基因總覽
FAS 是蛋白質編碼基因,產物 Fas cell surface death receptor 屬於細胞表面受體。其主要形式為單次穿膜的第一型膜蛋白,包含細胞外區、穿膜區與細胞質區;細胞外區具有三段 TNFR-Cys 重複序列,細胞質區則含有 Death domain。除主要膜型外,另有可分泌的異構型。這些結構特徵使 FAS 能以細胞表面受體的形式接收訊號,並由細胞質區連結後續的訊號傳遞。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000652046 ★ | 88,990,798–89,017,059 | 9 |
| ENST00000690268 | 88,986,740–89,029,605 | 11 |
| ENST00000357339 | 88,990,559–89,029,605 | 8 |
| ENST00000697035 | 88,990,695–89,014,302 | 9 |
| ENST00000696776 | 88,990,695–89,029,605 | 10 |
| ENST00000696779 | 88,990,695–89,029,605 | 5 |
| ENST00000696780 | 88,990,696–89,029,605 | 9 |
| ENST00000562983 | 88,990,785–89,029,605 | 10 |
| ENST00000696781 | 88,990,798–89,029,605 | 6 |
| ENST00001140016 | 88,990,798–89,029,605 | 9 |
| ENST00000696768 | 88,990,805–89,029,605 | 7 |
| ENST00000355740 | 88,990,827–89,029,605 | 8 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Fas cell surface death receptor 是 TNFSF6/FASLG 的受體。受體活化後,接頭分子 FADD 會將 CASP8 招募至受體,形成 death-inducing signaling complex(DISC)。CASP8 在此複合體中經蛋白水解活化,接著啟動後續的 caspase 級聯反應;caspase 是具天冬胺酸特異性的半胱胺酸蛋白酶,這連續反應促成細胞凋亡。
FAS 所介導的凋亡可能參與周邊免疫耐受的建立,也可能參與成熟 T 細胞在抗原刺激後的自我清除;來源指出這兩種作用可能各自發生,或同時具有作用。這些描述將 FAS 訊號連結至免疫細胞的調節,但未進一步限定其在上述生物學情境中的相對貢獻。
不同異構型的作用有所差異:分泌型異構型 2 至 6 在體外可阻斷細胞凋亡。這項觀察適用於體外條件,不應直接視為已確立其在體內的作用。整體而言,現有資料支持 FAS 透過受體活化、FADD 招募及 CASP8 活化,啟動凋亡相關的蛋白酶級聯;其免疫調節意義則以可能參與周邊耐受及成熟 T 細胞清除來描述。
Promoter 與基因調控
>FAS ENST00000652046 GRCh38 chr10:88989798-88990898 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGTGGACGATGCCAAAGGAATACTGAAACCTTTAGTGTGTCCAGTCTGGAACTGCATCCAAATTCAGGT TCAGTAATGATGTCATTATCCAAACATACCTTCTGTAAAATTCATGCTAAACTACCTAAGAGCTATCTAC CGTTCCAAAGCAATAGTGACTTTGAACAGTGTTCACCAGAGCACGAAAGAATTACAAGATTTTTTTTTAA AGAAAATTGGCCAGGAAATAATGAGTAACGAAGGACAGGAAGTAATTGTGAATGTTTAATATAGCTGGGG CTATGCGATTTGGCTTAAGTTGTTAGCTTTGTTTTCCTCTTGAGAAATAAAAACTAAGGGGCCCTCCCTT TTCAGAGCCCTATGGCGCAACATCTGTACTTTTTCATATGGTTAACTGTCCATTCCAGAAACGTCTGTGA GCCTCTCATGTTGCAGCCACAACATGGACAGCCCAGTCAAATGCCCCGCAAGTCTTTCTCTGAGTGACTC CAGCAATTAGCCAAGGCTCCTGTACCCAGGCAGGACCTCTGCGCTCTGAGCTCCATTCTCCTTCAAGACC TCCCCAACTTCCCAGGTTGAACTACAGCAGAAGCCTTTAGAAAGGGCAGGAGGCCGGCTCTCGAGGTCCT CACCTGAAGTGAGCATGCCAGCCACTGCAGGAACGCCCCGGGACAGGAATGCCCATTTGTGCAACGAACC CTGACTCCTTCCTCACCCTGACTTCTCCCCCTCCCTACCCGCGCGCAGGCCAAGTTGCTGAATCAATGGA GCCCTCCCCAACCCGGGCGTTCCCCAGCGAGGCTTCCTTCCCATCCTCCTGACCACCGGGGCTTTTCGTG AGCTCGTCTCTGATCTCGCGCAAGAGTGACACACAGGTGTTCAAAGACGCTTCTGGGGAGTGAGGGAAGC GGTTTACGAGTGACTTGGCTGGAGCCTCAGGGGCGGGCACTGGCACGGAACACACCCTGAGGCCAGCCCT GGCTGCCCAGGCGGAGCTGCCTCTTCTCCCGCGGGTTGGTGGACCCGCTCAGTACGGAGTTGGGGAAGCT CTTTCACTTCGGAGGATTGCTCAACAACCATGCTGGGCATCTGGACCCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAS_3 ↗ | 10:88,953,816 | 正股 | 88,953,767–88,953,826 |
| FAS_4 ↗ | 10:88,990,283 | 正股 | 88,990,234–88,990,293 |
| FAS_2 ↗ | 10:88,990,637 | 正股 | 88,990,588–88,990,647 |
| FAS_1 ↗ | 10:88,990,803 | 正股 | 88,990,754–88,990,813 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_84LM9W · promoter · 88986558–88986750 · regulatory
ENSR10_CBSF6 · enhancer · 88986751–88987779 · regulatory
ENSR10_5QX5FJ · CTCF_binding_site · 88987139–88987160 · regulatory
ENSR10_BMMSR · promoter · 88990069–88991026 · regulatory
ENSR10_84LMDM · promoter · 88991312–88991448 · regulatory
ENSR10_BMMSZ · enhancer · 88991449–88992263 · regulatory
ENSR10_93BBPD · enhancer · 88993100–88993597 · regulatory
ENSR10_93BBPL · enhancer · 88993968–88994238 · regulatory
ENSR10_84LMGC · promoter · 88994239–88994422 · regulatory
· motif · 88986659–88986672 · motif
· motif · 88986746–88986759 · motif
· motif · 88987102–88987113 · motif
· motif · 88987102–88987113 · motif
· motif · 88987108–88987123 · motif
· motif · 88987108–88987123 · motif
· motif · 88987141–88987157 · motif
· motif · 88987295–88987310 · motif
· motif · 88987480–88987488 · motif
· motif · 88987558–88987573 · motif
· motif · 88987999–88988014 · motif
· motif · 88987999–88988014 · motif
· motif · 88988000–88988014 · motif
· motif · 88988014–88988027 · motif
· motif · 88989820–88989842 · motif
· motif · 88989820–88989842 · motif
· motif · 88989872–88989885 · motif
· motif · 88989872–88989885 · motif
· motif · 88990159–88990168 · motif
· motif · 88990308–88990324 · motif
· motif · 88990669–88990678 · motif
· motif · 88990863–88990872 · motif
· motif · 88991148–88991155 · motif
· motif · 88991239–88991250 · motif
· motif · 88991239–88991250 · motif
· motif · 88991241–88991250 · motif
· motif · 88991372–88991385 · motif
· motif · 88991599–88991608 · motif
· motif · 88991599–88991610 · motif
· motif · 88991706–88991719 · motif
· motif · 88992023–88992036 · motif
· motif · 88993645–88993656 · motif
· motif · 88994311–88994324 · motif
· motif · 88995551–88995559 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:335 aa
Fas cell surface death receptor 長 335 個胺基酸。其 N 端訊號肽位於第 1–25 位,細胞外區為第 26–173 位,穿膜螺旋為第 174–190 位,細胞質區為第 191–335 位。細胞外區含 TNFR-Cys 1、2、3 三段重複序列;細胞質區含 Death domain(第 230–314 位)。另註有與 HIPK3 及 CALM 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Isoform 1 是細胞膜上的單次穿膜第一型膜蛋白,並定位於膜筏。 Isoform 2 至 6 則為分泌型;這些異構型在定位形式上不同於細胞膜上的 Isoform 1。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
未繪示構造:Membrane raft。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 12 個夥伴
- CALM3P62158 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CASP8Q14790 · UniProt INTERACTION · 15 experiments · 2 筆來源紀錄
- CAV1Q03135 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- DAXXQ9UER7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FADDQ13158 · UniProt INTERACTION · 22 experiments · 2 筆來源紀錄
- FASLGP48023 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PMLP29590 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PML-RARQ15156 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PTPN13Q12923 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRCP12931 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Pdcd6P12815 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- YES1P07947 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
FAS 是 DISC 的組成部分;此複合體包含細胞表面受體 FAS/CD95、FADD 與 CASP8,CASP8 招募至複合體對其加工成 p18 與 p10 次單元是必要的。FAS 也與 NOL3 直接互作;依相似性資料,NOL3 可抑制 DISC 組裝及 FAS 活化誘導的 FAS–FADD 結合增加。其他互作對象包括 DAXX、HIPK3、RIPK1、FAIM2、BABAM2、FEM1B 與 CALM;FAS 亦與 HIPK3、FADD 同屬一複合體(依相似性)。未受刺激時,FAS 與 BIRC2、DDX3X、GSK3B 互作;受體刺激會進一步增強與 BIRC2、DDX3X 的互作,並伴隨兩者被切割。
疾病與遺傳關聯
FAS 基因變異與自體免疫淋巴增生症 1A(ALPS1A)相關,來源將此病描述為由影響該基因的變異所致。此凋亡障礙通常在幼年期出現,並有自體反應性淋巴球累積;臨床特徵包括非惡性淋巴結腫大及肝脾腫大,也可能出現自體免疫性溶血性貧血、血小板減少與嗜中性球減少。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Fas cell surface death receptor 是 TNFSF6/FASLG 的受體。受體活化後,接頭分子 FADD 招募 CASP8,形成 death-inducing signaling complex(DISC);CASP8 在其中經蛋白水解活化,進而啟動介導細胞凋亡的 caspase 級聯反應。FAS 介導的凋亡可能參與周邊免疫耐受、抗原刺激後成熟 T 細胞的自我清除,或兩者兼具。分泌型異構型 2 至 6 在體外可阻斷凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for TNFSF6/FASLG. The adapter molecule FADD recruits caspase CASP8 to the activated receptor. The resulting death-inducing signaling complex (DISC) performs CASP8 proteolytic activation which initiates the subsequent cascade of caspases (aspartate-specific cysteine proteases) mediating apoptosis. FAS-mediated apoptosis may have a role in the induction of peripheral tolerance, in the antigen-stimulated suicide of mature T-cells, or both. The secreted isoforms 2 to 6 block apoptosis (in vitro) PMID 19118384 ↗ · PMID 7533181 ↗ · PMID 9184224 ↗ |
| 交互作用 | FAS、FADD 與 CASP8 組成 DISC;CASP8 招募至複合體是其加工成 p18 與 p10 次單元所必需。FAS 直接透過 DED domain 與 NOL3 的 CARD domain 互作;依相似性資料,NOL3 可抑制 DISC 組裝及 FAS 活化所誘導的 FAS–FADD 結合增加。FAS 另與 DAXX、HIPK3、RIPK1、FAIM2、BABAM2、FEM1B、CALM 互作,並與 HIPK3、FADD 同屬複合體(依相似性)。未受刺激時,FAS 與 BIRC2、DDX3X、GSK3B 互作;受體刺激會增強與 BIRC2、DDX3X 的互作,並伴隨兩者被切割。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the death-induced signaling complex (DISC) composed of cell surface receptor FAS/CD95, adapter protein FADD and the CASP8 protease; recruitment of CASP8 to the complex is required for processing of CASP8 into the p18 and p10 subunits. Interacts directly (via DED domain) with NOL3 (via CARD domain); inhibits death-inducing signaling complex (DISC) assembly by inhibiting the increase in FAS-FADD binding induced by FAS activation (By similarity). Binds DAXX. Interacts with HIPK3 (By similarity). Part of a complex containing HIPK3 and FADD (By similarity). Binds RIPK1 and FAIM2. Interacts with BABAM2 and FEM1B. Interacts with CALM. In the absence of stimulation, interacts with BIRC2, DDX3X and GSK3B. The interaction with BIRC2 and DDX3X is further enhanced upon receptor stimulation and accompanied by DDX3X and BIRC2 cleavage PMID 10535980 ↗ · PMID 10542291 ↗ · PMID 15465831 ↗ · PMID 18846110 ↗ · PMID 19118384 ↗ · PMID 21109225 ↗ · PMID 24914971 ↗ · PMID 7538908 ↗ · PMID 9184224 ↗ · PMID 9322534 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 1 是細胞膜上的單次穿膜第一型膜蛋白,並位於膜筏。 | 含實驗來源 | 證據與來源Isoform 1; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Membrane raft PMID 1713127 ↗ · PMID 25301068 ↗ |
| 細胞定位 | Isoform 2; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 3; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 4; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 5; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | Isoform 6; Secreted | 資料庫紀錄 | |
| 疾病關聯 | 自體免疫淋巴增生症 1A(ALPS1A)是一種凋亡障礙,通常在幼年期發病,並造成自體反應性淋巴球累積;其特徵包括非惡性淋巴結腫大及肝脾腫大,也可有自體免疫性溶血性貧血、血小板減少與嗜中性球減少。此病由影響該基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源Autoimmune lymphoproliferative syndrome 1A ALPS1A A disorder of apoptosis that manifests in early childhood and results in the accumulation of autoreactive lymphocytes. It is characterized by non-malignant lymphadenopathy with hepatosplenomegaly, and autoimmune hemolytic anemia, thrombocytopenia and neutropenia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601859 PMID 10090885 ↗ · PMID 10340403 ↗ · PMID 10515860 ↗ · PMID 11418480 ↗ · PMID 17336828 ↗ · PMID 20935634 ↗ · PMID 7540117 ↗ · PMID 8929361 ↗ · PMID 9028321 ↗ · PMID 9028957 ↗ · PMID 9322534 ↗ · PMID 9821419 ↗ · PMID 9927496 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCTCCCGCGGGTTGGTGGACCCGCTCAGTACGGAGT40TGGGGAAGCTCTTTCACTTCGGAGGATTGCTCAACAACCA80TGCTGGGCATCTGGACCCTCCTACCTCTGGTTCTTACGTC120TGTTGCTAGATTATCGTCCAAAAGTGTTAATGCCCAAGTG160ACTGACATCAACTCCAAGGGATTGGAATTGAGGAAGACTG200TTACTACAGTTGAGACTCAGAACTTGGAAGGCCTGCATCA240TGATGGCCAATTCTGCCATAAGCCCTGTCCTCCAGGTGAA280AGGAAAGCTAGGGACTGCACAGTCAATGGGGATGAACCAG320ACTGCGTGCCCTGCCAAGAAGGGAAGGAGTACACAGACAA360AGCCCATTTTTCTTCCAAATGCAGAAGATGTAGATTGTGT400GATGAAGGACATGGCTTAGAAGTGGAAATAAACTGCACCC440GGACCCAGAATACCAAGTGCAGATGTAAACCAAACTTTTT480TTGTAACTCTACTGTATGTGAACACTGTGACCCTTGCACC520AAATGTGAACATGGAATCATCAAGGAATGCACACTCACCA560GCAACACCAAGTGCAAAGAGGAAGGATCCAGATCTAACTT600GGGGTGGCTTTGTCTTCTTCTTTTGCCAATTCCACTAATT640GTTTGGGTGAAGAGAAAGGAAGTACAGAAAACATGCAGAA680AGCACAGAAAGGAAAACCAAGGTTCTCATGAATCTCCAAC720TTTAAATCCTGAAACAGTGGCAATAAATTTATCTGATGTT760GACTTGAGTAAATATATCACCACTATTGCTGGAGTCATGA800CACTAAGTCAAGTTAAAGGCTTTGTTCGAAAGAATGGTGT840CAATGAAGCCAAAATAGATGAGATCAAGAATGACAATGTC880CAAGACACAGCAGAACAGAAAGTTCAACTGCTTCGTAATT920GGCATCAACTTCATGGAAAGAAAGAAGCGTATGACACATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。