演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FBXO10FBX10

F-box protein 10

FBXO10 編碼 F-box protein 10,是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識成分,參與多種蛋白質的泛素化與降解。

Homo sapiens9p13.2UniProt Q9UK96
OFFICIAL SYMBOL
FBXO10
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q9UK96
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FBXO10 是一個蛋白質編碼基因,其產物正式名稱為 F-box protein 10。這種蛋白質屬於 F-box 蛋白家族,並作為 SCF(SKP1-CUL1-F-box protein)型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識成分。它含有 F-box 結構域,另有多個 PbH1 重複序列;這些結構特徵構成辨識其蛋白質家族與分子角色的基礎。FBXO10 的主要角色是參與特定蛋白質的泛素化及後續降解;各受質及相關生物學作用見功能說明。

Official symbol
FBXO10
Gene name
F-box protein 10
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13589
UniProt
Q9UK96
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FBX10

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99p13.2
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegFBXO10pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:37,510,892–37,576,392
Gene span
65,501 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000432825 ★37,510,892–37,576,38011
ENST0000096708537,510,892–37,576,39211
ENST0000096708637,510,892–37,576,11211
ENST0000102124937,510,892–37,576,3929
ENST0000108692637,510,892–37,576,39211
ENST0000113419537,510,892–37,576,39211
ENST0000102125137,513,586–37,576,39211
ENST0000102125237,515,143–37,576,39211
ENST0000097810837,515,598–37,576,39210
ENST0000110780637,535,346–37,576,3923
ENST0000054160737,541,556–37,576,3493

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FBXO10 是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識成分,參與將特定蛋白質標記為泛素化受質,並促進其後續降解。此作用可改變受質蛋白的穩定性,進而影響其參與的細胞過程;目前列出的受質涉及細胞凋亡、溶酶體降解與 B 細胞受體訊號。

其中,FBXO10 介導抗凋亡蛋白 BCL2 的泛素化與降解,因此可藉由控制 BCL2 的穩定性參與細胞凋亡調節。這項功能描述的是對 BCL2 蛋白量穩定性的調控,來源未進一步指定其在何種細胞或條件下發生。

FBXO10 也可使晚期糖化終產物受體 RAGE 泛素化,並促進其後續溶酶體降解。這與 BCL2 的描述不同,來源明確指出 RAGE 後續進入溶酶體降解途徑,但未提供其他定位或調控條件。

此外,FBXO10 直接控制 HGAL/GCSAM 的泛素化與降解,並因此降低 BCR 訊號。這顯示 FBXO10 介導的蛋白質降解可連結至訊號傳遞變化;來源所述的方向是 HGAL/GCSAM 降解增加與 BCR 訊號下降相關。上述作用共同指出,FBXO10 可藉由辨識不同受質並促進其泛素化及降解,參與調控蛋白質穩定性與相關細胞功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37576380 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FBXO10 ENST00000432825 GRCh38 chr9:37576280-37577380 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGCTTCAGACAAGCTAGACGTTTTCCATTTCCACAAAGAGCGATCTTTTCTCCTCCAACCCAACCCACC
TGGTCCAAGAGTTTTCACAGGGCTTACCCTGCCCCTCTTCCATTTGGCTAACTCTTTATCTTACTCTGAG
AGGTCTTCCTTGACTACCCTTCCTTGGTCCCTAATTTATTTAGTTTTATTTTTGAAACAAGAGTCTCGCC
CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCATGGCTCACTGTTAACCTCGAACTCCTGAGCTCAAGT
GATCTTTCCTCCAGCCTCGGCCTGCAAAAGCGCTGGGATTACAGGCATGAACACCTGGCCCCTATTTTTA
AATTACAGCTCCTTCCGTGCATTTTCTACAATTTTAAACACATATTGGTTTAAATGACACTTGATTACCG
TCTACCTTCTCCACTACAGAATTAACTTCAGGAGAAGAGGAACCATATCTGCTTTGTTCACTTTTGTGCC
CATAATAGTAACGGCACCAGCAGCAACAAACATACAGCATTTACTTTGTGGCAGGCATTATGCTAAGCGC
CATACATACAACTAATTTAATATGTACTCCTAGTACATTGTCTGGCAGGTAGCCAATGGTCAGTTTGTTC
AGTGAATGAACCCAGACCCTACATGCTCATCTACAGGGTGCCTAGCACCCCAGGAAACTGCTCCTTATAC
TGTTAGATAACTGGTGCTCGCAGGAATCTTATTTACACTGTATTGGCCTTAGCATGCCTCCCTGCAGTTT
CCACCCACTGGTTCTATTTCTGCCCCTTCTGGGGCCACGCAACACGAGCCTGAATCGTCCTTCCGCAAGC
TCGCCTTTGCAGTACCCGAAGCCCCACGCGCCCCCTCCTCGTCTGCCTTCCTCCCGCCTCCCGGTGCCCC
TCCTGCAGATACAGCTTTTATGCGCGGTGGTCGGGAAGCCCAGCCCCGGCCAGCCAGCTGCTCCCGGCAT
CCTTCGCCGCCTTGCGCGTCACATGACGGCGGCGGCTCCGCACGATCCCCAGGCAGCTGTCCGCCCCCGG
GCGGGGCTGGCCGCACGCCGCAATCCTACCGGCTGCTGCGGCTCCAGCGGG
FBXO10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FBXO10_1 ↗9:37,576,238負股37,576,228–37,576,287

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_D3TC3 · enhancer · 37574106–37576369 · regulatory

ENSR9_9JWNT · promoter · 37576370–37576870 · regulatory

· motif · 37575729–37575742 · motif

· motif · 37575771–37575784 · motif

· motif · 37575771–37575784 · motif

· motif · 37575779–37575792 · motif

· motif · 37576274–37576287 · motif

· motif · 37576278–37576295 · motif

· motif · 37576308–37576323 · motif

· motif · 37576328–37576341 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:956 aa

1 aa956 aa結構域功能區域重複區
依 Q9UK96 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

F-box protein 10 長 956 個胺基酸。其 N 端第 1–48 位為 F-box 結構域;蛋白質另含多個 PbH1 重複序列,分布於第 198–854 位的若干區段。第 314–367 位被註記為無序區域。

結構域F-box1–48 aa
重複區PbH1 1198–217 aa
重複區PbH1 2238–260 aa
重複區PbH1 3427–448 aa
重複區PbH1 4449–470 aa
重複區PbH1 5471–493 aa
重複區PbH1 6494–516 aa
重複區PbH1 7538–560 aa
重複區PbH1 8561–583 aa
重複區PbH1 9584–606 aa
重複區PbH1 10607–629 aa
重複區PbH1 11630–652 aa
重複區PbH1 12653–675 aa
重複區PbH1 13717–739 aa
重複區PbH1 14740–762 aa
重複區PbH1 15764–786 aa
重複區PbH1 16787–809 aa
重複區PbH1 17832–854 aa
功能區域Disordered314–367 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UK96…

AlphaFold · Q9UK96

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

FBXO10 的細胞定位記錄為細胞質;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FBX10FBXO10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

FBXO10 與 CUL1、SKP1 組成 SCF(FBXO10) 複合體。另有與 BCL2 及 PRDM1 互作的記錄;來源未進一步說明這些互作的具體條件或功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

FBXO10 缺陷可能是瀰漫性大型 B 細胞淋巴瘤的成因之一;提出的關聯途徑是缺陷可能使具有淋巴瘤關鍵作用的癌蛋白 BCL2 累積。此描述屬可能的疾病關聯,並非確定的因果結論。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FBXO10 是 SCF 型 E3 ubiquitin ligase 複合體的受質辨識成分,可介導抗凋亡蛋白 BCL2 泛素化與降解,藉由控制其穩定性參與細胞凋亡;也使 RAGE 泛素化並進入後續溶酶體降解,且直接控制 HGAL/GCSAM 的泛素化與降解,因而降低 BCR 訊號。含實驗來源
證據與來源

Substrate-recognition component of the SCF (SKP1-CUL1-F-box protein)-type E3 ubiquitin ligase complex. Mediates the ubiquitination and degradation of BCL2, an antiapoptotic protein, thereby playing a role in apoptosis by controlling the stability of BCL2. Targets also the receptor for advanced glycation end products RAGE for ubiquitination and subsequent lysosomal degradation. Directly controls HGAL/GCSAM ubiquitination and degradation and thereby decreases BCR signaling

PMID 23431138 ↗ · PMID 28515150 ↗ · PMID 31570756 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性FBXO10 的分子活性包括蛋白質修飾,具體涉及蛋白質泛素化。資料庫紀錄
證據與來源

Protein modification; protein ubiquitination

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用FBXO10 與 CUL1、SKP1 構成 SCF(FBXO10) 複合體;另有與 BCL2 及 PRDM1 互作的記錄。來源未在此項資料中說明互作條件或其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Component of the SCF(FBXO10) complex consisting of CUL1, SKP1 and FBXO10. Interacts with BCL2. Interacts with PRDM1

PMID 23431138 ↗ · PMID 24613396 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位FBXO10 的細胞定位記錄為細胞質。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm

PMID 23431138 ↗ · PMID 31570756 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯FBXO10 缺陷可能是瀰漫性大型 B 細胞淋巴瘤的成因之一;可能的關聯途徑是缺陷使癌蛋白 BCL2 累積,而 BCL2 在淋巴瘤中具有關鍵作用。此主張保留「可能」的不確定性。含實驗來源
證據與來源

Defects in FBXO10 may be a cause of diffuse large B-cell lymphoma by allowing the accumulation of BCL2, an oncoprotein that has a critical role in lymphomas

PMID 23431138 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000432825 · 4,702 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACATGACGGCGGCGGCTCCGCACGATCCCCAGGCAGCTGT40
41CCGCCCCCGGGCGGGGCTGGCCGCACGCCGCAATCCTACC80
81GGCTGCTGCGGCTCCAGCGGGGGCGGCGGGTGGCTTCCAG120
121GGCACCGGCGGCCGCGGCCCGGACTCCGCGGTGGGCGAGC160
161GCCCTGTGAGGTGACCATGGAGGCTGGTGGCCTCCCCTTG200
201GAGCTGTGGCGCATGATCTTAGCCTACTTGCACCTTCCCG240
241ACCTGGGCCGCTGCAGCCTGGTATGCAGGGCCTGGTATGA280
281ACTGATCCTCAGTCTCGACAGCACCCGCTGGCGGCAGCTG320
321TGTCTGGGTTGCACCGAGTGCCGCCATCCCAATTGGCCCA360
361ACCAGCCAGATGTGGAGCCTGAGTCTTGGAGAGAAGCCTT400
401CAAGCAGCATTACCTTGCATCCAAGACATGGACCAAGAAT440
441GCCTTGGACTTGGAGTCTTCCATCTGCTTTTCTCTATTCC480
481GCCGGAGGAGGGAACGACGTACCCTGAGTGTTGGGCCAGG520
521CCGTGAGTTTGACAGCCTGGGCAGTGCCTTGGCCATGGCC560
561AGCCTGTATGACCGAATTGTGCTCTTCCCAGGTGTGTACG600
601AAGAGCAAGGTGAAATCATCTTGAAGGTGCCTGTGGAGAT640
641TGTAGGGCAGGGGAAGTTGGGTGAAGTGGCCCTGCTGGCC680
681AGCATTGATCAGCACTGCTCAACCACACGCCTGTGCAACC720
721TCGTCTTCACGCCAGCCTGGTTCTCACCCATCATGTATAA760
761GACAACATCAGGTCACGTCCAGTTTGACAACTGCAACTTT800
801GAGAACGGGCACATCCAGGTCCATGGCCCGGGTACTTGCC840
841AAGTGAAGTTCTGTACCTTCAAAAACACCCATATCTTCCT880
881GCACAACGTGCCCCTGTGTGTCCTGGAAAACTGTGAATTT920
921GTGGGCAGTGAAAACAACTCTGTGACTGTTGAGGGTCACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。