基因總覽
FBXO15 的正式名稱為 F-box protein 15,屬於蛋白質編碼基因,其產物是長 510 個胺基酸的蛋白質。蛋白質序列中具有 F-box 結構域;來源將其描述為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識組成部分。這些資料指出了 FBXO15 的蛋白質性質、結構特色與在複合體中的基本角色,但未提供其他結構區域或更詳細的受質資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000419743 ★ | 74,073,368–74,147,834 | 10 |
| ENST00000879153 | 74,073,344–74,147,867 | 10 |
| ENST00000879154 | 74,073,344–74,147,867 | 9 |
| ENST00000879155 | 74,073,344–74,147,867 | 9 |
| ENST00001132402 | 74,073,344–74,147,867 | 10 |
| ENST00000580088 | 74,073,444–74,123,510 | 3 |
| ENST00000579517 | 74,122,592–74,126,101 | 3 |
| ENST00000582526 | 74,130,470–74,147,843 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO15 的功能註解將其定位為 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體中的受質辨識組成部分。SCF 是由 SKP1、CUL1 與 F-box protein 組成的複合體;此註解指出,FBXO15 在其中承擔辨識受質的角色。這項描述界定了它在複合體中的功能定位,但沒有列出可辨識的特定受質,也未說明辨識條件或後續作用的具體步驟。
作為受質辨識組成部分,FBXO15 的功能與 SCF 複合體的 E3 ubiquitin ligase 性質相關。現有資料僅支持這項複合體層級的角色,未提供 FBXO15 如何選擇或接觸受質、是否影響特定細胞過程,或其功能對生物學結果的具體影響。因此,不宜據此推定特定受質、反應機制或生理效應。
Promoter 與基因調控
>FBXO15 ENST00000419743 GRCh38 chr18:74147734-74148834 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACGGCTCGTAGAAAAGTACAAATCATGTTCACGGAAAATCGTTCCGCTTAGGGACGATGCTAACTACAAT TAGGAAAGCTTTAGGGTTCACTACACATGCGGCCGGACACGTACTCAAGCCTATACGTTTACATTACATG GGGTGTTAGGCAAAAACGTCAGTTTCCGCAGCGTAAATGAAAACGAAAAGTCTCCAGGGAGAACCTGATG TCTACCTTCCCTTCTGTCTTCTTTCCATTTTAATTAACAGGCTCTGATCACCTTCTGGGCTGACATTCAC AGTGTCCCCGCCATGCCTTCGCAAAGTCACCTGGGAAACCCCCGTCTTCCTGGGAATAGTAGTTTGAAAA CCTCGCTCTTAACTGGGATACGGCAAAGAGGCGCGCAAAAGAGACTACATCTCCCACAATTCAAGGCGGC CAGAGCACGGCGCAGGTCCTTCCCGCGCCCCCAGACGCCTCCGCGCCCAGCGTCGGCGCAGACGCTGCGC GTCCCTGGAGCGGCGGAAAGTGGGGTGTTGGTGGGGGAATTGGTACCACCCACCCTACGTGGTTCAGGCG GGACTTGCAAAAGCCAAATTAGCAGTTACAATCTACGTGTTTTCCTGATCCTTATAGAGAGGACTGTGCA CAGTGGGAAATACCCCCTTGGACTGTGGTCTTGCCAATTCCGCGTGGGCAAATGATTTAGTTTTTGCGTT TTACTGTGTTTTCAGAAAAACTGGACAATAAAGAGTCAGCAAGTGGGGATGAACGAGGCCGCTGCAAAGC AGGCACCGGTTTCCTAAATGGTTAAGCCGCGAACTTGGCTTGGCGCCCTAGGCGGCAGAATGTTAGGGGT GGGTAAGGAAGCCGAGGCCCGGAAGTTTCTAGAAGCCCGCTCTGTGAGCGGGTGTCTGGCGCGGTGCCGT CTGCGCAAGGGTGGGCATACCGTTACTTTTGCTCACGCGCGCATGCGCATAAGGGGTGTGGCGACGTGCG GGCGTGGGGGCGGTGCGTGCACTCTTCGTTTCAGCCCTGGCGCGGTCCTGTGGTGAACTCCTTGTCTCTA TGGCGACTGGACGCGGTCGGATCTTGCAGCAGCACTGGCTCGGCCTCCAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO15_1 ↗ | 18:74,147,834 | 負股 | 74,147,824–74,147,883 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:510 aa
FBXO15 蛋白質長 510 個胺基酸,序列註解標示一個 F-box 結構域,位於第 77 至 117 個胺基酸。來源未列出其他結構域或功能區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXO15 與 SKP1 及 CUL1 有直接交互作用。此處提供的是直接交互作用資訊;來源未進一步描述其結合條件或相關複合體之外的功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO15 是 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase 複合體中的受質辨識組成部分;這項註解指出其在該複合體內負責受質辨識,但未提供特定受質或更詳細的辨識機制。 | 推論支持 | 證據與來源Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex |
| 交互作用 | FBXO15 與 SKP1 和 CUL1 有直接交互作用。此註解確認了這兩項直接互作關係,但沒有進一步說明互作條件或其功能後果。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCTTCGTTTCAGCCCTGGCGCGGTCCTGTGGTGAACTC40CTTGTCTCTATGGCGACTGGACGCGGTCGGATCTTGCAGC80AGCACTGGCTCGGCCTCCAGACGCTGCGCGGGCCCAGCAG120GGGCGGTGGCGCGGCCCGGGGGCGCGCCAGGGCCTTTGGG160TGCAGAAAGGGGCCAGGGGTCAAGCTTTCTGCAGGCTCTG200CTGCCCTGAGGTGCCATGCCGGAGGTGGACAGCACTGGGA240GAGCTCTTTCTCCTGCTGTTCTGGGTTCCTGGATGGAATG280CCTTCAGAAATCTTGCTGAAGATATTTTCCTACTTGGATG320CTGTGAGCCTTCTGTGTACTGGATGTGTGAGCAGGCGCTT360TTATCATCTAGCCAATGACAATTTTATTTGGATCGGAATC400TACTCAACTGCTTTTTCACCTGCAAGATCAAATTGGAAAT440TTAATTCAGTAGAGAAGATAGCTATGTCTATGAGCTTTCT480GTCAGTTCAGGATAAAGAAGCTGGTTATTGGAAGAAAGAA520TATATCACAAAACAAATAGCATCTGTAAAAGCCGCACTAG560CTGACATTCTCAAACCTGTCAACCCTTACACAGGCCTTCC600AGTTAAGACCAAAGAGGCCCTCAGAATATTTGGTTTAGGT640TGGGCAATTATACTGAAAGAAAAAGGTGGAAAAGAATATA680TCATGGAGCATGTTGATCTTTCCATAAATGACACATCAGT720TACTGTTATATGGTATGGCAAAAAATGGCCATGCCTAGCA760TCATTGTCAACCTTAGATTTATGTGGCATGACACCAGTTT800TTACCGACTGGTATAAAACTCCCACCAAACATAGACTCCG840ATGGCATTCTTTAATTGCAAAGTACAATCTGAGTCATTTG880ACCATATCTACCATGATTGGCTGTGACAGACTCATTCGGA920TCTTCTGCCTGCACCCTGGCCTCCTGGTGGGAGTGTGGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。