演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXO15MGC39671

F-box protein 15

FBXO15(F-box protein 15)是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識組成部分。

Homo sapiens18q22.3UniProt Q8NCQ5
OFFICIAL SYMBOL
FBXO15
CHROMOSOME
18
UNIPROT
Q8NCQ5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXO15 的正式名稱為 F-box protein 15,屬於蛋白質編碼基因,其產物是長 510 個胺基酸的蛋白質。蛋白質序列中具有 F-box 結構域;來源將其描述為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識組成部分。這些資料指出了 FBXO15 的蛋白質性質、結構特色與在複合體中的基本角色,但未提供其他結構區域或更詳細的受質資訊。

Official symbol
FBXO15
Gene name
F-box protein 15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13617
UniProt
Q8NCQ5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MGC39671FBX15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q22.3
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegFBXO15pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr18:74,073,344–74,147,867
Gene span
74,524 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000419743 ★74,073,368–74,147,83410
ENST0000087915374,073,344–74,147,86710
ENST0000087915474,073,344–74,147,8679
ENST0000087915574,073,344–74,147,8679
ENST0000113240274,073,344–74,147,86710
ENST0000058008874,073,444–74,123,5103
ENST0000057951774,122,592–74,126,1013
ENST0000058252674,130,470–74,147,8433

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXO15 的功能註解將其定位為 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體中的受質辨識組成部分。SCF 是由 SKP1、CUL1 與 F-box protein 組成的複合體;此註解指出,FBXO15 在其中承擔辨識受質的角色。這項描述界定了它在複合體中的功能定位,但沒有列出可辨識的特定受質,也未說明辨識條件或後續作用的具體步驟。

作為受質辨識組成部分,FBXO15 的功能與 SCF 複合體的 E3 ubiquitin ligase 性質相關。現有資料僅支持這項複合體層級的角色,未提供 FBXO15 如何選擇或接觸受質、是否影響特定細胞過程,或其功能對生物學結果的具體影響。因此,不宜據此推定特定受質、反應機制或生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 74147834 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXO15 ENST00000419743 GRCh38 chr18:74147734-74148834 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACGGCTCGTAGAAAAGTACAAATCATGTTCACGGAAAATCGTTCCGCTTAGGGACGATGCTAACTACAAT
TAGGAAAGCTTTAGGGTTCACTACACATGCGGCCGGACACGTACTCAAGCCTATACGTTTACATTACATG
GGGTGTTAGGCAAAAACGTCAGTTTCCGCAGCGTAAATGAAAACGAAAAGTCTCCAGGGAGAACCTGATG
TCTACCTTCCCTTCTGTCTTCTTTCCATTTTAATTAACAGGCTCTGATCACCTTCTGGGCTGACATTCAC
AGTGTCCCCGCCATGCCTTCGCAAAGTCACCTGGGAAACCCCCGTCTTCCTGGGAATAGTAGTTTGAAAA
CCTCGCTCTTAACTGGGATACGGCAAAGAGGCGCGCAAAAGAGACTACATCTCCCACAATTCAAGGCGGC
CAGAGCACGGCGCAGGTCCTTCCCGCGCCCCCAGACGCCTCCGCGCCCAGCGTCGGCGCAGACGCTGCGC
GTCCCTGGAGCGGCGGAAAGTGGGGTGTTGGTGGGGGAATTGGTACCACCCACCCTACGTGGTTCAGGCG
GGACTTGCAAAAGCCAAATTAGCAGTTACAATCTACGTGTTTTCCTGATCCTTATAGAGAGGACTGTGCA
CAGTGGGAAATACCCCCTTGGACTGTGGTCTTGCCAATTCCGCGTGGGCAAATGATTTAGTTTTTGCGTT
TTACTGTGTTTTCAGAAAAACTGGACAATAAAGAGTCAGCAAGTGGGGATGAACGAGGCCGCTGCAAAGC
AGGCACCGGTTTCCTAAATGGTTAAGCCGCGAACTTGGCTTGGCGCCCTAGGCGGCAGAATGTTAGGGGT
GGGTAAGGAAGCCGAGGCCCGGAAGTTTCTAGAAGCCCGCTCTGTGAGCGGGTGTCTGGCGCGGTGCCGT
CTGCGCAAGGGTGGGCATACCGTTACTTTTGCTCACGCGCGCATGCGCATAAGGGGTGTGGCGACGTGCG
GGCGTGGGGGCGGTGCGTGCACTCTTCGTTTCAGCCCTGGCGCGGTCCTGTGGTGAACTCCTTGTCTCTA
TGGCGACTGGACGCGGTCGGATCTTGCAGCAGCACTGGCTCGGCCTCCAGA
FBXO15 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXO15_1 ↗18:74,147,834負股74,147,824–74,147,883

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:510 aa

1 aa510 aa結構域
依 Q8NCQ5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

FBXO15 蛋白質長 510 個胺基酸,序列註解標示一個 F-box 結構域,位於第 77 至 117 個胺基酸。來源未列出其他結構域或功能區域。

結構域F-box77–117 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8NCQ5…

AlphaFold · Q8NCQ5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MGC39671FBXO15JPH3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXO15 與 SKP1 及 CUL1 有直接交互作用。此處提供的是直接交互作用資訊;來源未進一步描述其結合條件或相關複合體之外的功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXO15 是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase 複合體中的受質辨識組成部分;這項註解指出其在該複合體內負責受質辨識,但未提供特定受質或更詳細的辨識機制。推論支持
證據與來源

Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用FBXO15 與 SKP1 和 CUL1 有直接交互作用。此註解確認了這兩項直接互作關係,但沒有進一步說明互作條件或其功能後果。推論支持
證據與來源

Directly interacts with SKP1 and CUL1

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000419743 · 1,675 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCTTCGTTTCAGCCCTGGCGCGGTCCTGTGGTGAACTC40
41CTTGTCTCTATGGCGACTGGACGCGGTCGGATCTTGCAGC80
81AGCACTGGCTCGGCCTCCAGACGCTGCGCGGGCCCAGCAG120
121GGGCGGTGGCGCGGCCCGGGGGCGCGCCAGGGCCTTTGGG160
161TGCAGAAAGGGGCCAGGGGTCAAGCTTTCTGCAGGCTCTG200
201CTGCCCTGAGGTGCCATGCCGGAGGTGGACAGCACTGGGA240
241GAGCTCTTTCTCCTGCTGTTCTGGGTTCCTGGATGGAATG280
281CCTTCAGAAATCTTGCTGAAGATATTTTCCTACTTGGATG320
321CTGTGAGCCTTCTGTGTACTGGATGTGTGAGCAGGCGCTT360
361TTATCATCTAGCCAATGACAATTTTATTTGGATCGGAATC400
401TACTCAACTGCTTTTTCACCTGCAAGATCAAATTGGAAAT440
441TTAATTCAGTAGAGAAGATAGCTATGTCTATGAGCTTTCT480
481GTCAGTTCAGGATAAAGAAGCTGGTTATTGGAAGAAAGAA520
521TATATCACAAAACAAATAGCATCTGTAAAAGCCGCACTAG560
561CTGACATTCTCAAACCTGTCAACCCTTACACAGGCCTTCC600
601AGTTAAGACCAAAGAGGCCCTCAGAATATTTGGTTTAGGT640
641TGGGCAATTATACTGAAAGAAAAAGGTGGAAAAGAATATA680
681TCATGGAGCATGTTGATCTTTCCATAAATGACACATCAGT720
721TACTGTTATATGGTATGGCAAAAAATGGCCATGCCTAGCA760
761TCATTGTCAACCTTAGATTTATGTGGCATGACACCAGTTT800
801TTACCGACTGGTATAAAACTCCCACCAAACATAGACTCCG840
841ATGGCATTCTTTAATTGCAAAGTACAATCTGAGTCATTTG880
881ACCATATCTACCATGATTGGCTGTGACAGACTCATTCGGA920
921TCTTCTGCCTGCACCCTGGCCTCCTGGTGGGAGTGTGGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。