演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

FAXDC2FLJ13758

fatty acid hydroxylase domain containing 2

FAXDC2 是蛋白質編碼基因,產物屬於 sterol desaturase family,具有多段跨膜螺旋及 fatty acid hydroxylase 結構域。

Homo sapiens5q33.2UniProt Q96IV6
OFFICIAL SYMBOL
FAXDC2
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q96IV6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

FAXDC2(fatty acid hydroxylase domain containing 2)是蛋白質編碼基因,其產物為 Fatty acid hydroxylase domain-containing protein 2。此蛋白質屬於 sterol desaturase family,具有 fatty acid hydroxylase 結構域與多段跨膜螺旋。現有資料指出,FAXDC2 可促進巨核細胞分化;其具體分子作用方式與相關生物學意義,見功能說明。

Official symbol
FAXDC2
Gene name
fatty acid hydroxylase domain containing 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1334
UniProt
Q96IV6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ13758C5orf4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q33.2
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegFAXDC2pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:154,818,486–154,859,252
Gene span
40,767 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000326080 ★154,818,492–154,850,6039
ENST00000517938154,818,492–154,850,6098
ENST00000888401154,818,492–154,850,6539
ENST00000888402154,818,492–154,850,65311
ENST00000888403154,818,492–154,850,6536
ENST00000888404154,818,492–154,850,6539
ENST00000888405154,818,492–154,850,6537
ENST00000962790154,818,492–154,850,65310
ENST00001138988154,818,492–154,850,6539
ENST00000519501154,823,450–154,850,6036
ENST00000518651154,824,461–154,850,6035
ENST00000520968154,824,484–154,859,2526

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

FAXDC2 與巨核細胞分化相關。現有資料指出,FAXDC2 會促進這項分化過程,並伴隨 ERK 磷酸化增加及 RUNX1 表現上調。

這項功能描述將 ERK 磷酸化與 RUNX1 表現變化列為 FAXDC2 促進巨核細胞分化時的相關作用,但未進一步說明分子作用順序、直接作用對象或其他中間機制。因此,資料支持的是上述調節與分化促進的關聯,不宜據此延伸至未記載的路徑細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 154850603 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>FAXDC2 ENST00000326080 GRCh38 chr5:154850503-154851603 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCAGCCAAGTTTCTGAGTTTTGTTTATTTTAGAAAGGAGTCTTCCTGTGCTGCCCAGGCTGGTCTCAAAT
ACCTGGGCTCAAGTGATCCTCCAACCTCAGCCTCCCAAATAGTTGGGACTACAGGTGAGCACCACCATGC
CTAGCCAATCTCCATGTTTGATTGTTAAGTGGAAAAAGCAAGGTGCACAACAAACATACTATGGTGCTGT
TGCTAAAGGAGAAGCACAAGGCCTACACATGTTTCTATTTACAGAGGTAAGCTCTGGAAGGATATACAAA
AATCTGGTCACAGAGGTTGTCTCTTGGGAGGAAAAAAAGGGGACTGAGGAGAAATTAAAAAAAGACTTTT
CATTGTACATTCTTTTGACCCTATTGTATTTTATATCATTTGCACATTTGCTTATTTAAAAAGTTTTCAG
AAATTTAAAAGCAGCTCTTTTTCCAAAGTGCTCCTCACTTCATGTCATGGGTCCTGTATCCTAAGTTCCC
CTATTTCAATCACAGTGCAAATTTACCCTCCACAGGCATGCCTTTCCTGCATCTAGACTCACTAGAAATA
GCTGATGCATCTCTCCTCCCTTGCCTGCCCTCCACAGGAAAAGAAGCAATGAAAAAAAAGAAAATGAGAT
CCTCTGGTCTCTGTCACCTTTTTATCAACTTGTACTACCTGCCATTATCTGACACCCACATCTTTTCTTG
AATCTGCCTCCTCCTATGGGACAGCGACATTTTCTTAAGTTGCAGATGATGGAGAAAATTTTTTAAAAGA
AAAAAAGGGGGCAGGGGGAGGGAAGCCCAGAGTTTGGCCAAATGCACGTTTTTCAAGTTCCTGCTTGAGC
TTAGATTCCCTTTCCGCTTTAAGGACATGCCCTCTGGAAAGAAGGGTGTTTTGTTTCCAGCCCACACAGA
CCCAAACTTTTTTCATCACGTGCCTGGTCCGAGCCAGTACGCAGCTCTGTAATGAGATCACCATGGCCAG
CCTCCCACCCGAGCAAAAACAAGGTTAGCCTGCAGCAGAGCCGCAGCAGCAACAGCCACCAAAGCGGGGG
CTGAAAGGGAAGAGAACTTAGATTTGACCTGTGCAAGGACCTCAGCAGCTT
FAXDC2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
FAXDC2_1 ↗5:154,850,597負股154,850,587–154,850,646

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

在 K562 細胞經 12-O-tetradecanoyl phorbol-acetate(TPA)誘導巨核細胞分化的條件下,FAXDC2 表現量上升;此調控描述限定於該細胞與誘導條件。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:333 aa

1 aa333 aa結構域跨膜區
依 Q96IV6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Fatty acid hydroxylase domain-containing protein 2 長333個胺基酸,屬於 sterol desaturase family。序列註解列出六段螺旋型跨膜區,分別位於胺基酸29–49、77–97、134–154、168–188、215–235及237–257;fatty acid hydroxylase 結構域位於176–299。

跨膜區Helical29–49 aa
跨膜區Helical77–97 aa
跨膜區Helical134–154 aa
跨膜區Helical168–188 aa
跨膜區Helical215–235 aa
跨膜區Helical237–257 aa
結構域Fatty acid hydroxylase176–299 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96IV6…

AlphaFold · Q96IV6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Membrane

資料將 FAXDC2 標示於細胞質與膜,並註明其為多次跨膜蛋白;未提供更具體的定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 30 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ13758FAXDC2AQP6ARL13BCD79ACGRRF1CLDN7CREB3L1CYB5R3EBPELOVL4ERGIC3FFAR2GOLT1AGPR152GPX8HSD17B13MGST3NEMP1PANX1PGRMC2RETREG3SLC10A1SLC10A6SLC30A8STOMSTX4TMEM106CTMEM139TMEM86BTMPRSS2TMX2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 30 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能FAXDC2 促進巨核細胞分化,並伴隨 ERK 磷酸化增強及 RUNX1 表現上調。資料未進一步界定這些分子變化之間的先後順序或直接作用機制。含實驗來源
證據與來源

Promotes megakaryocyte differentiation by enhancing ERK phosphorylation and up-regulating RUNX1 expression

PMID 27689744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位FAXDC2 的定位資料列出細胞質與膜,並將此蛋白質註記為多次跨膜蛋白;資料未提供定位變化的條件或異構型之間的差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 27689744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在 K562 細胞接受 12-O-tetradecanoyl phorbol-acetate(TPA)誘導巨核細胞分化的情境中,FAXDC2 表現量上升;此描述限於該細胞系及誘導條件。含實驗來源
證據與來源

Up-regulated during 12-O-tetradecanoyl phorbol-acetate (TPA)-induced megakaryocytic differentiation of K562 cells

PMID 27689744 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000326080 · 2,947 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGGTTAGCCTGCAGCAGAGCCGCAGCAGCAACAGCCACC40
41AAAGCGGGGGCTGAAAGGGAAGAGAACTTAGATTTGACCT80
81GTGCAAGGACCTCAGCAGCTTGGACACAGCCCACTGCAGA120
121GATGAAAGGAGAAGCTGGACATATGCTACACAATGAAAAG160
161TCAAAGCAGGAGGGACACATCTGGGGCTCTATGAGGAGGA200
201CAGCTTTCATCCTGGGCTCTGGACTTCTCTCATTTGTGGC240
241CTTCTGGAACTCAGTGACATGGCATCTTCAGAGATTTTGG280
281GGTGCTTCTGGCTACTTTTGGCAAGCCCAGTGGGAGAGGC320
321TGCTGACTACATTTGAAGGGAAGGAGTGGATCCTCTTCTT360
361TATAGGTGCCATCCAAGTGCCTTGTCTCTTCTTCTGGAGC400
401TTCAATGGGCTTCTATTGGTGGTTGACACAACAGGAAAAC440
441CTAACTTCATCTCTCGCTACCGAATTCAGGTCGGCAAGAA480
481TGAACCTGTGGATCCTGTGAAACTGCGCCAGTCTATCCGC520
521ACAGTTCTTTTCAACCAGTGCATGATATCTTTCCCCATGG560
561TGGTCTTCCTCTATCCCTTCCTCAAATGGTGGAGAGACCC600
601CTGCCGCCGTGAGCTACCCACCTTCCACTGGTTCCTCCTG640
641GAGCTGGCCATCTTCACGCTGATCGAGGAAGTCTTGTTCT680
681ACTATTCACACCGGCTCCTTCACCACCCAACATTCTACAA720
721GAAAATCCACAAGAAACACCATGAGTGGACAGCTCCCATT760
761GGCGTGATCTCTCTCTATGCCCACCCTATAGAGCATGCAG800
801TCTCCAACATGCTACCGGTGATAGTGGGCCCATTAGTAAT840
841GGGCTCCCACTTGTCCTCCATCACCATGTGGTTTTCCTTG880
881GCCCTCATCATCACCACCATCTCCCACTGTGGCTACCACC920
921TTCCCTTCCTGCCTTCGCCTGAATTCCACGACTACCACCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。