基因總覽
FBXL4 是人類的蛋白質編碼基因，產物 F-box and leucine rich repeat protein 4 屬於含 F-box 與 leucine-rich repeat（LRR）的蛋白質。其結構包含一個 F-box 區域及多個 LRR 重複序列，並作為粒線體定位的 SCF-FBXL4 泛素 E3 連接酶複合體中的底物辨識成分。這些結構特色與其在蛋白質降解調控中的角色相符；來源指出，該複合體參與限制粒線體自噬。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369244 ★ | 98,868,535–98,947,946 | 10 |
| ENST00000229971 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892539 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892540 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892541 | 98,868,535–98,948,006 | 8 |
| ENST00000892542 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892543 | 98,868,535–98,948,006 | 10 |
| ENST00000892544 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892546 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
| ENST00000892548 | 98,868,535–98,948,006 | 8 |
| ENST00000892550 | 98,868,535–98,948,006 | 11 |
| ENST00000892552 | 98,868,535–98,948,006 | 9 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXL4 是粒線體定位的 SCF-FBXL4 泛素 E3 連接酶複合體中的底物辨識成分。此複合體藉由調控粒線體自噬受體 BNIP3 與 NIX 的降解，參與限制粒線體自噬。來源指出，這項作用涉及受體蛋白的降解調控，並將 FBXL4 的角色定位於粒線體品質調節相關過程；但未進一步說明此調控的完整分子步驟或其在不同條件下的差異。
另一項功能描述指出，FBXL4 可挽救粒線體損傷，方式是逆轉 DRP1 介導的粒線體分裂過度活化。這項敘述的證據標示為相似性推定（By similarity），因此應視為由相似蛋白或系統推論的功能，而非此處已直接證實的結果。來源未提供此效應的實驗背景，也未具體說明它與 BNIP3、NIX 降解途徑之間的關係。
整體而言，來源支持 FBXL4 具有兩項與粒線體狀態相關的功能描述：參與限制粒線體自噬，以及依相似性推定可改善粒線體損傷並抑制 DRP1 介導的分裂過度活化。前者連結至 BNIP3 和 NIX 的降解調控；後者則保留其推論性質，不宜視為已確立的普遍作用。
Promoter 與基因調控
>FBXL4 ENST00000369244 GRCh38 chr6:98947846-98948946 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGTTCAACATTTTATTAAATATTTTCCATCTTAGTGGATATTTTGTAACAAGATAAATATGATGCAAAC TAAAAAAAGTGCCAAGGGCGGGCGCGGTGGCTCACGGCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGCAG GTGGATCACAAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTAGCCAATATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATA CAAAATATTAGCTTGGCGCCCTTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACC TGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGCGACAGAGCGAGACTCC GTCTCAAAAAATACATAAATAAATAAATAAAGTGCCATACTGAATCTACCAAAAATAAATCAAAATGAGT AAGAGAGGCTGCCAGACCATCTTCTTCATCAGAGGTAATGGTCAGAGGCTTCTGAACGTTGGTATGGAAA TGAGCCTGCAGGCAGGATTTGTATGCAGGGAAGAGGAGGTTTGTAAACTAGGTGAATTATACCTTCAGAG TGCATATAATGTATATTATACTTTTCCTCTACGTATGCGTACCAGCCGTATTACCTATGTATCATCTGAT CCACCAAGTCTGGACTGAAGAAGTCCTTGTAGGACCACACTACACATGGCGAGCCGGTACTCGGAAGGGA TTATTCCGAAGAGGATTTGTAGACACTACCCGCTGTGTATGACCTAGGCCCTTTACACGGGCACCACTGG AGCTAGGAAGCCAGCAGAAAGCTCCTCCCCCTGGCCTGGGAGCGGGCTGTCCGTAGGACCCAGAGCACCT CCCATGGGAGAAACGCCCGGCTTTGCTTCTGGCCCCGCCCCGCCTCCCTCCAGGCCCCGCCCCGCCTCCC CGGCCCCGCCCCAACCCCGCGGCCCCGCCCCTCCTCCCCGGCTCCGCCCCGCCTCCCCGGGCCCGCCGCT CCTCGCGGCCTCCGCGTCTTCCTTCCGGGTCGCGCTAGGCCGGGCTTGCGGCGGTTGTGCCGCATCTAGA GAGTCGGGGAGCCGCCCCCGCACCCAGGCCTTCTCGCGCTGCCTGGTCGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXL4_1 ↗ | 6:98,947,945 | 負股 | 98,947,935–98,947,994 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_93G9CW · enhancer · 98944730–98945234 · regulatory
ENSR6_CCS4M · enhancer · 98946426–98947935 · regulatory
ENSR6_BPM7F · promoter · 98947936–98948496 · regulatory
· motif · 98945115–98945127 · motif
· motif · 98945517–98945530 · motif
· motif · 98945672–98945685 · motif
· motif · 98947431–98947447 · motif
· motif · 98947431–98947447 · motif
· motif · 98947626–98947639 · motif
· motif · 98947634–98947647 · motif
· motif · 98947671–98947684 · motif
· motif · 98947734–98947747 · motif
· motif · 98947873–98947886 · motif
· motif · 98947936–98947947 · motif
· motif · 98947936–98947947 · motif
· motif · 98947938–98947947 · motif
· motif · 98948096–98948109 · motif
· motif · 98948096–98948109 · motif
· motif · 98948455–98948470 · motif
· motif · 98948455–98948470 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：621 aa
F-box and leucine rich repeat protein 4 長 621 個胺基酸。其 F-box 位於第 277–332 位，另含九個 LRR 重複區，分布於第 376–609 位：LRR 1 至 LRR 9 依序涵蓋第 376–397、402–421、427–448、452–474、480–501、504–524、532–558、559–583 與 584–609 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXL4 的定位包括細胞質、細胞核及粒線體外膜。 來源列出這些位置，但未提供定位隨條件改變的資訊，也未描述異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- DNM2P50570-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TPP1O14773 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBXL4 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box）蛋白質連接酶複合體的一部分。來源另記載 FBXL4 與 VCP 及 PPTC7 互作；其中，FBXL4 與 PPTC7 的互作可促進 BNIP3、NIX 的降解並抑制粒線體自噬。來源未說明 VCP 互作的功能後果。
疾病與遺傳關聯
FBXL4 基因變異與粒線體 DNA 耗竭症候群 13（MTDPS13）相關。此病為自體隱性疾病，典型描述包括嬰兒早期發病的腦病、肌張力低下、乳酸性酸中毒及嚴重的整體發育遲緩。患者組織來源的細胞可見粒線體氧化磷酸化缺陷及 mtDNA 含量降低；來源將該疾病歸因於影響 FBXL4 基因的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXL4 是粒線體定位的 SCF-FBXL4 泛素 E3 連接酶複合體中的底物辨識成分，參與限制粒線體自噬，方式涉及調控粒線體自噬受體 BNIP3 與 NIX 的降解。另有相似性推定指出，FBXL4 可藉由逆轉 DRP1 介導的粒線體分裂過度活化，挽救粒線體損傷；此部分屬推論性質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate-recognition component of the mitochondria-localized SCF-FBXL4 ubiquitin E3 ligase complex that plays a role in the restriction of mitophagy by controlling the degradation of BNIP3 and NIX mitophagy receptors. Rescues also mitochondrial injury through reverting hyperactivation of DRP1-mediated mitochondrial fission (By similarity) PMID 36896912 ↗ · PMID 38992176 ↗ |
| 交互作用 | FBXL4 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box）蛋白質連接酶複合體的一部分，並與 VCP 互作。FBXL4 也與 PPTC7 互作；這項互作可促進 BNIP3 與 NIX 的降解，並抑制粒線體自噬。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a SCF (SKP1-CUL1-F-box) protein ligase complex. Interacts with VCP. Interacts with PPTC7; this interaction promotes destruction of BNIP3 and NIX and mitophagy suppression PMID 36896912 ↗ · PMID 38992176 ↗ |
| 細胞定位 | FBXL4 的細胞定位記錄包括細胞質、細胞核及粒線體外膜。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | FBXL4 基因變異與粒線體 DNA 耗竭症候群 13（MTDPS13）相關。此自體隱性疾病可於嬰兒早期發病，表現為腦病、肌張力低下、乳酸性酸中毒及嚴重整體發育遲緩；患者組織來源細胞可見粒線體氧化磷酸化缺陷與 mtDNA 含量下降。來源將疾病歸因於影響該基因的變異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial DNA depletion syndrome 13 MTDPS13 An autosomal recessive disorder characterized by early infantile onset of encephalopathy, hypotonia, lactic acidosis, and severe global developmental delay. Cells derived from patient tissues show defects in mitochondrial oxidative phosphorylation and decreased mtDNA content. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615471 PMID 23993193 ↗ · PMID 23993194 ↗ · PMID 27182039 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCTTCCGGGTCGCGCTAGGCCGGGCTTGCGGCGGTTGTGC40CGCATCTAGAGAGTCGGGGAGCCGCCCCCGCACCCAGGCC80TTCTCGCGCTGCCTGGTCGCTGGTGAAGCCCGCGGCGCGC120GCCTCTCCCGGACCCTGCAGGATTTTTCTTCCTGGCCTGG160TTCCCTTGCCTTCTCCATTTGCTTCATTCGCTTGGATTTT200CAAGAAGCTTTGAAGCTGGATAGGAGTCTCCAGTCTTCCT240CTTGATCCATATGTTTCAGGTAAAAGAATGTCACATGTCA280GCATTTGTACCTGAAGTCAGCATGCAAAGTTCAGGGTACC320TGGATGAATGCCAACTTTTGCATTTCCCATGTGTATCCTG360TGACCATTCTATCTGGGAACATCCTTCAAAGAGTTCATGC400ATCTTACTGAGGACACCTGACCTTTTGAAGCTTCATAATT440CACATCTAGATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTC480TGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAG520GACAGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCT560ATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAGAGG600TAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCA640TTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACTATGTGGAAT680TTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACT720TTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAACTTATGGGACATGGTG760GGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACG800CCACCTAATTTTCAGAGCCAGGACTATGTGGAACTTACTT840TTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGA880AACCTATCATCCCGGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGT920TCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。