCTCGAATTCTTTTT CCTCCAACCCTCTGTTTACCTGTTGGCCACTCTTAAAACCTGGCACAGTGGAGCCTGCATTTCGCAGCTC CGGAGTGACCAGGACAATGTGACTGGGCGTGCTCCGTAGGTAGGGCTGATTTGGGACACACTACGTCTTG AATGAAGGTTTTCAACGCTACTTGTTTCAGGATTCGACGCGTCTTCATTCTAGGGTTATATTGAGACATT GCAGTCCCTCCCACGCTCTTGGCCGCCACACTTGTTAATTTTATCCCCGTGCCCAATTTTGTAGCCAGCC CTCCTGGATCTCGCGGCCAATCAGGAGCCCACACATTGTTGCCTAAGAGACCCCGGATGCCAGCGACGGG ATTTATAGACGGTGATTGGGCTGCTGGAAGCTGGGAGGGGTGAGGGACTGGAGGGAGTCGGAGAAAAAGC TGACCTAATGAAACTGTGGCAACGTCAGCGCTTGAGGCTTGAAGAGGGAGACAAGCTAAAAGAGGTGAGA GCTGTGGGCAGTGCATGAAAAAGATGGAGACTCTCTCTTTGGAAAGCTCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO16_1 ↗ | 8:28,490,229 | 負股 | 28,490,219–28,490,278 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_8SLMB · enhancer · 28489971–28490218 · regulatory
ENSR8_B7MMT · promoter · 28490219–28490768 · regulatory
ENSR8_58NX93 · CTCF_binding_site · 28490831–28490852 · regulatory
ENSR8_58NXQC · CTCF_binding_site · 28493703–28493724 · regulatory
ENSR8_9FBCR · promoter · 28493715–28494222 · regulatory
ENSR8_58NXSQ · CTCF_binding_site · 28494222–28494243 · regulatory
ENSR8_C4SC9 · enhancer · 28494223–28495610 · regulatory
· motif · 28490441–28490454 · motif
· motif · 28490446–28490456 · motif
· motif · 28490588–28490610 · motif
· motif · 28490833–28490849 · motif
· motif · 28491024–28491037 · motif
· motif · 28491024–28491037 · motif
· motif · 28493705–28493721 · motif
· motif · 28493876–28493891 · motif
· motif · 28493908–28493917 · motif
· motif · 28493932–28493941 · motif
· motif · 28494146–28494157 · motif
· motif · 28494157–28494168 · motif
· motif · 28494163–28494174 · motif
· motif · 28494163–28494174 · motif
· motif · 28494224–28494240 · motif
· motif · 28494239–28494250 · motif
· motif · 28494332–28494347 · motif
· motif · 28494707–28494722 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：292 aa
F-box protein 16 長 292 個胺基酸，含有位於第 86–132 位的 F-box 結構域。序列註解另標示兩段預測為無序區域，分別位於第 188–224 位及第 238–292 位；這些區域屬於序列特徵註解，來源未提供其具體功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MORF4L1Q9UBU8-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MORF4L2Q15014 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NXT1Q9UKK6 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TRIM54Q9BYV2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXO16 是 SCF（SKP1-cullin-F-box）蛋白質連接酶複合體的一部分。來源另記載 FBXO16 與 CTNNB1、HNRNPL、RELA 及 ULK1 互作；這些是互作紀錄，與其在 SCF 複合體中的成員身分分開描述。來源未進一步界定各互作的結合方式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO16 是 SCF E3 ubiquitin-protein ligase 複合體的底物辨識成分，可促進目標蛋白質泛素化及蛋白酶體降解。它可能作為腫瘤抑制因子，透過不依賴上游活化訊號的方式促使細胞核 CTNNB1 降解，進而抑制上皮—間質轉化；也控制 hnRNPL 降解、負向調節 NF-kappa-B 訊號，並透過促進 ULK1 的 Lys-48 連結多聚泛素化抑制自噬。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of an SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex that mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Functions as a putative tumor suppressor by targeting nuclear beta-catenin/CTNNB1 for degradation independently of upstream activating signals, thereby inhibiting epithelial-to-mesenchymal transition. Controls the ubiquitination and degradation of hnRNPL. Negatively regulates NF-kappa-B signaling by mediating the polyubiquitination and degradation of RELA. Inhibits autophagy by promoting 'Lys-48'-linked polyubiquitination of the serine/threonine-protein kinase ULK1 PMID 30714168 ↗ · PMID 34333526 ↗ · PMID 39384743 ↗ · PMID 40529355 ↗ |
| 交互作用 | FBXO16 是 SCF（SKP1-cullin-F-box）蛋白質連接酶複合體的一部分。來源另記載 FBXO16 與 CTNNB1、HNRNPL、RELA 及 ULK1 互作；此處列出的是複合體成員身分與互作關係，未進一步說明各互作的具體方式。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a SCF (SKP1-cullin-F-box) protein ligase complex. Interacts with CTNNB1. Interacts with HNRNPL. Interacts with RELA. Interacts with ULK1 PMID 30714168 ↗ · PMID 34333526 ↗ · PMID 39384743 ↗ · PMID 40529355 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AACGTCAGCGCTTGAGGCTTGAAGAGGGAGACAAGCTAAA40AGAGGATATCCAGTTGTTTCATGATGGCATTTGCACCTCC80AAAAAACACAGATGGTCCCAAAATGCAGACAAAGATGAGC120ACCTGGACACCCCTAAACCATCAGCTATTGAATGACCGGG160TATTTGAAGAAAGAAGAGCCCTGCTTGGCAAATGGTTTGA200CAAATGGACAGACTCTCAAAGAAGAAGAATCCTCACAGGC240CTGTTGGAGCGCTGCTCGCTGTCCCAGCAAAAGTTCTGCT280GTCGAAAGCTTCAAGAGAAAATTCCAGCAGAAGCCCTGGA320CTTTACAACCAAGCTTCCAAGGGTGTTATCTTTATACATC360TTTTCTTTCCTGGACCCTCGGAGCCTTTGTCGTTGTGCAC400AGGTGTGCTGGCATTGGAAGAACCTTGCTGAGCTGGACCA440GCTCTGGATGCTGAAATGTTTACGGTTTAACTGGTACATC480AATTTCTCTCCAACTCCCTTTGAGCAGGGGATCTGGAAGA520AGCACTATATTCAAATGGTGAAAGAACTTCATATTACCAA560GCCTAAGACACCCCCAAAGGATGGATTTGTAATCGCTGAC600GTTCAACTAGTTACAAGCAATTCTCCAGAGGAAAAACAGT640CCCCTTTATCAGCTTTTCGGTCCTCTTCCTCTTTAAGAAA680GAAGAATAACTCAGGGGAGAAAGCACTTCCACCCTGGCGA720TCTTCTGATAAGCACCCAACAGATATCATTCGTTTTAATT760ACCTAGACAACCGTGACCCCATGGAGACTGTCCAGCAAGG800AAGAAGAAAAAGAAACCAAATGACCCCAGACTTCAGCCGA840CAGTCACATGATAAGAAAAATAAATTGCAGGACAGAACTA880GGCTAAGAAAAGCACAATCAATGATGTCGAGGAGAAATCC920CTTCCCACTATGTCCCTAAGTGCCAGCTCTCCCCTAAAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。