基因總覽
FBXO11 是蛋白質編碼基因，產物為 927 個胺基酸的 F-box protein 11，屬於 F-box 蛋白家族。其名稱所指的 F-box 是蛋白質中的一個結構區域；此外，蛋白質還含有多個 PbH1 重複序列及 UBR-type zinc finger。這些結構特徵構成其分子辨識與作用的基礎。FBXO11 的主要角色是作為 SCF 複合體中的底物辨識成分，參與蛋白質修飾與泛素化。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000403359 ★ | 47,806,920–47,906,498 | 23 |
| ENST00001115824 | 47,785,204–47,906,554 | 23 |
| ENST00000405808 | 47,789,322–47,809,185 | 4 |
| ENST00001020774 | 47,789,326–47,906,554 | 23 |
| ENST00000402508 | 47,806,920–47,888,719 | 23 |
| ENST00000895446 | 47,806,920–47,906,554 | 23 |
| ENST00001123437 | 47,806,920–47,906,554 | 24 |
| ENST00001145078 | 47,806,920–47,906,554 | 23 |
| ENST00000945015 | 47,806,922–47,906,554 | 23 |
| ENST00000945016 | 47,806,926–47,906,554 | 22 |
| ENST00000683894 | 47,806,937–47,905,580 | 22 |
| ENST00000493962 | 47,812,849–47,835,962 | 14 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXO11 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 ubiquitin-protein ligase complex 的底物辨識成分，協助複合體辨認目標蛋白並促進其泛素化；被標記的蛋白質可進一步經蛋白酶體降解。來源列出的目標包括 DTL/CDT2、BCL6、SNAI1 與 PRDM1/BLIMP1，顯示此途徑可作用於不同生物學過程中的調控蛋白。
在生發中心 B 細胞中，SCF(FBXO11) 促進 BCL6 泛素化與降解，並參與這些細胞朝記憶 B 細胞及漿細胞終末分化。此功能將蛋白質穩定性的調節連結至 B 細胞分化。該複合體也促進 DTL 降解；這是調節 TGF-beta 訊號、細胞遷移，以及細胞週期進程與退出時機的重要步驟。對 SNAI1 的作用則具有修飾狀態條件：SCF(FBXO11) 可促進經 GSK3B 磷酸化的 SNAI1 泛素化及降解。
FBXO11 也能結合磷酸化的 p53/TP53，並使其發生 neddylation，進而抑制其轉錄活性。於造血調節方面，來源指出 FBXO11 參與紅血球生成，但不參與髓系生成或巨核細胞生成；其機制之一是促進 BAHD1 降解。BAHD1 與異染色質相關，能將共抑制因子募集至 H3K27me3 標記，因此其降解可促進紅血球相關基因活化。
在細菌毒素引發的反應中，FBXO11 參與巨噬細胞死亡與發炎，並調節 C5AR1 和 IL-1beta 的表現。它亦透過辨認 CIITA 的 P/S/T domain 中的 degron，促使 CIITA 泛素化並經蛋白酶體降解，因而調節 MHC-II 的量。另在抗病毒反應中，FBXO11 促進 TBK1-IRF3-IFN-I 軸的活化，並介導 TRAF3 的 Lys-63-linked 泛素化，以增強 TRAF3 與 TBK1 的交互作用。
Promoter 與基因調控
>FBXO11 ENST00000403359 GRCh38 chr2:47906398-47907498 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCCAGTTTTACCACATCCAAAAAATGCACAACAAAAGAGAGAAGGGGGAGAATCGAGAATACATTTTC AGCCGCAAGGCAATAAAAACACGTTTCCCTTGGAGAGAGATTATGTTGGGGGCATCAGGTATAAAGGTAA TTCCTGTTGAGGGTTTTTCTTTTCCTTGCAGTTTGTGGGACCTAAAAAAAAAAAATTAAAAATTAAATCA CATAAACAATCACAACATCAACACATTTACTTCTCTCCTCTCACATATTATTTTCCCACACATTGTATAC ACTTCTTCAAAGAACAAATCAAATTGGCCAAAGGTCAAAGCCTTTTCAAGGTTTAGATGATATACGATTA GGCACCGACTCCAAACTTCGCTTACCAAGCCCAAAGCTCGGAGACGGAAATCTTCAGGGTTTGCAAATAC CCTCAGCTTGGCTAAAGGGCACGAAATCTCTAGCGCTCCCTACAGCTCAGATTTTGAACCCACCTACCAC AGAAAACCCGAGTTACCAAAGATTGGCTCCCTCGTTCCACTTTTTTTTCAGCTCAAAAAAATCGGGTGAA GGTTGGGGTAGGGGGGAAGCTGAAACGGCGAACCGAAGGATTAATCACTTCTCCCCATTACATCAGCAAC CCCCGCCCTTTCCTCCGAGCACCTCCTCTCCCAGAATCGTCGCTACGCACTGGCGCTCTCTTCGCCCACC CCCTGCTCTATTATTTGCCCTGATACCTCCCCATTATCACCCGCCCCGCCACACTCCCCCTTTCCTCTTT CCCCCTCCTAGGCGGGGGAGGGAGGAAACCCGAGAGAGGAAACAGGGCGTTGAAGGGACTTCGCGATAAG AGCGGAGGCCCCATTGGCCGGAAGGTTGTACGGGCGCCTTAGATTGGCCGCCTGGACGGAATCCCCGCCC CTCCTTTCCCCGCCCACCCACCCCTCCCCCCGCCGCCCCGCGGCCCTCCCCCGCGCCCCCGGCCAGCCCC GCGGCGGGGAGGGACCGACTGGGCGAGTGGAGGCTCCGGCGGTGTCAATGGCTCCTCCTGCCACGGAGCA GCAGCAGAAGCAGCGGCGACAGGGCTGACGAGGAGGAGGAGGAAAGGTTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO11_3 ↗ | 2:47,905,515 | 負股 | 47,905,505–47,905,564 |
| FBXO11_2 ↗ | 2:47,905,753 | 負股 | 47,905,743–47,905,802 |
| FBXO11_1 ↗ | 2:47,906,585 | 負股 | 47,906,575–47,906,634 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_C6QCB · enhancer · 47903734–47905569 · regulatory
ENSR2_5F984W · CTCF_binding_site · 47904662–47904683 · regulatory
ENSR2_9P2DM · promoter · 47905570–47906070 · regulatory
ENSR2_83F2RP · promoter · 47906488–47906730 · regulatory
ENSR2_C6QCH · enhancer · 47906731–47907845 · regulatory
· motif · 47901992–47902004 · motif
· motif · 47902154–47902169 · motif
· motif · 47902159–47902171 · motif
· motif · 47902162–47902169 · motif
· motif · 47903905–47903916 · motif
· motif · 47904197–47904209 · motif
· motif · 47904199–47904214 · motif
· motif · 47904626–47904639 · motif
· motif · 47904626–47904639 · motif
· motif · 47904664–47904680 · motif
· motif · 47904780–47904790 · motif
· motif · 47904834–47904847 · motif
· motif · 47904959–47904974 · motif
· motif · 47905134–47905149 · motif
· motif · 47905134–47905149 · motif
· motif · 47905218–47905231 · motif
· motif · 47905353–47905366 · motif
· motif · 47905397–47905410 · motif
· motif · 47905522–47905535 · motif
· motif · 47905537–47905550 · motif
· motif · 47905570–47905583 · motif
· motif · 47905573–47905586 · motif
· motif · 47905591–47905604 · motif
· motif · 47905606–47905619 · motif
· motif · 47905618–47905631 · motif
· motif · 47905633–47905646 · motif
· motif · 47905755–47905768 · motif
· motif · 47905761–47905774 · motif
· motif · 47905828–47905841 · motif
· motif · 47906358–47906369 · motif
· motif · 47906529–47906539 · motif
· motif · 47906532–47906545 · motif
· motif · 47906537–47906547 · motif
· motif · 47906559–47906569 · motif
· motif · 47906562–47906572 · motif
· motif · 47906563–47906576 · motif
· motif · 47906564–47906574 · motif
· motif · 47906567–47906580 · motif
· motif · 47906572–47906582 · motif
· motif · 47906587–47906597 · motif
· motif · 47906633–47906642 · motif
· motif · 47906635–47906646 · motif
· motif · 47906705–47906715 · motif
· motif · 47906707–47906720 · motif
· motif · 47906739–47906749 · motif
· motif · 47906751–47906761 · motif
· motif · 47906795–47906808 · motif
· motif · 47906796–47906806 · motif
· motif · 47906859–47906869 · motif
· motif · 47906901–47906916 · motif
· motif · 47906911–47906931 · motif
· motif · 47906920–47906931 · motif
· motif · 47907018–47907033 · motif
· motif · 47907051–47907064 · motif
· motif · 47907097–47907108 · motif
· motif · 47907108–47907122 · motif
· motif · 47907181–47907195 · motif
· motif · 47907182–47907195 · motif
· motif · 47907226–47907237 · motif
· motif · 47907358–47907372 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：927 aa
F-box protein 11 長 927 個胺基酸，含有位於第 153–199 位的 F-box domain。第 395–830 位由 19 個 PbH1 重複序列組成；第 833–904 位則為 UBR-type zinc finger。第 1–132 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXO11 的細胞定位資料指出其位於細胞核及染色體；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- BCL6P41182 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 12 experiments · 2 筆來源紀錄
- SNAI1O95863 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
FBXO11 是 SCF(FBXO11) 複合體的組成成分；此複合體由 CUL1、RBX1、SKP1 與 FBXO11 組成。此資料描述的是複合體組成，未另列其他實體結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
FBXO11 變異可造成常染色體顯性發育障礙，其表現與發病時間具有差異，通常在嬰兒期或生命最初數年出現；臨床特徵包括智能障礙、語言發展遲緩、過動或動作亢進、癲癇、生前及出生後生長遲緩、小頭症與顏面異常。另有資料指出，FBXO11 缺陷可能與瀰漫性大型 B 細胞淋巴瘤有關，可能透過 BCL6 累積而產生影響；此處表述為可能的病因關聯。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXO11 是 SCF E3 ubiquitin-protein ligase complex 的底物辨識成分，促進 DTL/CDT2、BCL6、SNAI1 和 PRDM1/BLIMP1 等蛋白質泛素化及蛋白酶體降解。它也可結合並 neddylate 磷酸化 p53/TP53，以抑制其轉錄活性；參與紅血球生成但不參與髓系或巨核細胞生成，並經由降解 BAHD1 活化紅血球基因。另涉及細菌毒素反應中的巨噬細胞死亡與發炎、CIITA 降解和 MHC-II 量調節，以及 TBK1-IRF3-IFN-I 抗病毒軸活化；其中可透過 TRAF3 的 Lys-63-linked 泛素化增強其與 TBK1 的交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins, such as DTL/CDT2, BCL6, SNAI1 and PRDM1/BLIMP1. The SCF(FBXO11) complex mediates ubiquitination and degradation of BCL6, thereby playing a role in the germinal center B-cells terminal differentiation toward memory B-cells and plasma cells. The SCF(FBXO11) complex also mediates ubiquitination and degradation of DTL, an important step for the regulation of TGF-beta signaling, cell migration and the timing of the cell-cycle progression and exit. The SCF(FBXO11) complex also catalyzes ubiquitination and degradation of GSK3B-phosphorylated SNAI1. Binds to and neddylates phosphorylated p53/TP53, inhibiting its transcriptional activity. Plays a role in the regulatiom of erythropoiesis but not myelopoiesis or megakaryopoiesis. Mechanistically, activates erythroid genes by mediating the degradation of BAHD1, a heterochromatin-associated protein that recruits corepressors to H3K27me3 marks. Participates in macrophage cell death and inflammation in response to bacterial toxins by regulating the expression of complement 5a receptor 1/C5AR1 and IL-1beta. Acts as a critical regulator to determine the level of MHC-II by mediating the recognition of degron at the P/S/T domain of CIITA leading to its ubiquitination and subsequent degradation via the proteasome. Participates in the antiviral repsonse by initiating the activation of TBK1-IRF3-IFN-I axis. Mediates the 'Lys-63'-linked ubiquitination of TRAF3 to strengthen the interaction between TRAF3 and TBK1 PMID 17098746 ↗ · PMID 22113614 ↗ · PMID 23478441 ↗ · PMID 23478445 ↗ · PMID 23892434 ↗ · PMID 24613396 ↗ · PMID 24968003 ↗ · PMID 25827072 ↗ · PMID 29059170 ↗ · PMID 33156908 ↗ · PMID 36179686 ↗ · PMID 36897010 ↗ · PMID 37279268 ↗ |
| 分子活性 | FBXO11 具有蛋白質修飾與蛋白質泛素化相關活性。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXO11 是 SCF(FBXO11) 複合體的組成成分；此複合體由 CUL1、RBX1、SKP1 與 FBXO11 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the SCF(FBXO11) complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1 and FBXO11 PMID 23478441 ↗ · PMID 23478445 ↗ |
| 細胞定位 | FBXO11 的定位資料列出細胞核與染色體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome PMID 16487488 ↗ · PMID 17098746 ↗ · PMID 22113614 ↗ · PMID 25827072 ↗ · PMID 23892434 ↗ |
| 疾病關聯 | FBXO11 變異可造成常染色體顯性發育障礙，表現與起病時間不一，通常於嬰兒期或生命最初數年發病。相關特徵包括智能障礙、語言發展遲緩、動作亢進、過動、癲癇、生前及出生後生長遲緩、小頭症與顏面異常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Intellectual developmental disorder with dysmorphic facies and behavioral abnormalities IDDFBA An autosomal dominant developmental disorder with variable manifestations and onset in infancy or first years of life. Clinical features include intellectual disability, speech delay, hyperkinetic disorder, hyperactivity, seizures, pre- and postnatal growth retardation, microcephaly, and facial dysmorphism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618089 PMID 27620904 ↗ · PMID 29796876 ↗ · PMID 30057029 ↗ |
| 疾病關聯 | FBXO11 缺陷可能是瀰漫性大型 B 細胞淋巴瘤的成因之一；提出的關聯途徑是 BCL6 累積，而 BCL6 是在淋巴瘤中具有重要作用的致癌蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Defects in FBXO11 may be a cause of diffuse large B-cell lymphoma by allowing the accumulation of BCL6, an oncoprotein that has a critical role in lymphomas PMID 22113614 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGCGAGTGGAGGCTCCGGCGGTGTCAATGGCTCCTCCTG40CCACGGAGCAGCAGCAGAAGCAGCGGCGACAGGGCTGACG80AGGAGGAGGAGGAAAGGTTCCTTTAAGGAGGAGGAAGGAC120GACGCCTCTTTTTCCCCCTATCTCCTCCCTTCACACTCAT160TTCCCCTTCGCCGAGGAGAGAAGGGGGGGAGGAGAGAGAA200GAGACCGAAGAAAGAGAGAAAAATTCCTCACAGAAATCTC240TTTCAGGGGGTGTGGGGGGGAGGAAGAGGGAAAAAAAAGA280GCCGGGCGCCCCCTGCTCCCTCCCTCCCTTCTCTCCCTCT320CTTTTTCTCCCTTCCTCACCCGCCCGCCCACTCCCCCCGC360TGCCGGAGACGCCGCTCGCGAGTCGGCGGGACCGGGATCT400GTCTCTTCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGCTTCGCC440TCGGGATCCCCAAGCGGCGGACGCCCTTTCTTTCTTTCTC480TCGGTCTGCCCGTCTTTCTGCCTTCGTCCCTCGCGGCCGC520CCCGCCCGGCGGCTTCGGCCTTCCCCGTGCGTCAGGCCCT560CCCGGCCGGCCTCGCTCGGTCTCCGTCTGTCTACCCGGGC600CTTTCTCCGGACTCGGGGTCCCGCTCGCCCCCTCCGCCCT640CAGCGTCTCCCCTTCCCCTCGCCCCCTCTCCTTCCTCCCC680CCTCTCCCACTCTCCCCACCCCTTTCTCCTGCCCCGAAGC720TCGCTGTGCGTGTGCGTGTGTGTGTCCCTCCGCCAACGCC760GCCACCTCAGCCCGGCAAATGAACTCCGTCCGAGCCGCCA800ACCGGAGACCCAGGCGAGTGTCGCGGCCGCGCCCGGTGCA840GCAACAGCAGCAGCAGCCCCCGCAGCAGCCGCCGCCGCAG880CCGCCCCAGCAGCAGCCGCCCCAGCAGCAGCCTCCGCCGC920CGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCGCCGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。