基因總覽
FBXL9P 的正式名稱為 F-box and leucine rich repeat protein 9, pseudogene，屬於假基因。RefSeq 摘要將其與 F-box 蛋白家族中的 Fbls 類相聯繫；該家族類別以含有 leucine-rich repeats 為特徵。摘要所述的 F-box 與重複序列架構，是對該基因相關序列的描述，不能據此認定 FBXL9P 會產生蛋白質。摘要也記載兩種轉錄變異體被報告為編碼相同蛋白質，並指出可能還有其他變異體，但其全長性質尚未表徵；這些內容未消除其假基因分類所帶來的限制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000637079 ★ | 67,207,605–67,226,998 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
RefSeq 摘要將 FBXL9P 相關序列描述為 F-box 蛋白家族 Fbls 類的成員。一般而言，F-box 蛋白是 SCF（SKP1-cullin-F-box）泛素蛋白連接酶複合體的四個次單元之一；此類複合體參與依賴磷酸化的泛素化。摘要並將 F-box 蛋白分為三類：含 WD-40 domains 的 Fbws、含 leucine-rich repeats 的 Fbls，以及具有不同蛋白質互作模組或沒有可辨識基序的 Fbxs。
該摘要描述的序列具有約 40 個胺基酸長的 F-box 基序，以及九個串聯的 leucine-rich repeats，符合其所歸類的 Fbls 特徵。然而，FBXL9P 被列為假基因；上述家族與結構描述不應解讀為已證明此位點產生功能性蛋白質，也不足以確定它實際參與 SCF 複合體或泛素化作用。
摘要提及兩種轉錄變異體，並將其描述為編碼相同蛋白質；其他變異體也可能存在，但其全長性質尚未表徵。這些轉錄本資訊及蛋白質描述來自 RefSeq 摘要，不能單獨證明假基因具有已確認的蛋白質功能。
Promoter 與基因調控
>FBXL9P ENST00000637079 GRCh38 chr16:67226898-67227998 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCAAGCAGGGCTGAGGACTAGGGAACTGACTATAAGTGGGCATAGAAGCAAGGAGGTAGGCACTTACATT GGCCCCCAGTATGATCCGCAGGTAGAACTTCAGAGTCTCTCTGTTCTCTTCAAATATCTGCTTCTTCCCT CTCGTGCCCACTTTGCCCTTGGGCTGCAGAGGAATGATGAGATGCCGTCAGGAGGCCACGGTCCTCCTCA TTCTCCCCACCAGCCTGGTGAGCTATAGAGCTCCATCCGCAACTCAGCCAGGTCCCCGTAGTGCAGAAAC CTAGCAAAATCCCTGGGATGTCCACCCATCCTCCAGTCCATTCTGCCTAGGGCTGACGCCATCTCTCCAG CACCCGCAGCTAGGATCAATCGCCTCTTGCTCGCCCTGGAACAATTCAATCCTAAGCTAATACCGCCTCT GGATCCCGTGGTAGTCTGGCTTTAGGCTAACGACTCTTCCAAGGGTACTCCTGAGCGGAGTTGAATGGTG CCTCTCTCAGGCCTCCGCTGGCGTAGTCCCGATCTGGGTTAACCCCCACCTCAGGTCACTTAGATCTCTG GCCTGCCCTGGTACTGATGCCCACCCCGCTCTGGCACTAGTCCTGGTATGGTCCTGCGCCGCCATCCCCC CAGCCCAGCTCTAGCACGGTCTGGCCAGGGATGGCGCCCCGCTCTGGCCCACCCCATATCCCTTAATGTT CTTTCTCAGTTTTCACTCTCACAGCCCCTGGAGAGCTTTGCTGGTGCGGACCCCGCCCTATCCATCCTCC TTACCGCCATGGTGCGAGGCAAATACCCAGCCCGGGAAACACGGGAGAGCGACCGAAACCGCAATCACTA AGCACCACATCGGCAGCTCATGCACTTCCGGCGCAGACCGAAGTCGTCAGCTTTTGCGACGGAAATAGGT CTCACTTCCTTCCCAAGCCCCGCCCCAAAGAGGCGAGACTACATTTCCCAGAAAGCCTTGCGCAGTGGGG GCGGAGGCGGCAGGGATGCGATGGCGGAGTCGCTGCCCCTGGAGGTGAGAGGAAGCCGCCCTCAGGCCTA GCTCTGGACAGGCCCCGCCCTCGCGGTCCTGAGCTTTGGGGAGGGGCTGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_BHC83 · enhancer · 67226212–67226855 · regulatory
ENSR16_9ZNG9 · promoter · 67226856–67227178 · regulatory
ENSR16_BHC87 · enhancer · 67227179–67227782 · regulatory
· motif · 67224242–67224256 · motif
· motif · 67225058–67225070 · motif
· motif · 67225061–67225068 · motif
· motif · 67225343–67225358 · motif
· motif · 67226851–67226861 · motif
· motif · 67226902–67226912 · motif
· motif · 67226927–67226937 · motif
· motif · 67226990–67227000 · motif
· motif · 67227012–67227022 · motif
· motif · 67227062–67227072 · motif
· motif · 67227125–67227136 · motif
· motif · 67227127–67227136 · motif
· motif · 67227162–67227176 · motif
· motif · 67227165–67227173 · motif
· motif · 67227165–67227182 · motif
· motif · 67227217–67227227 · motif
· motif · 67227263–67227276 · motif
· motif · 67227263–67227276 · motif
· motif · 67231222–67231234 · motif
· motif · 67231224–67231231 · motif
· motif · 67231304–67231317 · motif
· motif · 67231882–67231894 · motif
· motif · 67231885–67231892 · motif
基因座與轉錄註解
FBXL9P 依 HGNC／Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000637079 ★ | transcribed_unitary_pseudogene | 1,634 nt | 6 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | RefSeq 摘要將相關序列歸為含 F-box 與 leucine-rich repeats 的 Fbls 類，並指出 F-box 蛋白是參與依賴磷酸化泛素化之 SCF 複合體的次單元。摘要記載兩種轉錄變異體被描述為編碼相同蛋白質；其他變異體可能存在，但全長性質尚未表徵。由於 FBXL9P 分類為假基因，這些描述不等同於已確認其產生功能性蛋白質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene encodes a member of the F-box protein family which is characterized by an approximately 40 amino acid motif, the F-box. The F-box proteins constitute one of the four subunits of ubiquitin protein ligase complex called SCFs (SKP1-cullin-F-box), which function in phosphorylation-dependent ubiquitination. The F-box proteins are divided into 3 classes: Fbws containing WD-40 domains, Fbls containing leucine-rich repeats, and Fbxs containing either different protein-protein interaction modules or no recognizable motifs. The protein encoded by this gene belongs to the Fbls class and, in addition to an F-box, contains 9 tandem leucine-rich repeats. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. Other variants may occur, but their full-length natures have not been characterized. |
DNA 與 RNA 序列
ATGGCGGAGTCGCTGCCCCTGGAGATGCTCACATATATTC40TGAGCTTCCTGCCTCTGTCAGATCAGAAAGAGGCCTCCCT80CGTGAGTTGGGCTTGGTACCGTGCTGCCCAGAATGCCCTT120CGGGAGACAGATGTGCGATACAACATCCCCGTGTCCTCTG160CCTCCCTCTCGGCCATCAAGAGCCTGGGCCTCAGGGGCAT200CTGCTGCATCAGCCTGACCAACCTGGATGGCTCTCTGGCT240TCACACCAGGTGCTACAATCTGTTGCTTACCACCTGGGCC280CACACCTGCAGAGCTTGTCCCTGGGTGGAGGCAGCCCCAC320AGAGGCCTCCTCTGTGGCCCTGATCCTGGGCTGCCCAGCC360CTGTGTGTCCTTGACCTCAGTGGCTGCAATAGCCTCTTCA400CCTCGGGCACACTGCTGGCTCAGCCAGAGATGGCACAGAG440CGTCCAGCAGGCTTTGAGCGGCCTCCGTGAGCTCAACCTG480GCTGGCCTGCGAGACCTGGCTGACCTCAGCTTCAACCAGC520TCAGCAGCTGTGCCCCCAGCCTGGAGCGCCTCTCCTTGGC560ATACTGCCACCTCACCTTCGAGCTAGGCCCAGCCTGAGGC600TCCATCGGCCCCCAAGACTCCTCTCCCGCCCAGTTCTCCT640TCTGCAACCTGCTGCGATTAGTGCAAGAGCGGGCTGGCAG680GCTGCGTGCCCTGGACCTGAGTGGCACTGGCTTGCCCCCC720GAGGCCCTGCAGGCTCTGGGCCAGGTAGCTGGGCTGCAGC760TTCAGGAGCTGAGCCTGCACAGCTGCCGGGACCTCTCCAC800AGAGGCTGTGGCTACCCTGTGCTTCCAGCAACCAGGCCTT840ACCTCCCTGGACCTCAGTGGCTGCTCAGAACTGACTGATG880GGGCGCTCTTGGCCGTGAGCCGGGGCCTGCGGCACCTGCG920GCGCCTGAGCCTGGGGAAGCTGCAGCGGCTGACAGATGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。