基因總覽
FBH1（F-box DNA helicase 1）是蛋白質編碼基因，產物屬於 helicase family 的 UvrD subfamily。FBH1 同時具有 DNA 解旋酶與 SCF(FBH1) E3 ubiquitin ligase complex 底物辨識成分的角色，與細胞處理停滯或受損複製叉有關。其蛋白質序列包含 F-box、UvrD-like helicase ATP-binding 區域，以及 PIP-box 和 APIM motif 等特徵；這些序列特徵與其蛋白質家族及分子功能相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000362091 ★ | 5,890,243–5,937,593 | 21 |
| ENST00000908864 | 5,890,196–5,937,595 | 19 |
| ENST00000908865 | 5,890,196–5,937,595 | 20 |
| ENST00000908866 | 5,890,196–5,937,595 | 22 |
| ENST00000908867 | 5,890,196–5,937,595 | 22 |
| ENST00000908868 | 5,890,196–5,937,595 | 20 |
| ENST00000914586 | 5,890,196–5,937,595 | 19 |
| ENST00000951953 | 5,890,196–5,937,595 | 21 |
| ENST00000951954 | 5,890,196–5,937,595 | 21 |
| ENST00000951955 | 5,890,196–5,937,595 | 20 |
| ENST00000951956 | 5,890,196–5,937,595 | 21 |
| ENST00000951957 | 5,890,196–5,937,595 | 13 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
FBH1 以 3′→5′方向沿 DNA 移動，並將 ATP 水解與雙股 DNA 解旋耦合。它參與細胞對停滯或受損複製叉的反應，並具有抑制過度同源重組的作用：在停滯的複製叉上，FBH1 促進 RAD51 filament 解離，減少過度的鏈交換。這項抗重組作用有助於維持基因組穩定。
FBH1 也參與停滯 DNA 複製叉的重塑，可催化複製叉回退，使複製叉反轉，並讓兩條新合成的 DNA 鏈互相退火。這種結構改變是 FBH1 處理複製叉的一種方式，與其解旋酶活性相關。
在長時間複製壓力下，FBH1 與 MUS81 一起促進核酸內切作用造成的 DNA 切割及雙股斷裂，並促進細胞死亡；來源指出，這可能有助於清除承受過度複製壓力的細胞。此處描述的是複製壓力持續一段時間後的反應，而非所有複製壓力情境都必然發生的結果。
除了直接作用於 DNA，FBH1 也作為 SCF(FBH1) E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分，參與 RAD51 的 ubiquitination，進而調節 RAD51 在細胞內的位置。FBH1 因此兼具 DNA 解旋與蛋白質 ubiquitination 相關功能，並透過這些作用參與複製叉處理及同源重組調控。
Promoter 與基因調控
>FBH1 ENST00000362091 GRCh38 chr10:5889243-5890343 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCCGGCCGGCCCCGGGCAGCCCCCGGCCGCCTGCAGCTCCTCCTTCAGGGCGCGCAGCCGGCCCTCCTG CACCAGCCTGCAGAGGCGCCGCGGGTCCCCGGGCTGGGCCATCGCCGCGGGTCGGGCCGGGCTGCGCGGG GAGGCGGCGGGCGGGACACCGGCGGCCGGGCAGGGAGAAGCCGAGGGCGAGTGGGACTTTCCGCCTCTTC ACGCAACCTGCCCCGCGCGCCCCGAACCCGGCAGAACCGCCCCTCACGCCCCCGGCTTTGTCCCCGGCAG AGCCGCCTCCTCAAACCCCCGGCCTAGTCCGCAGGCGGGCTGCCCCCTCACAGCCCCGGCCTGCCCCGCG TGGGAGAAGCCGCGGTTCCGGGCACGGGGCGGTTTTTCCTCAGGGACGGAGCGGTCCGGGATGAGCACGG AGGGGCCTGGGGATCCGAGAGCGCTGGCGTCCGCCGTCCTGGAGCTGCAGCGGCCCGTACGTGATTCGGG ACTGAACACGTAAGGGAGTGGGGCGCGCCGCTACACCGCAAAGCCCCAAAGTGGAGGGTCCGGGAGGGCG CGCACAGCCTCGCCCGGCGCCGTGCAGGGTGGCTCCTGAGGCAGCCAGGCCCAAGCGTGACCTGCCCCGC ACGCGTCCTCAGGGCCGCCCCAGCCTCCAGCCCCTGGGGGCCGGCGTTCCTGGGCTCCGCCCCCGTCCCC GCCCCTCGACCGCCGCTGCTCCGCGGGGACTCGGGGAGCTCGAAGGAACTCTGGGAAAGTTTCCCGCTCC GCCCCGGCCCGAGCGGAAGCGCGGATGGGGCGTGGCCCGGTAGCTGTGGCCGCGCCCCCACCGATTGCGC ATTTCGATTGGCGTTAGTGGCCGTCCGTCAGCACGCCCCCTCCGGTCTCGCGTCCCGATTGGTCGCGGGG GCCGTCAGTCCGGCTCCGGCGGCGGGCGCTTCCCGGGGCTGCGGCGGGGCGGAGCTCGCGGAGGAAGTCG GCGGGCGTCTCGGGCTCCAGGTCCCGGCCAGAGGAGGAGCTCGCTGCCGGGGGACGCTGGGCTGAGCGGC CGGCGGCGCGGGCCCGGCGGCGGCGGCAGCGGGGTCCGGGTCCGGAGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FBXO18_1 ↗ | 10:5,890,252 | 正股 | 5,890,203–5,890,262 |
| FBXO18_2 ↗ | 10:5,894,370 | 正股 | 5,894,321–5,894,380 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_53DDND · CTCF_binding_site · 5888452–5888473 · regulatory
ENSR10_94C5B · promoter · 5889861–5890253 · regulatory
ENSR10_CKR5 · enhancer · 5890254–5891498 · regulatory
ENSR10_53DF2Z · CTCF_binding_site · 5890521–5890542 · regulatory
ENSR10_94C5W · enhancer · 5892025–5892353 · regulatory
· motif · 5888454–5888470 · motif
· motif · 5888824–5888841 · motif
· motif · 5889497–5889510 · motif
· motif · 5889524–5889537 · motif
· motif · 5889561–5889574 · motif
· motif · 5889587–5889600 · motif
· motif · 5889627–5889640 · motif
· motif · 5889765–5889773 · motif
· motif · 5889765–5889780 · motif
· motif · 5889765–5889782 · motif
· motif · 5889901–5889914 · motif
· motif · 5889901–5889914 · motif
· motif · 5889926–5889936 · motif
· motif · 5889938–5889948 · motif
· motif · 5890038–5890048 · motif
· motif · 5890061–5890071 · motif
· motif · 5890112–5890122 · motif
· motif · 5890523–5890539 · motif
· motif · 5890537–5890550 · motif
· motif · 5890547–5890560 · motif
· motif · 5890588–5890601 · motif
· motif · 5890706–5890721 · motif
· motif · 5890711–5890723 · motif
· motif · 5890740–5890753 · motif
· motif · 5892326–5892339 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1043 aa
FBH1 蛋白質長 1043 個胺基酸，屬於 helicase family 的 UvrD subfamily。其特徵包括 F-box、UvrD-like helicase ATP-binding 區域，以及 PIP-box 和 APIM motif。另有兩段序列被註記為無序區域；這些是序列特徵註解，不代表其在所有條件下都呈現固定構形。
蛋白質三維結構
細胞內定位
FBH1 位於細胞核及染色體，沒有 DNA 損傷時可見於核質；發生 DNA 損傷或複製壓力時，則會累積至相關位置。 FBH1 定位到 DNA 損傷位點需要 PCNA。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- APBB1O00213-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SRCP12931 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
FBH1 是 SCF(FBH1) E3 ubiquitin-protein ligase complex 的組成部分；此複合體由 CUL1、SKP1、RBX1 和 FBH1 組成。FBH1 與 RAD51、RPA2 有互作，並透過 PIP-box 和 RanBP2-type zinc finger 與 PCNA 互作。來源另指出 FBH1 參與 RAD51 ubiquitination 與位置調節，但這項功能關係不等同於複合體組成或直接結合證據。
疾病與遺傳關聯
FBH1 缺陷常見於黑色素瘤，並與細胞在複製壓力下存活率增加相關。來源指出，FBH1 失活可能參與致癌轉化；這描述的是可能的角色，並未將 FBH1 缺陷確立為黑色素瘤的直接原因。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | FBH1 是 3′至5′ DNA 解旋酶，也是 SCF(FBH1) E3 ubiquitin ligase complex 的底物辨識成分，參與停滯或受損複製叉的反應。它促進停滯複製叉上的 RAD51 filament 解離，以抑制過度同源重組；亦可催化複製叉回退。長時間複製壓力下，FBH1 與 MUS81 促進 DNA 切割及細胞死亡，可能清除承受過度壓力的細胞；該複合體也介導 RAD51 ubiquitination，調節其細胞內位置。 | 含實驗來源 | 證據與來源3'-5' DNA helicase and substrate-recognition component of the SCF(FBH1) E3 ubiquitin ligase complex that plays a key role in response to stalled/damaged replication forks. Involved in genome maintenance by acting as an anti-recombinogenic helicase and preventing extensive strand exchange during homologous recombination: promotes RAD51 filament dissolution from stalled forks, thereby inhibiting homologous recombination and preventing excessive recombination. Also promotes cell death and DNA double-strand breakage in response to replication stress: together with MUS81, promotes the endonucleolytic DNA cleavage following prolonged replication stress via its helicase activity, possibly to eliminate cells with excessive replication stress. Plays a major role in remodeling of stalled DNA forks by catalyzing fork regression, in which the fork reverses and the two nascent DNA strands anneal. In addition to the helicase activity, also acts as the substrate-recognition component of the SCF(FBH1) E3 ubiquitin ligase complex, a complex that mediates ubiquitination of RAD51, leading to regulate RAD51 subcellular location PMID 11956208 ↗ · PMID 17724085 ↗ · PMID 19736316 ↗ · PMID 23319600 ↗ · PMID 23361013 ↗ · PMID 25585578 ↗ · PMID 25772361 ↗ |
| 分子活性 | FBH1 將 ATP 水解與雙股 DNA 解旋耦合，並沿 DNA 以 3′至5′方向移動。此描述指出其解旋活性所伴隨的能量反應及移動方向，未在此條目中列出特定細胞情境或其他實驗條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Couples ATP hydrolysis with the unwinding of duplex DNA by translocating in the 3'-5' direction. PMID 11956208 ↗ · PMID 23393192 ↗ |
| 分子活性 | ATP + H2O = ADP + phosphate + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | FBH1 涉及蛋白質修飾，具體註記為蛋白質 ubiquitination。此條目僅列出相關活性類別，未在此處說明受修飾的蛋白質、發生條件或具體結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | FBH1 是 SCF(FBH1) E3 ubiquitin-protein ligase complex 的一員，該複合體由 CUL1、SKP1、RBX1 與 FBH1 組成。FBH1 也與 RAD51、RPA2 互作，並透過 PIP-box 和 RanBP2-type zinc finger 與 PCNA 互作；這些互作描述不應與複合體組成混為一談。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the SCF (SKP1-CUL1-F-box) E3 ubiquitin-protein ligase complex SCF(FBH1) composed of CUL1, SKP1, RBX1 and FBH1. Interacts with RAD51. Interacts with RPA2. Interacts (via PIP-box and RanBP2-type zinc finger) with PCNA PMID 11956208 ↗ · PMID 19736316 ↗ · PMID 23319600 ↗ · PMID 23393192 ↗ · PMID 23677613 ↗ |
| 細胞定位 | FBH1 位於細胞核及染色體；沒有 DNA 損傷時定位於核質，發生 DNA 損傷或複製壓力時則累積至相關位點。FBH1 定位到 DNA 損傷位置需要 PCNA，這項條件描述的是其定位需求。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome; Accumulates at sites of DNA damage or replication stress. PCNA is required for localization to DNA damage sites. Localizes to the nucleoplasm in absence of DNA damage PMID 19736316 ↗ · PMID 23677613 ↗ · PMID 23319600 ↗ |
| 疾病關聯 | FBH1 缺陷常見於黑色素瘤，並與細胞在複製壓力下存活率增加相關。FBH1 失活可能參與致癌轉化，但來源僅表述為可能的角色，並未證明其為黑色素瘤發生的直接原因。 | 含實驗來源 | 證據與來源Defects in FBH1 are frequently observed in melanomas, resulting in increased survival in response to replicative stress. Its inactivation may play a role in oncogenic transformation PMID 23466708 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCCCGGCCAGAGGAGGAGCTCGCTGCCGGGGGACGCTGG40GCTGAGCGGCCGGCGGCGCGGGCCCGGCGGCGGCGGCAGC80GGGGTCCGGGTCCGGAGCGCCACATGAGACGGTTTAAGCG120GAAGCATCTTACTGCCATTGACTGCCAGCATTTGGCTCGG160AGTCACTTGGCTGTGACCCAGCCCTTCGGTCAAAGATGGA200CAAACAGAGATCCGAACCATGGTCTCTATCCTAAACCGAG240AACAAAAAGAGGGAGTAGGGGTCAGGGAAGTCAAAGATGC280ATCCCTGAGTTCTTCCTAGCAGGCAAGCAGCCGTGCACCA320ATGACATGGCCAAAAGCAATTCTGTTGGCCAGGACAGCTG360TCAGGACTCTGAGGGTGACATGATCTTTCCTGCAGAGAGC400AGCTGTGCACTGCCTCAGGAAGGCAGTGCAGGGCCGGGCT440CACCAGGGTCTGCCCCGCCCTCCAGGAAGCGGTCTTGGTC480CTCTGAGGAAGAGAGTAACCAGGCTACCGGGACCAGCCGG520TGGGATGGAGTTTCTAAGAAAGCTCCACGGCACCATTTGT560CTGTGCCATGCACAAGGCCTAGGGAGGCCAGGCAAGAAGC600AGAGGACAGTACGTCTCGGCTCTCTGCGGAGTCTGGTGAA640ACCGACCAAGATGCTGGGGACGTGGGTCCTGATCCCATTC680CTGACTCATACTATGGGCTTCTTGGGACCTTGCCCTGCCA720GGAAGCACTGAGCCACATTTGCAGCCTGCCTAGTGAGGTC760CTGAGGCACGTGTTTGCCTTCCTCCCGGTGGAAGACCTCT800ATTGGAACCTGAGCTTGGTGTGCCACTTGTGGAGGGAGAT840CATCAGTGACCCGCTGTTCATTCCTTGGAAGAAGCTGTAC880CATCGATACCTGATGAATGAAGAGCAAGCTGTCAGCAAAG920TGGACGGCATCCTGTCTAACTGTGGCATAGAAAAGGAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。