基因總覽
FASLG 是蛋白質編碼基因,產物 Fas ligand 亦稱 Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6,屬於腫瘤壞死因子家族。這種細胞激素具有跨膜型態,包含細胞質區、單次穿膜區及細胞外區;其細胞外區含有 THD 結構域。Fas ligand 可呈現細胞膜上的形式,也有可溶性形式。它的生物學角色與免疫細胞功能及細胞凋亡訊號相關;具體的受體作用與細胞反應於功能段說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367721 ★ | 172,659,103–172,666,876 | 4 |
| ENST00000340030 | 172,658,990–172,666,075 | 3 |
| ENST00000875216 | 172,658,990–172,666,891 | 4 |
| ENST00001145550 | 172,658,990–172,666,891 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Fas ligand 是可結合 TNFRSF6/FAS 的細胞激素;TNFRSF6/FAS 會將凋亡訊號傳入細胞。這條訊號參與細胞毒性 T 細胞與自然殺手細胞介導的細胞凋亡,也與 T 細胞發育相關。換言之,Fas ligand 透過受體傳遞訊號,參與免疫細胞調節及細胞存亡。
在抗原活化的 T 細胞中,Fas ligand 可引發活化誘導性細胞死亡(AICD),包括細胞彼此攻擊或自我誘發死亡的情形,因而有助於免疫反應終止。TNFRSF6/FAS 介導的細胞凋亡也被認為參與周邊免疫耐受的形成;此處所述功能為相似性推論,並非來源明確指出的直接實驗證據。
Fas ligand 與 TNFRSF6B/DcR3 結合;TNFRSF6B/DcR3 是可阻斷細胞凋亡的誘餌受體。除了凋亡相關作用,Fas ligand 也可誘導 FAS 介導的 NF-kappa-B 活化,啟動非凋亡訊號路徑;這項功能亦標示為相似性推論。Fas ligand 能誘導細胞凋亡,但來源指出它似乎不是此過程不可或缺的因子。
此外,Fas ligand 的細胞質形式會抑制基因轉錄。這項作用與細胞膜外側配體所參與的受體訊號不同,呈現其不同形式可能涉及不同細胞功能。
Promoter 與基因調控
>FASLG ENST00000367721 GRCh38 chr1:172658103-172659203 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGGGCAACATAGCAAGTCCCCATCTGTACAAAAAAAAAAAAGAATAAATTAGTCAGGTGTAGTGACTTA TGCCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCCAAGGCAAGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGCTGCA GTTAACTACGATAGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCTATTTAAATAAA TAAGTAAATAAATAAACTGGGCAAACAATGAAAATGAAAACATTGCGAAATACAAAGCAGCTCTGTGGGT TCCACTGGTTTGCAGCCTCTGATCTAATTTCTAAAGTGGGTGTAGCAGGTTTTTAACCTGTAAATTATGG TGATCGGCAGGTCAGGGTAAATGGTAGTTGTGTGTGGGGAAGAGATGATGGCAACAGATGTTTTCCTCCT GCAAAAACTAAAATGTGGGAGTGACTTCTCTGGCCATGACTCCATGGTCTCTCCCCTCAGAGCCATTTTC AGTAAAATTTTTATAGTTTAAAAAATACGGTTCTGAACAATTTTTGTTAGAGTTATTTTGGGATTTTTAA ATAGTTTTTTGGTTGTGTATATGGTAGAATTCTTAAAATTATACAATTATAATGTATAAAAAAGCATGCA ATTATAATTCATAAAATTATAGCCCCACTGACCATTCTCCTGTAGCTGGGAGCAGTTCACACTAACAGGG CTATACCCCCATGCTGACCTGCTCTGCAGGATCCCAGGAAGGTGAGCATAGCCTACTAACCTGTTTGGGT AGCACAGCGACAGCAACTGAGGCCTTGAAGGCTGTTATCAGAAAATTGTGGGCGGAAACTTCCAGGGGTT TGCTCTGAGCTTCTTGAGGCTTCTCAGCTTCAGCTGCAAAGTGAGTGGGTGTTTCTTTGAGAAGCAGAAT CAGAGAGAGAGAGATAGAGAAAGAGAAAGACAGAGGTGTTTCCCTTAGCTATGGAAACTCTATAAGAGAG ATCCAGCTTGCCTCCTCTTGAGCAGTCAGCAACAGGGTCCCGTCCTTGACACCTCAGCCTCTACAGGACT GAGAAGAAGTAAAACCGTTTGCTGGGGCTGGCCTGACTCACCAGCTGCCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FASLG_1 ↗ | 1:172,659,103 | 正股 | 172,659,054–172,659,113 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_94JJ9Z · enhancer · 172654591–172654926 · regulatory
ENSR1_B39976 · enhancer · 172662419–172663159 · regulatory
ENSR1_8743R8 · enhancer · 172663788–172664039 · regulatory
· motif · 172658354–172658363 · motif
· motif · 172658354–172658363 · motif
· motif · 172662572–172662594 · motif
· motif · 172662572–172662594 · motif
· motif · 172662891–172662906 · motif
· motif · 172662898–172662906 · motif
· motif · 172662984–172662996 · motif
· motif · 172662986–172662993 · motif
· motif · 172663135–172663148 · motif
· motif · 172663154–172663176 · motif
· motif · 172663154–172663176 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:281 aa
Fas ligand 長 281 個胺基酸,屬於腫瘤壞死因子家族。其第 1–80 位為細胞質區,第 81–102 位是作為第二型膜蛋白訊號錨定的螺旋穿膜區,第 103–281 位位於細胞外;細胞外區第 145–281 位為 THD。第 20–71 位及第 118–142 位另註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Fas ligand 是單次穿膜的第二型膜蛋白,可見於細胞膜,也位於細胞質囊泡腔與溶酶體腔。 經 FGR 磷酸化及單泛素化後,會被內吞至分泌性溶酶體的多囊泡體。 細胞膜上的 Fas ligand 與 SPPL2A 共定位。 其可溶性形式可能經由細胞表面切割釋出至細胞外液;Fas ligand 胞質內域則可轉位至細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 32 個夥伴
- CASP8Q14790 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ECM1Q16610 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FADDQ13158 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FASP25445 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FNBP1Q96RU3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- FYNP06241 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- IHO1Q8IYA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ITKQ08881 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT33BQ14525 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP11-1Q8IUC1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK1A0A0S2Z4D7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK1P16333-1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- NOTCH2NLAQ7Z3S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PACSIN1Q9BY11 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PACSIN2Q9UNF0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PACSIN3Q9UKS6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PIK3R1P27986 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PSTPIP1O43586 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- RGS20O76081 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SEC23AQ15436 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNX33Q8WV41 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
Fas ligand 形成同源三聚體。來源另列出與其互作的蛋白質,包括 ARHGAP9、FGR、FYN、SRC、BTK、ITK、LYN、NCK1、NCK2、PIK3R1、SNX9 與 YES1 等;這些資料標示為互作,並未逐一說明其結合方式或是否共同組成複合體。
疾病與遺傳關聯
FASLG 變異被列為自體免疫淋巴增生症 1B(ALPS1B)的致病原因。此凋亡障礙於幼年發病,會造成自體反應性淋巴球累積;其特徵包括非惡性淋巴結腫大合併肝脾腫大,以及自體免疫性溶血性貧血、血小板減少與嗜中性球減少。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 8 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Fas ligand 是可結合 TNFRSF6/FAS 的細胞激素,該受體將凋亡訊號傳入細胞。它參與細胞毒性 T 細胞與自然殺手細胞介導的細胞凋亡,以及 T 細胞發育。抗原活化的 T 細胞中,Fas ligand 可引發活化誘導性細胞死亡,協助終止免疫反應;FAS 介導的凋亡也被認為參與周邊免疫耐受。它另可結合能阻斷凋亡的誘餌受體 TNFRSF6B/DcR3。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytokine that binds to TNFRSF6/FAS, a receptor that transduces the apoptotic signal into cells. Involved in cytotoxic T-cell-mediated apoptosis, natural killer cell-mediated apoptosis and in T-cell development. Initiates fratricidal/suicidal activation-induced cell death (AICD) in antigen-activated T-cells contributing to the termination of immune responses (By similarity). TNFRSF6/FAS-mediated apoptosis also has a role in the induction of peripheral tolerance (By similarity). Binds to TNFRSF6B/DcR3, a decoy receptor that blocks apoptosis PMID 17557115 ↗ · PMID 27806260 ↗ · PMID 7528780 ↗ · PMID 9228058 ↗ · PMID 9427603 ↗ |
| 功能 | Fas ligand 可誘導 FAS 介導的 NF-kappa-B 活化,進而啟動非凋亡訊號路徑;此功能屬相似性推論。它也能誘導細胞凋亡,但來源指出 Fas ligand 似乎不是此過程不可或缺的因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Induces FAS-mediated activation of NF-kappa-B, initiating non-apoptotic signaling pathways (By similarity). Can induce apoptosis but does not appear to be essential for this process PMID 27806260 ↗ |
| 功能 | Fas ligand 的細胞質形式會抑制基因轉錄。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | Fas ligand 形成同源三聚體。來源另列出與其互作的蛋白質:ARHGAP9、BAIAP2L1、BTK、CACNB3、CACNB4、CRK、DLG2、DNMBP、DOCK4、EPS8L3、FGR、FYB1、FYN、HCK、ITK、ITSN2、KALRN、LYN、MACC1、MIA、MPP4、MYO15A、NCF1、NCK1、NCK2、NCKIPSD、OSTF1、PIK3R1、PSTPIP1、RIMBP3C、SAMSN1、SH3GL3、SH3PXD2B、SH3PXD2A、SH3RF2、SKAP2、SNX33、SNX9、SORBS3、SPTA1、SRC、SRGAP1、SRGAP2、SRGAP3、TEC、TJP3 與 YES1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homotrimer. Interacts with ARHGAP9, BAIAP2L1, BTK, CACNB3, CACNB4, CRK, DLG2, DNMBP, DOCK4, EPS8L3, FGR, FYB1, FYN, HCK, ITK, ITSN2, KALRN, LYN, MACC1, MIA, MPP4, MYO15A, NCF1, NCK1, NCK2, NCKIPSD, OSTF1, PIK3R1, PSTPIP1, RIMBP3C, SAMSN1, SH3GL3, SH3PXD2B, SH3PXD2A, SH3RF2, SKAP2, SNX33, SNX9, SORBS3, SPTA1, SRC, SRGAP1, SRGAP2, SRGAP3, TEC, TJP3 and YES1 PMID 17164290 ↗ · PMID 19807924 ↗ · PMID 27806260 ↗ |
| 細胞定位 | Fas ligand 是單次穿膜的第二型膜蛋白,定位於細胞膜、細胞質囊泡腔及溶酶體腔。經 FGR 磷酸化並發生單泛素化後,它會被內吞至分泌性溶酶體的多囊泡體;在細胞膜上則與 SPPL2A 蛋白酶共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type II membrane protein; Cytoplasmic vesicle lumen; Lysosome lumen; Is internalized into multivesicular bodies of secretory lysosomes after phosphorylation by FGR and monoubiquitination. Colocalizes with the SPPL2A protease at the cell membrane PMID 17557115 ↗ · PMID 9427603 ↗ · PMID 17164290 ↗ |
| 細胞定位 | Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6 的可溶性形式會分泌至細胞外;它可能由細胞表面切割後釋放到細胞外液。 | 含實驗來源 | 證據與來源Tumor necrosis factor ligand superfamily member 6, soluble form; Secreted; May be released into the extracellular fluid by cleavage from the cell surface PMID 9427603 ↗ |
| 細胞定位 | Fas ligand 胞質內域可轉位至細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源FasL intracellular domain; Nucleus; The FasL ICD cytoplasmic form is translocated into the nucleus PMID 17557115 ↗ |
| 疾病關聯 | FASLG 變異會造成自體免疫淋巴增生症 1B(ALPS1B)。此凋亡障礙於幼年發病,造成自體反應性淋巴球累積,臨床特徵包括非惡性淋巴結腫大合併肝脾腫大、自體免疫性溶血性貧血、血小板減少及嗜中性球減少。 | 含實驗來源 | 證據與來源Autoimmune lymphoproliferative syndrome 1B ALPS1B A disorder of apoptosis that manifests in early childhood and results in the accumulation of autoreactive lymphocytes. It is characterized by non-malignant lymphadenopathy with hepatosplenomegaly, and autoimmune hemolytic anemia, thrombocytopenia and neutropenia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601859 PMID 26334989 ↗ · PMID 8787672 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCAGTCAGCAACAGGGTCCCGTCCTTGACACCTCAGCCT40CTACAGGACTGAGAAGAAGTAAAACCGTTTGCTGGGGCTG80GCCTGACTCACCAGCTGCCATGCAGCAGCCCTTCAATTAC120CCATATCCCCAGATCTACTGGGTGGACAGCAGTGCCAGCT160CTCCCTGGGCCCCTCCAGGCACAGTTCTTCCCTGTCCAAC200CTCTGTGCCCAGAAGGCCTGGTCAAAGGAGGCCACCACCA240CCACCGCCACCGCCACCACTACCACCTCCGCCGCCGCCGC280CACCACTGCCTCCACTACCGCTGCCACCCCTGAAGAAGAG320AGGGAACCACAGCACAGGCCTGTGTCTCCTTGTGATGTTT360TTCATGGTTCTGGTTGCCTTGGTAGGATTGGGCCTGGGGA400TGTTTCAGCTCTTCCACCTACAGAAGGAGCTGGCAGAACT440CCGAGAGTCTACCAGCCAGATGCACACAGCATCATCTTTG480GAGAAGCAAATAGGCCACCCCAGTCCACCCCCTGAAAAAA520AGGAGCTGAGGAAAGTGGCCCATTTAACAGGCAAGTCCAA560CTCAAGGTCCATGCCTCTGGAATGGGAAGACACCTATGGA600ATTGTCCTGCTTTCTGGAGTGAAGTATAAGAAGGGTGGCC640TTGTGATCAATGAAACTGGGCTGTACTTTGTATATTCCAA680AGTATACTTCCGGGGTCAATCTTGCAACAACCTGCCCCTG720AGCCACAAGGTCTACATGAGGAACTCTAAGTATCCCCAGG760ATCTGGTGATGATGGAGGGGAAGATGATGAGCTACTGCAC800TACTGGGCAGATGTGGGCCCGCAGCAGCTACCTGGGGGCA840GTGTTCAATCTTACCAGTGCTGATCATTTATATGTCAACG880TATCTGAGCTCTCTCTGGTCAATTTTGAGGAATCTCAGAC920GTTTTTCGGCTTATATAAGCTCTAAGAGAAGCACTTTGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。