基因總覽
FBXL2（F-box and leucine rich repeat protein 2）是人類蛋白質編碼基因，產物屬於含 F-box 與 leucine-rich repeat（LRR）的蛋白質。它是 SCF(FBXL2) E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識成分；此複合體參與標的蛋白質的泛素化及後續蛋白酶體降解。FBXL2 的結構包含 F-box，以及多個 LRR 重複區，這些結構特色與其作為複合體組成成分及辨識底物的角色相符。來源並指出，FBXL2 的底物辨識方式不同於許多 F-box 蛋白，較偏向辨識 calmodulin-binding motifs，而非磷酸化降解基序。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000484457 ★ | 33,277,442–33,388,092 | 15 |
| ENST00000898645 | 33,277,438–33,388,619 | 15 |
| ENST00000898646 | 33,277,438–33,388,619 | 17 |
| ENST00000898647 | 33,277,438–33,388,619 | 12 |
| ENST00000898648 | 33,277,438–33,388,619 | 14 |
| ENST00000958148 | 33,277,438–33,388,619 | 14 |
| ENST00001142069 | 33,277,438–33,388,619 | 15 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBXL2 是 SCF(FBXL2) E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識成分，促使標的蛋白質接上泛素，進而由蛋白酶體降解。與許多 F-box 蛋白不同，FBXL2 的底物辨識似乎不依賴磷酸化降解基序，而偏向辨識 calmodulin-binding motifs；calmodulin 可拮抗此作用，限制底物泛素化。這項調節出現在 cyclins CCND2 與 CCND3：calmodulin 會抑制兩者的多聚泛素化及後續降解。FBXL2 促進 CCND2、CCND3 降解時，會誘導細胞週期停滯於 G(0)。
FBXL2 也參與調控訊息傳遞與自噬。SCF(FBXL2) 促進 PIK3R2 泛素化及蛋白酶體降解，藉此調節 phosphatidylinositol 3-kinase 訊息傳遞與自噬。另有相似性推定指出，SCF(FBXL2) 可使 PCYT1A 單泛素化並促進其降解，進而調節 phosphatidylcholine 合成；phosphatidylcholine 用於細胞膜及肺表面活性物質的形成。
在發炎調節方面，SCF(FBXL2) 透過泛素化與降解 TRAF1、TRAF2、TRAF3、TRAF4、TRAF5 和 TRAF6，參與發炎反應調控；此項功能描述屬於相似性推定。SCF(FBXL2) 也會泛素化並降解 NLRP3，因此是 NLRP3 inflammasome 的負向調節因子。
FBXL2 的膜相關作用與其修飾及定位有關。由 PTAR1 與 RABGGTB 組成的 GGTase-3 complex 使 FBXL2 geranylgeranylation，並將其導向細胞膜；FBXL2 在膜上組成 SCF(FBXL2)，促進膜錨定蛋白質降解。這使 FBXL2 的作用範圍涵蓋多種細胞調節途徑，但各項底物與作用的證據性質並不完全相同。
Promoter 與基因調控
>FBXL2 ENST00000484457 GRCh38 chr3:33276442-33277542 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAACTACAAGTGTCCCATCGCACTGGGTCCTTCTTCATAGAGT TAATGGACTAGATTTCAGGATATCTAGAGTTCCCTTCAACCATATTAAAAACATTCAACAAATTGCCAGT TGATTTAATGAATTAGACAACATGCATAGAATGCTATTCCATTAAGTGGTATGCAAAGATAATAATTTTT TTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCAGCTCACT GCAAGCTCCACCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTGCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGT CCCCCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCATCGTGTTAGCCAGGATGG TCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGCGTGAGCCA CTGCGCCTGGCCCCAAGATAATCATTTTTAATCTAAAAAAGTAGATTATAAAACAGTTACCTATGGTTTG CCACCATTTTTAAGAATACAGTATATTATAACAACTCATTGGAAGCTTGAAGCAGATAGAATGGAATCTG AGCAGTAGCTACTTCAGGTGCTGGGGTGAGTGTCGTTTTATCCTTTTAAATTCTTGTTATTGGTAATTTA AAATGTTTTCAATAATCATGCATTACCTGTATAACGTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAATCCATGGTCTCTT TCAGCTGGGCAGTCTGCGGCTGGGTAATCTGTCAGGTGAGGGACATCAAGGTGATCAGACTGAGAGGATG GACCAGATACGAAGTGGGAGAGGCGAAGAGGCCCAGTTCCAGGGCCGGGGGCGAGGGGTGGGCGGTCCAA AGGGCACCGCCCCTGCGGGTCACGTGCTCGCCGACCACCAATGGCCGCCTCCGAGCCCACCTTGGGGACG GGGCGGGGCGCCTGGCTGGCGTCACCAGGACAACGGGCGTCGCCGGCGCCGTGTGACTTCGGGCTGTGGG CTCGCTCGCGGCTCTTCGGCCATGGTGAGTCTGGGACCCGCGTCTGCCTAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXL2_1 ↗ | 3:33,277,442 | 正股 | 33,277,393–33,277,452 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_9H7LS · enhancer · 33277031–33277376 · regulatory
ENSR3_73XSHJ · promoter · 33277377–33277452 · regulatory
ENSR3_B8LBH · enhancer · 33277453–33277970 · regulatory
ENSR3_8ZF98 · enhancer · 33278143–33278330 · regulatory
ENSR3_9H7M7 · promoter · 33278331–33278684 · regulatory
· motif · 33277343–33277358 · motif
· motif · 33277344–33277357 · motif
· motif · 33277361–33277377 · motif
· motif · 33277361–33277377 · motif
· motif · 33277370–33277379 · motif
· motif · 33277370–33277379 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：423 aa
FBXL2 蛋白質長 423 個胺基酸，含有位於第 9–55 位的 F-box，以及 13 個連續排列的 leucine-rich repeat（LRR），範圍自第 61 位延伸至第 401 位。第 80–90 位標註為與 calmodulin 互作的區域；蛋白質末端第 420–423 位則具有 CAAX motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBXL2 被標註位於膜並具有 lipid-anchor。 功能資料指出，PTAR1 與 RABGGTB 組成的 GGTase-3 complex 可使 FBXL2 geranylgeranylation，並將其導向細胞膜；因此其膜定位與該修飾及複合體作用相關。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- CCT5P48643 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PTAR1Q7Z6K3 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- RABGGTBP53611 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
FBXL2 是由 CUL1、SKP1、RBX1 與 FBXL2 組成的 SCF(FBXL2) E3 泛素蛋白連接酶複合體成員。它會與 calmodulin 互作；calmodulin 可能拮抗 SCF(FBXL2) 對底物的泛素化。FBXL2 也與 PTPN13 互作，並可能與 PIK3R1 互作。感染情境下，FBXL2 與 hepatitis C virus 非結構蛋白 NS5A 互作，與 NS5B 的互作效率較低；這些互作被描述為對病毒 RNA 複製至關重要。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBXL2 是 SCF(FBXL2) 複合體的底物辨識成分，促進多種蛋白質泛素化及降解；其底物辨識似乎偏向 calmodulin-binding motifs，且受 calmodulin 拮抗，影響細胞週期、訊息傳遞、自噬與發炎調節。部分作用為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Calcium-activated substrate recognition component of the SCF (SKP1-cullin-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex, SCF(FBXL2), which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Unlike many F-box proteins, FBXL2 does not seem to target phosphodegron within its substrates but rather calmodulin-binding motifs and is thereby antagonized by calmodulin. This is the case for the cyclins CCND2 and CCND3 which polyubiquitination and subsequent degradation are inhibited by calmodulin. Through CCND2 and CCND3 degradation induces cell-cycle arrest in G(0). SCF(FBXL2) also mediates PIK3R2 ubiquitination and proteasomal degradation thereby regulating phosphatidylinositol 3-kinase signaling and autophagy. PCYT1A monoubiquitination by SCF(FBXL2) and subsequent degradation regulates synthesis of phosphatidylcholine, which is utilized for formation of membranes and of pulmonary surfactant (By similarity). The SCF(FBXL2) complex acts as a regulator of inflammation by mediating ubiquitination and degradation of TRAF proteins (TRAF1, TRAF2, TRAF3, TRAF4, TRAF5 and TRAF6) (By similarity). The SCF(FBXL2) complex acts as a negative regulator of the NLRP3 inflammasome by mediating ubiquitination and degradation of NLRP3. The GGTase-3 complex, composed of PTAR1 and RABGGTB, geranylgeranylates and targets FBXL2 to the cellular membranes, where FBXL2 forms part of the SCF(FBXL2) complex that mediates the degradation of membrane-anchored proteins PMID 22020328 ↗ · PMID 22323446 ↗ · PMID 23604317 ↗ · PMID 26037928 ↗ · PMID 31209342 ↗ |
| 分子活性 | FBXL2 具有蛋白質修飾相關活性，涉及蛋白質泛素化。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBXL2 與 CUL1、SKP1、RBX1 組成 SCF(FBXL2) 複合體；它會與 calmodulin、PTPN13 互作，並可能與 PIK3R1 互作。calmodulin 可能拮抗複合體對底物的泛素化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complex SCF(FBXL2) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBXL2. Interacts with calmodulin; may antagonize substrate ubiquitination by SCF(FBXL2). May interact with PIK3R1. Interacts with PTPN13 PMID 10531037 ↗ · PMID 22020328 ↗ · PMID 23604317 ↗ · PMID 31209342 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，FBXL2 與 hepatitis C virus 非結構蛋白 NS5A 互作，與 NS5B 的互作效率較低；此反應對 hepatitis C virus RNA 複製至關重要。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with hepatitis C virus non-structural protein 5A (NS5A) and less efficiently, with hepatitis C virus non-structural protein 5B (NS5B); a reaction crucial for hepatitis C virus RNA replication PMID 15893726 ↗ |
| 細胞定位 | Membrane / Lipid-anchor | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCACCAGGACAACGGGCGTCGCCGGCGCCGTGTGACTTC40GGGCTGTGGGCTCGCTCGCGGCTCTTCGGCCATGGTTTTC80TCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCA120AAGAACTTCTGTTAAGAATATTTTCCTTCTTGGATATAGT160AACTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAGGCTTGGAAC200ATCTTAGCCCTGGATGGAAGCAACTGGCAAAGAATAGATC240TTTTTAACTTTCAAACAGATGTAGAGGGTCGAGTGGTGGA280AAATATCTCGAAGCGATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTC320AGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTTGGGGATTCCTCCTTGA360AGACCTTTGCACAGAACTGCCGAAACATTGAACATTTGAA400CCTCAATGGATGCACAAAAATCACTGACAGCACGTGTTAT440AGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTGGATC480TGACCTCCTGTGTGTCTATTACAAACAGCTCCTTGAAGGG520GATCAGTGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTC560TCTTGGTGTGATCAGATCACGAAGGATGGCATCGAGGCAC600TGGTGCGAGGTTGTCGAGGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAG640GGGCTGCACACAGTTAGAAGATGAAGCTCTGAAACACATT680CAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCCTCAACTTGCAGT720CCTGCTCACGTATCACGGATGAAGGTGTGGTGCAGATATG760CAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCTTTCGGGT800TGCAGCAACCTCACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTT840TGAACTGTCCGCGACTGCAAATTTTGGAGGCTGCCCGATG880CTCCCATTTGACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGG920AATTGCCACGAATTGGAGAAGATGGATCTTGAAGAATGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。